Cell Biology Gravitational Biology

Transkript

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2 Biologie im Nebenfach Informationen für Nebenfächler-Informatik Dr. Peter Richter Department Biologie Lehrstuhl für Zellbiologie AG für Gravitationsbiologie Staudtstr. 5, Erlangen, Deutschland Tel Fax:

3 Informatik und Biologie Molekularbiologie (Lernfähige) Algorithmen für die Verwaltung und Auswertung astronomischer Datenmengen Vergleiche kompletter Genome Struktur- und Funktionsvorhersagen von Enzymen und anderen Biomolekülen Software auch für immer komplexere Analysehardware Simulation von Stoffwechselvorgängen bis hin zu gesamten Zellen

4 Sequence homolgy Sequence homology: 95% E-Value: 1e-52 Analogy AS: 58%

5 Von der mrna zum Protein atgccggccc tcacccagga acagatcaac gagttccgcg aggccttcac cctgttcgac aaggatgggg acgggtcaat cacgacgaag gagattggcg ccgtgatgcg ggccctgggc caaaacccga cggaggagga actccagaaa atcatcgagg aggtggacca ggatggcaac ggcatcatgg atttcgagga gttcctggcc ctgatgagca agaagatgca cgaggagtac gagcttgacg acatcgagga ggcgttccgc attttcgaca agaaccagga cggcttcatc tccttgccag aactgcgcct tgtaatcgac aagctcgggg agcgcatgcc agagtctgag atcaaagaca tgttcaacga ggtcgacctg gacaaggatg gcaagatcag cttccaggac ttcgccgcca tcctgaaggg ggcatgagtc gcgacccact gcttgccaca ccagcctgga gctcggctgt cccgaggccc cggggcatgt agcacgaccg caataaactt ttaatgcctt tctctgatcc caaaggaaag gtcgccctgc tttcccctgc ccaacctttt cgcacacctc atctctgttc acagccttac ccccaccgcc ctaatctttg cgacggtgcg tgtatcgcgc gaagagccct ttcttcccca ttctcgttca ccgtgctgtg ctgtgaccag tccggcggtg ctattggcca cggccggggg gctgtgggct acctccccgc ccactccccc tactgccgtg gccctctcgt cgtcggccgc acaggcgcgt gtgaaccccc ggggccaccg ccccacacgt cgcgggggcg cggtggctag ccccgccgcg gaccctcccc gaccccgacg cctctcactc tctggggatg gtctcgacgt ggcccgctta aaaaaaaaaa aaaaaaaa MPALTQEQINEFREAFTLFDKDGDGSITTKEIGAVMRALGQNPTEEELQKIIEEVDQD GNGIMDFEEFLALMSKKMHEEYELDDIEEAFRIFDKNQDGFISL 5

