Lehrveranstaltungen im SS 2016. Info-Veranstaltung Mittwoch, den 27. Januar 2016 15.15 bis ca. 16.30 Uhr Vorlesungssaal der Informatik (03-428)

Lehrveranstaltungen im SS 2016 Info-Veranstaltung Mittwoch, den 27. Januar 2016 15.15 bis ca. 16.30 Uhr Vorlesungssaal der Informatik (03-428)

Veranstaltungsplan Informatik SS 2016 29.01.2016 Veranstaltung Typ BSc BEd MEd abi nwi Dozent / Lehrbeauftragter Tag Uhrzeit Raum Grundstudium 356 Propädeutik VL Schröder,H.-J. / N.N. Mi. 12.04.16/10-16 C03 010 Einf. i.d. Programmierung VL+Üb E. Schömer Mo. 14-16 N1 015 Einf. i.d. Softwareentwicklung VL+Üb A. Hildebrandt Di. 14-16 C01 030 Programmiersprachen VL+Üb A.Karwath Mi. 14-16 HS20 050 Berechenbarkeit u. formale Sprachen (TGI I) VL+Üb E. Althaus Mo. 12-14 HS16 Schwerpunkte (Wahlpflicht) 228 Datenbanken I VL+Üb S. Kramer Di. 14-16 03 428 286 Kommunikationsnetze VL+Üb L. Nagel Di. 12-14 03 428 555 Maschinelles Lernen VL+Üb S. Kramer Do. 14-16 03-428 557 Computergrafik und Animation VL+Üb A.v.Dziegielewski Di. 10-12 04-426 381 Strukturbasierte Bioinformatik VL+Üb A. Hildebrandt / M.Carnini Mo. 12-14 03-428 10056 Advanced Topics in Operating Systems VL+Üb A. Brinkmann Nach Vereinbarung 314 Modellierung I VL+Üb M. Wand Do 16-18 04-426 10059 Parallel Algorithms & Architectures VL+Üb Ch. Hundt / B. Schmidt Do. 12-14 04-426 423 Kryptographie und IT-Sicherheit VL+Üb E. Althaus Mo. 14-16 03-428 450 Fortgeschrittene Algorithmen VL+Üb E. Althaus Mi. 12-14 03-428 10070 Mobile Computing + Web Entwicklung VL+Üb C. Wille Do 8-10/10-12 04-426 293 Statistical Geometry Processing VL+Üb M.Wand Mo. 16-18 04-426 386 Verteilte Systeme VL+Üb T. Süß 204 Bildverarbeitung VL+Üb E. Schömer Mi. 14-16 04-426 10060 Design Pattern Vl+Üb S. Endler Mo. 10-12 04-426 Fachdidaktik - B.Ed. + M.Ed. 160 Fachdidaktik Sem. E.Messner 170 Informatik&Gesellschaft (B.Ed.) (HS) Sem. H.-J. Schröder 760 Projektpraktikum (M.Ed.) Prakt. E.Schömer / H.-J. Schröder Praktika 223 Computergrafik Prakt. A.v.Dziegielewski 210 Algorithmische Geometrie Prakt. A.v.Dziegielewski 101 Berufspraktikum Prakt. H.-J.Schröder 660 Vertiefungspraktikum Bioinformatik Prakt. AG Hildebrandt 600 Paralleles Programmieren mit CUDA Prakt. Ch. Hundt / B. Schmdit 04.04-15.04.16 04-220 644 Machine Understanding of Visual Data - PraktikumPrakt. M. Wand /Chuan Li 556 Data Mining Prakt. S. Kramer 625 APC: Strategies, Algorithms & Data Structures/FA Prakt. M. Blumenstock Di 16:15-19:00 04-426 Seminare 224 Computergrafik Sem. A.v.Dziegielewski 208 Algorithmische Geometrie Sem. A.v.Dziegielewski 590 Paralleles Rechnen Sem. Ch. Hundt / B. Schmidt 635 Data Mining Sem. S. Kramer 650 Vertiefungsseminar Bioinformatik Sem. A.Hildebrandt 570 Vertiefungsseminar Betriebssysteme Sem. A.Brinkmann 642 Machine Understanding of Visual Data - Seminar Sem. M. Wand /Chuan Li Mi 16-18 04-426 2000 Master Seminar Sem. alle Profs Nach Vereinbarung 690 Informationssysteme Sem. H.-J. Schröder Di 14-16 03-424 Master 802 Mathematik für Bioinformatiker (ANA) Tut. A.Malevich Mi. 10-12 05-136 0004 Einführungsveranstaltung für M.Sc. NaWi E. Althaus Mi/13.04.16/14-16 03-424 0005 Einführungsveranstaltung für M.Sc. Bioinf. Hildebrandt Mo/11.04.16/14-16 03-424 Legende: Pflichtveranstaltung Wahlpflichtveranstaltung

