F&E-Informationsmanagement bei KWS

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Irmgard Lichtenberg
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1 Sommertagung Biometrie 8./9. Juni 2006 F&E-Informationsmanagement bei KWS Werner Schultz KWS SAAT AG, Einbeck

2 Organigramm Züchtung & Forschung Institutsleitung G. Strittmatter Züchtung und Forschung Services und Steuerung Zuckerrübe INS-ZR R. Jansen Zuchtstationen INS-ZS H. Klingemann Zentrale Serviceeinheiten INS-SE H. Harling Controlling Koordination Verwaltung G. Strittmatter Mais INS-MA R. Leipert Raps/Zwischenfrüchte INS-ÖF A. Gertz PLANTA R. Nehls Phytopathologie INS-PL B. Holtschulte Chemie INS-CH E. Hilscher Datenverarbeitung INS-DV W. Schultz Controlling/ Verwaltung INS-CT R. Heidhues Patentmanagement INS-PT M. Pohl Zuchtmethodik A. Zacharias Neue Aktivitäten INS-NA H. Harling Qualitätsmanagement B. Heberle

Leipert Raps/Zwischenfrüchte INS-ÖF A. Gertz PLANTA R. Nehls Phytopathologie INS-PL B. Holtschulte Chemie INS-CH E. Hilscher Datenverarbeitung INS-DV W.

3 INS-DV interne Serviceabteilung für das F&E-Informationsmanagement INS-DV Gesamtkoordination W. Schultz Andreas Menze Biocomputing LIMS Werner Schultz A. Menze A. Klocke / J. Ochsmann Biometrie Datenmanagement (Access) Bernd Truberg B. Truberg / W. Puscz / J. Hahne J. Ochsmann / Y. Akgün Annette Klocke Projektkoordination Sybase-Anw. Info-Management Lotus Notes W. Schultz / M.-M. Nafe A. Menze / R. Fingerhut Michael Nafe Jörg Ochsmann Druckservice Forschungskooperationen H. Henne / R. Fingerhut A. Menze Heidi Henne IT-Koordination Anwendungsbetreuung Jürgen Hahne W. Schultz / A. Menze Diverse Reinhilde Fingerhut Y. Akgün

Akgün Annette Klocke Projektkoordination Sybase-Anw. Info-Management Lotus Notes W. Schultz / M.-M. Nafe A. Menze / R.

4 Begriffsdefinition Bioinformatik bei KWS = Züchtungsinformatik = F&E-Informationsmanagement Ziel: die durchgängige datentechnische Unterstützung der Zuchtprozesse vom Feldversuchswesen bis zur Biotechnologie

5 F&E-Informationen Saatgutbestände Abstammungen Qualitätsdaten Sortenanmeldungen Versanddaten Feldpläne Boniturdaten Interne Aufträge Probenverfolgung Versuchspläne Randomisierung Klimadaten Workflow- Dokumentation Biometrische Verrechnung Markerdaten Externe Datenbestände Tüten / Etiketten Sequenzdaten Literatur / Dokumente Bilder / Bilddaten Adressen Schnittstellen

Randomisierung Klimadaten Workflow- Dokumentation Biometrische Verrechnung Markerdaten

6 F&E-Informationsmanagment - Beispiel Versuchsdurchführung ZR Versuchsdurchführung Versuchsplanung Zuchtdaten Bestände Versuchsanlage Druck (Listen, Etiketten, Tüten) Versand Versuchsdurchführung Felddaten- Erfassung Laboraufträge Analyse Datentransfer Versuchsauswertung Felddaten- Erfassung Biometrische Verrechnung Graphische Darstellung Ergebnisablage Datentransfer Datenablage Prüfung / Anmeldung Versand- und Aufbereitungsaufträge Anmeldeinformationen Zertifikate

Laboraufträge Analyse Datentransfer Versuchsauswertung Felddaten- Erfassung Biometrische Verrechnung Graphische

7 F&E-Informationsmanagement - Beispiel Versuchsdurchführung ZR Versuchsdurchführung Versuchsplanung IBIS Access LVS Plab* Drucker Versuchsdurchführung MDE LIMS Access Versuchsauswertung Plab* statistica Drucker Ergebnisablage IBIS Access LIMS Prüfung / Anmeldung Saatvers LVS Sortenregister digitale Signatur * wird zurzeit abgelöst

Versuchsauswertung Plab* statistica Drucker Ergebnisablage IBIS Access LIMS

8 F&E-Informationsmanagement - Beispiel Markerentwicklung Markerentwicklung Sequenz PDW Vergleich mit bekannten Sequenzen Biomax Biogemma Identifizierung von Kandidatengenen Biomax PDW Entwicklung von Markern Marker- DB Labor- DB LIMS Feldversuche / Überführung in Zuchtmaterial IBIS Access statistica

Identifizierung von Kandidatengenen Biomax PDW Entwicklung von Markern

9 Vernetzte Informations-Systeme in der Pflanzenzüchtung Zucht- Datenbank LIMS Marker-/ Labor-DB... Lager / Bestandsführung Netze & Kommunikation essentiell: übergreifende Koordination MDE Biometrie für unterschiedliche Fruchtarten / Züchtungsziele überregional / international / dezentral gewachsene Strukturen

