Einsatz von LIMS bei KWS. Jörg Ochsmann INS-DV KWS SAAT AG Einbeck - Germany

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1 Einsatz von LIMS bei KWS Jörg Ochsmann INS-DV KWS SAAT AG Einbeck - Germany

2 Was ist ein "LIMS"? LIMS = LaborInformations- und ManagementSystem Laborsoftware zur Erfassung von Labordaten Abbildung der Laborarbeitsabläufe (barcode-gestützte) Erfassung und Rückverfolgung aller Proben Verwaltung von Aufträgen / Projekten automatisierten Datenübernahme von / an Laborgeräte und Auftraggeber (Lagerverwaltung) (Verwaltung von Verbrauchsmaterial) (Kunden- und Lieferantendaten) in einer Datenbank das bei KWS verwendete Programm heißt "Nautilus" 2

3 LIMS-Labore bei KWS LIMS (Nautilus) wird derzeit in vier unterschiedlichen Laboren benutzt: Chemielabor (PCH seit 2002) "klassisches" Analytiklabor Qualitätslabor (PQL seit 2003) PLT Cell Service (PCS seit 2002) ca. 50 Mitarbeiter, 5 Laborräume Integration von Kulturräumen und Gewächshäusern Langzeitlagerung (Klonbank seit 1981) PLT Markerlabor (PMA im Aufbau) ca. 30 Mitarbeiter Hochdurchsatz 3

4 Ziele bei der Einführung von LIMS Reduzierung / Ablösung von handschriftlichen Aufzeichnungen, Probenbeschriftungen usw. Fehlervermeidung durch elektronische Datenübertragung und gleichzeitige Einführung eines Barcode-Systems Erfassung und strukturierte Ablage aller erfassten Labordaten in einer Datenbank Gewährleistung einer lückenlosen Probenverfolgung Zeitersparnis Bewältigung des zunehmenden Proben- / Datenaufkommens Bewältigung der zunehmenden Komplexität der Arbeitsabläufe Vernetzung der Datenbank mit anderen Systemen Neue Auswertungmöglichkeiten von Laborarbeitsabläufen und daten 4

5 Ziele bei der Einführung von LIMS Reduzierung / Ablösung von handschriftlichen Aufzeichnungen, Probenbeschriftungen usw. Fehlervermeidung durch elektronische Datenübertragung und gleichzeitige Einführung eines Barcode-Systems Erfassung und strukturierte Ablage aller erfassten Labordaten in einer Datenbank Gewährleistung einer lückenlosen Probenverfolgung Zeitersparnis Bewältigung des zunehmenden Proben- / Datenaufkommens Bewältigung der zunehmenden Komplexität der Arbeitsabläufe Vernetzung der Datenbank mit anderen Systemen Neue Auswertungmöglichkeiten von Laborarbeitsabläufen und daten 5

6 Beschriftung im Labor früher heute 6

7 Ziele bei der Einführung von LIMS Reduzierung / Ablösung von handschriftlichen Aufzeichnungen, Probenbeschriftungen usw. Fehlervermeidung durch elektronische Datenübertragung und gleichzeitige Einführung eines Barcode-Systems Erfassung und strukturierte Ablage aller erfassten Labordaten in einer Datenbank Gewährleistung einer lückenlosen Probenverfolgung Zeitersparnis Bewältigung des zunehmenden Proben- / Datenaufkommens Bewältigung der zunehmenden Komplexität der Arbeitsabläufe Vernetzung der Datenbank mit anderen Systemen Neue Auswertungmöglichkeiten von Laborarbeitsabläufen und daten 7

8 Datentransfer 1 Automatisierung des Datentransfers zur Fehlervermeidung Datenerfassung über Barcode MDEs Terminals / BDEs Anbindung von Laborgeräten Waagen HPLC N-Analysator O-Elektrode 8

9 Datentransfer im PLT Cell Service Aufbau der Labore File-Server/ Netzlaufwerk L:\ LIMS-Datenbank -Server PC mit LIMS Hintergrundprozess und Terminal mit Barcodeleser und Sondersoftware für Drucker Terminalkommunikation Station zur Datenübertragung vom MDE auf den PC 9

