Gemeinsam stark: Bakterien in Biofilmen

Transkript

1 GESELLSCHAFTEN VAAM 199 Vereinigung für Allgemeine und Angewandte Mikrobiologie e. V. (VAAM) Gesellschaft für Biochemie und Molekularbiologie e. V. (GBM) Gesellschaft für Genetik (GfG) Deutsche Gesellschaft für Experimentelle und Klinische Pharmakologie und Toxikologie (DGPT) Verband Biologie, Biowissenschaften und Biomedizin in Deutschland e.v. (VBIO) Seite 199 Seite 207 Seite 215 Seite 218 Seite 222 VAAM-Forschungspreisträger 2019: Knut Drescher Gemeinsam stark: Bakterien in Biofilmen Biofilm von Vibrio cholerae, aufgenommen mit einem Konfokalmikroskop bei 100-facher Ver - größerung. Jede einzelne Zelle ist je nach Orientierung zu ihren Nachbarzellen eingefärbt. Hartmann/Drescher Die meisten Bakterien leben in engen Gemeinschaften, den Biofilmen. Wie sich die Zellen je nach Umweltbedingungen und zellulären Eigenschaften in Biofilmen organisieren, erforscht Prof. Dr. Knut Drescher vom Max-Planck-Institut für terrestrische Mikrobiologie und der Universität in Marburg. Der Physiker und Mikrobiologe entschlüsselt interdisziplinär und quantitativ die Wechselwirkungen in Biofilmen. Für seine Arbeiten erhielt er den Forschungspreis 2019 der Vereinigung für Allgemeine und Angewandte Mikro biologie (VAAM). Die VAAM verlieh diese mit Euro dotierte Auszeichnung für herausragende aktuelle Arbeiten auf dem Gebiet der Mikrobiologie am 17. März im Rahmen ihrer Jahrestagung in Mainz. ó Bakterien leben nicht wie lange Zeit vermutet hauptsächlich als Einzeller. Sie kommunizieren mittels Botenstoffen von Zelle zu Zelle und leben in multizellulären Gemeinschaften. Biofilme sind wohl die Hauptform bakteriellen Lebens und haben somit einen enormen Einfluss auf alle Stoffumsätze der Erde, auf die Agrarwirtschaft, aber auch auf technologische Prozesse und unsere Gesundheit. Drescher untersucht diese bakteriellen vielzelligen Verhaltensweisen und die mechanistische Grundlage dafür. Mich fasziniert, wie aus vielen einzelnen bakteriellen Zellen Gemeinschaften entstehen, die multizelluläre Eigenschaften und Funktionen ausbilden, ohne über ein zentrales Nervensystem oder einen zentralen Schrittmacher zu verfügen, der die Gemeinschaften koordiniert, so der Preisträger. Ein Beispiel für multizelluläre Funktionen ist die erhöhte Resistenz gegen Antibiotika in Biofilmen. Solche bakteriellen Verhaltensweisen, die nur im multizellulären Kontext funktionieren, sind der Schlüssel für das Verständnis der Evolution bakterieller Gemeinschaften. Sie sind zudem die Grundlage für eine zielgerichtete Manipulation solcher Gemeinschaften und deren Optimierung für technische Anwendungen. Drescher erforscht die Entstehung bakterieller Gemeinschaften in Raum und Zeit. Physikalische und computergestützte Methoden ermöglichen ihm die quantitative Charakterisierung von Biofilmentstehung und Signalantworten. Aus solchen Daten können wir mathematische Modelle entwickeln, Hypothesen für Wirkmechanismen testen und damit die Biofilmforschung umkrempeln und beschleunigen, so Drescher. Seine Forschungsgruppe entwickelt neue Methoden in der Mikroskopie und Bildverarbeitung, um Prozesse in Biofilmen auf der Einzelzell ebene quantitativ zu erfassen. Aus Einzelzell-Daten identifizierte die Gruppe beispielsweise die wichtigsten Zell-Zell-Wechselwirkungen in der frühen Phase der Biofilmentstehung des Choleraerregers Vibrio cholerae und dessen Reaktionen auf veränderte Umweltbedingungen. Am Beispiel von Giftstoffen zeigten sie, dass einige Signalantworten nur auf Einzelzell-Ebene erfolgen, andere Signalantworten jedoch nur multizellulär funktionieren. Eine multizelluläre Verhaltensweise ist auch die schwarmartige Ausbreitung von Bakterien. Dieses Schwärmen verfolgte die Arbeitsgruppe ebenfalls bis zu einzelnen Zellen. Die Ergebnisse lassen eine einheitliche, quantitative Dynamik von Bakterien in verschiedenen Systemen vermuten. Dreschers Ziel ist ein allgemeingültiges Modell bakterieller multizellulärer Dynamik und Funktion, basierend auf molekularen Mechanismen und formuliert in der Sprache der Mathematik. Seine Arbeiten sind ein wunderbares Beispiel, wie Physik die mikrobiologische Forschung befruchten kann, lobt das internationale Auswahlkomitee der VAAM. Drescher habe das internationale Feld der quantitativen Mikrobiologie entscheidend geprägt und sei führend im Bereich der bakteriellen Biofilmforschung. Seine Arbeiten werden die mikrobiologische Forschung der kommenden Jahrzehnte entscheidend voranbringen, zeigt sich die VAAM-Präsidentin Prof. Ruth Schmitz- Streit überzeugt. ó Prof. Dr. Knut Drescher, Quelle: MPI Marburg Prof. Dr. Knut Drescher (35) leitet seit 2014 die Forschungsgruppe Bak - terielle Biofilme am Max- Planck-Institut für terrestrische Mikrobiologie in Marburg und ist seit 2015 Professor für Biophysik an der Philipps-Universität Marburg. Er studierte Physik, mit Fokus auf theoretische Physik, an der University of Oxford (GB) und promovierte in experimenteller Biophysik bei Prof. Ray Goldstein an der Univer - sity of Cambridge (GB). Als Postdoktorand untersuchte er die Entstehung von Biofilmen in den Laboren von Prof. Bonnie Bassler, Prof. Howard Stone und Prof. Ned Wingreen an der Princeton University (USA). Seit vier Jahren leitet er eine Forschungsgruppe in Marburg an der Grenze zwischen Mikrobiologie und Bio physik. Informationen: Ein ausführlicher wissenschaftlicher Artikel folgt in BIOspektrum 3/2019. Anja Störiko

