Metadatenmanagement in MIRACUM. Dennis Kadioglu KAIROS-Workshop»Meta Data Repository/MDR«

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1 Metadatenmanagement in MIRACUM Dennis Kadioglu KAIROS-Workshop»Meta Data Repository/MDR«0

2 Metadaten in MIRACUM Ziel: Von Beginn an eine möglichst detaillierte und formale Beschreibung der an den Standorten dokumentierten Informationen Wir unterscheiden dabei Metadaten für 1.Datenelemente 2.Datensätze 3.Dokumente und Bilder 4.Provenance (ist zum Teil schon in 1, 2 und 3 enthalten) 1

3 DIZ-Architektur Clinical Module ID-Management Module Reporting (including identifiable) for routine care, quality mgmt, controlling Routine business intelligence Maintains structured participant consent information Consent- Management Queries for cohort identification/feasibility studies aggregated analyses; anonymized or pseudonymized microdata queries Source system 1 2 Comm - Server Source system 2 Clinical data repository Clinical Decision Support NLP Local ID- Management Maintains local master patient index; generates primary as well as project-specific pseudonyms data repository Federation data longterm archive

4 Interkonsortiale Vernetzung Consent Management queries Consent Management data repository Local search client Central search broker Local search client data repository Local ID-Management Central record linkage Local ID-Management Site A Site B 3

5 Metadatendienste - lokal Clinical Module ID-Management Module ETL Reporting (including identifiable) for routine care, quality mgmt, controlling Routine business intelligence Maintains structured participant consent information Consent- Management Queries for cohort identification/feasibility studies aggregated analyses; anonymized or pseudonymized microdata queries Anfragen formulieren 4 Source system 1 Comm - Server Source system 2 MDR Clinical data repository Clinical Decision Support NLP Local ID- Management Maintains local master patient index; generates primary as well as project-specific pseudonyms MDR data repository Federation data longterm archive

6 5 Metadatendienste - global data repository Local ID-Management Consent Management Site A data repository Local ID-Management Consent Management Central search broker Site B Local search client Local search client queries Central record linkage Anfragen übersetzen Anfragen übersetzen MDR Anfragen übersetzen MDR Anfragen übersetzen MDR Anfragen formulieren

7 Datenintegration mit Hilfe von Metadaten Metadatenbasierte Implementierung von ETL- Prozessen Formulierung von Queries und Suchanfragen basierend auf den im MDR beschriebenen Datenelementen Mappings zwischen Datenelementen innerhalb eines Standortes. aus dem MDR eines DIZ und dem zentralen MIRACUM- MDR. aus dem MDR eines DIZ und denjenigen aus dem MDR eines weiteren DIZ. 6

8 Standards und Softwarelösungen (1) object class patient property disease Conceptual Representational data element concept patient's disease data element conceptual domain liver angiosarcoma gastrinoma value domain 7 Diagnosis (ICD-10) C22.3 C25.4

9 Standards und Softwarelösungen (2) 8

10 Standards und Softwarelösungen (2) 9

11 Standards und Softwarelösungen (3) 10

12 Standards und Softwarelösungen (3) 11

13 Standards und Softwarelösungen (3) 12

14 Standards und Softwarelösungen (3) 13

15 MIRACOLIX Tools 14

16 MIRACOLIX Tools Medical Informatics ReusAble eco-system of open source Linkable and Interoperable software tools 15

17 MIRACOLIX Tools Medical Informatics ReusAble eco-system of open source Linkable and Interoperable software tools 16

18 M-MDR 17

19 M-MDR 18

20 M-MDR 19

21 MDRs in MIRACUM M-MDR als zentrales MDR für das gesamte Konsortium -> harmonisierte, gemeinsame Datensätze Lokales MDR an jedem Standort des Konsortiums -> individuelle, lokal genutzte Datensätze Namespaces zur Organisation und Rechtevergabe lokal und global Übergreifende Suche nach bereits existierenden Datenelementen -> Wiederverwendung, falls möglich und sinnvoll 20

22 Nächste Schritte Erfassung der lokal verwendeten Datenelemente an allen Standorten Priorisierung und Eingrenzung noch offen, folgt aber in jedem Fall NSG-Vorgaben Ableitung sinnvoller gemeinsamer Datensätze unter Berücksichtigung existierender Standards 21

23 Einige offene Fragen Mappings im MDR oder in einer weiteren Softwarekomponente? Wie sehen diese aus? Konkrete Ausspezifizierung und Umsetzung einer Föderation von MDRs in MIRACUM Wie kann diese aussehen? IT-Unterstützung für Abstimmung von gemeinsamen Datensätzen im MDR oder weitere Softwarekomponente? Terminologien, Klassifikationen, Ontologien im MDR oder einer weiteren Softwarekomponente? 22