10 Datenerfassung mit MDE 10

11 Datenerfassung mit Terminal in Sterilbank 11

12 Ansicht der Daten im LIMS Datenverwaltung in Nautilus am Beispiel Klonbank Transgene: Laboransicht 12

13 Ziele bei der Einführung von LIMS Reduzierung / Ablösung von handschriftlichen Aufzeichnungen, Probenbeschriftungen usw. Fehlervermeidung durch elektronische Datenübertragung und gleichzeitige Einführung eines Barcode-Systems Erfassung und strukturierte Ablage aller erfassten Labordaten in einer Datenbank Gewährleistung einer lückenlosen Probenverfolgung Zeitersparnis Bewältigung des zunehmenden Proben- / Datenaufkommens Bewältigung der zunehmenden Komplexität der Arbeitsabläufe Vernetzung der Datenbank mit anderen Systemen Neue Auswertungmöglichkeiten von Laborarbeitsabläufen und daten 13

14 ZR-Spenderpflanzen im Gewächshaus 14

15 Ernte im Gewächshaus 15

16 Etikettierung 16

17 Cytologische Untersuchung 17

18 LIMS im Gewächshaus 18

19 Getopfte Pflanzen 19

20 Ziele bei der Einführung von LIMS Reduzierung / Ablösung von handschriftlichen Aufzeichnungen, Probenbeschriftungen usw. Fehlervermeidung durch elektronische Datenübertragung und gleichzeitige Einführung eines Barcode-Systems Erfassung und strukturierte Ablage aller erfassten Labordaten in einer Datenbank Gewährleistung einer lückenlosen Probenverfolgung Zeitersparnis Bewältigung des zunehmenden Proben- / Datenaufkommens Bewältigung der zunehmenden Komplexität der Arbeitsabläufe Vernetzung der Datenbank mit anderen Systemen Neue Auswertungmöglichkeiten von Laborarbeitsabläufen und daten 20

21 Arbeitsabläufe: Beispiel ZR-DH-Produktion Flussdiagramm Nautilus Workflow 21

22 Auswertungen und Berichte Spezialisierte Access-Tools über lesende ODBC-Verbindung Tool für komplexe Auswertungen (Labornutzer) Tägliche Berichte Jahresberichte Planung Export nach Excel Tool für Klonbank (Nicht-Labornutzer) Spezialisierte Übersicht Komplexe dynamische Filter Export nach Excel 22

23 Auswertungen und Berichte Beispiel 1 23

24 Auswertungen und Berichte Beispiel 2 24

25 Ziele bei der Einführung von LIMS Reduzierung / Ablösung von handschriftlichen Aufzeichnungen, Probenbeschriftungen usw. Fehlervermeidung durch elektronische Datenübertragung und gleichzeitige Einführung eines Barcode-Systems Gewährleistung einer lückenlosen Probenverfolgung Zeitersparnis Erfassung und strukturierte Ablage aller Labordaten in einer Datenbank Bewältigung des zunehmenden Proben- / Datenaufkommens Bewältigung der zunehmenden Komplexität der Arbeitsabläufe Vernetzung der Datenbank mit anderen Systemen Neue Auswertungmöglichkeiten von Laborarbeitsabläufen und daten 25

26 Datentransfer 2 Automatisierung des Datentransfers zur Fehlervermeidung Standardisierung und Automatisierung der Schnittstellen LIMS LIMS Zuchtdatenbanken (IBIS, ÖfDB) SAP LVS MarkerDB 26

27 LIMS Hauptsysteme Zuchtdatenbanken Sybase, Access Lagerverwaltung / Saatgutversand Sybase (LVS) Sortenregister Sybase Marker-DB Oracle (mit Access-Frontend) Labordaten- Management Oracle (LIMS) PlantData Warehouse ( Gendatenbank ) Access Anwendungsdokumentation Datenerfassung Qualitätsdaten Rübenlabor ZKW Beetmobil biom. Verrechnung Genstat statistica (PSW) Datentransfer Access, ODBC, Standard-Schnittstellen, Fileserver (LIMS) Active Sync (MDE) Felddatenerfassung Symbol PDT 8100 (MDE 2004, Pocket Excel) Biomax / Biogemma (Sequenzanalyse gegen öff. Daten, Datenintegration) Labordatenerfassung MDE / LIMS Planungstools Access-Frontends Flächenplanung Datenausgabe 27 Datentransfer zurück in die Ursprungs-DBs Access, ODBC Datentransfer Access, ODBC Standard-Schnittstellen, Fileserver (LIMS) Active Sync (MDE) Grafikausgabe Statistica Excel Auswertungen Access Datentransfer zurück in die Ursprungs-DBs Access, ODBC