Veranstaltungsplan SS2016 Informatik Uhrzeit Montag Montag Dienstag Dienstag Mittwoch Donnerstag Freitag 8.00 Lineare Algebra I Ergänzungen zur Ergänzung zur Ana I Mobile Computing & Analysis I Linearen Algebra I Web-Entwicklung 9.00 Hog Angeloni F. Leinen Schneider C. Wille F. Leinen N1 03-428 03 428 04-426 S1 29.01.2016 10.00 Verteilte Systeme Design Pattern Computergrafik u. Mathe f. Bioinform. Mobile Computing & Animation Tutorium Web-Entwicklung 11.00 T. Süß S. Endler A.v.Dziegielewski M. Malevich C. Wille 04-426 04-426 04-426 05-136 Übung 04 426 12.00 Strukturbasierte Berechenbarkeit u. Analysis I Kommunikationsnetze Fortg. Algorithmen Parallel Alg. &Arch. Lineare Algebra I Bioinformatik formale Sprachen E. Althaus Ch. Hundt 13.00 A. Hildebrandt E.Althaus leinen L.Nagel Hog Angeloni 03 428 1./2. Sem. /HS 16 S1 03-428 03-428 04 426 N1 14.00 Einf. i.d. Kryptographie und IT Einf.i.d. Datenbanken I Programmiersprachen Bildverarbeitung Maschinelles Lernen Programmierung E. Althaus Softwareentwicklung S. Kramer E. Schömer S. Kramer 15.00 E. Schömer A.Hildebrandt A.Karwath 1. Sem. /N1 03-428 2.Sem. /CO1 03 428 HS20 04-426 03-428 16.00 Statist. Geo. Processing APC Praktikum MUoVD/Seminar Modellierung 1 17.00 M. Wand M. Blumenstock M.Wand/Chuan Li M. Wand 04 426 04-426 04-426 04 426 18.00 19.00 Bitte beachten Sie, dass in diesem Plan nicht alle Veranstaltungen, die im SS 2016 angeboten werden aufgelistet sind. Legende: Mathe-Pfl. Master Schwerpunkt Kernzeit (BEd) Mathe-WPfl. B.Ed. Wahlzeit 1 (BEd) Informatik-Pfl. M.Ed. Wahlzeit 2 (BEd) Informatik-WPfl. Informatik-Seminar Informatik-Praktikum

AG Prof. Dr. André Brinkmann Vorlesungen 27. Januar 2016 Johannes Gutenberg-Universität Mainz * Institut für Informatik

AG Prof. Dr. André Brinkmann Vertiefungsseminar Betriebssysteme Anmeldung direkt bei Prof. Brinkmann per E-Mail weitere Veranstaltungen aus der AG: Vorlesung: Dozent: Kommunikationsnetze Lars Nagel 27. Januar 2016 Johannes Gutenberg-Universität Mainz * Institut für Informatik

