DC-Rap Technischer Import von medizinischen Bilddaten

Transkript

1 r Import r Import von medizinischen und freie 29. Januar 2008

2 Allgemeines r Import Dieser Vortrag ist veröffentlicht unter und freie Dieser Vortrag ist lizensiert unter Creative Commons BY 3.0

3 Übersicht r Import und freie und freie

4 Übersicht r Import und freie und freie

5 Blinded Readings Klinik Klinik Klinik Klinik Klinik r Import Tech. Import / Verblindung und freie Experte Experte Experte Experte Experte Ziel: größtmögliche Objektivität der Experten Transparenz Dokumentation

6 Blinded Readings Klinik Klinik Klinik Klinik Klinik r Import Tech. Import / Verblindung und freie Experte Experte Experte Experte Experte Ziel: größtmögliche Objektivität der Experten Transparenz Dokumentation

7 Blinded Readings Klinik Klinik Klinik Klinik Klinik r Import Tech. Import / Verblindung und freie Experte Experte Experte Experte Experte Ziel: größtmögliche Objektivität der Experten Transparenz Dokumentation

8 r Import / Verblindung Überprüfung Reparatur r Import und freie Dokumentation Markierung Anonymisierung Verblindung

9 Auftraggeber Bayer Schering Pharma AG Auftragnehmer Rent a PACS GmbH - Multimediale Archive Auftrag r Import (von CDs) Datenformat: DICOM-Standard Grafik und Zusatzinformationen DICOM-Überprüfung DICOM-Reparatur DICOM-Änderung Markierung, Anonymisierung, Verblindung Integration mit vorhandener GUI Name DICOM-Parser von Rent a PACS r Import und freie

10 Auftraggeber Bayer Schering Pharma AG Auftragnehmer Rent a PACS GmbH - Multimediale Archive Auftrag r Import (von CDs) Datenformat: DICOM-Standard Grafik und Zusatzinformationen DICOM-Überprüfung DICOM-Reparatur DICOM-Änderung Markierung, Anonymisierung, Verblindung Integration mit vorhandener GUI Name DICOM-Parser von Rent a PACS r Import und freie

11 Auftraggeber Bayer Schering Pharma AG Auftragnehmer Rent a PACS GmbH - Multimediale Archive Auftrag r Import (von CDs) Datenformat: DICOM-Standard Grafik und Zusatzinformationen DICOM-Überprüfung DICOM-Reparatur DICOM-Änderung Markierung, Anonymisierung, Verblindung Integration mit vorhandener GUI Name DICOM-Parser von Rent a PACS r Import und freie

12 Auftraggeber Bayer Schering Pharma AG Auftragnehmer Rent a PACS GmbH - Multimediale Archive Auftrag r Import (von CDs) Datenformat: DICOM-Standard Grafik und Zusatzinformationen DICOM-Überprüfung DICOM-Reparatur DICOM-Änderung Markierung, Anonymisierung, Verblindung Integration mit vorhandener GUI Name DICOM-Parser von Rent a PACS r Import und freie

13 Auftraggeber Bayer Schering Pharma AG Auftragnehmer Rent a PACS GmbH - Multimediale Archive Auftrag r Import (von CDs) Datenformat: DICOM-Standard Grafik und Zusatzinformationen DICOM-Überprüfung DICOM-Reparatur DICOM-Änderung Markierung, Anonymisierung, Verblindung Integration mit vorhandener GUI Name DICOM-Parser von Rent a PACS r Import und freie

14 Auftraggeber Bayer Schering Pharma AG Auftragnehmer Rent a PACS GmbH - Multimediale Archive Auftrag r Import (von CDs) Datenformat: DICOM-Standard Grafik und Zusatzinformationen DICOM-Überprüfung DICOM-Reparatur DICOM-Änderung Markierung, Anonymisierung, Verblindung Integration mit vorhandener GUI Name DICOM-Parser von Rent a PACS r Import und freie

15 Auftraggeber Bayer Schering Pharma AG Auftragnehmer Rent a PACS GmbH - Multimediale Archive Auftrag r Import (von CDs) Datenformat: DICOM-Standard Grafik und Zusatzinformationen DICOM-Überprüfung DICOM-Reparatur DICOM-Änderung Markierung, Anonymisierung, Verblindung Integration mit vorhandener GUI Name DICOM-Parser von Rent a PACS r Import und freie

