Einführung in die strukturierte Literaturrecherche

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1 Einführung in die strukturierte Literaturrecherche Martin Boeker Department für Medizinische Biometrie und Medizinische Informatik & Comprehensive Cancer Center Freiburg, Geschäftsbereich Krebsregister und IT Workshop Die systematische Literaturrecherche

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3 MEDLINE ca. 23,6 Millionen Referenzen täglich neue Einträge

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7 Wenn wir finden wollen gibt es viele Methoden zum Suchen... ist praktische Übung wichtig... hängt das Vorgehen von der Aufgabe ab... hilft ein grundsätzliches technisches Verständnis beim Suchen Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

8 Gliederung Hintergründe Funktionsweise von Suchmaschine und Formen von Indexen Beurteilung des Suchergebnisses Suchen in MEDLINE mit PubMed MeSH-Thesaurus Textwort-basierte Suche Operatoren und Funktionen Suchstrategien Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

9 Aufbau Suchmaschine Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

10 Aufbau Suchmaschine Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

11 Aufbau Suchmaschine Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

12 Volltextindexierung Automatisch Jedes gefundene Wort: Indexeintrag Verweis auf die entsprechende Textstelle Eventuell sprachliche Aufarbeitung Normalisierung Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

13 Katalogindexierung Manuell Zuordnung von mehreren Schlagwörtern nach inhaltlich-semantischen Kriterien Verschlagwortung Kontrolliertes Vokabular Synonym-/Homonymkontrolle hierarchisierte Struktur z.b. Medline: Medical Subject Headings (MeSH) Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

14 Beurteilung der Güte von Suchergebnissen Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

15 Beurteilung der Güte von Suchergebnissen Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

16 Beurteilung der Güte von Suchergebnissen Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

17 Vierfeldertafel: Precision und Recall Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

18 Precision: Genauigkeit Anteil der gefundenen relevanten Dokumente an allen gefundenen Dokumenten Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

19 Recall: Ausbeute, Sensitivität Anteil der gefundenen relevanten Dokumente an allen relevanten Dokumenten Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

20 Abwägung zwischen Zielsetzung und Ressourcen Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

21 vom Hersteller zur Suchoberfläche Datenbank Suchoberfläche Name Hersteller Hersteller Name NLM PubMed Medline NLM Ovid Ovid MEDLINE DIMDI MEDPILOT Cochrane Cochrane Wiley Cochrane Library Library Collaboration Ovid EBM Reviews DIMDI MEDPILOT Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

22 Medline Anbieter: National Library of Medicine ca Journals 1 weltweit in aktuell 39 Sprachen Zeitraum ab neue Referenzen täglich in Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

23 PubMed Suchoberfläche Anbieter: National Library of Medicine Zugang: zusätzlich über Medline hinaus suchbar as supplied by publisher aktuelle elektronische Zitate Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

24 PubMed Subsets Datenbestand am : Zitate Aktualität in process, publisher, other Medline nicht oder nur unvollständig verschlagwortet > nicht mit MeSH suchbar Verschlagwortung nach einigen Tagen bis zu einigen Monaten Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

25 Fragestellung Ist bei Patienten mit Ösophagusvarizen eine effektive Primärprävention der Ösophagusvarizenblutung möglich? Suche nach Metaanalysen. Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

26 Was sind Ösophagusvarizen? Therapiemöglichkeiten für die Primärprophylaxe medikamentös Verödung Betablocker chirurgisch Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

27 Das PICO-Schema Zerlegung der Fragestellung nach folgenden Aspekten: Patient Intervention Outcome Comparison Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

28 Analyse der Fragestellung nach PICO Ist bei Patienten mit Ösophagusvarizen eine effektive Primärprophylaxe der Ösophagusvarizenblutung möglich? Suche nach Metaanalysen Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

29 Analyse der Fragestellung nach PICO Ist bei Patienten mit Ösophagusvarizen eine effektive Primärprophylaxe der Ösophagusvarizenblutung möglich? Suche nach Metaanalysen Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

30 Analyse der Fragestellung nach PICO Ist bei Patienten mit Ösophagusvarizen eine effektive Primärprophylaxe der Ösophagusvarizenblutung möglich? Suche nach Metaanalysen Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

31 Analyse der Fragestellung nach PICO Ist bei Patienten mit Ösophagusvarizen eine effektive Primärprophylaxe der Ösophagusvarizenblutung möglich? Suche nach Metaanalysen Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

32 Analyse der Fragestellung nach PICO Ist bei Patienten mit Ösophagusvarizen eine effektive Primärprophylaxe der Ösophagusvarizenblutung möglich? Suche nach Metaanalysen Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

33 Analyse der Fragestellung nach PICO Ist bei Patienten mit Ösophagusvarizen eine effektive Primärprophylaxe der Ösophagusvarizenblutung möglich? Suche nach Metaanalysen Ösophagusvarizen Primärprophylaxe Ösophagusvarizenblutung Metaanalyse Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

34 Analyse der Fragestellung nach PICO Ist bei Patienten mit Ösophagusvarizen eine effektive Primärprophylaxe der Ösophagusvarizenblutung möglich? Suche nach Metaanalysen Ösophagusvarizen: esophageal varices Primärprophylaxe: primary prophylaxis (prevention) Ösophagusvarizenblutung: esophageal bleeding (hemorrhage) Metaanalyse: metaanalysis Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

