Leibniz-Rechenzentrum

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1 Leibniz-Rechenzentrum der Bayerischen Akademie der Wissenschaften Technical Report Perspectives of High End Computing A Joint Workshop of the RRZE, KONWIHR and LRZ Erlangen, March 17, 200 März 2006 LRZ-Bericht Direktorium: Prof. Dr. H.-G. Hegering (Vorsitzender) Prof. Dr. A. Bode Prof. Dr. Chr. Zenger Leibniz-Rechenzentrum Boltzmannstraße Garching UST-ID-Nr. DE Telefon: (089) Telefax: (089) lrzpost@lrz.de Internet:

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3 LRZ i 1 Übersicht 1 2 HLRB-2: Der neue Höchstleistungsrechner in Bayern Dynamics of nano droplets Computational requirements of large-scale atomistic simulations in computational materials science LES and Hybrid LES-RANS Methods for the Simulation of Turbulent Flows Challanges and Applications Efficient turbulence simulation of high-pressure microflows: vorticity in nozzle sections Lattice Boltzmann Methods for Nano Technology, Material Sciences, and Biomedical Applications Numerical Investigation of Turbulent Mixing and Chemical Reaction at High Schmidt Number Large-scale coupled groundwater / surface water flow, transport, and reaction models in post-mining areas Numerical Methods for Computational Fluid Dynamics with Free Capillary Boundaries Simulieren geht über Probieren Storage-Efficient Implementation of Parallel Flow Simulation Codes on Adaptive Space- Partitioning Grids Advances of Quantum Control by Gradient-Flow Algorithms on Parallel Clusters Rational protein design, still a daunting computational challenge Veränderte Proteindynamik als Ursache von Krankheiten: Neue Einblicke aus Computersimulationen Mechanismus der Regulierung der Tetrazyklin-Resistenz durch Moleküldynamik...183

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5 LRZ 1 1 Übersicht Dr. Wellein, Dr. Hager Dr. Brehm Prof. Reinhard Prof. Hartmaier Dr. Breuer Dr. Beronov Iglberger, M.Sc. Prof. Manhart Dr. Müller Dipl.-Math. Krahl Prof. Rüde Dr. Mehl Dr. Schulte-Herbrüggen, Dipl.-Inf. Gradl Regionales Rechenzentrum Erlangen-Nürnberg Leibniz-Rechenzentrum München Begrüßung HLRB-2: Der neue Höchstleistungsrechner in Bayern Lehrstuhl für Theoretische Physik II, Universität Erlangen-Nürnberg Dynamik von Quantentropfen: Metallcluster und Kerne Lehrstuhl für Allgemeine Werkstoffeigenschaften, Universität Erlangen- Nürnberg Computational requirements of large-scale atomistic simulations in computational materials science Lehrstuhl für Strömungsmechanik, Universität Erlangen-Nürnberg LES and Hybrid LES-RANS Methods for the Simulation of Turbulent Flows - Challenges and Applications Lehrstuhl für Strömungsmechanik, Universität Erlangen-Nürnberg Efficient turbulence simulation of high-pressure microflows: vorticity in nozzle sections Lehrstuhl für Systemsimulation, Universität Erlangen-Nürnberg Lattice Boltzmann Methods for Nano Technology, Material Sciences, and Biomedical Applications Fachgebiet Hydromechanik, Technische Universität München Numerical Investigation of Turbulent Mixing and Chemical Reaction at High Schmidt Number Ingenieurbüro für Grundwasser GmbH, Leipzig Large-scale coupled groundwater / surface water flow, transport, and reaction models in post-mining areas Lehrstuhl für Angewandte Mathematik 3, Universität Erlangen-Nürnberg Numerische Methoden zur Strömungssimulation mit freien Rändern Lehrstuhl für Systemsimulation, Universität Erlangen-Nürnberg Advanced Multigrid Software for Peta-Scale Finite Element Simulations Lehrstuhl für Informatik mit Schwerpunkt Wissenschaftliches Rechnen, Technische Universität München Storage-Efficient Implementation of Parallel Flow Simulation Codes on Adaptive Space-Partitioning Grids Organische Chemie, Technische Universität München Lehrstuhl für Systemsimulation, Universität Erlangen-Nürnberg Advances of Quantum Control by Gradient-Flow Algorithms on Parallel Clusters