16 Auftraggeber Bayer Schering Pharma AG Auftragnehmer Rent a PACS GmbH - Multimediale Archive Auftrag r Import (von CDs) Datenformat: DICOM-Standard Grafik und Zusatzinformationen DICOM-Überprüfung DICOM-Reparatur DICOM-Änderung Markierung, Anonymisierung, Verblindung Integration mit vorhandener GUI Name DICOM-Parser von Rent a PACS r Import und freie

17 Qualitätssicherung fester Ansprechpartner beim Kunden Fehlerbehandlung ausführlich mit Kunden besprochen Dokumentation zitieren des DICOM-Standards im Quelltext Debugging-Ausgaben interne Unit-Tests für kritische Funktionen externe Unit-Tests für Verarbeitung von DICOM-Dateien großes Spektrum an realen(!) Abweichungen vom DICOM-Standard läuft sehr stabil r Import und freie

18 Qualitätssicherung fester Ansprechpartner beim Kunden Fehlerbehandlung ausführlich mit Kunden besprochen Dokumentation zitieren des DICOM-Standards im Quelltext Debugging-Ausgaben interne Unit-Tests für kritische Funktionen externe Unit-Tests für Verarbeitung von DICOM-Dateien großes Spektrum an realen(!) Abweichungen vom DICOM-Standard läuft sehr stabil r Import und freie

19 Qualitätssicherung fester Ansprechpartner beim Kunden Fehlerbehandlung ausführlich mit Kunden besprochen Dokumentation zitieren des DICOM-Standards im Quelltext Debugging-Ausgaben interne Unit-Tests für kritische Funktionen externe Unit-Tests für Verarbeitung von DICOM-Dateien großes Spektrum an realen(!) Abweichungen vom DICOM-Standard läuft sehr stabil r Import und freie

20 Qualitätssicherung fester Ansprechpartner beim Kunden Fehlerbehandlung ausführlich mit Kunden besprochen Dokumentation zitieren des DICOM-Standards im Quelltext Debugging-Ausgaben interne Unit-Tests für kritische Funktionen externe Unit-Tests für Verarbeitung von DICOM-Dateien großes Spektrum an realen(!) Abweichungen vom DICOM-Standard läuft sehr stabil r Import und freie

21 Qualitätssicherung fester Ansprechpartner beim Kunden Fehlerbehandlung ausführlich mit Kunden besprochen Dokumentation zitieren des DICOM-Standards im Quelltext Debugging-Ausgaben interne Unit-Tests für kritische Funktionen externe Unit-Tests für Verarbeitung von DICOM-Dateien großes Spektrum an realen(!) Abweichungen vom DICOM-Standard läuft sehr stabil r Import und freie

22 Qualitätssicherung fester Ansprechpartner beim Kunden Fehlerbehandlung ausführlich mit Kunden besprochen Dokumentation zitieren des DICOM-Standards im Quelltext Debugging-Ausgaben interne Unit-Tests für kritische Funktionen externe Unit-Tests für Verarbeitung von DICOM-Dateien großes Spektrum an realen(!) Abweichungen vom DICOM-Standard läuft sehr stabil r Import und freie

23 Qualitätssicherung fester Ansprechpartner beim Kunden Fehlerbehandlung ausführlich mit Kunden besprochen Dokumentation zitieren des DICOM-Standards im Quelltext Debugging-Ausgaben interne Unit-Tests für kritische Funktionen externe Unit-Tests für Verarbeitung von DICOM-Dateien großes Spektrum an realen(!) Abweichungen vom DICOM-Standard läuft sehr stabil r Import und freie

24 Qualitätssicherung fester Ansprechpartner beim Kunden Fehlerbehandlung ausführlich mit Kunden besprochen Dokumentation zitieren des DICOM-Standards im Quelltext Debugging-Ausgaben interne Unit-Tests für kritische Funktionen externe Unit-Tests für Verarbeitung von DICOM-Dateien großes Spektrum an realen(!) Abweichungen vom DICOM-Standard läuft sehr stabil r Import und freie