2 200 GESELLSCHAFTEN VAAM Personaliameldungen aus der Mikrobiologie 2018 Promotionen 2018 RWTH Aachen Nilam Borah: Identification of host-specific virulence factors of the smut fungus Sporisorium reilianum by genotype to phenotype mapping Betreuer: Jan Schirawski Universität Bayreuth Mauricio Toro Nahuelpan: Magnetoskeleton Elucidating cytoskeletal elements involved in magnetosome chain assembly and segregation of Magnetospirillum gryphiswaldense Betreuer: Dirk Schüler Humboldt-Universität Berlin Susanne Herbst: Die Funktion der redox-sensitiven periplasmatischen CSS-Domäne in der c- di-gmp-spezifischen Phosphodiesterase PdeC bei der Biofilmbildung in Escherichia coli Betreuerin: Regine Hengge TAGUNG Freie Universität Berlin Vu Van Loi: Redox-sensing mechanisms under hypochlorite stress in Staphylococcus aureus Betreuerin: Haike Antelmann Marcel Imber: Thiol-redox proteomics of Mycobacterium smegmatis in response to ROS, RNS and antibiotics Betreuerin: Haike Antelmann Mohamed Boshra: Experimente zum proteomweiten Austausch von L-Tryptophan in Escherichia coli gegen 4-Aza- und 4-Fluor-Tryptophan Betreuer: Rupert Mutzel Zahra Sabet: Untersuchungen zur Wirkung des arbuskulären Mykorrhizapilzes G. intraradices auf die Gesundheit und das Wachstum der Unterlagsrebe (5 BB) an salzbelasteten Standorten Betreuer: Rupert Mutzel Marie Reinhardt: Nachweis, Prävalenz und Charakterisierung von Yersinia pseudotuberculosis aus Schwarzwild im Nordosten Deutschlands Betreuer: Karsten Nöckler (BfR), Rupert Mutzel Torsten Semmler: Population Genetics of Escherichia coli a Genomic Approach Betreuer: Lothar Wieler (RKI), Rupert Mutzel You never walk alone We and our microbiome 18.Juni 2019, Cineplex Kino, Biegenstr. 1, Marburg Liebe Mikrobiologinnen und Mikrobiologen, eine Vielzahl von Mikroben besiedelt den menschlichen Organismus, das Mikro biom. In den vergangenen Jahren wurden wir Zeugen hochspannender Forschungs ergebnisse, die die Bedeutung des menschlichen Mikrobioms für Gesundheit und Wohlbefinden nachdrücklich untermauern. Schlüsselrollen des menschlichen Mikrobioms sind die Bereitstellung von Nahrungsstoffen, die Programmierung des Immunsystems und die Verhinderung der Besiedlung des Darmtraktes durch pathogene Mikroorganismen. Führende Wissenschaftler/innen aus Grundlagenforschung und Industrie werden am 18. Juni 2019 in Marburg zum eintägigen SYNMIKRO-Symposium zusammenkommen, über neue Ergebnisse der menschlichen Mikrobiom-Forschung berichten und diskutieren. Zu diesem spannenden Symposium laden wir Sie alle herzlich ein. Die Teilnahme am Symposium ist gebührenfrei, aber eine Anmeldung ist aus organisatorischen Gründen erforderlich ( Wir würden uns freuen, wenn wir möglichst viele Teilnehmer/innen in Marburg anlässlich dieses Symposiums begrüßen können. Das Symposium ist auch für Studierende geeignet. Mit kollegialen Grüßen, Anke Becker and Erhard Bremer TU Berlin Simon Boecker: Studies towards the heterologous production of fungal cyclodepsipeptides and the structure and mechanistics of their synthetases Betreuerin: Vera Meyer Tutku Kurt: Genetic, metabolic and bioprocess engineering approaches to optimize Aspergillus niger as production host for bioactive cyclodepsipeptides Betreuerin: Vera Meyer Universität Bielefeld Thomas Baier: Strategien zur Optimierung der heterologen Proteinproduktion in der eukaryotischen Mikroalge Chlamydomonas reinhardtii Betreuer: Olaf Kruse Nadja A. Henke: Regulation of carotenoid biosynthesis and metabolic engineering for terpenoid production in Corynebacterium glutamicum Betreuer: Volker F. Wendisch Gesa Lippky: Evaluation von Herstellprozessen alternativer Kraftstoffe durch mikrobielle Photosynthese Betreuer: Olaf Kruse Michael Przyklenk: Encapsulation of Metarhizium brunneum as basis for an attract-and-kill strategy to control herbivorous soil insects Betreuer: Karsten Niehaus Viktoria Tomczak: Microbe-plant-herbivore interactions: Impacts of arbuscular mycorrhiza on the performance and behavior of generalist herbivores Betreuerin: Caroline Müller Manuel Wittchen: Transkriptomsequenzierung bei Corynebakterien zur Charakterisierung von Mutanten in der RNA-Synthese und im RNA- Abbau Betreuer: Jörn Kalinowski Timo Wolf: Transcriptional regulation of acarbose biosynthesis in Actinoplanes sp. SE50/110 analyzed by next-generation sequencing, tran - scriptomics and genome editing Betreuer: Jörn Kalinowski Universität Bochum Christoph Senges: Secondary metabolites of Streptomyces chartreusis Betreuerin: Julia Bandow Simon Czolkoss: Exploring phospholipid biosynthesis and membrane heterogeneity in the plant pathogen Agrobacterium tumefaciens Betreuer: Franz Narberhaus Daria Radchenko: Cellular signaling pathways in the filamentous fungus Sordaria macrospora: Molecular genetic analysis of the STRIPAK_associated germinal center kinase SmKIN3 in developmental processes Betreuer: Ulrich Kück Universität Bonn Anna Siemen: Identifizierung und Charakterisierung neuartiger Oxidoreduktasen in Gluconobacter oxydans und Produktion des potentiellen Süßstoffes 5-Keto-D-Fruktose Betreuer: Uwe Deppenmeier Lena Kröninger: Schlüsselenzyme der Methanogenese und der Energiekonservierung im Darmbewohner Methanomassiliicoccus luminyensis Betreuer: Uwe Deppenmeier

