Austrian Agency for Health and Food Safety
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- Uwe Thomas
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1 Austrian Agency for Health and Food Safety
2 Epidemiologie der Tuberkulose in Österreich für 2017 Lukas Richter, Sabine Pfeiffer, Daniela Schmid und Alexander Indra MED/Institut für medizinische Mikrobiologie und Hygiene Wien
3 Tuberkulose in Europa 2015
4 TB notifications, EU/EEA, TB cases notified in 30 EU/EEA countries Notification rate of 11.4 per population (range ) Cases per population < 5 5 to 9 10 to to Not reporting 4
5 Notified TB cases, EU/EEA, Continuous decline between 2007 and 2016: Number of TB cases decreased by 31% Notification rate decreased by 32% TB cases Year of reporting Source: ECDC/WHO (2018). Tuberculosis surveillance and monitoring in 20,0 18,0 16,0 14,0 12,0 10,0 8,0 6,0 4,0 2,0 0,0 TB cases/
6 Tuberkulose-Inzidenz nach Staatsangehörigkeit,
7 TB in persons of foreign origin, EU/EEA, TB cases were notified in persons originating from other countries than the reporting country 32.7% of all TB cases (range %) Proportion of cases < 1% 1 to 9.9% 10 to 49.9% 50 to 74.9% 75% Not reporting 7
8 TB cases in persons of foreign origin, EU/EEA, The percentage of cases in persons of foreign origin increased from 21.0% in 2007 to 32.7% in 2016 Rate per total population was stable between 3.4 and Percentage of foreign cases Rate per of total population 10,0 8,0 Percentage 10 6,0 4,0 2,0 Cases/ Year of reporting 0,0 Source: ECDC/WHO (2018). Tuberculosis surveillance and monitoring in 8
9 TB notification rate by age group, EU/EEA, Annual decrease by 2 4% in all age groups TB cases/ Year of reporting Source: ECDC/WHO (2018). Tuberculosis surveillance and monitoring in 9
10 TB in children under 15 years, EU/EEA, TB cases notified in children under 15 years 4.1% of all TB cases (range %) 3.0 per child population (range ) Cases per children < 1 1 to to to Not reporting Source: ECDC/WHO (2018). Tuberculosis surveillance and monitoring in 10
11 TB Fälle nach Staatsangehörigkeit und Altersgruppe 2016
12 TB Fälle nach Staatsangehörigkeit und Altersgruppe 2017
13 TB Inzidenz & Anzahl der Fälle
14 TB Inzidenz & Anzahl der Fälle Tuberkulosefälle im Jahr Tuberkulosefälle im Jahr Tuberkulosefälle im Jahr Tuberkulosefälle im Jahr 2016
15 TB Diagnose bei Asylsuchenden Zeit zwischen Einreise und TB-Diagnose
16 TB Diagnose bei Asylsuchenden Zeit zwischen Einreise und TB-Diagnose >70% im ersten Jahr
17 TB Diagnose bei Asylsuchenden Zeit zwischen Einreise und TB-Diagnose knapp 90% in den ersten 4 Jahren
18 Multidrug-resistant TB (MDR TB), EU/EEA, MDR TB cases notified in 30 EU/EEA countries 3.7% of all TB cases (range %) Proportion of cases < 1% 1 to 1.9% 2 to 4.9% 5 to 9.9% 10% Not reporting Source: ECDC/WHO (2018). Tuberculosis surveillance and monitoring in Europe data 18
19 Proportion of multidrug-resistant TB (MDR TB), EU/EEA, 2016* MDR TB cases notified in 30 EU/EEA countries 3.7% of all TB cases (range %) Lithuania Estonia Latvia Romania Hungary Norway Spain Greece Luxembourg Sweden EU/EEA Austria Finland Bulgaria Germany Slovakia Italy Ireland Cyprus Netherlands France Czech Republic Denmark Portugal United Kingdom Belgium Poland *Croatia, Iceland, Malta and Slovenia reported zero MDR TB cases for Source: ECDC/WHO (2018). Tuberculosis surveillance and monitoring in Percentage of MDR TB cases 19
20 MDR TB cases and percentages of all TB cases tested for drug resistance, EU/EEA, The total number of MDR TB cases decreased from in 2007 to in 2016 Proportion of MDR TB cases among all TB cases tested for drug resistance decreased from 5.2% in 2007 to 3.7% in , No of cases ,0 4,0 3,0 2,0 1,0 Percentage Year of reporting 0,0 Source: ECDC/WHO (2018). Tuberculosis surveillance and monitoring in 20
21 Extensively drug-resistant TB (XDR TB), EU/EEA, % of MDR TB cases with second line DST* results were extensively drug-resistant (range % and % for countries reporting more than five XDR TB cases) Proportion of MDR TB cases < 1% 1 to 9.9% 10 to 14.9% 15 to 24.9% 25% Not reporting * DST drug susceptibility test Source: ECDC/WHO (2018). Tuberculosis surveillance and monitoring in 21