AG Softwaretechnik Vorlesung + Übung Dozent Web & Mobile Development Prof. Dr. C. Wille (Lehrauftrag) Inhalte: - Konzepte und technische Grundlagen von Webservern und Java basierter Webtechnologien - Konzeption und Entwicklung von Servlets /JSP / JSF - Rolle von Scriptsprachen wie Javascript im modernes Webdesign - Konzepte und Entwicklungsschritte mobiler Applikationen - Software Plattform Android und ihre Komponenten - GUI-Programmierung für mobile Endgeräte - Datenverwaltung und Content Provider - Datenzugriff über Asynchrone Task / Webservice mit SOAP und REST - Entwicklung von Anwendungen mit Sensoren und Ortsbezogenheit - Netzwerkprogrammierung für mobile Geräte Vorlesungen - Sicherheit webbasierter und mobiler Anwendungen - Plattformübergreifende Programmierung. Studiengang Termin B.Sc. / M.Ed. Do. 8-10 Uhr (V), Do. 10-12 Uhr (Ü) 27. Januar 2016 Johannes Gutenberg-Universität Mainz * Institut für Informatik

Mobile Computing Praktikum Praktikum Dozent/en Inhalte Web-Programmierung Prof. Dr. C. Wille(Lehrauftrag) Plattform für Tiergesundheit und Kollaboration Im Rahmen des Software Praktikums soll ein Prototyp für eine Plattform für Tiergesundheit und Kollaboration der Tierhalter entstehen. Zielstellungen: Aufbau einer Plattform zur Erfassung und Darstellung von Tiergesundheitsdaten Mischung aus Patients-like-me (Strukturierte Daten) und Facebook (unstrukturierte Daten) Erfassung und Pflege von Daten des Haustiers, wie Medikamente, Veterinärmediziner, Nebenwirkungen, Aktivität, Vitalparameter, Futter, Freizeit, Fotos, Berichte, Trainings, Sensorik Webseite für Browser Android App (und ios) Studiengang Termin B.Sc. 22. Februar - 4. März 2016 (ganztägig) 27. Januar 2016 Johannes Gutenberg-Universität Mainz * Institut für Informatik

Webentwicklung Praktikum Dozent/en Inhalte Studiengang Termin Web-Programmierung 27. Januar 2016 Johannes Gutenberg-Universität Mainz * Institut für Informatik Jens Grochtdreis (Lehrauftrag) Literatur: Das große Little Boxes-Buch (http://little-boxes.de/) In diesem Praktikum ergänzen sich theoretische und praktische Teile. Je nach Wissensstand der Teilnehmer werden wir die unterschiedlichen Facetten der Frontend-Entwicklung beleuchten. Denn egal welche komplizierten Probleme serverseitig und mit Datenbankprogrammierung gelöst werden: am Ende kommt HTML heraus, das mit CSS ansprechend und nutzbar gestaltet werden soll. Die Teilnehmer sollen sich idealerweise ein Projekt vornehmen, an dem sie am Ende des Praktikums das Gelernte austesten können. Dieses Projekt sollte sich im Wesentlichen mit HTML, CSS und Javascript realisieren lassen. Der Kurs baut Vorlesungen auf Vorkenntnissen der Teilnehmer über HTML und CSS auf. Es ist deshalb ratsam, dass jeder Teilnehmer das empfohlene "Little Boxes" liest bzw. sich mit Onlineangeboten wie "A beginner's guide to HTML & CSS (http://learn.shayhowe.com/html-css/) auf einen arbeitsfähigen Stand bringt. B.Sc. 29. März 8. April 2016 (ganztägig)

Webentwicklung - Praktikum HTML CSS Grundaufbau eines HTML- Dokumentes Semantik Formulare Tabellen Kaskade und Spezifität Layouts mit Floats und Positionierung Clearing/Clearfix elastisch,flexibel, pixelbasiert CSS3 Das DOM Das Boxmodell jquery Grundidee (unobtrusive JavaScript) Wie binde ich jquery ein? Einfache DOM-Manipulationen Browser Debuggen im Browser graceful degredation, progressive enhancement Performance Responsive Webdesign Zunahme der Devicetypen Ein Design für viele Devices Mediaqueries Stolpersteine unterschiedliche Layouttypen Navigationen anpassen Codereihenfolge Barrierefreiheit Sinn, Betroffene, Nutzniesser Mehr als "Web für Blinde" Barrierefreiheit und JavaScript Codequalität Barrierefreiheit testen 5 27. Januar 2016 Johannes Gutenberg-Universität Mainz * Institut für Informatik