3 201 Katharina Moritz: Escherichia coli und Synechocystis sp. als heterologe Produktionssysteme für Ectoin und Hydroxyectoin Betreuer: Erwin E. Galinski Tobias Koch: Ein neuer Weg der mikrobiellen Schwefeloxidation: Das Heterodisulfidreduktaseähnliche System Betreuerin: Christiane Dahl Carina Eva Marx: Characterization and mode of action analysis of the antibiotic hypeptin Betreuer: Hans-Georg Sahl Technische Universität Braunschweig Julia Adamczack: Der letzte Biosyntheseschritt des Nitritreduktasekofaktors Häm d 1 in Pseudomonas aeruginosa Betreuerin: Gunhild Layer Hannes Beims: Charakterisierung der Paenibacillus larvae Genotypen ERIC I-V und alternative Therapieverfahren zur Behandlung der Amerikanischen Faulbrut Betreuer: Michael Steinert Hilger Jagau: Interaktion von Streptococcus pneumoniae mit Faktoren der Blutgerinnung Betreuerin: Simone Bergmann Helmholtz-Zentrum für Infektions - forschung/tu Braunschweig Carina Maria Schmühl: Mechanisms of niche adaption by Yersinia Betreuerin: Petra Dersch Maria Kusmierek: Identification of regulatory mechanisms important to control the Yersinia pseudotuberculosis type III secretion and virulence Betreuerin: Petra Dersch DSMZ/TU Braunschweig Selma Gomes Vieira: Bacterial adaptation strategies and interactions in different soil habitats Betreuer: Jörg Overmann Nora Roesky: Vom Genotyp zum Phänotyp Phaeobacter inhibens DSM unter Berücksichtigung der extrachromosomalen Elemente: Phänotypisches MicroArray und Auswertungsmethoden Betreuer: Markus Göker Universität Bremen David Aromokeye: Iron oxide driven methanogenesis and methanotrophy in methanic sediments of Helgoland Mud Area, North Sea Betreuer: Michael W. Friedrich Wiebke Bünger: Physiological and molecular analysis of plant-associated symbionts from domesticated and wild plant species Betreuerin: Barbara Reinhold-Hurek Tobias Pees: Role of quorum sensing during the interaction between Azoarcus sp. BH72 and rice Betreuerin: Barbara Reinhold-Hurek Jessica Döring: Investigations of the effect of branched ribonucleotides in RNA and DNA on the polymerase-catalyzed nucleic acid synthesis Betreuer: Thomas Hurek Universität Bremen/MPI für Marine Mikrobiologie Bremen Lennart Kappelmann: Some like it sweet Genomic Analyses of Polysaccharide Utilization in Marine Flavobacteriia Betreuer: Rudolf Amann Edinson Puentes Cala: The anaerobic monoterpene metabolism in Castallaniella defragans Betreuer: Jens Harder Beatriz Elizabeth Noriega Ortega: Chemodiversity of marine dissolved organic matter and marine bacterial exometabolomes Betreuer: Thorsten Dittmar Tanja Fischer: Surface structures and taxonomy of marine Flavobacteriia Betreuer: Jens Harder Josephine Rapp: Diversity and function of microbial communities in the Arctic Ocean Betreuer: Jan Hendrik-Hehemann Burak Avci: Niches of abundant heterotrophic bacteria during North Sea spring algal blooms Betreuer: Rudolf Amann Oliver Jäckle: Evolution and physiology of the Paracatenula symbiosis Betreuerin: Nicole Dubilier Niels Schoffelen: The impact of phosphorus limitation on N2 fixation Betreuer: Marcel Kuypers Jon Graf: Microbial oxidation of methane in stratified freshwater lakes Betreuer: Marcel Kuypers Rafael Lazo Perez: Unravelling the molecular basis of the anaerobic degradation of hydrocarbons in archaea Betreuerin: Antje Boetius Eduard Fadeev: Dynamics of pelagic microbial communities in the Arctic Ocean Betreuerin: Antje Boetius Ralf Hoffmann: Organic carbon cycling in Potter Cove (Antarctica): Subject to glacier retreat Betreuerin: Antje Boetius Technische Universität Darmstadt Thea Lotz: Development of photo-responsive synthetic RNA devices Betreuerin: Beatrix Süß Universität Düsseldorf/ Forschungszentrum Jülich Angela Kranz: High-resolution genome and transcriptome analysis of Gluconobacter oxydans 621H and growth-improved strains by next-generation sequencing Betreuer: Michael Bott Universität Düsseldorf Kaitlyn Courville: Infection biology of the smut fungus Thecaphora thlaspeos in its Brassica ceae hosts Betreuer: Michael Feldbrügge Universität Dresden Qiang Liu: Characterization of ECF42, a novel group of extracytoplasmic function (ECF) sigma factors with C-terminal extensions Betreuer: Thorsten Mascher Universität Frankfurt am Main Manuela Gottardi: Biosynthesis of L-phenylalanine derived compounds by metabolic engi - neering in Saccharomyces cerevisiae Betreuer: Eckhard Boles Hendrik Wolff: Mass spectrometric analysis of microbially produced natural products Betreuer: Helge B. Bode Sarah Nowak: Characterisation and structural assignments of monomodular non-ribosomal peptide synthetases from the entomopathogenic bacterium Xenorhabdus KJ12.1 Betreuer: Helge B. Bode Annabell Linck: Mass spectrometric characterisation of natural products and reprogramming of non-ribosomal peptide synthetases from entomopathogenic bacteria Betreuer: Helge B. Bode Frank