22 Proportion of extensively drugresistant TB (XDR TB), EU/EEA, XDR TB cases notified in 14 EU/EEA countries* 20.1% of all MDR TB cases (range %) Hungary Portugal Latvia Romania Estonia Lithuania Poland EU/EEA Sweden Finland United Kingdom Italy Austria France Germany Percentage of XDR TB cases *Croatia, Iceland, Malta and Slovenia reported zero MDR TB cases and Belgium, Bulgaria, Cyprus, Czech Republic, Denmark, Ireland, Netherlands, Norway and Slovakia did not diagnose any XDR TB among MDR TB cases in
23 Pulmonary XDR TB cases and percentages of all tested, EU/EEA, * The total number of pulmonary XDR TB cases increased from 72 in 2009 to 185 in 2016 The proportion of pulmonary XDR TB cases among MDR TB increased from 10.7% in 2009 to 20.6% in ,0 No of cases Year of reporting 25,0 20,0 15,0 10,0 5,0 0,0 Percentage * Number of reporting countries increased from 12 in 2007 to 26 in 2016 Source: ECDC/WHO (2018). Tuberculosis surveillance and monitoring in 23
24 MDR/XDR TB Fälle
25 MDR/XDR TB Fälle MDR TB Gesamt Herkunftsland n n n n n Afghanistan Aserbaidschan Äthiopien Bangladesch Deutschland Georgien Irak Kongo, Demokr. Republik Litauen Marokko Mongolei Nicht bekannt Nigeria Österreich Rumänien Russische Föderation Serbien Slowakei Somalia Syrien Türkei Ukraine Usbekistan Gesamt (n) XDR TB Gesamt Herkunftsland n n n n n Georgien Rumänien Russische Föderation Ukraine Gesamt (n)
26 Tuberkulose in Österreich Anzahl Fälle
27 Treatment success, EU/EEA, % of all TB cases* had a successful treatment outcome after 12 months (range %) Proportion of treatment success < 60% 60 to 84.9% 85% Not reporting * Six EU/EEA countries did not report treatment outcome data 27
28 Treatment success as of 2016 in all TB cases notified in 2015, EU/EEA 71.5% of all TB cases had a successful treatment outcome after 12 months (range %) Iceland Norway Slovakia Netherlands Sweden Bulgaria Slovenia Romania Belgium United Kingdom Latvia Austria EU/EEA Portugal Hungary Estonia Czech Republic Lithuania Germany Cyprus Ireland Poland Denmark Finland Croatia Percentage of treatment success Source: ECDC/WHO (2018). Tuberculosis surveillance and monitoring in 28
29 Treatment success of all notified TB cases, , EU/EEA Proportion of successfully treated cases decreased from 75.5% in 2006 to 71.5% in 2015* Total number Total number of successfully treated cases Treatment success % 100% No of cases % 60% 40% 20% Percentage Year of reporting 0% * Number of countries reporting treatment outcome data increased from 22 in 2006 to 24 in 2015 Source: ECDC/WHO (2018). Tuberculosis surveillance and monitoring in 29
30 Treatment success as of 2016 in MDR TB cases notified in 2014*, EU/EEA 37.5% of all MDR TB cases notified in 2014 were successfully treated (range %) Proportion of treatment success < 40% 40 to 69.9% 70% Not reporting * Cyprus, Iceland and Slovenia reported zero MDR TB cases in 2014 Source: ECDC/WHO (2018). Tuberculosis surveillance and monitoring in 30
31 Treatment success in MDR TB*, EU/EEA, % of all MDR TB cases notified in 2013 were successfully treated (range %) Netherlands Belgium Austria Sweden Latvia Norway Estonia United Kingdom Portugal Denmark Bulgaria Germany Romania Hungary Lithuania Ireland Poland Slovakia EU/EEA Treatment success (%) Source: European Centre for Disease Prevention and Control/WHO Regional Office for Europe. Tuberculosis surveillance and monitoring in Europe 2017 * Croatia, Czech Republic, Iceland and Slovenia reported zero MDR TB cases in
32 Treatment success as of 2016 for MDR TB cases reported in 2014*, EU/EEA 37.5% of all MDR TB cases notified in 2014 were successfully treated (range %) Sweden Norway Latvia Netherlands Austria Estonia Belgium Portugal United Kingdom Ireland Denmark Bulgaria Czech Republic Romania Slovakia Germany Lithuania Croatia EU/EEA Percentage of treatment success * Cyprus, Iceland and Slovenia reported zero MDR TB cases in 2014 Source: ECDC/WHO (2018). Tuberculosis surveillance and monitoring in 32
33 Treatment outcomes of MDR TB cases notified in , EU/EEA, 2016 The treatment success rate has been stable between % 50% 40% 30% 20% 10% 0% Success Died Failed Defaulted or unknown MDR TB cohort 2011 MDR TB cohort 2012 MDR TB cohort 2013 MDR TB cohort 2014 Still on treatment Source: ECDC/WHO (2018). Tuberculosis surveillance and monitoring in 33
