DiversityCollection. Theorie, Projekte, Datenflüsse, Netzwerke und Dienste

Transkript

1 DiversityCollection Theorie, Projekte, Datenflüsse, Netzwerke und Dienste Dagmar Triebel

2 Datenbank-Framework Diversity Workbench Seit 1999 beteiligt: Biologische Bundesanstalt Berlin Universität Bayreuth Botanische Staatssammlung München/ SNSB

3 Datentypen in der Biodiversitätsforschung Biodiversitäts -forschung Beschreibende Daten Beobachtungsu. Sammlungsdaten Bild- Mediendaten Thesauri Taxonomische Daten Geographische Daten Literaturdaten

4 Hauptkomponenten der Diversity Workbench Komp. für Biodiv.forsch. Diversity Collection Diversity Descriptions Diversity Resources Thesaurus Komp. Diversity TaxonNames Diversity Gazetteer Diversity References

5 Diversity Workbench-Entwicklungen in M Aktuelle Schwerpunkte: Modellierung von Datenbanken Entwicklung von.net Clients für Sammlungsdaten (seit 1999) Taxonomische Daten (seit 2003) In Planung: Deskriptive (inkl. organismenbezogene ökologische) Daten

6 DiversityCollection - ER-Diagramm

7 DiversityCollection: Projekte, Datenimport Projekte/ Sammlungen Aktuell ca Datensätze 16 mykologische Projekte/ Samml. (davon 10 der SNSB) 9 botanische Projekte (davon 3 der SNSB) 1 zoologisches Projekt (der SNSB) Datenimporte laufend bzw. in Planung INFOCOMP mit Typusbelegen von Compositae (urspr. in Filemaker Pro) Sammlungen von Kiesel- und Zieralgen ( Belege; urspr. in MS Access bzw. Specify)

8 DiversityCollection: Export, Datenfluss, Präsentation im Internet CF (JSP) CACHE CACHE XML ABCD 2.06 Dateneingabe in DiversityCollection Export ausgewählter Datenfelder Spiegelung in PostgreSQL und autom. Generierung spezieller ABCD-Tabellen Präsentation im Internet

9 DiversityCollection: Wege zur Präsentation von Projekten/ Sammlungen im Internet Projektspezifische lokale Webschnittstellen GBIF International Portal Themen- oder organismenspezifische Portale

10 DiversityCollection: Präsentation im Internet I Projektspezifische lokale Webschnittstellen Eigener Client für jedes Projekt (Sammlung) auf hausinternem Server Auf Eigenheiten des jeweiligen Projektes abgestimmt Anbindung von speziellen Webservices z. B. Visualisierung von Fundortdaten über GoogleMaps und Generic Point Mapper Einbindung von DiversityTaxonNames z. B. voller Zugriff auf alle Synonyme aus den Datenbanken DiversityTaxonNames_fungi/_myxomycetes

11 DiversityCollection: Webschnittstellen Suchmaske

12 DiversityCollection: Webschnittstellen Ergebnistabelle

13 DiversityCollection: Webschnittstellen Detailansicht, Verknüpfung Unter diesem Namen wird der Beleg geführt

14 DiversityCollection: Webschnittstellen Generic Point Mapper Webservice

15 DiversityCollection: Webschnittstellen GoogleMaps Webservice

16 DiversityCollection: Präsentation im Internet II GBIF International Portal Daten über gemeinsames Portal präsentiert, aber lokal in jeweiliger Institution (also auf Server an SNSB) gehostet Standardisierte Datenabfrage via BioCASe-Wrapper über ABCD-Protokoll Einheitliche Datenstruktur für alle Projekte bzw. Sammlungen (zur Zeit über 300 Datenprovider) Von SNSB aktuell 46 Concepts (= Datenfelder) an GBIF International geliefert

17 DiversityCollection: GBIF International Portal 12 Projekte bzw. Datenquellen Belege ~ Belege mit Koordinaten ~ Taxa 100% an GBIF- Namensindex angeschlossen

18 DiversityCollection: Präsentation im Internet III Themen- oder organismenspezifische Portale Mycology.Net API-Portal (Mellon-Foundation, kein open access ) Portale auf Basis von BioCASe/ABCD Deutsches GBIF-Portal Mykologie (in Planung)

19 DiversityCollection: Dienste Dienste am IT Zentrum Zentrale Datenhaltung und zentrale/ direkte Datenanbindung der SNSB-Sammlungen (und Sammlungen des GBIF-D Knotens Mykologie) an GBIF-Netzwerk, daher keine Datenzwischenhändler mehr nötig Projektspezifische Optimierung von Arbeitsabläufen vor Ort Importe, Exporte, Thesauri, Backup, Archivierung, Bildverwaltung, Druck von Etiketten und Listen Projektbasierte Rechteverwaltung

20 DiversityCollection: Workshop heute Dr. Markus Weiss Dr. Olga Feher Weitere Infos unter