Wesche: Synthesis, Identification and Characterization of Natural Products and Artificial Derivatives Produced by Xenorhabdus and Photorhabdus Betreuer: Helge B. Bode Katharina Jaschinski: Charakterisierung kleiner regulatorischer RNAs von Haloferax volcanii und Identifizierung ihrer Ziele Betreuer: Jörg Soppa Anna Katharina Ludt: Polyploidie in Prokaryoten Betreuer: Jörg Soppa Schölmerich Marie: Physiology and bioenergetics of the thermophilic acetogen Thermoanaerobacter kivui and the rumen bacterium Pseudobutyrivibrio ruminis Betreuer: Volker Müller Universität Freiburg Markus Warnke: Steroid degradation in the denitryfying model organism Sterolibacterium denitrificans CHOL1S Betreuer: Matthias Boll Thi Ngoc Thuong Lê: Regulation of the Ups pili system involved in DNA damage response in Sulfolobus Betreuerin: Sonja Albers Oliver Tiedt: The complete anaerobic degradation of haloaromatic compounds and the key enzymes involved Betreuer: Matthias Boll Achim Mall: Novel strategies for autotrophic carbon fixation in prokaryotes From diverse pathways to diversity within pathways Betreuer: Ivan Berg Mario Mergelsberg: Anaerobic Degradation of Phthalate Betreuer: Matthias Boll Universität Gießen Binoy Ambika Maniranjan: Bacterial and Fungal Microbiota of Flower Pollen and Potential Impact on Pollen-related Allergies Betreuerin: Sylvia Schnell Universität Göttingen Jonathan Rosenberg: Vitamin B6 production in Bacillus subtilis: Interference of heterologous and host pathways Betreuer: Fabian Commichau Blanca Rincon Tomas: Symbiontic adaptation of prokaryotic microorganisms in extreme deep-sea environments Betreuer: Michael Hoppert Bingyao Zhu: SubtiWiki 3.0: A relational database for the functional genome annotation of the model organism Bacillus subtilis Betreuer: Jörg Stülke Jan Kampf: Insights into the biofilm formation of Bacillus subtilis Betreuer: Jörg Stülke

4 198_242_BIOsp_0219_ :10 Seite GES ELL SCH AFTE N VAAM Ulla-Maria Schneider: Characterization of Npl3mediated RNA quality control in Saccharomyces cerevisiae Betreuerin: Heike Krebber Daniel Becker: Maturation and nuclei-cytoplasmic shuttling of snrnas in Saccharomyces cerevisiae Betreuerin: Heike Krebber Hugo Amoedo Machi: The Aspergillus fumigatus VAP-VIP methyltransferase pathway modulates stress response, secondary metabolism and azole restistance Anna Maria Köhler: Specific ubiquitin dependent protein degradation requires a trimeric CandA complex in Aspergillus nidulans Cindy Meister: Interplay of the COP9 signalosome deneddylase and the UspA deubiquitinase to coordinate fungal development and secondary metabolism Sabine Thieme: Insertion of an intrinsically disordered domain in VelB supports selective heterodimer formation of fungal velvet domain regulatory proteins in Aspergillus nidulans Benedict Dirnberger: Proteomics of A. nidulans sexually differentiated cells revealed increased protein levels of monodictyphenone (mdp) and xanthone (xpt) biosynthetic proteins and of a maltose permease like transporter of Hülle cells MphA supporting fungal growth and development Universität Greifswald Universität Hohenheim Ulrike Binsker: Characterizing and deciphering the interaction of human platelets and plateletderived proteins with Streptococcus pneumoniae and Staphylococcus aureus Betreuer: Sven Hammerschmidt Alejandro Gómez-Mejia: Tackling the regulation of pneumococcal fitness and virulence factors Betreuer: Sven Hammerschmidt Simone Nübling: Mikrobielle Biodiversitätsanalyse von verzehrfertigen Blattsalaten als Methode zum Monitoring innovativer Waschverfahren Betreuer: Herbert Schmidt Charlotte M. Toulouse: Novel aspects of respiration and metal homeostasis in Vibrio cholera Betreuerin: Julia Fritz-Steuber Universität Halle-Wittenberg Universität Jena Lucy Bütof: Metall-Chaperone in Cupriavidus metallidurans: Charakterisierung der putativen P-loop GTPasen CobW1/2/3 Betreuer: Dietrich H. Nies, Gary Sawers, W. Maret Jennifer Gadkari: Energiekonservierung über Organohalid-Respiration in Sulfurospirillum multivorans Sebastian Keller: Biosynthesis and utilization of structurally diverse norcobamide cofactors in the tetrachloroethanol-respiring bacterium Sulfurospirillum multivorans Cindy Kunze: Structural anfuctional relations in cobamide-containing reductive dehalogenases from anaerobic bacteria Stefan Kruse: Hydrogen metabolism and syntrophic interactions of Sulfurospirillum spp. in anaerobic co-cultures Martin Sperfeld: Microbial communities at a gasworks site: A marker gene- and cultivation-based approach to explore anaerobic aromatic compound degradation Universität Hamburg Simone Wegen: Characterization of Candidatus Nitrotoga and its Competitiveness in Co-Culture with Nitrospira Betreuerin: Eva Spieck Birhanu Mekuaninte Kinfu: Function-Based Searches for Selected Phosphotransferases and Establishing in Vitro Transcription Platform for Cell-Free Metagenomics Betreuer: Wolfgang Streit Universität Hannover Eyleen Sabine Heidrich: Aktivierung des PspSystems durch TatA-induzierten Membranstress in Escherichia coli Betreuer: Thomas Brüser Magnetospirillum Mikrobe des Jahres 2019 x x x x Ketten aus Eisenoxid-Kristallen bilden eine Kompassnadel So orientieren sich die Bakterien in Gewässern am Erdmagnetfeld Diese Magnetosomen können zusätzliche Eigenschaften erhalten So entstehen Anwendungsmöglichkeiten in Medizin und Technik