35 Medline Datenbankeintrag Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

36 Medline Datenbankeintrag Fortsetzung Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

37 Medical Subject Heading (MeSH) ca MeSH Deskriptoren Entry Terms ( verwandte Begriffe ) 76 Subheadings ( Qualifier ) Therapy, Prevention and Control sprachliche Definitionen Indexierungszeitraum 2 Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

38 Polyhierarchische Struktur des MeSH ein Term kann mehrere Eltern haben mehrere Kinder haben Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

39 MeSH Database Entry Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

40 MeSH Database Entry Fortsetzung Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

41 Boolsche Operatoren: OR logisches ODER (OR) Vereinigungsmenge (Disjunktion) höchstens so viele Treffer wie beide Ausgangsmengen zusammen mindestens so viele Treffer wie die größere der zwei Ausgangsmengen disjunction Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

42 Boolsche Operatoren: AND logisches UND (AND) Schnittmenge (Konjunktion) höchstens so viele Treffer wie die kleinere der zwei Ausgangsmengen mindestens 0 Treffer and Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

43 Boolsche Operatoren: NOT logisches NICHT (NOT) genau: A AND (NOT B) (negierte materielle Implikation) Reihenfolge wichtig! höchstens so viele Treffer wie die vordere Menge mindestens 0 Treffer VORSICHT: kann zu unerwarteten Ergebnissen führen nonimplication Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

44 Analyse von Freitexten zur Textwortsuche Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

45 Textwortsuche: prevention of variceal bleeding Auflistung Bleed-ing Hemorrhage(s) Haemorrhage(s) Prophylaxis Prevention Variceal Varices Varix Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

46 Textwortsuche: prevention of variceal bleeding Auflistung > Trunkierung Bleed* Hemorrhag* Haemorrhag* Varic* Prophyla* Prevent* Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

47 Textwortsuche: prevention of variceal bleeding Auflistung > Trunkierung > Verknüpfung (OR) Bleed* Hemorrhag* Haemorrhag* OR Varic* Prophyla* Prevent* OR Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

48 Textwortsuche: prevention of variceal bleeding Auflistung > Trunkierung > Verknüpfung (OR) > Verknüpfung (AND) Bleed* Hemorrhag* Haemorrhag* OR Varic* AND Prophyla* Prevent* OR Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

49 Warum Textwort- und Schlagwortsuche wichtig sind VORTEILE der MeSH Suche automatische Berücksichtigung von verschiedenen Schreibweisen Suche nach Unter-/Oberbegriffen inhaltliche Einschränkungen durch Subheadings Verschlagwortung basiert auf menschlichem Verständnis (Experten) Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

50 Warum Textwort- und Schlagwortsuche wichtig sind VORTEILE der MeSH Suche automatische Berücksichtigung von verschiedenen Schreibweisen Suche nach Unter-/Oberbegriffen inhaltliche Einschränkungen durch Subheadings Verschlagwortung basiert auf menschlichem Verständnis (Experten) NACHTEILE der MeSH Suche Verschlagwortung basiert auf menschlichem Verständnis (schlechte Reliabilität) noch keine Verschlagwortung von aktuellen Zitierungen kein MeSH Term für neue und seltene Begriffe (Substanzen) Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

51 Suche einschränken: Filterbar Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

52 inkrementell und dokumentiert arbeiten: History Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

53 Abwägung zwischen Zielsetzung und Ressourcen Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

54 Der Standard Building Blocks Zerlegung der Fragestellung in Blöcke, z.b. nach dem PICO Schema Population, Patient Intervention Comparison, Control [Methodenfilter] Outcome Schlagwörter (MeSH) und Textwörter/Synonyme für jeden Block finden Suche nach Blöcken getrennt Verknüpfung von Teilsuchen innerhalb der Blöcke mit ODER Blöcke mit AND verknüpfen Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

55 schwieriger Anfang der Suche: Perlen züchten Citation pearl growing 6 1. spezifische Suche z.b. naïve Suche 2. Auswahl sehr relevanter Quellen 3. Analyse der Verschlagwortung und der Textwörter in Titel und Abstract 4. damit schrittweiser Aufbau (Züchtung) und Verfeinerung der Suche 6 Booth (2008). Unpacking your literature search toolbox: on search styles and tactics. Health Information and Libraries Journal, 25 Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

56 Umgang mit Komplexität an der Zielsetzung bleiben Blöcke intelligent verknüpfen divide and conquer Sortierung die inhaltlich spezifischsten Blöcke zuerst Blöcke mit wenigen Treffern zuerst Blöcke auslassen Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

57 weitere Techniken Beeren lesen Berry picking, ausgehend von einer oder wenigen Quellen Bibliographie auswerten: Backward chaining Zitierungen auswerten: Cited reference search, Forward chaining Autoren-Suche Journal/Datenbank Hand-Suche Kein Ersatz für das Standard Vorgehen, aber möglicherweise eine wichtige Ergänzung Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

58 Strategie linear Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

59 Strategie inkrementell Martin Boeker strukturierte Literaturrecherche /45

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