IT-Sicherheit Vorlesung + Übung Kryptographie u. IT-Sicherheit Dozent Inhalte Studiengang Termin E. Althaus + N.N. (Lehrauftrag) Kryptographie (6 Termine) IT-Sicherheit (6 Termine): - Terminologie / klassische IT-Sicherheit - Zertifikate - Identifizierung / Authentifizierung - Firewalls - IPsec - TLS - Mail-Sicherheit Vorlesungen - B.Sc. / B.Ed. /M.Ed. Vorlesung: Mo. 14-16 Uhr 27. Januar 2016 Johannes Gutenberg-Universität Mainz * Institut für Informatik

Datenbanken Seminar Dozent Inhalte Studiengang Termin Informationssysteme Dr. H.-J. Schröder NoSQL Data Matching Security Engineering Sicherheitsmodell Authentifikation Digitale Identiät. B.Sc. / M.Ed. n.v. Vorlesungen 27. Januar 2016 Johannes Gutenberg-Universität Mainz * Institut für Informatik

Vorlesungen AG Computational Geometry 08.079.204 Bildverarbeitung Univ.-Prof. Dr. Elmar Schömer Mi, 20. Apr. 2016 [14:00] - Mi, 20. Jul. 2016 [16:00] 08.079.010 Einführung in die Programmierung Univ.-Prof. Dr. Elmar Schömer Mo, 18. Apr. 2016 [14:00] - Mo, 18. Jul. 2016 [16:00] 08.079.557 Computergrafik und Animation Andreas von Dziegielewski Di, 19. Apr. 2016 [10:00] - Di, 19. Jul. 2016 [12:00] Seminare+Praktika 8.079.208 Algorithmische Geometrie - Seminar 8.079.210 Algorithmische Geometrie - Praktikum 8.079.223 Computergrafik Praktikum 8.079.224 Computergrafik Seminar

Vorlesungen 08.079.204 Bildverarbeitung Univ.-Prof. Dr. Elmar Schömer Mi, 20. Apr. 2016 [14:00] - Mi, 20. Jul. 2016 [16:00] 08.079.010 Einführung in die Programmierung Univ.-Prof. Dr. Elmar Schömer Mo, 18. Apr. 2016 [14:00] - Mo, 18. Jul. 2016 [16:00] 08.079.557 Computergrafik und Animation Andreas von Dziegielewski Di, 19. Apr. 2016 [10:00] - Di, 19. Jul. 2016 [12:00] Seminare+Praktika AG Computational Geometry 8.079.208 Algorithmische Geometrie - Seminar 8.079.210 Algorithmische Geometrie - Praktikum 8.079.223 Computergrafik Praktikum 8.079.224 Computergrafik Seminar

08.079.204 Bildverarbeitung Univ.-Prof. Dr. Elmar Schömer Mi, 20. Apr. 2016 [14:00] - Mi, 20. Jul. 2016 [16:00]

Vorlesungen 08.079.204 Bildverarbeitung Univ.-Prof. Dr. Elmar Schömer Mi, 20. Apr. 2016 [14:00] - Mi, 20. Jul. 2016 [16:00] 08.079.010 Einführung in die Programmierung Univ.-Prof. Dr. Elmar Schömer Mo, 18. Apr. 2016 [14:00] - Mo, 18. Jul. 2016 [16:00] 08.079.557 Computergrafik und Animation Andreas von Dziegielewski Di, 19. Apr. 2016 [10:00] - Di, 19. Jul. 2016 [12:00] Seminare+Praktika AG Computational Geometry 8.079.208 Algorithmische Geometrie - Seminar 8.079.210 Algorithmische Geometrie - Praktikum 8.079.223 Computergrafik Praktikum 8.079.224 Computergrafik Seminar

08.079.557 Computergrafik und Animation Andreas von Dziegielewski Di, 19. Apr. 2016 [10:00] - Di, 19. Jul. 2016 [12:00]

Lehrangebot Visual Computing Sommersemester 2016

Modellierung I Modellierung 1: Lineare Modelle Lineare Algebra 101 Mit praktischen Anwendung Zusammenhänge im Rückblick