5 203 Kirtzel, Julia: Geomicrobiology of Schizophyllum commun Betreuerin: Erika Kothe Leibniz-Institut für Naturstoff- Forschung und Infektionsbiologie Hans-Knöll-Institut/Universität Jena Gulimila Shabuer: Naturstoffe aus Pflanzen-assoziierten anaeroben Bakterien Betreuer: Christian Hertweck Huiyun Peng: Elucidating and Mimicking the Evolutionary Processes in Modular Type I Polyketide Synthases Betreuer: Christian Hertweck Zerrin Üzüm: Bacterial Endosymbionts in Plant- Pathogenic Fungi Betreuer: Christian Hertweck Agnieszka Litomska: Biosynthesis and Biological Function of 6-Thioguanine from the Phytopathogenic Bacterium Erwinia amylovora Betreuer: Christian Hertweck Stefanie Allert: Pathogenicity mechanisms of Candida albicans during translocation through epithelial barriers Betreuer: Bernhard Hube Bettina Böttcher: Identifizierung pathogenitätsrelevanter Gene in Candida albicans und Candida dubliniensis Betreuer: Bernhard Hube Toni Förster: Identification and characterization of translocation-associated factors of Candida albicans Betreuer: Bernhard Hube Volha Skrahina: Role of micronutrients during fungal infections Betreuer: Bernhard Hube Lisa Mahler: Microfluidic droplets for single cell segregation and cultivation of environmental microbial communities with integrated screening for antibiotic production and targeted isolation Betreuer: Martin Roth Miguel Tovar: Engineering picoliter droplets for ultra-high throughput microbial biotechnology Betreuer: Martin Roth Liesa Heinrich: In situ Bildgebung der AA-Amyloidose mithilfe eines auf B10 basierenden VHH- Antikörpers Betreuer: Uwe Horn Yuchen Lin: The role of Age-Related Maculopathy Susceptibility Protein 2 (ARMS2) in the complement regulation of ARPE-19 cells Betreuer: Christine Skerka Emeraldo Jo: Modulation of human monocytes by pathogenic fungus Candida albicans Betreuer: Christine Skerka Anika Westphal: Die Funktion von Ssl11 und PurA von Staphylococcus aureus bei der Komplementevasion Betreuer: Peter Zipfel Joao Saraiva: Distinguishing fungal from bacterial infection: A Mixed Integer Linear Programming approach Betreuer: Rainer König Iordana Shopova: Extracellular mechanisms of neutrophil granulocytes against Aspergillus fumigatus Betreuer: Axel Brakhage Jacob Weber: Regulation and manipulation of natural product biosynthesis in Aspergillus fumigatus Betreuer: Axel Brakhage Hanno Schoeler: Zelluläre Detektion von Virulenzfaktoren von Aspergillus fumigatus und deren Effekte auf Immunzellen Betreuer: Axel Brakhage Marcel Noßmann: Identifizierung von Protein- Protein-Interaktionen des human-pathogenen Pilzes Aspergillus fumigatus unter Verwendung eines Arginin-tRNA-adaptierten Saccharomyces cerevisiae Stammes Betreuer: Axel Brakhage Bianca Hoffmann: Automated Quantification of Experimental Arthritis based on in vivo PET/CT Imaging Betreuer: Marc Thilo Figge und Hans Peter Saluz Sandra Timme: Agent-based modeling of the spatio-temporal interaction between immune cells and human-pathogenic fungi Betreuer: Marc Thilo Figge Universität Kaiserslautern Benjamin Ledermann: From metagenomes to green algae The biochemical variety of bilin biosynthesis enzymes Betreuerin: Nicole Frankenberg-Dinkel Marco Aras: Metabolic channeling during phycoerythrobilin biosynthesis Betreuerin: Nicole Frankenberg-Dinkel Universität Karlsruhe, KIT Arin Ali: Biochemical Characterization of the Fungal Phytochrome FphA from Aspergillus nidulans Betreuer: Reinhard Fischer Xiaolei Gao: Molecular Characterization of Microtubule Organizing Centers (MTOCs) in the Filamentous Fungus Aspergillus nidulans Betreuer: Reinhard Fischer Ruben Betz: The Abuscular Mycorrhiza SP7-like Effector Family Targets the Conserved Plant RNA Machinery Betreuerin: Natalia Requena Hongju Ma: Divalent Cations Stimulate DNA Repair Activities of Bacterial (6-4) Photolyase Betreuer: Tilman Lamparter Lex Winandy: Expression und Charakterisierung von Aspergillus nidulans-hydrophobien und deren potentieller Einsatz im Denkmalschutz Betreuer: Reinhard Fischer Cornelia T. Klessing: Abreinigung cellulosehaltiger Biomasse unter Generierung elektrischer Energie und Acetoin Betreuer: Johannes Gescher Maximilian Wenderoth: Etablierung von CRISPR/Cas9 in Alternaria alternata und die Untersuchung der Biosysthesewege von Alternariol, Hortein und Altertoxin Betreuer: Reinhard Fischer Oswald Florian: Upgrading the toolbox for fermentation of crude syngas: Process characterization for complete carbon usage, cyanide adaption and production of C 4 components Betreuer: Christoph Syldatk, Anke Neumann Oliver Buß: ω-transaminase as Promising Biocatalysts for the Chiral Synthesis of β-amino Acids Betreuer: Christoph Syldatk, Jens Rudat Stefan Dörsam: Evaluation of Renewable Resources as Carbon Sources for Organic Acid Production with Filamentous fungi Betreuer: Christoph Syldatk, Katrin Ochsenreither Universität Kiel Anne Buddeweg: Elucidation of function and regulatory mechanisms of non-coding RNAs in Archaea with special regards to srna41 