Austrian Agency for Health and Food Safety

Transkript

1 Austrian Agency for Health and Food Safety

2 Epidemiologie der Tuberkulose in Österreich für 2016 Alexander Indra MED/Institut für medizinische Mikrobiologie und Hygiene Wien

3 Tuberkulose in Europa 2015

5 Tuberkulose-Inzidenz nach Staatsangehörigkeit,

6 TB Fälle nach Staatsangehörigkeit und Altersgruppe 2017

8 TB Inzidenz & Anzahl der Fälle Tuberkulosefälle im Jahr Tuberkulosefälle im Jahr Tuberkulosefälle im Jahr 2016

9 Treatment success in new confirmed TB cases and relapses, started on treatment in 2014*, EU/EEA, % of new confirmed cases and relapses had a successful treatment outcome (range %) Iceland Slovakia Sweden Bulgaria Netherlands Romania Norway Estonia Latvia United Kingdom Belgium Lithuania Slovenia Czech Republic Austria Hungary Portugal Croatia Germany Cyprus Poland Spain Ireland Denmark Finland EU/EEA Treatment success (%) Source: European Centre for Disease Prevention and Control/WHO Regional Office for Europe. TB surveillance and monitoring in Europe, 2017 * Cases started on second line treatment are excluded 9

10 Treatment success in new confirmed TB cases and relapses notified in 2014*, EU/EEA, % of new confirmed TB cases and relapses had a successful treatment outcome (range %) Proportion of treatment success < 60% 60 to 84.9% 85% Not reporting Source: European Centre for Disease Prevention and Control/WHO Regional Office for Europe. TB surveillance and monitoring in Europe, 2017 * Six EU/EEA Member States did not report treatment outcome data 10

11 TB Diagnose bei Asylsuchenden Zeit zwischen Einreise und TB-Diagnose

12 TB Diagnose bei Asylsuchenden Zeit zwischen Einreise und TB-Diagnose >70% im ersten Jahr

13 TB Diagnose bei Asylsuchenden Zeit zwischen Einreise und TB-Diagnose knapp 90% in den ersten 4 Jahren

14 Multidrug-resistant TB (MDR TB), EU/EEA, % of TB cases with DST* results were multidrug-resistant (range %) Proportion of cases < 1% 1 to 1.9% 2 to 4.9% 5 to 9.9% 10% Not reporting Source: European Centre for Disease Prevention and Control/WHO Regional Office for Europe. TB surveillance and monitoring in Europe, 2017 * DST drug susceptibility results reported for at least isoniazid and rifampicin 14

15 MDR TB notification rate, EU/EEA, cases/ Rate was stable at 0.3 per population between 2011 and ,5 0,4 0,3 0,2 0, Year of reporting Source: European Centre for Disease Prevention and Control/WHO Regional Office for Europe. Tuberculosis surveillance and monitoring in Europe

16 Multidrug resistance among new pulmonary TB cases, EU/EEA, % of new pulmonary TB cases with DST* results had MDR TB (range %) Proportion of cases < 1% 1 to 1.9% 2 to 4.9% 5 to 9.9% 10% Not reporting Source: European Centre for Disease Prevention and Control/WHO Regional Office for Europe. TB surveillance and monitoring in Europe, 2017 * DST drug susceptibility results reported for at least isoniazid and rifampicin 16

17 Multidrug resistance among previously treated pulmonary TB cases, EU/EEA, % (range %) of previously treated pulmonary TB cases with DST* results had MDR TB Proportion of cases < 1% 1 to 4.9% 5 to 14.9% 15 to 24.9% 25% Not reporting Source: European Centre for Disease Prevention and Control/WHO Regional Office for Europe. TB surveillance and monitoring in Europe, 2017 * DST drug susceptibility results reported for at least isoniazid and rifampicin 17

18 Extensively drug-resistant TB (XDR TB), EU/EEA, % of MDR TB cases with second line DST* were extensively drug-resistant (range % and % for countries reporting more than five cases) Proportion of cases < 1% 1 to 9.9% 10 to 14.9% 15 to 24.9% 25% Not reporting Source: European Centre for Disease Prevention and Control/WHO Regional Office for Europe. Tuberculosis surveillance and monitoring in Europe 2017 * DST drug susceptibility test 18