Modellierung I Lineare Modelle Repräsentationen Funktionenräume Finite Elemente Meshes, Gitter, Meshless Signaltheorie, Sampling Geometrische Modelle (3D) Automatisches Modellieren Least-Squares Variationsmethoden Dynamische Modelle (Animation, Simulation) Eigencats Fortsetzung: Modellierung II, WS16/17 Nicht-lineare Modelle (obviously )

Modellierung I Organisatorisches Format: V2+Ü2 Vorlesung: Do 16-18h Raum: 04 426 Dozent: Michael Wand Start: 21. 04. 2016 Zielgruppe:Fortg. Bachelor oder Master Michael Wand Vorkenntnisse: Programmieren (EiP, EiS), C++ hilfreich Mathematik (Analysis, Algebra) Computergraphik hilfreich

Statistical Geometry Processing Statistical Geometry Processing 3D Geometrie Gemessene Geometrie 3D Scanner (z.b. Kinect) Rekonstruktion aus Bildern Korrespondenzen Shape Matching Symmetrie Generative statistische Modelle Mustererkennung Maschinelles Lernen von 3D Geometrie Diskriminative Modelle (Semi-) automatische 3D Modellierung

Statistical Geometry Processing Organisatorisches Format: V2+Ü2 Vorlesung: Mo 16-18h Raum: 04 426 Dozent: Michael Wand Start: 18. 04. 2016 Zielgruppe:Fortg. Bachelor oder Master Michael Wand Vorkenntnisse Mathematik Grundvorlesungen Programmieren (EiP, EiS), C++ hilfreich Modellierung I oder Computer Graphik/Vision Modellierung II oder maschinelles Lernen / Data Mining empfohlen

Seminar + Praktikum [screenrant.com] [prostheticknowledge.tumblr.com] [Deeper] Machine Understanding of Visual Data Object recognition (2D Bilder, 3D Geometrie) Deep learning Generative Modelle (Neural Art / Bildsynthese)

Seminar Organisation Seminar: Semesterbegleitend Zeit/Raum: n.n. (tba) Dozenten: Chuan Li, Michael Wand Sprache: Englisch Teilnehmer: max. 15 Teilnehmer Chuan Li Vorkenntnisse Mathematik Grundvorlesungen Hilfreich: Maschinelles Lernen oder Data Mining oder Modellierung II oder Computer Vision

Praktikum Organisation Seminar: Semesterferien (Sommer) Zeit/Raum: n.n. (tba) Dozenten: Chuan Li, Michael Wand Sprache: Englisch Teilnehmer: max. 15 Teilnehmer Chuan Li Vorkenntnisse Seminarteilname ist verpflichtend Programmierkenntnisse ( EiP/EiS) C++ oder Python/SciPy hilfreich

Parallele und Verteilte Architekturen Lehrangebot: SS 2015 Vorlesungen Parallele Algorithmen & Architekturen (PAA) Praktikum Paralleles Programmieren mit CUDA Seminar Paralleles Rechnen Prof. Bertil Schmidt

Vorlesung: Parallel Algorithms & Architectures (PAA) Architekturen GPUs und GPU-Cluster PRAM CPUs Programmierung CUDA OpenACC MPI Algorithmen Matrix Multiplikation Sortieren Reduktion SpMV Convolution K-Means Clustering Multi-core CPUs Manycores GPUs Supercomputers

CUDA Block-Praktikum Paralleles Programmieren mit CUDA 4.4. 15.4.2016

Seminarvorbesprechung: Paralleles Rechnen Prof. Bertil Schmidt

Scheinkriterien und Organisation Vortrag von ca. 45min (inklusive Q&A) Termin: wird noch bekanntgegeben (zwei Vorträge pro Termin) Abgabe der Vortragsfolien zwei Wochen vor dem Vortrag einzureichen per Email Danach persönliche Vorbesprechung mit Professor Schmidt (1-2 Wochen vor dem Vortrag) Abgabe einer ausführlichen Ausarbeitung (Deutsch oder Englisch) als Basis für die Bewertung des schriftlichen Teils. Ausarbeitung im IEEE CS Format (Umfang mindestens 6 Seiten) - Abgabe bis spätestens vier Wochen nach dem Vortrag! Teilnahme am Seminar (Anwesenheitspflicht) Praktische Tipps im Merkblatt für Seminare http://www1.informatik.uni-mainz.de/lehre/we/seminar- Arbeitsempfehlungen.pdf