25 Übersicht r Import und freie und freie

26 Steckbrief Betriebssystem GNU/Linux BSD? (Cygwin?) Compiler GCC / C++ Standard-Libraries libiconv, libuuid, libglib mitgelieferte Libraries libxml, libxslt, libs11n Auslieferung Quellcode-Paket (930 KB, LOC, 980 Commits) RPM-Paket (450 KB) Gesamt-Paket (27 MB) r Import und freie

27 Steckbrief Betriebssystem GNU/Linux BSD? (Cygwin?) Compiler GCC / C++ Standard-Libraries libiconv, libuuid, libglib mitgelieferte Libraries libxml, libxslt, libs11n Auslieferung Quellcode-Paket (930 KB, LOC, 980 Commits) RPM-Paket (450 KB) Gesamt-Paket (27 MB) r Import und freie

28 Steckbrief Betriebssystem GNU/Linux BSD? (Cygwin?) Compiler GCC / C++ Standard-Libraries libiconv, libuuid, libglib mitgelieferte Libraries libxml, libxslt, libs11n Auslieferung Quellcode-Paket (930 KB, LOC, 980 Commits) RPM-Paket (450 KB) Gesamt-Paket (27 MB) r Import und freie

29 Steckbrief Betriebssystem GNU/Linux BSD? (Cygwin?) Compiler GCC / C++ Standard-Libraries libiconv, libuuid, libglib mitgelieferte Libraries libxml, libxslt, libs11n Auslieferung Quellcode-Paket (930 KB, LOC, 980 Commits) RPM-Paket (450 KB) Gesamt-Paket (27 MB) r Import und freie

30 Steckbrief Betriebssystem GNU/Linux BSD? (Cygwin?) Compiler GCC / C++ Standard-Libraries libiconv, libuuid, libglib mitgelieferte Libraries libxml, libxslt, libs11n Auslieferung Quellcode-Paket (930 KB, LOC, 980 Commits) RPM-Paket (450 KB) Gesamt-Paket (27 MB) r Import und freie

31 Kommunikations-Wege zu r Import Kommandozeile (stdin/stdout) TCP/IP inetd xinetd Shared Folder -Script separates Shellscript beobachtet den Shared Folder Auftrags-XML-Datei -Ausgabe XML-Datei -Ausgabe CSV-Datei und freie

32 Kommunikations-Wege zu r Import Kommandozeile (stdin/stdout) TCP/IP inetd xinetd Shared Folder -Script separates Shellscript beobachtet den Shared Folder Auftrags-XML-Datei -Ausgabe XML-Datei -Ausgabe CSV-Datei und freie

33 Kommunikations-Wege zu r Import Kommandozeile (stdin/stdout) TCP/IP inetd xinetd Shared Folder -Script separates Shellscript beobachtet den Shared Folder Auftrags-XML-Datei -Ausgabe XML-Datei -Ausgabe CSV-Datei und freie

34 Kommunikations-Wege zu r Import Kommandozeile (stdin/stdout) TCP/IP inetd xinetd Shared Folder -Script separates Shellscript beobachtet den Shared Folder Auftrags-XML-Datei -Ausgabe XML-Datei -Ausgabe CSV-Datei und freie

35 Kommunikations-Wege zu r Import Kommandozeile (stdin/stdout) TCP/IP inetd xinetd Shared Folder -Script separates Shellscript beobachtet den Shared Folder Auftrags-XML-Datei -Ausgabe XML-Datei -Ausgabe CSV-Datei und freie

36 Kommunikations-Wege zu r Import Kommandozeile (stdin/stdout) TCP/IP inetd xinetd Shared Folder -Script separates Shellscript beobachtet den Shared Folder Auftrags-XML-Datei -Ausgabe XML-Datei -Ausgabe CSV-Datei und freie

37 Sprache von Offene Schnittstellen XML-Formate Syntax: XML-Schemas Semantik: Dokumentation Eingabe Domänenspezifische Spache (DSL) Konfigurationsdateien Ausgabe Critical-Log (wichtige Warnungen) Debug-Log Modify-Log Report(s) r Import und freie