34 Treatment success in XDR TB cases, EU/EEA, % of the XDR TB cases notified in 2013 were treated successfully (range 0 100%)* United Kingdom Sweden Portugal Ireland Denmark Latvia Austria Estonia Lithuania Romania Poland Hungary Germany Bulgaria EU/EEA Percentage of treatment success * Belgium, Cyprus, Czech Republic, Netherlands, Slovenia and Slovakia reported zero XDR TB cases in Ten countries did not report second line drug susceptibility testing results or treatment outcome data for XDR TB cases. Source: ECDC/WHO (2018). Tuberculosis surveillance and monitoring in 34
35 Europaweite Ausbruchsabklärung 2016/2017
36 Next-Generation-Sequenzierung Im Einsatz zur TB Ausbruchsabklärung Sequenzierung aller österreichischen Tuberkulose Isolate Resistenztestung Ausbruchsabklärung Alle Daten werden den zuständigen Gesundheitsbehörden zur Verfügung gestellt
37 länderübergreifende Abklärung 25 Fällen multiresistenter Tuberkulose
38 länderübergreifende Abklärung Fälle von multiresistenter Tuberkulose zwischen Februar 2016 und und April 2017 Wurden 29 MDR Patienten in 7 europäischen Ländern identifiziert Deutschland, Schweiz, Finland, Österreich, Schweden und Frankreich und Großbritanien Alle waren von Horn von Afrika oder aus dem Sudan Alle zeigten Resistentz gegen INH, RIF, Ethambutol, Pyrazinamid und Capreomycin Alle zeigten den gleichen MIRU/VNTR Typ Mittels NGS waren alle Isolate maximal 5 SNPs getrennt
39 länderübergreifende Abklärung Fälle von multiresistenter Tuberkulose 2016 und 2017: Mehr als 800 Isolate sequenziert
40 länderübergreifende Abklärung Fälle von multiresistenter Tuberkulose
41 länderübergreifende Abklärung Fälle von multiresistenter Tuberkulose
42 länderübergreifende Abklärung Fälle von multiresistenter Tuberkulose
43 länderübergreifende Abklärung Fälle von multiresistenter Tuberkulose
44 länderübergreifende Abklärung Fälle von multiresistenter Tuberkulose
45 länderübergreifende Abklärung Fälle von multiresistenter Tuberkulose
46 Next-Generation-Sequenzierung: Ausbruchsabklärung Zur Erfüllung der gesetzlichen Aufgaben werden state of the art Technologien durch die AGES eingesetzt Alle TB-Isolate seit 2016 wurden durch die AGES sequenziert Österreich ist eines wenigen europäischen Ländern die derzeit schon Next-Generation-Sequenzierung routinemäßig benutzen Durch Einsatz von neuerster Technologien unterstützt die AGES die österreichischen Gesundheitsbehörden bei der Sicherstellung des erfolgreichen österreichischen Weges der Tuberkulosebekämpfung
47 Danke Die Nationale Referenzzentrale für Tuberkulose, AGES möchte sich bei allen Sanitätsbehörden und bei allen MitarbeiterInnen des Gesundheitssystems für deren Bemühungen bedanken, ohne die eine erfolgreiche Bekämpfung der Tuberkulose in Österreich nicht möglich wäre. Danke an alle Kolleginnen der AGES-IMED WIEN Abteilungen klinische Molekularbiologie, Mikrobiologie und Surveillance und Infektionsepidemiologie
48 PD. Dr. Mag. Alexander Indra Leiter: IMED Wien AGES Österreichische Agentur für Gesundheit und Ernährungssicherheit GmbH Währingerstraße 25a A-1090 Wien
49 WHOLE GENOME SEQUENCING: Anwendung in der Mikrobiologie Amplikon-Sequenzierung NGS-Datenanalyse z.b. Resistenztestung Vergleich verschiedener Bakterien gleicher Spezies Identifikation unbekannter Pathogenitätsfaktoren Identifikation unbekannter Erreger Suche nach mikrobiologischen Verursachern Beschreibung neuer Erreger Erkennung neuer Spezies durch Vergleich mit Sequenzen anderer Bakterien
50 NGS-Data-Analyse
51 NGS-Data-Analyse Spezies Identifikation Subtypen Ausbruchsabklärung? Genotypische Resistenz Sequenzdaten Nachweis bekannter Mutationen 1. Online Datenbanken Pathogenitätsfaktoren Virulenzgene
52 NGS-Data-Analyse
53 What is compared? Allel gegen Allel Vergleich Eine MLST/SBT mit hunderten/tausenden Genen Gen Varianten (Allele) werden gegeneinander verglichen Ein neues Allel wird unabhängig der Anzahl an Mutationen im Gen definiert Eine Kern Gruppe von Genen (core-genom) die bei allen Spezies vorkommt wird verglichen Nicht so dikrematative wie SNP und Genom vergleich Die Nomenklatur ist leicht zu vereinheitlichen Source: A. Indra,
54 Vergleich verschiedener Bakterien gleicher Spezies 54
Austrian Agency for Health and Food Safety
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