7 Anhang 7.1 Abkürzungsverzeichnis. Ångström. Absorption bei 280 nm AU-rich element antisense. Abs 280nm

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1 Anhang Anhang 7.1 Abkürzungsverzeichnis Å Ångström Abb. Abbildung Abs 280nm Absorption bei 280 nm ARE AU-rich element as antisense Bsp. Beispiel bzw. beziehungsweise C. elegans Caenorhabditis elegans ca. zirka Cap G(5 )ppp(5 )N-Struktur Ci Curie (3,7x10 10 Bequerel) cpm counts per minute DEPC Diethylpyrocarbonat ds doppelsträngig DTT Dithiothreitol E. coli Escherichia coli EDTA Ethylenamintetraacetat eif eukaryotischer Translationsinitiationsfaktor g Gramm oder Erdbeschleunigung GFP green fluorescent protein GSH Glutathion GST Glutathion-S-Transferase HA Hämagglutinin h human oder Stunde HEPES Hydroxyethyl-piperazinyl-ethansulfonsäure IPTG Isopropyl-β-D-thigalactosid KAc Kaliumacetat kda kilo-dalton LB Luria Bertani max. maximal MgAc Magnesiumacetat mind. mindestens min Minute(n) mirna micro RNA ms milli-siemens N. crassa Neurospora crassa Ni-NTA Nickel-nitrilo-tri-acetic-acid NMD Nonsense-Mediated mrna-decay NP40 Nonidet P40 nt Nukleotide OD Optische Dichte ORF open reading frame PCR Polymerase-Kettenreaktion pers. persönlich PFA Paraformaldehyd PMSF Phenylmethylsulfonylfluorid PNK Polynukleotidkinase

2 Anhang 129 Pol RNA-Polymerase PTC premature translation termination codon RNAi RNA-Interferenz rrna ribosomale RNA RT Raumtemperatur oder Reverse Transkription s sense S. pombe Schizosaccharomyces pombe S2-Zellen Schneider2-Zellen S. cerevisiae Sacharomyces cerevisiae snrna small nuclear RNA snorna small nucleolar RNA ss single strand SDS Natriumdodecylsulfat t Zeit Tab. Tabelle TCA Trichloressigsäure Tris Tris-(hydroxymethyl)-aminomethan u.a. unter anderem UTR untranslated region UV ultraviolett v/v Volumen/Volumen w/v Masse/Volumen Y Tyrosin z.b. zum Beispiel z.t. zum Teil

3 Anhang Lebenslauf Name: Michael Reuter geboren am: in: Halle/Saale Familienstand: ledig Staatsangehörigkeit: deutsch Schulausbildung 06/1994 Abitur am Adolf-Reichwein-Gymnasium Halle/Saale 07/1994 bis 06/1995 Grundwehrdienst in Bad Frankenhausen und Dietersdorf Studium 10/1995 bis 9/1997 Grundstudium Biologie, Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg 10/1997 Vordiplom in Biologie 10/1997 bis 9/1999 Hauptstudium Biologie, Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg, Schwerpunkte: Mikrobiologie, Biochemie, Genetik, Immunologie, Organische Chemie 11/1999 bis 12/2000 Diplomarbeit: Funktion von Thiolen und Zink in den Untereinheiten des Proteins C der Glycin-Reduktase von Eubacterium acidaminophilum 12/2000 Hochschulabschluss, Diplom-Biologe Berufstätigkeit 2/2001 bis 4/2001 wissenschaftlicher Mitarbeiter an der Martin-Luther-Universität Halle- Wittenberg in der Arbeitsgruppe Allgemeine Mikrobiologie von Herrn Prof. Dr. J. R. Andreesen 8/2001-6/2006 Doktorarbeit an der Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg in der Arbeitsgruppe Allgemeine Biochemie, Prozessierung und Abbau von mrna in Eukaryoten von Herrn Prof. Dr. E. Wahle Halle/Saale, den Michael Reuter

4 Anhang Publikationen Kohlstock, U. M., Rucknagel, K. P., Reuter, M., Schierhorn, A., Andreesen, J. R., Sohling, B. (2001) Cys359 of GrdD is the active-site thiol that catalyses the final step of acetyl phosphate formation by glycine reductase from Eubacterium acidaminophilum. Eur J Biochem., 268 (24): Wu, M., Reuter, M., Lilie, H., Liu, Y., Wahle, E., Song, H. (2005) Structural insight into poly(a) binding and catalytic mechanism of human PARN. EMBO J., 24 (23):

5 Anhang Erklärung Hiermit versichere ich, dass ich die vorliegende Arbeit selbständig verfasst und ausschließlich unter Verwendung der angegebenen Hilfsmittel und Quellen angefertigt habe. Aus anderen Untersuchungen bzw. Arbeiten dem Wortlaut oder Sinn entsprechend entnommene Stellen, sind durch Quellenangaben sowie die entsprechenden Verweise gekennzeichnet. Weiterhin versichere ich, das die Arbeit an keiner anderen Einrichtung zur Erlangung eines akademischen Grades eingereicht wurde. Halle/Saale, den Michael Reuter

6 Anhang Danksagung In erster Linie möchte ich mich bei meinem Doktorvater Prof. Elmar Wahle für die engagierte wissenschaftliche Betreuung sowie das stete Interesse am Fortgang der Arbeit bedanken. Unter anderem geht die Kooperation mit der Arbeitsgruppe von H. Song, die letztlich zu den wichtigen Ergebnissen führte, auf seine Initiative zurück. Bei Herrn Prof. Albrecht Bindereif bedanke ich für die Übernahme der Begutachtung dieser Arbeit. Weiterhin gilt mein Dank Joao Tavernez, der den überwiegende Anteil an den Untersuchungen zur intrazellulären Lokalisation von PARN hat. Bei Prof. Helmut Holtmann, Prof. Andreas Kulozik und Prof. Reinhard Lührmann bedanke ich mich für die Möglichkeit in ihren Arbeitsgruppen zu arbeiten. Bei den Mitgliedern der Arbeitsgruppen, besonders bei Reinhard Winzen, Niels Gehring und Tilman Achsel bedanke ich mich für die freundlichen Aufnahme und Unterstützung, die dafür gesorgt haben, dass aus einem kurzen ein kurzweiliger, effektiver Aufenthalt wurde. Allen Mitgliedern der Arbeitsgruppe Allgemeine Biochemie, Prozessierung und Abbau von mrna in Eukaryoten danke ich herzlich für die gute Zusammenarbeit, besonders aber den momentanen bzw. früheren Lebendinventar des Labors 412, Claudia Temme, Bodo Moritz, Clemens Bönisch, Isabell Nahrmann, Eva Dehlin und Ulla Niesbach-Klösgen, für die angenehme Atmosphäre, die fachlichen und weniger fachlichen Debatten und die Hilfsbereitschaft. Im Besonderen gilt der Dank meiner Familie, meinen Eltern, Großeltern und meinem Bruder, die mich in jeder Form und zu jeder Zeit mit allen Mitteln unterstützt, motiviert und Anteil an meiner Arbeit genommen haben.