in Methanosarcina mazei strain Gö1 Betreuerin: Ruth Schmitz-Streit Fernando D. K. Tria: Rooting phylogenetic trees Betreuerin: Tal Dagan Benjamin L. Springstein: Identification and functional characterization of cytoskeletal proteins in cyantobacteria Betreuerin: Tal Dagan Universität Konstanz Sina Blessing: The role of Not4 in cellular ho - meostasis during proliferation and differentiation in Saccharomyces cerevisiae Betreuerin: Elke Deuerling Universität Leipzig/Helmholtz Zentrum für Umweltforschung-UFZ Yuting Guo: Heterogenic responses of bacteria towards silver nanoparticles Carolin Urban: Fundamental study and process description of a bioelectrorefinery based on the electrochemical upgrading of n-carboxylic acids derived from renewable resources, Falk Harnisch Denise Przybylski: Criteria of efficiency, stability and productivity of microorganisms with the potential for synthesis and overproduction of 2- hydroxyisobutyric acid Nadya Kurteva: 2-hydroxyisobutyryl-CoA mutase kinetic and structural characterization of an enzyme for the biotechnological production of methacrylates Ingrid E. Meyer Cifuentes: Understanding the role of a novel Magnetospirillum strain as an anaerobic toluene degrader in constructed wetland model systems through integrated omics Babett Wintsche: Effects of trace element limitation on metabolic functions of microbial communities in anaerobic digesters Mónica A. Vásquez Piñeros: Role of bacterial strains and bacterial communities from constructed wetlands during the biodegradation of dimethylphenol isomers Universität Mainz Corinna Kübler: Entwicklung von neuen Testsystemen zur Identifizierung von resistenzbrechenden antibiotisch aktiven Naturstoffen Betreuer: Eckhard Thines Christine Barth: Phylogenie von [FeS]-haltigen O2-Sensoren und Interaktion des O2-Sensors NreB mit dem Nitratsensor NreA aus Staphylococcus carnosus Betreuer: Gottfried Unden Alexander Strecker: Der C 4 -Dicarboxylat-Metabolismus von Escherichia coli: die Rolle von DcuA und von DcuS im Signaltransfer Betreuer: Gottfried Unden

6 204 GESELLSCHAFTEN VAAM Universität Marburg Laura Teichmann: Molekulare Autopsie der nah verwandten ABC-Transporter OpuB und OpuC aus Bacillus subtilis Betreuer: Erhard Bremer Yacine Refes: Biochemistry of the key spatial regulators MipZ and PopZ in Caulobacter cre - scentus Betreuer: Martin Thanbichler Sabine Rosskopf: Regulation of peptidoglycan biosynthesis in Hyphomonas neptunium Betreuer: Martin Thanbichler Max-Planck-Institut für terrestrische Mikrobiologie/Universität Marburg Bastian Vögeli: Control of reactive intermedi - ates in enzymes and enzyme complexes, Betreuer: Tobias Erb Thomas Schwander: The design and realization of synthetic pathways for the fixation of carbon dioxide in vitro Betreuer: Tobias Erb Frau Joana Lopes: Chemotaxis of Escherichia coli to compounds present in human gut Max Mundt: Synthetic noise control in eukaryotic gene expression and signal transduction Olga Lamprecht: Heterogeneity of gene expression in Escherichia coli Oliver Schauer: Antigen 43-mediated biotin display and fabrication of bacteria-driven micro - swimmers Leanid Laganenka: Role of chemotaxis in autoaggregation of Escherichia coli Michael Daume: L7Ae- and LSm-RNA interactomes of Sulfolobus acidocaldarius Betreuer: Lennart Randau Anna-Lena Henche: Living on the edge: Insights into the unique Aap type 4 Pilus, its interaction with other surface structures & post-translational protein secretion Betreuerin: Sonja-Verena Albers Wanyang Wang: The bacterial gut microbiota of wood-and humus-feeding termites: Diazotrophic populations and compartment-specific response of bacterial communities to environmental factors Betreuer: Andreas Brune Nicole Ludwig: A protein complex formed by Ustilago maydis effectors is essential for virulence Betreuerin: Regine Kahmann Mariana Schuster: Establishment of CRISPR- Cas9 genome editing technology for the study of effector families in the plant pathogen Ustilago maydis Betreuerin: Regine Kahmann Rehab Abdallah: Community transcriptomics reveals drainage effects on paddy soil microbiome across all three domains of life Betreuer: Werner Liesack Dobromir Szadkowski: Identification and characterization of RomX and RomY, two novel motility regulators in Myxococcus xanthus Betreuerin: Lotte Søgaard-Andersen Alejandra Alvarado: The ParC/ParP system in the localization and segregation of chemotaxis signalling arrays in Vibrio cholerae and Vibrio parahaemolyticus Betreuer: Simon Ringgaard Samada Muraleedharan: Understanding cell division and its regulation in the human pathogenic bacterium Vibrio parahaemolyticus Betreuer: Simon Ringgaard Max-Planck-Institut für terrestrische Mikrobiologie Marburg/Universität Heidelberg Alper Mutlu: Phenotypic memory couples en try and exit from dormancy by a spore quality- quantity tradeoff in Bacillus subtilis Betreuerin: Ilka Bischofs-Pfeifer TU München Etienne Valerie Doll: Extended-Shelf-Life Milch Populationsdynamik während der Herstellung und Kühllagerung Jessica A. Hellinckx: Analyse des Repressors IoIR im myo-inositol-stoffwechsel von Salmonella enterica serovar Typhimurium Betreuer: Thilo M. Fuchs Sarah M. M. Hücker: RIBOseq-based discovery of non-annotated genes in Escherichia coli O157:H7 Sakei and their functional characterization Jakob J. Schardt: Characterization of Listeria sensu stricto specific genes involved in colonization of the gastrointestinal tract by Listeria monocytogenes Betreuer: Thilo M. Fuchs Franziska Breitenwieser: Analyse der bakteriellen Biodiversität von boviner Rohmilch mittels kultureller und kulturunabhängiger Verfahren Christopher Huptas: Speziesabgrenzung innerhalb der Gattung Pseudomonas und Bacillus cereus s. I. auf der Basis von Genomsequenzen Verena Schmidt: Microbiota of raw and microfiltered ESL milk Vu Thuy Trang Pham: Charakterisierung thermostabiler Enzyme aus funktionell durchforsteten metagenomischen Genbanken Betreuer: Wolfgang Liebl Matthias Mechelke: Enzymatische Hydrolyse von Hemicellulose zu Oligosacchariden Betreuer: Wolfgang Liebl Maximilian Surger: Charakterisierung und Modifizierung der Kohlenwasserstoffproduktion in Mikrokokken Betreuer: Wolfgang Liebl Lisa Vogt-Hrabak: Influence of grape-associated filamentous fungi and their exoproteom on the gushing in sparkling wine Veronika Kupfer: The influence of plant- and yeast-derived proteins on gushing in sparkling wine Tomas van Nassau: Combination of bacteriophage lysins and high hydrostatic pressure for the inactivation of Listeria monocytogenes and Staphylococcus aureus Marion Fraunhofer: Characterization of EPS-producing brewery-associated lactobacilli Linda Höll: Identification and growth dynamics of meat spoilage microbiota in modified atmo sphere packaged poultry meat Tharalinee Osen: Evaluation of levan-producing acetic acid bacteria for their potential in glutenfree baking applications Julia Brandt: Structure, biosynthesis and possible ecological role of a novel heteropolysaccharide from Kozakia baliensis Thomas Kafka: Role of lipid phase composition and cell surface hydrophobicity in high pres sure inactivation of Lactobacillus plantarum Maik Hilgarth: Spoilage-associated psychrotrophic and psychrophilic microbiota on modified atmosphere packaged beef LMU München Claudia Vilhena: Phenotypic heterogeneity and the biological significance of a pyruvate sensing network in Escherichia coli Betreuerin: Kirsten Jung Ralph Krafczyk: Exceptionally sweet Studies on the arginine rhamnosyltransferase EarP Betreuerin: Kirsten Jung Felix Becker: Non-Selective Evolution and Co - operativity under selective conditions of growing Pseudomonas putida metapopulations Betreuer: Heinrich Jung Helmholtz-Zentrum München/TU München Lu Zhang: Insights into trophic connectivities and carbon flow through bacterial members of a belowground food web Betreuer: Tillmann Lüders Universität Münster Karsten Zecher: Interaction of marine diatoms with heterotrophic bacteria and their impact on biofouling Betreuer: Bodo Philipp Franziska Birmes: Bacterial degradation of Pseudomonas aeruginosa 2-alkyl-4-hydroxyquinoline quorum sensing signals and antibiotics: Biochemistry and inter-species interactions Betreuerin: Susanne Fetzner Rodrigo Andler: Studies on bacterial and enzymatic degradation of rubber Betreuer: Alexander Steinbüchel Florian Meyer: The catabolism of ferulic acid and vanillin in Amycolatopsis sp. ATCC Betreuer: Alexander Steinbüchel Universität Regensburg Pia Berlik: Structural and functional analysis of MscS-like channels from Nanoarchaeum equitans Betreuer: Harald Huber, Christine Ziegler

7 198_242_BIOsp_0219_ :10 Seite Universität Rostock Nancy Magnus: Unraveling the regulatory mechanisms controlling the biosynthesis and emission of the volatile organic compound sodorifen produced by Serratia plymuthica 4Rx13 Betreuerin: Birgit Piechulla Universität des Saarlandes Domenik Rammo: KDEL-Rezeptor-Trafficking und Rezeptor/Liganden-Dynamik in Säugerzellen Betreuer: Manfred Schmitt Andrea Blum: Lokalisation und Funktion von KDEL-Rezeptoren in Hefe- und Säugerzellen Betreuer: Manfred Schmitt Universität Stuttgart Dominique Darimont: Etablierung und Charakterisierung einer Cytochrom P450 monooxygenase für Bioeletrokatalyse in einem dreidimensionalen CNT-SIGEL Meike Lenz: Studien zur katalytischen Promiskuität von Imin-reduzierenen Enzymen Jan Klenk: Identifikation und Charakterisierung neuer Biokatalysatoren für die C-H-Oxyfunktionalisierung Rebecca Demming: Enzymatische Hydratisierung kurzkettiger Fettsäuren und Alkene Leonie Weinmann: Biosynthese von N-Heterocyclen mittels Putrescinoxidase und Iminreduktase Nico Kress: Development of a Chemoenzymatic ( ) Menthol Synthesis Philipp Trauzettel: Methyltransferasen für die chemo- und regioselektive Alkylierung phenolischer Synthesebausteine Patrick Buchholz: Data Integration und Data Mining for the Exploration of Enzymatic Sequence-Structure-Function Relationships Betreuer: Jürgen Pleiss Janina R. Jüngert: Stringent response and phosphorylation of PHB synthase and PHB depolymerase influence PHB content of Ralstonia eutropha H16 Betreuer: Dieter Jendrossek Stephanie Schulze: Neue Einblicke in die Funktionalität PHB-Granula-assozierter Proteine in Ralstonia eutropha H16 Betreuer: Dieter Jendrossek Universität Tübingen Mohammad Alanjary: Developing genome mining tools for the discovery of