38 Sprache von Offene Schnittstellen XML-Formate Syntax: XML-Schemas Semantik: Dokumentation Eingabe Domänenspezifische Spache (DSL) Konfigurationsdateien Ausgabe Critical-Log (wichtige Warnungen) Debug-Log Modify-Log Report(s) r Import und freie

39 Sprache von Offene Schnittstellen XML-Formate Syntax: XML-Schemas Semantik: Dokumentation Eingabe Domänenspezifische Spache (DSL) Konfigurationsdateien Ausgabe Critical-Log (wichtige Warnungen) Debug-Log Modify-Log Report(s) r Import und freie

40 Vorführung r Import und freie

41 Übersicht r Import und freie und freie

42 nutzt freie läuft unter RHEL 4 nutzt ausschließlich freie Libraries nutzt ausschließlich freie Hilfsprogramme r Import und freie bash, sed,... GPL libiconv LGPL libuuid BSD (3-Klausel) libglib 2.4 LGPL libxml MIT/X11 xsltproc (libxslt) MIT/X11 libs11n 1.2 Public Domain

43 nutzt freie läuft unter RHEL 4 nutzt ausschließlich freie Libraries nutzt ausschließlich freie Hilfsprogramme r Import und freie bash, sed,... GPL libiconv LGPL libuuid BSD (3-Klausel) libglib 2.4 LGPL libxml MIT/X11 xsltproc (libxslt) MIT/X11 libs11n 1.2 Public Domain

44 nutzt freie läuft unter RHEL 4 nutzt ausschließlich freie Libraries nutzt ausschließlich freie Hilfsprogramme r Import und freie bash, sed,... GPL libiconv LGPL libuuid BSD (3-Klausel) libglib 2.4 LGPL libxml MIT/X11 xsltproc (libxslt) MIT/X11 libs11n 1.2 Public Domain

45 nutzt freie läuft unter RHEL 4 nutzt ausschließlich freie Libraries nutzt ausschließlich freie Hilfsprogramme r Import und freie bash, sed,... GPL libiconv LGPL libuuid BSD (3-Klausel) libglib 2.4 LGPL libxml MIT/X11 xsltproc (libxslt) MIT/X11 libs11n 1.2 Public Domain

46 mit freier entwickelt r Import Betriebssystem (Entwicklungsrechner) Debian 4.0 (Etch) SuSE 10.0 CentOS 4.3 (kompatibel zu RHEL 4) Editor Vim Eclipse KHexEdit Versionskontrolle Mercurial (hg) und freie

47 mit freier entwickelt r Import Betriebssystem (Entwicklungsrechner) Debian 4.0 (Etch) SuSE 10.0 CentOS 4.3 (kompatibel zu RHEL 4) Editor Vim Eclipse KHexEdit Versionskontrolle Mercurial (hg) und freie

48 mit freier entwickelt r Import Betriebssystem (Entwicklungsrechner) Debian 4.0 (Etch) SuSE 10.0 CentOS 4.3 (kompatibel zu RHEL 4) Editor Vim Eclipse KHexEdit Versionskontrolle Mercurial (hg) und freie

49 mit freier entwickelt (2) r Import Build-System GCC make autoconf, automake Debugger gdb KDbg (GUI für gdb) Profiler Valgrind KCacheGrind (GUI für Valgrind) und freie

50 mit freier entwickelt (2) r Import Build-System GCC make autoconf, automake Debugger gdb KDbg (GUI für gdb) Profiler Valgrind KCacheGrind (GUI für Valgrind) und freie

51 mit freier entwickelt (2) r Import Build-System GCC make autoconf, automake Debugger gdb KDbg (GUI für gdb) Profiler Valgrind KCacheGrind (GUI für Valgrind) und freie

52 Freie SHA1-Implementierung Was ist SHA1? Einsatz in Checksumme zwischen verschiedenen Durchläufen Gute Implementierung für C++? Gute Implementierung für C Steve Reid: Implementierung für C Bruce Guenter: Anpassung für bglibs Umsetzung nach C++ viele kleine Verbesserungen Public Domain Separates Projekt r Import und freie

53 Freie SHA1-Implementierung Was ist SHA1? Einsatz in Checksumme zwischen verschiedenen Durchläufen Gute Implementierung für C++? Gute Implementierung für C Steve Reid: Implementierung für C Bruce Guenter: Anpassung für bglibs Umsetzung nach C++ viele kleine Verbesserungen Public Domain Separates Projekt r Import und freie