.. Lager / Bestandsführung Netze & Kommunikation essentiell: übergreifende

10 Zielsetzung: Integrierte Züchtungslandschaft Hauptsysteme Datenerfassung Zuchtdatenbanken Sybase, Access Qualitätsdaten Rübenlabor ZKW Lagerverwaltung / Saatgutversand Sybase (LVS) Beetmobil Sortenregister Sybase biom. Verrechnung Genstat statistica (PSW) Marker-DB Oracle (mit Access-Frontend) Datentransfer Access, ODBC, Standard-Schnittstellen, Fileserver (LIMS) Active Sync (MDE) Anwendungsdokumentation Felddatenerfassung Symbol PDT 8100 (MDE 2004, Pocket Excel) Labordaten- Management Oracle (LIMS) Biomax / Biogemma (Sequenzanalyse gegen öff. Daten, Datenintegration) PlantData Warehouse ( Gendatenbank ) Access Labordatenerfassung MDE / LIMS Planungstools Access-Frontends Flächenplanung Datenausgabe Datentransfer zurück in die Ursprungs-DBs Access, ODBC Datentransfer Access, ODBC Standard-Schnittstellen, Fileserver (LIMS) Active Sync (MDE) Grafikausgabe Statistica Excel Auswertungen Access Datentransfer zurück in die Ursprungs-DBs Access, ODBC

Verrechnung Genstat statistica (PSW) Marker-DB Oracle (mit Access-Frontend) Datentransfer Access, ODBC, Standard-Schnittstellen, Fileserver (LIMS) Active Sync (MDE) Anwendungsdokumentation

11 Herausforderungen Optimierung / Neuaufbau von Altsystemen Zusammenführung fruchtart-übergreifender Anwendungen Standardisierung Optimierung der Datenflüsse / Schnittstellen

12 Komplexitätsreduzierung Integrierte Zuchtdatenbank ZR

13 Optimierung von Altsystemen Zuchtdatenbank Zuckerrübe

14 Zusammenführung fruchtart-übergreifender Anwendungen Sortenregister Lagerverwaltungssystem Versuchsverrechnung Saatvers

15 Optimierung der Datenflüsse z.b. Routineverrechnungen Zuckerr. Raps Mais LP Betaseed Versuchsplanung in der Zucht-DB IBIS ÖF-DB SID.... Export in Statistikprogramm Plabtrim Plabtrim PSW Plabtrim Plabtrim Verrechnung mit Statistik-Programm Plabstat Plabstat Plabstat Plabstat Plabstat Export der Ergebnisse Plabtrim Plabtrim Access Plabtrim Plabtrim Ergebnisse in der Zucht-DB IBIS ÖF-DB SID.... Export der Daten in Grafikprogrammn Access Access Access.... Grafikausgabe mit Grafikprogramm (z.b. statistica) - - Excel/ - - Access

Plabstat Plabstat Plabstat Export der Ergebnisse Plabtrim Plabtrim Access Plabtrim Plabtrim Ergebnisse in der Zucht-DB IBIS ÖF-DB

16 Optimierung der Datenflüsse Datenflüsse mit Plabtrim Plabstat Plabtrim Extern (IBIS, Druck) Strupar.dbf Strukop.dbf maversu.dbf maserie.dbf maprgld.dbf Parameter für Strukturpläne Kopfdaten für Strukturpläne Ortsangaben zu den einzelnen Sätzen, 1 Satz pro Einzelversuch Serienkopfdaten für Einzelversuche (pro Serie 1 Satz) Übersetzungsdatei Prüfglied - Ident I3att412.tt1 Plabstat-Inputdatei für Verrechnung Verrechnung p3att412.tt1 Einzelverrechnung autom. Überführung der Daten mzurdat.dbf Übersichtstabelle, in die alle Ergebnis-Rohdaten einfließen mzperg.dbf Streichen nach Erstverrechnung tmzurdat.dbf tmzperg.dbf Ergebnisdaten ins IBIS (Ausschnitte) Plabstat-Outputdatei für Verrechnung Ergebnisdaten evpr001.aut * Druckausgabe (Plabdru) mazvpli.tz1 Plabstat-Inputdatei für zus.verrechnung Verrechnung mazvplp.tz1 Plabstat-Outputdatei für zus.verrechnung zus.fass. Verrechnung mzperg.dbf Ergebnisdaten verskenn03.dbf stat. Maßzahlen zvpr001.aut * Druckausgabe (Plabdru) * je nach Drucker werden Teillisten benötigt Datei wird umbenannt, kopiert;

Prüfglied - Ident I3att412.tt1 Plabstat-Inputdatei für Verrechnung Verrechnung p3att412.tt1 Einzelverrechnung autom. Überführung der Daten mzurdat.

17 Optimierung Versuchsverrechnung Modularer Aufbau Zucht-DB Versuchsplanung Abstammungen Qualitäten Gewinnung von Meßdaten (z.b. Rübenlabor, INS-CH, ZR-P / QL ) Biometrische Verrechnung (z.b. Genstat) Grafische Darstellung (z.b. statistica) Standardisierte Schnittstellen: Access, ODBC

b. Rübenlabor, INS-CH, ZR-P / QL ) Biometrische Verrechnung (z.b. Genstat) Grafische Darstellung (z.

18 Optimierung der Datenflüsse LIMS

19 Optimierung der Datenflüsse Projekt Digitale Signatur des BSA Ziel: Online-Anmeldung beim BSA Technik: Signaturkarte & Lesegerät KWS im Pilotprojekt

20 Standardisierung Mobile Datenerfassung

21 Fazit Entwicklung der IT Komplexität der Informationen Ziele: 1. Durchgehende datentechnische Unterstützung der Zuchtprozesse 2. Schaffung einer integrierten Züchtungslandschaft Voraussetzung: Standardisierung, Komplexreduzierung Im Fokus: Pflanzenzüchtung, nicht IT

22 Sommertagung Biometrie Vielen Dank! Werner Schultz KWS SAAT AG, Einbeck

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