PubMed-Selbstlernkurs: medizinische Fachliteratur schnell und effizient suchen und finden

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1 PubMed-Selbstlernkurs: medizinische Fachliteratur schnell und effizient suchen und finden

2 Am Anfang: Stellen Sie sich vor, Sie wollen Ihre Doktorarbeit zum Thema Diabetes schreiben und sind nun auf der Suche nach passender Literatur. Im folgenden werden Sie drei Suchstrategien kennenlernen, die Ihnen dabei helfen, in PubMed schnell und effizient relevante Literatur zu finden: 1. Einfache Freitextsuche 2. Schlagwortsuche mit Medical Subject Headings (MeSH) 3. Freitextsuche im Advanced Search Builder PubMed Selbstlernkurs

3 Inhaltsverzeichnis Bevor es losgeht Allgemeine Informationen Generelle Suchstrategien Wie gelange ich zu PubMed? 1. Suchstrategie: Einfache Freitextsuche mit PubMed 2. Suchstrategie: Schlagwortsuche mit MeSH 3. Suchstrategie: Freitextsuche im Advanced Search Builder Organisation der Recherche MyNCBI Nutzung der Funktion Send to Weitere Hilfen für PubMed Glossar Erläuterung zu den Filtern in PubMed Publikationstypen in der Medizin

4 Allgemeine Informationen Was ist PubMed überhaupt? Größte Medizinische Datenbank der Welt Gratissuchdienst der NLM (National Library of Medicine) Weist Artikel aus Zeitschriften nach Sie finden: Literaturnachweise seit 1948 (für ältere Literatur gibt es eine gedruckte Version, den Index Medicus ) Bibliographische Angaben wie Autor oder Titel Meistens einen Abstract, d.h. eine Zusammenfassung des Artikels Häufig einen Link zum Volltext Zum allergrößten Teil werden englischsprachige Zeitschriften ausgewertet Bei nicht englischsprachigen Artikeln werden Titel und Abstract ins Englische übersetzt, der gesamte Artikel bleibt allerdings auf Deutsch, Französisch, Russisch etc. Da die Datenbanksprache Englisch ist, sollten Sie englische Suchwörter verwenden!!! PubMed Selbstlernkurs

5 Generelle Suchstrategien Nutzen Sie Trunkierungszeichen am Wortende, z.b. findet neoplas* auch neoplasia, neoplasic, neoplasie, neoplasm, neoplasms... Verwenden Sie ggfs. die Boolschen Operatoren AND OR NOT Mehrere Begriffe werden meistens automatisch mit AND verknüpft Ggfs. sollten Sie Klammern verwenden, insbesondere bei OR, z.b.: (Krankheit xy AND Medikament a) OR (Krankheit xy AND Medikament b) NOT nur sehr dosiert einsetzen, weil Sie unter Umständen ungewollt viele Artikel aussortieren Phrasensuche bei zusammenhängenden Begriffen, z.b. growth hormone Gehen Sie gezielt vor, z.b. vom Allgemeinen zum Speziellen Spielen Sie mit den Begriffen Verwenden Sie nicht zu viele, aber auch nicht zu wenige Suchworte

6 Wie gelange ich zu PubMed? Um alle möglichen Lizenzen für die Volltextsuche nutzen zu können, sollten Sie PubMed über die Homepage der SUB aufrufen Klicken Sie hierzu im Suchfenster der SUB-Hompage auf den DBIS Link

7 Wie gelange ich zu PubMed? Sie finden PubMed nun wahlweise unter dem Fachgebiet Medizin oder über die Schnellsuche

8 Wie gelange ich zu Pubmed? Wenn Sie PubMed gefunden haben, gibt es zwei Links zur Auswahl: han.sub.uni-goettingen.de/han/pubmed: Nutzen Sie diesen Link von zu Hause aus, wenn Sie nicht im Uni-Netzwerk eingeloggt sind. Mit Ihren Bibliotheks- Zugangsdaten können Sie sich auf dem Han-Server anmelden und verfügen dann auch von zu Hause aus über alle Lizenzen der Uni Göttingen Verlags-URL: Nutzen Sie diesen Link, wenn Sie an einem PC der Uni arbeiten oder Ihr Gerät mit dem Uni-Netzwerk verbunden ist