6 Strukturanalyse von Proteinen Euglena Trypanosoma

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8 GCTGCCGCAGCGGGAGGGCGTGGTGGCGGAGGGCGTCGCCGACGGA GAAGGGAAGAGGCTGCCGCAGCGGGAGGGCGTGGTGGCGGAGGGC GTCGCCGACGGAGAAGGGAAGAGGGTGGCGGAGGGCGTCGCCGACG GAGAAGGGAAGAGGCTGCCGCAGCGGGAGGGCGTGGTGGCGGAGGG CGTCGCCGACGGAGAAGGGAAGAGGCTGCCGCAGCGGGAGGGCGTG GTGGCGGAGGGCGTCGCCGACGGAGAAGGGAAGAGGGTGGCGGAGG GCGTCGCCGACGGAGAAGGGAAGAGGCTGCCGCAGCGGGAGGGCGT GGTGGCGGAGGGCGTCGCCGACGGAGAAGGGAAGAGGCTGCCGCAG CGGGAGGGCGTGGTGGCGGAGGGCGTCGCCGACGGAGAAGGGAAGA GGGTGGCGGAGGGCGTCGCCGACGGAGAAGGGAAGAGGCTGCCGCA GCGGGAGGGCGTGGTGGCGGAGGGCGTCGCCGACGGAGAAGGGAA GAGGGTGGCGGAGGGCGTCGCCGACGGAGAAGGGAAGAGATGGATA TCGAAAGTTAACGTCGCCGACGGAGAAGGTTATTGCTTCTCCTACTGG AAGAGATGATATCAACCTGAGCTGCCGCAGCGGGAGGGCGTATGGAG ATTAACGAAATGGGGGAGCACGAGATCATGGAATAAGCTGCCATGAAC GCCTGCCACCGCATCTGTCACACGTGAGCTGCCGCAGCGGGAGGGCG TGGTGGCGGAGGGCGTCGCCGACGGAGAAGGGAAGAGGCTGCCGCA GCGGGAGGGCGTGGTGGCGGAGGGCGTCGCCGACGGAGAAGGGAA GAGGGTGGCGGAGGGCGTCGCCGACGGAGAAGGGAAGAGGCTGCCG CAGCGGGAGGGCGTGGTGGCGGAGGGCGTCGCCGACGGAGAAGGGA AGAGGCTGCCGCAGCGGGAGGGCGTGGTGGCGGAGGGCGTCGCCGA CGGAGAAGGGAAGAGGGTGGCGGAGGGCGTCGCCGACGGAGAAGGG AAGAG Alanin, Ala, A (GCU, GCC, GCA, GCG) Asparaginsäure, Asp, D (GAU, GAC) Cystein, Cys, C (UGU, UGC) Aspartat (Asparaginsäure), Asp, D (GAU, GAC) Glutamat (Glutaminsäure), Glu, E (GAA, GAG) Phenylalanin, Phe, F (UUU, UUC) Glycin, Gly, G (GGU, GGC, GGA, GGG) Histidin, His, H (CAU, CAC) Isoleucin, Ile, I (AUU, AUC, AUA) Lysin, Lys, K,(AAA, AAG) Leucin, Leu, L (UUA, UUG, CUU, CUC, CUA, CUG) DIES IST EINE GEHEIME NACHRICHT Methionin, Met, M (AUG) Asparagin, Asn, N (AAU, AAC) Prolin, Pro, P (Iminosäure) (CCU, CCC, CCA, CCG) Glutamin, Gln, Q (GAA, GAG) Arginin, Arg, R (CGU, CGC, CGA, CGG, AGA, AGG) Serin, Ser, S (AGU, AGC, UCU UCC UCA UCG) Threonin, Thr, T (ACU, ACC,ACA, ACG) Valin, Val, V (GUU, GUC, GUA, GUG) Tryptophan, Trp, W (UGG) Tyrosin, Tyr, Y (UAU, UAC) STOPP: TAA, TAG, TGA Die Natur als Vorbild für Chiffrierung

9 Informatik und Biologie Ökologie z.b. Erstellen von Klimaprognosen und Folgen menschlicher Eingriffe 70 Meeresspiegeländerung [cm] Jahr

10 Analyse der Ausbreitung von Schädlingen Ausbreitung des gefährlichen Getreiderost Ug99 Verbreitung von Phelipanche spp. weltweit

11 Elektronik: µp-controlled operation and data sampling

12 Automatische Analyse von Genprodukten z.b. bei Weltraumexperimenten

13 Pflichtmodule: Ein Pflichtmodul ist ein Modul, welches verpflichtend erfolgreich abgeschlossen werden muss, um einen Studiengang abzuschließen. Generell sind dies vor allem grundlegende Module der ersten Semester, es gelten aber für jeden Studiengang eigene Bestimmungen Wahlpflichtmodule: Zusätzlich zu den Pflichtmodulen gibt es eine Reihe von Modulen, die zur Auswahl angeboten werden. Aus dieser Auswahl muss insgesamt eine bestimmte Anzahl belegt und erfolgreich abgeschlossen werden.

14 /studiensatzungen/techfak/fpo-ba- MA_Informatik.pdf

15 /recht/studiensatzungen/techfak/fpo-ba- MA_Informatik.pdf

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17 nebenfach/nebenfach.pdf Voraussetzungen nfaecher/nf-biologie.pdf 1) Die Vorlesung Biologie für Nebenfächler ist eine inhaltliche Voraussetzung für das erfolgreiche bestehen aller anderen Veranstaltungen im Nebenfach! 2) Inhaltliche Voraussetzung für das Teilmodul Anatomie und Morphologie der Organismen ist die Vorlesung Biologie für Nebenfachstudierende. 3) Modul Biologische Freilandübungen besteht aus beiden Teilleistungen und kann nicht geteilt werden. 4) Das Modul Zoologie besteht aus beiden Teilleistungen und kann nicht geteilt werden. 5) Das Modul Mikrobiologie kann geteilt werden. Die inhaltliche Voraussetzung für das Teilmodul Mikrobiologische Übungen ist die Vorlesung Biologie für Nebenfachstudierende. Die Vorlesung Allgemeine Mikrobiologie stellt eine Spezialisierung dar und kann zusätzlich belegt werden. 6) Das Modul Computational Biology erfordert Vorkenntnisse in Biochemie/ Thermodynamik und ist nur für Studierende der Informatik nach Absprache mit Prof. Dr. Böckmann.

18 studierende/nfaecher/nf-biologie.pdf Modulbeschreibungen PD. Dr. Michael Lebert:

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31 Vielen Dank!