Seminar: Paralleles Rechnen Themen 1. Association Rule Mining with the Micron Automata Processor 2. Parallel Distributed Memory Construction of Suffix Arrays 3. Big Data Clustering at Trillion Particle Scale 4. Deep learning with COTS HPC systems 5. PyCUDA and PyOpenCL 6. Breadth-First Graph Traversal on GPUs 7. Correlation Matrix Analysis of fmri Data on Xeon Phi 8. High-performance Graph Analytics on Manycore Processors 9. Julia: A fresh approach to parallel programming 10. Selber vorgeschlagenes Thema muss aber von mir genehmigt werden

Themenvergabe Email mit 2 bevorzugten Themen (mit Präferenz) an Prof Schmidt bis 04.02.2016 Ich werde dann versuchen die Themen an Studenten zuzuordnen Neue Themen können auch vorgeschlagen werden (müssen dann aber von mir genehmigt werden)

Institut für Informatik Design Patterns SoSe 2016 Dr. Stefan Endler endler@uni-mainz.de Johannes Gutenberg-Universität Mainz Vorlesung: Montags 10-12, Raum 04-426

Design Patterns Auswahl an Patterns Abbildung : Singleton Abbildung : Strategy Abbildung : Composite Abbildung : Abstract Factory Vorlesung: Montags 10-12, Raum 04-426 Johannes Gutenberg-Universität Mainz S. Endler 2

Design Patterns Erarbeitung anhand Real-Life Beispielen Vorlesung: Montags 10-12, Raum 04-426 Johannes Gutenberg-Universität Mainz S. Endler 3

Design Patterns Erarbeitung anhand Real-Life Beispielen Vorlesung: Montags 10-12, Raum 04-426 Johannes Gutenberg-Universita t Mainz S. Endler 3

Lehrveranstaltungen der theoretischen Informatik Theoretische Informatik: Formale Sprachen und Berechenbarkeit Fortgeschrittene Algorithmen Kryptographie Praktikum: APC Markus Blumenstock Achtung: wohl kein Seminar dieses Semester

Vorlesung: Komplexitätstheorie (TGI) Formale Sprachen: Chomsky-Hierarchie Reguläre Sprachen Kontextfreie Sprachen Berechenbarkeit: Berechnungsmodelle Unentscheidbarkeit Reduktionen Satz von Gödel Weitere Themen: Je nach Zeit Hoffentlich noch einige

Vorlesung: Fortgeschrittene Algorithmen Lineare und ganzzahlig lineare Programmierung, Optimierungsmethoden, Randomisierte Algorithmen, Approximationsalgorithmen, Online-Algorithmen, Sekundärspeicheralgorithmen, Parametrisierte Algorithmen Quantenalgorithmen 26. Januar 2016 Johannes Gutenberg-Universität Mainz 3

Kryptographie und IT-Sicherheit Kryptographie: Formale Grundlagen der Kryptographie Symmetrische Verschlüsselung Asymmetrische Verschlüsselung Message-Authentification-Codes und digitale Signaturen IT-Sicherheit: Über einen Lehrauftrag Termin und Inhalte noch nicht fixiert 26. Januar 2016 Johannes Gutenberg-Universität Mainz 4

Approaching Programming Contests Praktikum im Sommersemester 2016 Markus Blumenstock Arbeitsgruppe Algorithmik 27. Januar 2016