9 1. Suchstrategie: Einfache Freitextsuche mit PubMed Suchen Sie in PubMed nach diabetes mellitus. Es erscheint eine Trefferliste nach folgendem Muster: Über diesen Reiter können Sie die Sortierung Ihrer Treffer auswählen, z.b. nach Erscheinungsjahr oder Autor Um Ihre Treffer einzugrenzen, können Sie hier passende Filter wählen. Mehr Filter finden Sie unter Show additional Filters

10 1. Suchstrategie: Einfache Freitextsuche mit PubMed Wählen Sie einen oder mehrere Filter aus, um Ihre Suche einzugrenzen. Grenzen Sie z.b. den Erscheinungszeitraum über Publication dates oder die Sprache über Show additional filters Languages ein. ACHTUNG: Die gesetzten Filter bleiben bei weiteren Suchanfragen erhalten und müssen ggf. manuell entfernt werden! Eine genauere Erläuterung der einzelnen Filter finden Sie im Glossar Grenzen Sie ihre Ergebnisse mit einem weiteren Suchwort in der Suchleiste ein. Nutzen Sie hierfür die oben genannten Boolschen Operatoren AND, OR und NOT. Schreiben Sie z.b. diabetes mellitus AND (therapy OR medication).

11 2. Suchstrategie: Schlagwortsuche mit MeSH (Medical Subject Headings) Was sind MeSH und warum sollte man sie zu Recherchezwecken nutzen? MeSH = medizinische Schlagwörter, die das Thema des Artikels beschreiben; von Fachleuten vergeben Nachteil: Brandneue Artikel finden Sie noch nicht über MeSH, da die Schlagwörter erst nach und nach vergeben werden Sie können die Suche auf bestimmte Aspekte eines Themas begrenzen, z.b. diagnosis Mit der MeSH Database ist eine besonders präzise inhaltliche Suchanfrage möglich Sie ist aufgebaut wie eine Art Wörterbuch, inkl. Querverweisen zu Ober- und Unterthemen des jeweilig gesuchten Begriffes

12 2. Suchstrategie: Schlagwortsuche mit MeSH Geben Sie den Suchbegriff diabetes mellitus oben in die Suchleiste ein. Stellen Sie sicher, dass Sie in dem Reiter links daneben MeSH ausgewählt haben. ACHTUNG: Sie können in der MeSH-Database immer nur nach einem Suchbegriff suchen, diesen dann im Search Builder festhalten, zwischenspeichern und anschließend nach dem nächsten Begriff suchen! WICHTIG! Wählen Sie hier MeSH aus Sie können immer nur nach einem Begriff zur Zeit suchen. Stellen Sie sich die MeSH Database wie ein Lexikon vor! Unter den Treffern finden sich nun alle MeSH- Schlagwörter, die zu Ihrem gesuchten Begriff passen. Wählen Sie das Schlagwort aus, das für Ihre Recherche am besten ist.

13 2. Suchstrategie: Schlagwortsuche mit MeSH Wählen Sie in der Trefferliste das Schlagwort Diabetes Mellitus aus und klicken Sie darauf. Es öffnet sich ein neues Fenster mit den sogenannten Subheadings. Mit deren Hilfe können Sie Ihre Suche eingrenzen, wenn Sie z.b. nur zur Therapie von Diabetes recherchieren wollen Subheadings sind Unteraspekte des von Ihnen gewählten Themenbereiches. Wenn Sie z.b. nur nach Therapien für Diabetes suchen, können Sie durch Auswahl eines oder mehrerer Subheadings Ihre Suche eingrenzen. Über die Auswahl dieses Feldes ernennen Sie Ihr Suchwort zum Hauptschlagwort. Es werden Ihnen daraufhin nur Artikel angezeigt, die sich hauptsächlich mit der Thematik befassen

14 2. Suchstrategie: Schlagwortsuche mit MeSH Weiter unten auf der Seite finden Sie den so genannten MesSH-Tree Erweiterung der Suche auf hierarchisch untergeordnete MeSH Begriffe wird ausgeschlossen Im hierarchisch aufgebauten MeSH- Tree können Sie nachvollziehen, wo sich ihr MeSH Term einordnet. So können Sie überprüfen, ob Sie einen zu allgemeinen oder zu speziellen Begriff ausgewählt haben