54 Freie SHA1-Implementierung Was ist SHA1? Einsatz in Checksumme zwischen verschiedenen Durchläufen Gute Implementierung für C++? Gute Implementierung für C Steve Reid: Implementierung für C Bruce Guenter: Anpassung für bglibs Umsetzung nach C++ viele kleine Verbesserungen Public Domain Separates Projekt r Import und freie

55 Freie SHA1-Implementierung Was ist SHA1? Einsatz in Checksumme zwischen verschiedenen Durchläufen Gute Implementierung für C++? Gute Implementierung für C Steve Reid: Implementierung für C Bruce Guenter: Anpassung für bglibs Umsetzung nach C++ viele kleine Verbesserungen Public Domain Separates Projekt r Import und freie

56 Freie SHA1-Implementierung Was ist SHA1? Einsatz in Checksumme zwischen verschiedenen Durchläufen Gute Implementierung für C++? Gute Implementierung für C Steve Reid: Implementierung für C Bruce Guenter: Anpassung für bglibs Umsetzung nach C++ viele kleine Verbesserungen Public Domain Separates Projekt r Import und freie

57 Freie SHA1-Implementierung Was ist SHA1? Einsatz in Checksumme zwischen verschiedenen Durchläufen Gute Implementierung für C++? Gute Implementierung für C Steve Reid: Implementierung für C Bruce Guenter: Anpassung für bglibs Umsetzung nach C++ viele kleine Verbesserungen Public Domain Separates Projekt r Import und freie

58 Freie SHA1-Implementierung Was ist SHA1? Einsatz in Checksumme zwischen verschiedenen Durchläufen Gute Implementierung für C++? Gute Implementierung für C Steve Reid: Implementierung für C Bruce Guenter: Anpassung für bglibs Umsetzung nach C++ viele kleine Verbesserungen Public Domain Separates Projekt r Import und freie

59 Freie SHA1-Implementierung Was ist SHA1? Einsatz in Checksumme zwischen verschiedenen Durchläufen Gute Implementierung für C++? Gute Implementierung für C Steve Reid: Implementierung für C Bruce Guenter: Anpassung für bglibs Umsetzung nach C++ viele kleine Verbesserungen Public Domain Separates Projekt r Import und freie

60 Freie SHA1-Implementierung Was ist SHA1? Einsatz in Checksumme zwischen verschiedenen Durchläufen Gute Implementierung für C++? Gute Implementierung für C Steve Reid: Implementierung für C Bruce Guenter: Anpassung für bglibs Umsetzung nach C++ viele kleine Verbesserungen Public Domain Separates Projekt r Import und freie

61 Anwenderfreiheiten bei Spezialsoftware r Import Freie heißt: Jeder darf das Programm zu jedem Zweck ausführen studieren und verändern verbreiten verbessern und verbreiten jeder = Zielgruppe Bei Spezialanfertigungen: Zielgruppe = Auftraggeber Spezialanfertigungen sind freie? und freie

62 Anwenderfreiheiten bei Spezialsoftware r Import Freie heißt: Jeder darf das Programm zu jedem Zweck ausführen studieren und verändern verbreiten verbessern und verbreiten jeder = Zielgruppe Bei Spezialanfertigungen: Zielgruppe = Auftraggeber Spezialanfertigungen sind freie? und freie

63 Anwenderfreiheiten bei Spezialsoftware r Import Freie heißt: Jeder darf das Programm zu jedem Zweck ausführen studieren und verändern verbreiten verbessern und verbreiten jeder = Zielgruppe Bei Spezialanfertigungen: Zielgruppe = Auftraggeber Spezialanfertigungen sind freie? und freie

64 Anwenderfreiheiten bei Spezialsoftware r Import Freie heißt: Jeder darf das Programm zu jedem Zweck ausführen studieren und verändern verbreiten verbessern und verbreiten jeder = Zielgruppe Bei Spezialanfertigungen: Zielgruppe = Auftraggeber Spezialanfertigungen sind freie? und freie

65 Ende r Import und freie Vielen Dank für Ihre Aufmerksamkeit!