Tipps & Tricks: Umkodieren von ICD-9-Daten Daten zu ICD-10 in SAS mittels PROC SQL

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1 Tipps & Tricks: Umkodieren von ICD-9-Daten Daten zu ICD-10 in SAS mittels PROC SQL Andreas Deckert Institute of Public Health, Universität Heidelberg

2 Problemstellung Mortalitäts-Follow-Up einer Kohorte von 1990 bis 2010 Kategorisierung der Todesursachen entsprechend ICD-10 (International Statistical Classification of Diseases and Related Health Problems, 10th revision) 1998 Wechsel von ICD-9 zu ICD-10; dabei z.b. Einführung einer alpha-numerischen Notation mit stärkerer Differenzierung keine direkte Übertragung möglich Umsteigertabelle von ICD-9 zu ICD-10 vorhanden Andreas Deckert, Institute of Public Health Heidelberg 2

3 ICD-Daten ICD-9 Tabelle (Textfile vom DIMDI): ; Ischämische Herzkrankheiten 410; Akuter Myokardinfarkt ; Sonstige Formen von chronischen ischämischen Herzkrankheiten 414.0; Koronararteriosklerose 414.1; Herzwandaneurysma ICD-10 Tabelle: I21; Akuter Myokardinfarkt I21.0; Akuter transmuraler Myokardinfarkt der Vorderwand... I22; Rezidivierender Myokardinfarkt I22.0; Rezidivierender Myokardinfarkt der Vorderwand Umsteiger-Tabelle: ICD-10 ICD-9 ICD-9(dreistellig) 1:1 I21.0; 410; 410; A I23.3; 429.8; 429; A I24.0; 410; 410; Andreas Deckert, Institute of Public Health Heidelberg 3

4 Aufbau einer relationalen Datenbank PROC SQL; CREATE TABLE ICD10 (Code10 CHAR(7), Titel10 CHAR(255), CONSTRAINT Code10X PRIMARY KEY(Code10)); INSERT INTO ICD10 SELECT * FROM import_icd10 WHERE Code10 > ""; CREATE TABLE ICD9 (Code9 CHAR(7), Titel9 CHAR(255), CONSTRAINT Code9X PRIMARY KEY(Code9)); INSERT INTO ICD9 SELECT * FROM import_icd9 WHERE Code9 > ""; CREATE TABLE Umsteiger (Code10 CHAR(7), Code9 CHAR(7), Automatik CHAR1), CONSTRAINT UICD10 FOREIGN KEY(Code10) REFERENCES ICD10, CONSTRAINT UICD9 FOREIGN KEY(Code9) REFERENCES ICD9); INSERT INTO Umsteiger SELECT * FROM import_umsteiger WHERE Code10 > ""; quit; Andreas Deckert, Institute of Public Health Heidelberg 4

5 Verknüpfungsschema ICD9 Umsteiger ICD10 Code9 Titel Text Text Text Text text5 Code9 Code10 Automatik A01.4 A A02.0 A A A04.1 A A04.2 A A04.8 Code10 Titel10 A01.4 Text11 A02.0 Text12 A04.1 Text13 A04.2 Text14 A04.8 text n 0..n Andreas Deckert, Institute of Public Health Heidelberg 5

6 Wichtige Verknüpfungen INNER-Join A B LEFT-Join A B FULL-Join A B Andreas Deckert, Institute of Public Health Heidelberg 6

7 Kombination mit Daten /*Umkodieren von Daten in ICD9 in ICD10 mithilfe der DB*/ PROC SQL; CREATE UNIQUE INDEX _id ON mortality_icd9 (_id); CREATE TABLE results AS SELECT B.*, U.code10, I.titel10 FROM mortality_icd9 AS B LEFT JOIN (Umsteiger AS U LEFT JOIN ICD10 AS I ON U.code10=I.code10) ON B.cause=U.code9 quit; Pat_ID Code9 Code10 Titel K75.2 Unspez. reaktive Hepatitis K75.3 Granulomatöse Hepatitis K76.1 Chronische Stauungsleber K76.1 Chronische Stauungsleber Andreas Deckert, Institute of Public Health Heidelberg 7

8 Bereinigen der Ergebnisse Zu manchen ICD9-Codes gibt es mehrere ICD10-Einträge, da der ICD10 differenzierter ist! Über den vorher generierten Index können nun die mehrdeutigen Zuordnungen selektiert werden /*Filtern der multiplen ICD10-Einträge*/ PROC SQL; CREATE TABLE multiple_results AS SELECT * FROM results WHERE _id IN (SELECT _id FROM results GROUP BY _id HAVING count(_id > 1)) quit; Je nach Tiefe der ICD10-Auswertung nur die ICD10-Obergruppe bzw. aus multiplen ICD10 den passenden Code auswählen Andreas Deckert, Institute of Public Health Heidelberg 8

9 Löschen der Datenbank /*Anzeigen der Integritätsbedingungen in einer Tabelle:*/ PROC SQL; DESCRIBE TABLE CONSTRAINTS Umsteiger; quit; /*Löschen von mit Integritätsbedingungen verknüpften Tabellen; Fremdschlüssel müssen zuerst gelöscht werden!*/ PROC SQL; ALTER TABLE Umsteiger DROP CONSTRAINT UICD10, UICD9; ALTER TABLE ICD9 DROP CONSTRAINT Code9X; ALTER TABLE ICD10 DROP CONSTRAINT Code10X; DROP TABLE ICD9, ICD10, Umsteiger; quit; Andreas Deckert, Institute of Public Health Heidelberg 9

10 Links zu ICD9-ICD10 3. Find x. Homepage des Deutschen Instituts für Medizinsiche Dokumentation und Information (DIMDI): ICD9-ICD10-Überleitungstabelle von 2001: klassi/downloadcenter/icd-10-who/vorgaenger/version10/ueberleitung/ (neuere Versionen sind kostenpflichtig!) Andreas Deckert, Institute of Public Health Heidelberg 10