SASGraphs2PDF. Erstellung einer PDF Datei aus SAS Graphiken mit Hilfe von ODS PDF. Monika Kawohl, Dirk Spruck Aventis Behring GmbH Biometrie

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1 SASGraphs2PDF Erstellung einer PDF Datei aus SAS Graphiken mit Hilfe von ODS PDF Monika Kawohl, Dirk Spruck Aventis Behring GmbH Biometrie

2 Überblick Einleitung Standards für die Graphikerstellung Sortierte Wiedergabe aller Graphiken Erstellung der PDF Datei Einschränkungen Zusammenfassung Februar 2003 KSFE

3 Einleitung SAS Graphiken zur Visualisierung von Ergebnissen klinischer Studien PDF Datei sinnvoll für die Weitergabe der Ergebnisse Einsatz bereits beim Report Review möglich Bookmarks entsprechen elektronischen Inhaltsverzeichnis Reihenfolge der Erstellung der Graphiken nicht immer identisch mit gewünschter Ausgabereihenfolge Manuelle Sortierung notwendig Automatisierung wünschenswert Februar 2003 KSFE

4 Einleitung Beispiel PDF Datei Februar 2003 KSFE

5 Standards für die Graphikerstellung Speichern der Graphiken in permanentem SAS Katalog PROC GPLOT... GOUT=graph.&mprg; &mprg = Macrovariable mit dem SAS Programmnamen Jede Graphik hat eine Nummer Titel enthält Figure Nummer in standardisiertem Format Graphiktitel wird in der "Description" abgelegt %let mytitle= Figure 7.1: Hemoglobin (mmol/l); title3 "&mytitle";... PLOT hb*time / DESCRIPTION="&mytitle"; Februar 2003 KSFE

6 Standards für die Graphikerstellung Löschen des Kataloginhalts vor erneutem Erstellen der Graphiken %MACRO zcatdel; %IF %SYSFUNC(EXIST(graph.&mprg,CATALOG)) %THEN %DO; PROC GREPLAY NOFS; IGOUT=graph.&mprg; DELETE _ALL_; RUN; QUIT; %END; %MEND; %zcatdel; Februar 2003 KSFE

7 Sortierte Wiedergabe aller Graphiken SAS Dictionary Table Catalogs - Proc SQL: dictionary.catalogs - Data Step: sashelp.vcatalg Library name (LIBNAME) Member name (MEMNAME) Object name (OBJNAME) Object Description (OBJDESC) GRAPH AGLAB GPLOT4 Figure 7.5: Hemoglobin (mmol/l) GRAPH AGENROL GCHART Figure 4.1: Subject recruitment Februar 2003 KSFE

8 Sortierte Wiedergabe aller Graphiken Selektion der benötigten Observations => Data Set GRAPHS libname="graph" weitere Konventionen Extrahieren der Figure Nummer aus OBJDESC mit Hilfe von String Funktionen Zerlegen der Nummer in "Tokens": "A.10.2" = > C1="A"; N1=.; C2="10"; N2=10; C3="2"; N3=2 Sortieren des Data Sets GRAPHS nach N1, C1, N2, C2, N3, C3 Februar 2003 KSFE

9 Sortierte Wiedergabe aller Graphiken Erzeugen einer TXT Datei mit "PROC GREPLAY" Code zur Wiedergabe der Graphiken DATA _NULL_; SET graphs; FILE 'graphreplay.txt'; PUT 'IGOUT=graph.' memname ';'; PUT 'REPLAY ' objname ';'; PUT 'RUN;'; RUN; Februar 2003 KSFE

10 Erstellung der PDF Datei Einbetten des erzeugten SAS Codes GRAPHREPLAY.TXT in ODS Anweisungen ODS PROCLABEL="Figures"; OPTIONS ORIENTATION=LANDSCAPE; ODS PDF FILE="figures.pdf" STYLE=printer; GOPTIONS HSIZE=... HORIGIN=... TARGETDEVICE=psg ROTATE=LANDSCAPE; PROC GREPLAY NOFS; %INCLUDE "graphreplay.txt"; QUIT; ODS PDF CLOSE; Februar 2003 KSFE

11 Erstellung der PDF Datei Warnmeldung "file is damaged but being repaired" beim Öffnen der Datei in Adobe Acrobat verschwindet nach erstem Sichern in Adobe Acrobat Datei kann mit "File - Save as" in Adobe Acrobat 4.0 optimiert werden, d.h. Dateigröße kann deutlich verringert werden Februar 2003 KSFE

12 Einschränkungen Alle Graphiken müssen in gleicher Ausrichtung (Portrait/Landscape) vorliegen Alle Graphikkataloge sollten mit der gleichen TARGETDEVICE erstellt sein Description Parameter DES bei der TREPLAY Anweisung von PROC GREPLAY hat eine Länge von nur 40 Zeichen manuelle Anpassung der entsprechenden Bookmarks in Adobe Acrobat erforderlich Februar 2003 KSFE

13 Einschränkungen "(" ohne abschließende ")" in Graphik Description führt zu fehlenden Bookmarks in PDF Datei Probleme bei Ausgabe von rotierten Y-Achsen Labels bei Verwendung von Hardware Fonts Figure Nummer muss pro Graphikkatalogeintrag eindeutig sein, d.h. Verwendung von gleichen Titeln für mehr als eine Graphik (z.b. BY Processing) ist nicht möglich Februar 2003 KSFE

14 Zusammenfassung Bei der Programmentwicklung müssen benötigte Standards eingehalten und Einschränkungen beachtet werden PDF Datei Erstellung inklusive Bookmarks direkt mit SAS 8.2 Schnelle und einfache Erstellung der PDF Datei Kurzfristige Änderungswünsche durch Automatisierung leicht implementierbar Dictionary Table CATALOGS kann auch zur Unterstützung der Programmdokumentation verwendet werden Februar 2003 KSFE