15 2. Suchstrategie: Schlagwortsuche mit MeSH Damit Sie auf passende Artikel zugreifen können, müssen Sie Ihre Suchanfrage nun in PubMed starten: In der Suchleiste können Sie nach weiteren MeSH Terms suchen, die Sie für Ihre Recherche benötigen. Die Begriffe, die Sie bereits in den Search Builder eingefügt haben, bleiben dabei erhalten! Wählen Sie Ihren MeSH Term (und ggf. entsprechende Subheadings) aus und klicken Sie auf Add to search builder. Sie können auch selbst gewählte Subheadings eingeben, die nicht in der Liste vorkommen Achten Sie darauf, dass der richtige Operator ausgewählt ist! Wenn Sie alle MeSH Terms in den Search Builder eingefügt haben, klicken Sie auf Search PubMed, um zu den Volltexten zu gelangen

16 2. Suchstrategie: Schlagwortsuche mit MeSH TIPP: Wenn Sie sich nicht sicher sind, mit welchen Begriffen Sie suchen sollen, wählen Sie einen Artikel aus, der genau zu Ihrem Thema passt. Schauen Sie sich die MeSH Begriffe an, um Anregungen für Ihre Suche zu bekommen Besonders wichtige Begriffe (Major Topics) sind mit einem Sternchen versehen

17 3. Freitextsuche im Advanced Search Builder Im Gegensatz zur Suche mit MeSH Terms, bei der man nur mit medizinischen Schlagwörtern recherchieren kann, ist mit dem Advanced Search Builder eine sehr exakte Freitextsuche möglich. Gehen Sie auf PubMed Advanced unterhalb der Suchleiste.

18 3. Freitextsuche im Advanced Search Builder Es öffnet sich der PubMed Advanced Search Builder, in den Sie nun Ihren Suchbegriff diabetes mellitus (All fields) eingeben können. Hier gelangen Sie zu einer alphabetischen Liste aller Begriffe innerhalb des gewählten Suchfeldes Hier können Sie Ihre Suche spezifizieren. Sie können z.b. nur nach Autorennamen oder auch nach MeSH Terms suchen

19 3. Freitextsuche im Advanced Search Builder TIPP: Die Suchoption MeSH Terms oder Subheadings im Advanced Search Builder ist dann empfehlenswert, wenn Sie bereits ihre MeSH Terms festgelegt haben. Zur inhaltlichen Orientierung ist die MeSH- Database sinnvoller. Mit dem Advanced Search Builder werden bereits durchgeführte Suchanfragen (für eine Browsersitzung) gespeichert und sind neu kombinierbar. Hierüber können Suchanfragen eine Browsersitzung gespeichert werden Die History ist eine Art Vorschau auf die Ergebnismenge, die mit dieser Suchanfrage gefunden wird Bereits durchgeführte Suchanfragen können auch für neue Anfragen in den Builder übertragen und neu kombiniert werden

20 Organisation der Recherche MyNCBI (National Center for Biotechnology Information): Trefferlisten verarbeiten, Suchen personalisieren Wählen Sie rechts oben Sign in to NCBI Registrieren Sie sich bzw. melden Sie sich an Es öffnet sich ein Bildschirm, der so aussehen könnte Unter MyNCBI sehen Sie auf einen Blick Ihre Saved Searches/Collections/ Bibliography/Recent Activity Tipp: Collections teilen: Wenn Sie z.b. Ihrer Arbeitsgruppe Ihre Trefferlisten zukommen lassen möchten, können Sie Ihre Collections über eine spezifische Internetadresse öffentlich zugänglich machen Unter MyNCBI -> Collections Manage Collections klicken In der Spalte Sharing auf Private klicken Ändern des Status in Public

21 Organisation der Recherche MyNCBI: Treffer dauerhaft speichern Sie können einzelne Treffer direkt in einer Collection speichern Oder erst Treffer aus verschiedenen Suchanfragen im Clipboard zwischenspeichern (Send to Clipboard) Treffer ankreuzen (wenn Sie die ganze Liste importieren möchten, NICHT markieren und Send to Collection wählen Sie können zu verschiedenen Themen Collections anlegen Auch das Sichern von Suchanfragen ist möglich: Wählen Sie Create Alert (unter der Suchleiste) Klicken Sie Save und ergänzen die Angaben Über die gespeicherte Suchanfrage bekommen Sie nun immer -updates, wenn wieder Treffer in PubMed nachgewiesen werden, die genau zu Ihrer Suchanfrage passen