6 2 LRZ Dr. Grosso Prof. Muller Prof. Sticht Prof. Clark Lehrstuhl für Graphische Datenverarbeitung, Universität Erlangen- Nürnberg Lehrstuhl für Biotechnik, Universität Erlangen-Nürnberg Rational protein design, still a daunting computational challenge Lehrstuhl für Bioinformatik, Universität Erlangen-Nürnberg Veränderte Proteindynamik als Ursache von Krankheiten: Neue Einblicke aus Computersimulationen Computer-Chemie-Centrum, Universität Erlangen-Nürnberg Mechanismus der Regulierung der Tetrazyklin-Resistenz durch Moleküldynamik

7 LRZ 3 2 HLRB-2: Der neue Höchstleistungsrechner in Bayern Dr. Reinhold Bader, Dr. Matthias Brehm, Dr. Herbert Huber - Leibniz-Rechenzentrum München

8 4 LRZ

9 LRZ 5

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11 LRZ 7

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13 LRZ 9

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17 LRZ 13 3 Dynamics of nano droplets Prof. Reinhard, Lehrstuhl für Theoretische Physik II, Universität Erlangen-Nürnberg

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20 16 LRZ

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24 20 LRZ 4 Computational requirements of large-scale atomistic simulations in computational materials science Prof. Hartmaier - Lehrstuhl für Allgemeine Werkstoffeigenschaften, Universität Erlangen-Nürnberg

25 LRZ 21

26 22 LRZ

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30 26 LRZ

31 LRZ 27

32 28 LRZ

33 LRZ 29

34 30 LRZ

35 LRZ 31 5 LES and Hybrid LES-RANS Methods for the Simulation of Turbulent Flows Challanges and Applications Dr. M. Breuer Lehrstuhl für Strömungsmechanik, Universität Erlangen-Nürnberg

36 32 LRZ

37 LRZ 33

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40 36 LRZ

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50 46 LRZ

51 LRZ 47 6 Efficient turbulence simulation of high-pressure microflows: vorticity in nozzle sections Dr. Beronov - Lehrstuhl für Strömungsmechanik, Universität Erlangen-Nürnberg

52 48 LRZ

53 LRZ 49

54 50 LRZ

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59 LRZ 55 7 Lattice Boltzmann Methods for Nano Technology, Material Sciences, and Biomedical Applications Iglberger, M.Sc. - Lehrstuhl für Systemsimulation, Universität Erlangen-Nürnberg

60 56 LRZ

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70 66 LRZ

71 LRZ 67 8 Numerical Investigation of Turbulent Mixing and Chemical Reaction at High Schmidt Number Prof. Manhart - Fachgebiet Hydromechanik, Technische Universität München

72 68 LRZ

73 LRZ 69

74 70 LRZ

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79 LRZ 75

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81 LRZ 77 9 Large-scale coupled groundwater / surface water flow, transport, and reaction models in post-mining areas Dr. Müller - Ingenieurbüro für Grundwasser GmbH, Leipzig

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83 LRZ 79

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91 LRZ Numerical Methods for Computational Fluid Dynamics with Free Capillary Boundaries Dipl.-Math. Rolf Krahl Lehrstuhl für Angewandte Mathematik 3, Universität Erlangen-Nürnberg

92 88 LRZ

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111 LRZ Simulieren geht über Probieren Prof. Ulrich Rüde Lehrstuhl für Systemsimulation, Universität Erlangen-Nürnberg

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137 LRZ Storage-Efficient Implementation of Parallel Flow Simulation Codes on Adaptive Space-Partitioning Grids Dr. Mehl - Lehrstuhl für Informatik mit Schwerpunkt Wissenschaftliches Rechnen, Technische Universität München

138 134 LRZ

139 LRZ 135

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147 LRZ Advances of Quantum Control by Gradient-Flow Algorithms on Parallel Clusters Dr. Schulte-Herbrüggen - Organische Chemie, Technische Universität München, Lehrstuhl für Systemsimulation, Dipl.-Inf. Gradl - Universität Erlangen-Nürnberg

148 144 LRZ

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167 LRZ Rational protein design, still a daunting computational challenge Dr. Roberto Grosso Lehrstuhl für Graphische Datenverarbeitung, Universität Erlangen-Nürnberg; Prof. Yves A. Müller Lehrstuhl für Biotechnik, Universität Erlangen-Nürnberg

168 164 LRZ

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178 174 LRZ 15 Veränderte Proteindynamik als Ursache von Krankheiten: Neue Einblicke aus Computersimulationen Prof. Sticht - Lehrstuhl für Bioinformatik, Universität Erlangen-Nürnberg

179 LRZ 175

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187 LRZ Mechanismus der Regulierung der Tetrazyklin-Resistenz durch Moleküldynamik Prof. Clark - Computer-Chemie-Centrum, Universität Erlangen-Nürnberg

188 184 LRZ

189 LRZ 185

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