Medizininformatik für eine datenbasierte Gesundheitsversorgung und Forschung. Dennis Kadioglu CCC-AG-Doku

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1 Medizininformatik für eine datenbasierte Gesundheitsversorgung und Forschung Dennis Kadioglu CCC-AG-Doku 0

2 Medizininformatik... ist die Wissenschaft der systematischen Erschließung, Verwaltung, Aufbewahrung, Verarbeitung und Bereitstellung von Daten, Informationen und Wissen in der Medizin und im Gesundheitswesen. Sie ist von dem Streben geleitet, damit zur Gestaltung der bestmöglichen Gesundheitsversorgung beizutragen. (Definition Medizinische Informatik, Deutsche Gesellschaft für Medizinische Informatik, Biometrie und Epidemiologie e. V.) 1

3 BMBF-Förderkonzept MI Ziel: ein vernetztes Gesundheitswesen für eine Verbesserung von Forschungsmöglichkeiten und Patientenversorgung Aufgabe: kontextübergreifender Austausch und gemeinsames Nutzen von Daten und Wissen Aufgabe: Kompetenzvermittlung für datengetriebene Versorgung und Forschung 2

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5 Konsortien ADMIRE DIFUTURE* HD4CR HiGHmed* MIRACUM* share-it SMITH* 4

6 BMBF-Förderkonzept MI Ziel: ein vernetztes Gesundheitswesen für eine Verbesserung von Forschungsmöglichkeiten und Patientenversorgung Aufgabe: kontextübergreifender Austausch und gemeinsames Nutzen von Daten und Wissen Aufgabe: Kompetenzvermittlung für datengetriebene Versorgung und Forschung 5

7 SAP LIMS DIC Ontologies E A V E A V Research Search & Compose Metadata Data 6

8 Verstehen wir uns denn? I m feeling cold. I caught a cold. My diagnosis: COLD 7

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11 Zusammenarbeit: Intern, extern und national BMBF verpflichtet ALLE geförderten Konsortien zur Mit- und Zusammenarbeit in einem Nationalen Steuerungsgremium Drei AGs (Broad) Consent / Consent Management Data Sharing, Use & Access Interoperabilität Telcos und Workshops -> Eckpunktepapiere 10

12 Medical Informatics for Research and Care in University Medicine ~200 Beteiligte 8 Universitätsklinika, 8 Medizinische Fakultäten, 2 Hochschulen 11

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14 Use Cases 1. Alerting in Care - IT Support for Patient Recruitment 2. From Data to Knowledge - Clinico-molecular predictive knowledge tool 3. From Knowledge to Action - support for Molecular Tumor Boards 4. Rare Diseases 13

15 Alerting in Care - IT Support for Patient Recruitment Etablierung eines Studienregisters An jedem Standort Standortübergreifend (selektiver Umfang) Formalisierung von Ein-/Ausschlusskriterien MIRACUM-Datenelemente für Probandenrekrutierung im M-MDR Benachrichtigung am klinischen Arbeitsplatz IT-unterstütztes Probandenmanagement 14

16 MIRACUM-Auswertungen 15

17 MIRACUM-Auswertungen 16

18 MIRACUM-Auswertungen 17

19 MIRACUM-Auswertungen 18

20 MIRACUM-Auswertungen 19

21 From Data to Knowledge - Clinicomolecular predictive knowledge tool Anwendung von Machine Learning zur Mustererkennung und zum Clustering Componentwise Boosting, Deep Boltzmann Machines Inklusion von Daten aus allen Standorten, basierend auf harmonisiertem Datenmodell OMOP CDM Alarmierung am klinischen Arbeitsplatz SMART-on-FHIR 20

22 SMART-on-FHIR 21

23 SMART-on-FHIR 22

24 SMART-on-FHIR 23

25 From Knowledge to Action - support for Molecular Tumor Boards Etablierung einer Infrastruktur für das Teilen und gemeinsame Nutzen von Analyse-Pipelines für Hochdurchsatzdaten (Wissen teilen, Qualität sichern) Aufbau einer MIRACUM-Datenbank für genetische Varianten IT-Unterstützung für die Auswertung, Interpretation und Dokumentation in Molekularen Tumorboards 24

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27 Rare Diseases Identifikation von ähnlichen Patienten(-fällen) an den MIRACUM-Standorten zur Diagnosenunterstützung Identifikation der passenden Ansprechpartner/Experten im SE-Atlas Präsentation am klinischen Arbeitsplatz SMART-on-FHIR 26

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29 Use & Access 28

30 GUF is MIRACUM competence center IT-Unterstützung: MIRACOLIX Medical Informatics ReusAble ecosystem of Open source Linkable and Interoperable software tools Primary Data Sources ID-Management Tools Data Anonymization Tools Metadata Repository Data Harmonisation / Mapping Tool Natural Language Processing Tool ETL Tools Tools for Data Quality Analysis, Reporting and Visualisation Long-Term Research Data Archive Hospital-/Faculty- /MIRACUM-wide Trial- /Project Registry Data Integration and Data Exploration Repositories Modules for innovative user-friendly and efficient patient care process visualization Federated Authentication Consent Management System Project Proposal Management Tool IT infrastructure to share and easily deploy software pipelines Connector Component(s) Tools for Development, Deployment and Monitoring of IT Solutions 29

31 BMBF-Förderkonzept MI Ziel: ein vernetztes Gesundheitswesen für eine Verbesserung von Forschungsmöglichkeiten und Patientenversorgung Aufgabe: kontextübergreifender Austausch und gemeinsames Nutzen von Daten und Wissen Aufgabe: Kompetenzvermittlung für datengetriebene Versorgung und Forschung 30

32 Strengthening Medical Informatics Master Programme "Biomedical Informatics and Medical Data Science Fortbildungsprogramm für Mediziner Online-Kurse Summer Schools Training und Hospitation in der Konzeptphase und bis heute: 40 Webinare 31

33 Open Data? the culture of data sharing will be levelled up from a project-by-project based approach to daily common practice. Learning Health(care) System 32