Scheinkriterien Inhalt Contests! Approaching Programming Contests (Praktikum) Das Praktikum ist semesterbegleitend geplant Möglicher Termin: Dienstag 16:15-19:00 Uhr Betreuung: Markus Blumenstock Vorausgesetzte Kenntnisse: Einführung in die Programmierung Datenstrukturen und effiziente Algorithmen Kriterien zum Scheinerwerb: Regelmäßige Teilnahme Teilnahme am German Collegiate Programming Contest 2016 (Samstag, 04. Juni, 12-17 Uhr, in Mainz) Althaus et al. Arbeitsgruppe Algorithmik 27. Januar 2016 1/6

Scheinkriterien Inhalt Contests! Inhalt Lösen von Problemen, wie sie typischerweise in Programmierwettbewerben auftreten Algorithmen und Prinzipien, die häufig verwendet werden, sind u.a. Breitensuche/Tiefensuche Berechnen von minimalen Spannbäumen Berechnen von maximalen Flüssen Dynamische Programmierung Divide-And-Conquer-Verfahren Zahlentheoretische Algorithmen Einsetzbare Programmiersprachen sind Java, C++, evtl. Python Althaus et al. Arbeitsgruppe Algorithmik 27. Januar 2016 2/6

Scheinkriterien Inhalt Contests! NWERC 2015 in Linköping, Schweden Althaus et al. Arbeitsgruppe Algorithmik 27. Januar 2016 3/6

Scheinkriterien Inhalt Contests! NWERC 2015 in Linköping, Schweden Die beiden Mainzer Teams erreichten 2015 die Plätze 43 und 81 bei 95 antretenden Teams aus Nordwesteuropa. Wer will 2016 in Bath, UK eine echte Medaille nach Mainz holen? Althaus et al. Arbeitsgruppe Algorithmik 27. Januar 2016 6/6

Arbeitsgruppe Scientific Computing and Bioinformatics Prof. Dr. Andreas Hildebrandt Sommersemester 2016

Vorlesung Strukturbasierte Bioinformatik Termin: Montags, 12 14 Uhr Sprache: Englisch Inhalt: Grundlegende Begriffe der Bioinformatik Einführung in die Proteinphysik Simulation von Molekülbewegungen Proteinstrukturminimierung Docking und Wirkstoffdesign Werkzeuge: C++, Biochemical Algorithm Library (BALL)

Seminar Vertiefungsseminar Bioinformatik Termin: In Absprache mit den Teilnehmern Sprache: Englisch Scheinkriterien: 30 Minuten Vortrag 15 Minuten Diskussion Schriftliche Ausarbeitung (L ATEX) Themenbereiche (Auswahl): Proteinstrukturaufklärung Maschinelle Lernverfahren in der Bioinformatik Molekülbewegungen Docking Wirkstoffdesign

Praktikum Vertiefungspraktikum Bioinformatik Dauer: 2 Wochen, ganztägig Termin: WiSe 15/16: 7.3. 18.3.2016 SoSe 16: In Absprache mit den Teilnehmern Sprache: Englisch Aufbau: 1. Woche: Crashkurs C++ 2. Woche: BALL-Einführung Sollte idealerweise vor der Vorlesung Strukturbasierte Bioinformatik belegt werden!

Machine Learning Vorlesung Donnerstags 14 16 Uhr (?) Material auf Englisch Übung Zeit: TBA Live Übungen Prüfung mündlich oder schriftlich

Machine Learning Lernen = sich durch Erfahrungbei einer Aufgabeverbessern Aufgabe (performance task) T hinsichtlich eines Performancemaßes (performance measure) P beruhend auf Erfahrung E. Lernendes System Performance Task / Performance Measure Umgebung

Machine Learning Course Overview Decision trees Ensemble methods Bayesian learning Linear models Neural networks Instance-based learning SVMs and kernels

Machine Learning Course Overview Decision trees Ensemble methods Bayesian learning Linear models Neural networks Instance-based learning SVMs and kernels Hyperplane misclassified vectors Margin

Data Mining Praktikum Ablauf 3er Gruppen ein Datensatz pro Gruppe Daten analysieren wöchentliche Treffen

Data Mining Seminar Ablauf Thema aus dem Bereich Data Mining und Machine Learning ein Vortrag pro Woche nach jeder Präsentation Diskussion und Feedback Ausarbeitung Feedback zum Schreiben am Ende des Semesters