Installation von ProMoT/DIANA Nicolas Fähnrich Verwendetes System: Ubuntu 12.10 (64 bit) ProMoT http://promottrac.mpi-magdeburg.mpg.de/dist/promot-v-0-8-5/linux/promot-v-0-8-5- plusdeps.tar.bz2 sudo su apt-get install ia32-libs cd / tar xvjf [Pfad zur Installationsdatei]/promot-v-0-8-5-plusdeps.tar.bz2 gedit /home/[username]/.bashrc Zeile am Ende hinzufügen: export PATH=/usr/local/promot/bin:$PATH Speichern, schließen exit DIANA http://promottrac.mpi-magdeburg.mpg.de/dist/diana-v-0-8-3/diana-0.8.3.tar.gz sudo su Diverse Softwarepakete und Bibliotheken müssen installiert werden, bevor Diana kompiliert werden kann. apt-get install autoconf apt-get install auto apt-get install gcc apt-get install g++ apt-get install gfortran
apt-get install libblas-dev apt-get install liblapack-dev apt-get install libatlas-dev apt-get install python-dev apt-get install python-numpy apt-get install python-matplotlib apt-get install scons apt-get install libxerces-c2-dev apt-get install libxerces-c28 Für die Quelldateien der weiteren Komponenten wird ein Verzeichnis diana/src angelegt: cd /usr/local mkdir -p diana/src cd diana/src 1) Cantera 2.0.0 http://code.google.com/p/cantera/ tar xvzf Pfad zur Installationsdatei]/cantera-2.0.0.tar.gz cd cantera-2.0.0 scons build scons install 2) SWIG 1.3.40: http://sourceforge.net/projects/swig {Version 2.x.x funktioniert nicht!} tar xvzf [Pfad zur Installationsdatei]/swig-1.3.40.tar.gz cd swig-1.3.40./autogen.sh./configure
install 3) SuiteSparse 3.7.1: http://www.cise.ufl.edu/research/sparse/suitesparse {Version 4.x.x funktioniert nicht!} tar xvzf [Pfad zur Installationsdatei]/SuiteSparse-3.7.1.tar.gz cd SuiteSparse/ install 4) SUNDIALS 2.5.0: http://acts.nersc.gov/sundials tar xvzf [Pfad zur Installationsdatei]/sundials-2.5.0.tar.gz cd sundials-2.5.0./configure --with-cflags=-fpic --with-cxxflags=-fpic install 5) ARPACK 0.92.1: http://mathema.tician.de/software/arpack tar xvzf [Pfad zur Installationsdatei]/arpack-0.92.1.tar.gz cd arpack-0.92.1./configure
install 6) CppUnit 1.12.1: http://sourceforge.net/apps/mediawiki/cppunit tar xvzf [Pfad zur Installationsdatei]/cppunit-1.12.1.tar.gz cd cppunit-1.12.1./configure LDFLAGS=-ldl install 7) DIANA 0.8.3: http://promottrac.mpi-magdeburg.mpg.de/dist/diana-v-0-8-3/diana-0.8.3.tar.gz tar xvzf [Pfad zur Installationsdatei]/diana-0.8.3.tar.gz cd diana-0.8.3 gedit include/basic/dianasparsearray.hpp Folgende Zeilen bei den anderen #include Befehlen hinzufügen: #include <stddef.h> #include <unistd.h> Speichern, schließen./config/bootstrap./configure --prefix=/usr/local/diana --with-ufsparse=/usr/local --with-arpack=/usr/local/lib --with-blas=/usr/local/lib --with-lapack=/usr/local/lib --with-sundials=/usr/local --with-cppunit-prefix=/usr/local --with-xerces=/usr/local --with-swig=/usr/local --with-mdl2diana=/usr/local/bin
install gedit /home/[username]/.bashrc Zeile am Ende hinzufügen: export PATH=/usr/local/diana/bin:$PATH Speichern, schließen exit Wenn die Kompilierung nicht möglich ist liegt der Fehler meist bei einer fehlerhaften Installation eines notwendigen Pakets. Anhand des Konfigurationsskripts lässt sich der Fehler eingrenzen. Wenn das Skript alle Pakete gefunden hat sieht die Ausgabe wie folgt aus: Required packages SWIG = /usr/local/bin/swig -c++ SWIG_LIB = /usr/local/share/swig/1.3.40 SWIG_PYTHON_CPPFLAGS = -I/usr/local/include/python2.7 SWIG_PYTHON_OPT = -python SWIG_RUNTIME_LIBS = Python = /usr/bin/python PYTHON_VERSION = 2.7 PYTHON_PLATFORM = linux2 PYTHON_CPPFLAGS = -I/usr/local/include/python2.7 PYTHON_LDFLAGS = -L/usr/lib/python2.7/config/ Xerces XERCES_CPPFLAGS = -I/usr/local/include XERCES_LDFLAGS = -L/usr/local/lib XERCES_LIBS = -lxerces-c Umfpack UMFPACK_CPPFLAGS = -I/usr/local/UMFPACK/Include - I/usr/local/AMD/Include -I/usr/local/UFconfig -I/usr/local/UFconfig UMFPACK_LIBS = -L/usr/local/UMFPACK/Lib -lumfpack - L/usr/local/AMD/Lib -lamd BLAS BLAS_CPPFLAGS = BLAS_LIBS = -lblas Lapack LAPACK_LIBS = -llapack Sundials SUNDIALS_CPPFLAGS = -I/usr/local/include SUNDIALS_LDFLAGS = -L/usr/local/lib SUNDIALS_LIBS = -lsundials_nvecserial IDA_CPPFLAGS = IDA_LDFLAGS = IDA_LIBS = -lsundials_ida Optional packages
Matlab is not available. Cholmod CHOLMOD_CPPFLAGS = -I/usr/local/CHOLMOD/Include - I/usr/local/UFconfig CHOLMOD_LIBS = -L/usr/local/CHOLMOD/Lib -lcholmod - L/usr/local/CCOLAMD -lccolamd -L/usr/local/COLAMD -lcolamd - L/usr/local/AMD/Lib -lamd Cppunit CPPUNIT_CPPFLAGS = -I/usr/local/include CPPUNIT_LIBS = -L/usr/local/lib -lcppunit -ldl Metis is not available. OmniOrb is not available. Ipopt is not available. NOMAD is not available. CONDOR is not available.