22 Organisation der Recherche Nutzung der Funktion Send to Ihre Trefferliste in PubMed können Sie auf verschiedene Weise weiterverarbeiten. Nutzen Sie hierfür die Optionen unter dem Punkt Send to File: Download zum speichern (ideal für Endnote, da hier das Format Medline ausgewählt werden kann, was den Import einer unbegrenzten Treffermenge ermöglicht) Collections: fügt Treffer in MyNCBI generierten Sammlungen hinzu Order: Direktbestellung in den USA (kann teuer werden!) Citation Manager: Export in ein Literaturverwaltungsprogramm Clipboard: schiebt einzelne Treffer in die Zwischenablage schickt Treffer an -Adresse My Bibliographay: fügt Treffer zu Ihrer persönlichen Bibliographie in MyNCBI hinzu TIPP: Mittels Häkchen in die Kästchen über der Ergebnisnummer können Sie einzelne Treffer markieren, die Sie speichern wollen. Ohne eine solche Auswahl werden alle Treffer ausgewählt.

23 Weitere Hilfen für PubMed Zugriff auf Volltexte: Eine detaillierte Anleitung, wie Sie auf Volltexte zugreifen können, wenn der direkte Link in der Datenbank nicht funktioniert, finden Sie im Selbstlernkurs Zugriffsmöglichkeiten auf Volltexte von Zeitschriftenaufsätzen für Medizinstudierende PubMed Kurs der BBM: Termine finden Sie hier Information und Anmeldung direkt an der Theke der Bereichsbibliothek Medizin YouTube Tutorials: Die NCBI stellt zu wichtigen Funktionen in PubMed englischsprachige Video Tutorials zur Verfügung

24 Glossar - Erläuterungen zu den Filtern in PubMed Article Types: Publikationstyp des Artikels, z.b. Clinical Trial = klinische Studie Letter = Anmerkung, Kommentar zu einem Artikel o.ä. Meta-Analysis = fasst Daten aus verschiedenen Studien zusammen und wertet diese aus Practice Guideline = Leitlinien Randomized Controlled Trial = klinische Studie mit Kontrollgruppe(n), die Probanden werden den Gruppen zufällig zugeordnet Review = Übersichtsartikel zum (aktuellen) Forschungsstand Text Availability: Einschränkung auf Treffer, deren Volltexte vorhanden oder frei zugänglich sind Publication Dates: schränkt die Treffer anhand ihres Veröffentlichungsdatums ein Species: untersucht Spezies (Mensch oder Tier) - empfehlenswert für die Suche nach Tiermodellen Languages: Sprache des Original-Artikels Sex: Geschlecht der untersuchten Personen Subjects: Einschränkungen auf bestimmte Themengebiete (z.b. AIDS, Cancer, oder History of Medicine) Journal Categories: Begrenzung der Suche auf Zeitschriften eines Faches oder auf Datenbanken Ages: Alter der untersuchten Personen Search Fields: Auswahl eines Suchschlüssels, unter dem nach den eingegebenen Stichworten gesucht werden soll (Bsp. health ) Author ergibt Treffer wie Health, A. oder Health, VB Journal ergibt Treffer wie American Journal of Health Behavior oder North Carolina Journal of Mental Health

25 Glossar - Publikationstypen in der Medizin Journal Article: Artikel zu einem Thema einer Fachzeitschrift Review (Übersichtsarbeit): Artikel, der den derzeitigen Kenntnisstand zu einem Thema zusammenfasst. Sollte die wichtigsten veröffentlichten Fachaufsätze auswerten Clinical Trial: Aufsatz über die Ergebnisse einer klinischen Studie Systematic Review (Systematische Übersichtsarbeit): Größere wissenschaftliche Arbeit, die systematisch und methodisch alle verfügbaren Primärstudien zusammenfasst, qualitativ bewertet und die Ergebnisse evtl. statistisch (Meta- Analyse) beschreibt Guideline (Leitlinie): Handlungsempfehlungen, um die Entscheidungen von Ärzten über eine angemessene Gesundheitsversorgung für spezifische klinische Umstände zu unterstützen Health Technology Assessment (HTA-Bericht): Systematische Bewertung gesundheitsrelevanter Maßnahmen, die Wirksamkeit, Sicherheit und Wirtschaftlichkeit sowie soziale ethische, juristische und organisatorische Auswirkungen einer Intervention untersucht

26 Viel Erfolg!