19 MDR/XDR TB Fälle

20 MDR/XDR TB Fälle Herkunftsländer MDR TB Gesamt Herkunftsland n n n n Afghanistan Aserbaidschan Äthiopien Deutschland Kongo Litauen Marokko Österreich Rumänien Russ Föderation Slowakei Somalia Syrien Ukraine Staatenlos Usbekistan Gesamt (N) XDR-TB Gesamt Herkunftsland n n n n Georgien Rumänien Russ. Föderation Ukraine Gesamt (N)

21 Treatment success in MDR TB*, EU/EEA, % of all MDR TB cases notified in 2013 were successfully treated (range %) Netherlands Belgium Austria Sweden Latvia Norway Estonia United Kingdom Portugal Denmark Bulgaria Germany Romania Hungary Lithuania Ireland Poland Slovakia EU/EEA Treatment success (%) Source: European Centre for Disease Prevention and Control/WHO Regional Office for Europe. Tuberculosis surveillance and monitoring in Europe 2017 * Croatia, Czech Republic, Iceland and Slovenia reported zero MDR TB cases in

22 Treatment success in all cases with MDR TB*, EU/EEA, % of all MDR TB cases notified in 2013 was successfully treated (range %) Proportion of treatment success < 40% 40 to 69.9% 70% Not reporting Source: European Centre for Disease Prevention and Control/WHO Regional Office for Europe. TB surveillance and monitoring in Europe, 2017 * Croatia, Czech Republic, Iceland and Slovenia reported zero MDR TB cases in 2013, nine Member States did not report treatment outcome data for MDR TB cases 22

23 Treatment outcomes of MDR TB cases notified in , EU/EEA, 2015 Percentage Treatment success rates remained stable at 38-40% in the 2011, 2012 and 2013 cohorts Success Died Failed Defaulted or unknown Still on treatment MDR TB cohort 2011 MDR TB cohort 2012 MDR TB cohort 2013 Source: European Centre for Disease Prevention and Control/WHO Regional Office for Europe. TB surveillance and monitoring in Europe,

24 Treatment success in XDR TB cases, EU/EEA, % of the XDR TB cases notified in 2012 were treated successfully (range 0 100%) Belgium Portugal Sweden Latvia Hungary United Kingdom Austria Estonia Bulgaria Romania Lithuania Czech Republic Germany EU/EEA Treatment success (%) Source: European Centre for Disease Prevention and Control/WHO Regional Office for Europe. TB surveillance and monitoring in Europe, 2017 * Cyprus, Ireland, Netherlands, Norway and Slovakia reported zero XDR TB cases in countries did not report second line drug susceptibility testing results or XDR TB treatment outcome data 24

25 Anzahl Fälle Tuberkulose in Österreich

26 Diagnostik der Tuberkulose

27 WHOLE GENOME SEQUENCING: Anwendung in der Mikrobiologie Amplikon-Sequenzierung NGS-Datenanalyse z.b. Resistenztestung Vergleich verschiedener Bakterien gleicher Spezies - Identifikation unbekannter Pathogenitätsfaktoren Identifikation unbekannter Erreger - Suche nach mikrobiologischen Verursachern Beschreibung neuer Erreger - Erkennung neuer Spezies durch Vergleich mit Sequenzen anderer Bakterien

28 NGS-Data-Analyse

29 NGS-Data-Analyse Spezies Identifikation - Subtypen - Ausbruchsabklärung? Genotypische Resistenz - Sequenzdaten - Nachweis bekannter Mutationen oonline Datenbanken Pathogenitätsfaktoren - Virulenzgene

30 NGS-Data-Analyse

31 NGS-Data-Analyse

32 NGS-Data-Analyse

33 NGS-Data-Analyse

34 NGS-Data-Analyse

35 NGS-Data-Analyse

36 NGS-Data-Analyse

37 NGS-Data-Analyse

38 Vergleich verschiedener Bakterien gleicher Spezies 38

39 What is compared? Chromosom gegen Chromosom (Genome alignment) Zuverlässig, aber jedes Chromosom kann unterschiedlich sein Genetische Unterschiede bei jeder ca Zellteilung Zumindest 1 durchanalysiertes Genom nötig Anzahl an zu vergleichender Genome eingeschränkt Computerleistung ist beschränkt 39 Source: Aaron E. Darling et al. PLOS Genetics (DOI: /journal.pgen )