bioactive secondary metabolites Betreuerin: Nadine Ziemert Paul N. Schwarz: Metabolic Engineering of the heterologous host Amycolatopsis japonicum to optimize production of brasilicardin Betreuer: Efthimia Stegmann, Wolfgang Wohlleben Sergeii Krysenko: Characterization of polyamine and ethanolamine utilization pathways in Streptomyces coeilcolor M145 Betreuer: Wolfgang Wohlleben Andreas J. Bornikoel: Key players in cell wall modification, multicellularity and cell-cell communication in the filamentous cyanobacterium Anabeaena sp. PCC 7120 Betreuerin: Iris Maldener Universität Ulm Rahul Gauttam: Bacterial glyco-engineering: A prokaryotic expression system for recombinant protein glycosylation Betreuer: Bernhard Eikmanns Tobias Hahn: Untersuchung der ribosomalen RNA-Expression in Corynebacterium glutamicum Betreuer: Bernhard Eikmanns Vanessa Jag: Characterization of Oerskovia enterophila and investigation of its isophorone metabolism Betreuer: Peter Dürre Michael Karl: Insights into old and new acetogens: transformation barriers and genomics Betreuer: Peter Dürre Serin Weinmann: Impact of rrn operon deletions on the growth of Corynebacterium glutamicum Betreuer: Bernhard Eikmanns Universität Würzburg Nitish Gulve: Subversion of Host Genome Integrity by Human Herpesvirus 6 and Chlamydia trachomatis Betreuer: Thomas Rudel Caroline Tawk: The role of host-stress in the infection by the bacterial pathogen Shigella flexneri Betreuer: Jörg Vogel Irene Hampe: Analysis of the mechanism and the regulation of histatin 5 resistance in Candida albicans Betreuer: Joachim Morschhäuser Thorsten Bischler: Data Mining and Software Developments for RNA-seq based Approaches in Bacteria Betreuerin: Cynthia M. Sharma EMBL Conference Biological Solutions for the Global CO2 Challenge 3 4 June 2019 EMBL Advanced Training Centre Heidelberg I Germany Abstract Submission Deadline 11 March 2019 I Registration Deadline 23 April 2019 ORGANISERS SPEAKERS Mohsen Ben Haha Tobias Erb Kiran Patil Arren Bar-Even Sarah D Adamo Bärbel Friedrich Thomas Haas Doris Hafenbradl Cheryl Kerfeld Michael Koepke Olaf Kruse James C. Liao Peter Lindblad Volker Müller Joseph Noel Juha-Pekka Pitkänen

8 206 GESELLSCHAFTEN VAAM SYMPOSIUM Vereinigung für Allgemeine und Angewandte Mikrobiologie e. V. Präsidentin: Prof. Dr. Ruth Schmitz-Streit Universität Kiel Institut für Allgemeine Mikrobiologie Am Botanischen Garten Kiel Tel: Fax: rschmitz@ifam.uni-kiel.de 1. Vizepräsidentin: Prof. Dr. Christine Lang MBCC Group Consulting and Coaching in Microbiotics and Bioeconomy Leonhardtstr Berlin christine.lang@mybioconsulting.de 2. Vizepräsident: Prof. Dr. Oskar Zelder BASF SE/GBW A Ludwigshafen Tel: Fax: oskar.zelder@basf.com Schatzmeisterin: Prof. Dr. Beate Averhoff Molekulare Mikrobiologie & Bioenergetik Institut für Molekulare Biowissenschaften Universität Frankfurt a. M. Max-von-Laue-Straße Frankfurt a. M. Tel.: Fax: averhoff@bio.uni-frankfurt.de Schriftführer: Prof. Dr. Hubert Bahl Institut für Biowissenschaften Abteilung Mikrobiologie Universität Rostock Albert-Einstein-Straße Rostock Tel.: Fax: hubert.bahl@uni-rostock.de Geschäftsstelle: Leiterin: Dr. Katrin Muth Mörfelder Landstraße Frankfurt a. M. Tel.: Fax: muth@vaam.de Mitgliederverwaltung: Margo Genzmer mail@vaam.de Öffentlichkeitsarbeit: Dr. Sabine Haag-Richter haag-richter@vaam.de VAAM-Manuskriptbearbeitung: Dr. Anja Störiko Herderstraße Hofheim am Taunus Tel.: vaam@stoeriko.de VAAM-Homepage: Facebook: VAAM-Bankverbindung: Mitgliedsbeiträge werden ausschließlich per Lastschriftverfahren eingezogen. Volksbank Göttingen IBAN: DE BIC: GENODE51KS1 Mitgliedsbeiträge: 70 D pro Jahr; Ermäßigungen für Dechema-, DGHM- und GBM-Mitglieder (60 D), Pensionäre (45 D), sowie Studierende und Arbeitssuchende (25 D) HIPS-Symposium 27./28. Juni 2019, Saarbrücken Zur Feier des 10. Jubiläums des Helmholtz-Zentrums für Infektionsforschung Saarbrücken (HIPS) Eingeladene Sprecher: Petra Dersch Helmholtz-Zentrum für Infektionsforschung, Braunschweig Laura Ensign John Hopkins School of Medicine, Baltimore, Maryland Anne Imberty CERMAV, CNRS Grenoble Caren Meyers John Hopkins School of Medicine, Baltimore, Maryland Gerhard Klebe Universität Marburg Joachim Spatz Max-Planck-Institut für medizinische Forschung, Heidelberg Jörn Piel ETH Zürich Thomas Pietschmann TWINCORE, Hannover Susan Pulham HTW Saar Jörg Vogel Helmholtz-Institute for RNA-based Infection Research Suzanne Walker Harvard University Anmeldung online: hips.saarland/symposium/ bis 17. Mai 2019 Kontakt: hips-symposium@helmholtz-hzi.de Mitteilungen aus der Geschäftsstelle SEPA-Lastschrifteinzug Mitgliedsbeitrag ó Der jährliche Beitrag gemäß Mitgliedsstatus wird in diesem Jahr am 17. April mit einer SEPA-Lastschrift von den uns bekannten Konten eingezogen. Um unnötige und teure Rücklastschriften zu vermeiden, bitten wir alle Mitglieder, Änderungen ihrer Bankverbindungen bis spätestens 5. April per Mail der Mitgliederverwaltung (mail@vaam.de) mitzuteilen. Ein gültiges Lastschriftmandat ist durch die Gläubigeridentifikationsnummer der VAAM (DE27ZZZ ) gekennzeichnet sowie die Mandatsreferenznummer, die identisch mit der Mitgliedsnummer plus der Endung -001 oder -002 ist.