40 What is compared? Genom weite Mutationsanalyse (SNP-calling) Single nucleotide polymorphism (variants) (SNP or SNV) Zwei oder mehr Chromosome unterscheiden sich in zumindest einer SNP Funktioniert am besten mit klonalen Erregern Ein komplett analysiertes Genom ist notwendig zum Vergleich Der Vergleich muss immer gegen das gleiche Chromosom Source: A. Indra erfolgen Nomanklature kompliziert Jedes Isolate ist unterschiedlich SNP finden sich nach jeder Zellteilung

41 What is compared? Allel gegen Allel Vergleich Eine MLST/SBT mit hunderten/tausenden Genen Gen Varianten (Allele) werden gegeneinander verglichen Ein neues Allel wird unabhängig der Anzahl an Mutationen im Gen definiert Eine Kern Gruppe von Genen (core-genom) die bei allen Spezies vorkommt wird verglichen Nicht so dikrematative wie SNP und Genom vergleich Die Nomenklatur ist leicht zu vereinheitlichen Source: A. Indra,

42 Next-Generation-Sequenzierung Im Einsatz zur TB Ausbruchsabklärung 11a. des Tuberkulosegesetzes (2) Labors, die den Tuberkuloseerreger beim Menschen diagnostizieren, sind verpflichtet, Isolate an die nationale Referenzzentrale zur Resistenzbestimmung und Feintypisierung zu übermitteln. (3) Ausbrüche sind von der nationalen Referenzzentrale den zuständigen Bezirksverwaltungsbehörden zu melden.

43 Next-Generation-Sequenzierung Im Einsatz zur TB Ausbruchsabklärung Sequenzierung aller österreichischen Tuberkulose Isolate Resistenztestung Ausbruchsabklärung Alle Daten werden den zuständigen Gesundheitsbehörden zur Verfügung gestellt

44 länderübergreifende Abklärung 25 Fällen multiresistenter Tuberkulose

45 länderübergreifende Abklärung Fälle von multiresistenter Tuberkulose bislang sieben Fälle in der Schweiz sechs Fälle in Deutschland einer in Schweden zwei in Finnland zwei Fälle in Österreich

46 Next-Generation-Sequenzierung: Ausbruchsabklärung

47 Next-Generation-Sequenzierung: Ausbruchsabklärung 2016: Mehr als 500 Isolate bisher sequenziert

48 Next-Generation-Sequenzierung: Ausbruchsabklärung

49 Next-Generation-Sequenzierung: Ausbruchsabklärung Zur Erfüllung der gesetzlichen Aufgaben werden state of the art Technologien durch die AGES eingesetzt Alle TB-Isolate des Jahres 2016 wurden durch die AGES sequenziert Österreich ist eines wenigen europäischen Ländern die derzeit schon Next-Generation-Sequenzierung routinemäßig benutzen Durch Einsatz von neuerster Technologien unterstützt die AGES die österreichischen Gesundheitsbehörden bei der Sicherstellung des erfolgreichen österreichischen Weges der Tuberkulosebekämpfung

50 Danke Die Nationale Referenzzentrale für Tuberkulose, AGES möchte sich bei allen Sanitätsbehörden und bei allen MitarbeiterInnen des Gesundheitssystems für deren Bemühungen bedanken, ohne die eine erfolgreiche Bekämpfung der Tuberkulose in Österreich nicht möglich wäre. Danke an alle Kolleginnen der AGES-IMED WIEN Abteilungen klinische Molekularbiologie, Mikrobiologie und Surveillance und Infektionsepidemiologie

51 PD. Dr. Mag. Alexander Indra Leiter: IMED Wien AGES Österreichische Agentur für Gesundheit und Ernährungssicherheit GmbH Währingerstraße 25a A-1090 Wien