Medline-Suche mit PubMed

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1 Medline-Suche mit PubMed Fast Food oder Eigenproduktion AGMB-Tagung September 2004, Mannheim Edith Motschall Institut für Medizinische Biometrie und Medizinische Informatik Stefan-Meier-Str. 26, Freiburg i.br., Tel 0761/ , Aufwand abhängig v. Anspruch Ziel? -an Zeit - an Kenntnissen wieviel: Auswahl oder alles? - wofür: Überblick, syst. Review schnell und gut?

2 Retrievalbias: Das Dilemma zwischen Genauigkeit und Vollständigkeit nicht gefunden gefunden nicht relevant relevant Genauigkeit Vollständigkeit Precision = gefundene relevante Zitate alle gefundenen Zitate gefundene relevante Zitate Recall = in Datenbank vorhandene relevante Zitate Specificity = nicht gefundene nicht relevante Zitate alle nicht relevanten Zitate in der Datenbank Automatic Term Mapping bei Medline mit PubMed: Vorteil: schnell und einfach. Nachteil: interne Strategie nicht immer optimal im Hinblick auf Precision und Recall Ergebnis: 160 Zitate am

3 Textword: Möglichkeit der Truncation : Wortstamm und variable Endung: random* MeSH/subheading * Hauptaspekt des Artikels MeSH = Medical Subject Headings Thesaurus (kontrolliertes Vokabular), erstellt von der National Library of Medicine (NLM) - ca Begriffe (mit Verweisen und Synonymen) - polyhierarchische Struktur ( Tree structure) Anzeige und Suche mit der MeSH-Database (bei PubMed)

4 Limits (weitere Eingrenzungsmöglichkeiten): History (Suchstrategie in PubMed) ohne Premedline-Artikel, da Suche mit MeSH und Publication Type) Zutaten selber wählen: -MeSH - Limits -Journal Database etc. (z.b. Textword) am OR AND NOT Einzelne Suchschritte kombinieren mit

5 Formulierung einer Frage zerlegen im PICO-Format: P I C O Patients, population Intervention/Faktor (Exposure) Comparison (Vergleich, Kontrolle, Studiendesign) Outcome (Zielgröße) Nicht alle Komponenten erforderlich je nach Anzahl der Treffer bei den einzelnen Komponenten (z.b. P+I, I+C ) Medline via Ergebnis: 24 Zitate am

6 findet nicht randomised. In Premedline nur Freitextsuche! Filter table:

7 Clinical Queries Diagnosis sensitiv search filter Haynes et al, BMJ 2004: sensitiv*[title/abstract] OR sensitivity and specificity[mesh Terms] OR diagnos*[title/abstract] OR diagnosis[mesh:noexp] OR diagnostic * [MeSH:noexp] OR diagnosis,differential[mesh:noexp] OR diagnosis[subheading:noexp] Details: MeSH-Begriffe mit/ohne subheadings: diagnostic equipment diagnostic errors diagnostic imaging diagnostic services Details: Trunkierung bei "diagnostic * [MeSH:noexp]" schließt z.b. nicht "Diagnostic Techniques and Procedures" oder Unterbegriffe wie z.b. "Diagnostic Techniques, Cardiovascular mit ein. Vermutung: Die Trunkierung funktioniert nicht bei zusammengesetzten MeSH-Begriffen, in denen ein Komma oder ein "and" vorkommt. Response: Clinical Queries Etiology sensitiv search filter risk*[title/abstract] OR risk*[mesh:noexp] OR risk *[MeSH:noexp] OR cohort studies[mesh Terms] OR group*[text Word] Details: risk[mesh:noexp] [MeSH:noexp] mit/ohne subheadings risk adjustment risk assessment risk factors risk management risk taking Alternative: Suche mit MeSH-Database (explode function): risk[mesh] Risk Logistic Models Risk Assessment Risk Adjustment Risk Factors

8 Interne Strategie des Subsets systematic[sb]: *wird NICHTals wildcard innerhalb von Hochkommas erkannt und somit fälschlicherweise ignoriert (("systematic review*" OR "systematic literature review*" OR meta-analysis [pt] OR meta-analysis [ti] OR metaanalysis [ti] OR meta-analyses [ti] OR evidence-based medicine OR (evidence-based AND (guideline [tw] OR guidelines [tw] OR recommendations)) OR (evidenced-based AND (guideline [tw] OR guidelines [tw] OR recommendation*)) OR consensus development conference [pt] OR health planning guidelines OR guideline[pt] OR cochrane database syst rev OR acp journal club OR health technol assess OR evid rep technol assess summ OR evid based nurs OR evid based ment health OR clin evid) OR ((systematic [tw] OR systematically OR critical [tw] OR (study [tiab] AND selection [tiab]) OR (predetermined OR inclusion AND criteri* [tw]) OR exclusion criteri* OR "main outcome measures" OR "standard of care") AND (survey [tw] OR surveys [tw] OR overview* OR review [tw] OR reviews OR search* OR handsearch OR analysis [tw] OR critique [tw] OR appraisal OR (reduction AND risk AND (death OR recurrence))) AND (literature [tw] OR articles OR publications [tw] OR publication [tw] OR bibliography [tw] OR bibliographies OR published OR unpublished OR citation OR citations OR database OR internet [tw] OR textbooks [tw] OR references OR trials OR meta-analysis [mh] OR (clinical [tw] AND studies) OR treatment outcome)) NOT (case report [ti] OR case report [mh] OR editorial [ti] OR editorial [pt] OR letter [pt] OR newspaper article [pt])) Zum Abspeichern mit Cubby-Link bei One-line Strategien für (randomized) controlled trials (PubMed) Source: Karen A Robinson and Kay Dickersin Development of a highly sensitive search strategy for the retrieval of reports of controlled trials using PubMed. Int. J. Epidemiol : (teilweise modifiziert: [tiab] anstatt [tw], spätere Trunkierung von control* wegen der Warnmeldung ) Hohe Precision (nur MeSH-Terms and Publication Type, Artikel in Premedline werden hiermit nicht gefunden ) (randomized controlled trial[pt] OR controlled clinical trial[pt] OR randomized controlled trials[mh] OR random allocation[mh] OR single-blind method[mh] OR double-blind method[mh]) NOT (animal[mh] NOT human[mh]) Mittlere Precision Recall (randomized controlled trial[pt] OR controlled clinical trial[pt] OR randomized controlled trials[mh] OR random allocation[mh] OR single-blind method[mh] OR double-blind method[mh] OR clinical trial[pt] OR clinical trials[mh] OR clinical trial*[tiab] OR ((singl*[tiab] OR doubl*[tiab] OR trebl*[tiab] OR tripl*[tiab]) AND (mask*[tiab] OR blind*[tiab])) OR latin square*[tiab] OR placebos[mh] OR placebo*[tiab] OR random*[tiab] OR research design[mh:noexp]) NOT (animal[mh] NOT human[mh]) Hoher Recall (randomized controlled trial[pt] OR controlled clinical trial[pt] OR randomized controlled trials[mh] OR random allocation[mh] OR single-blind method[mh] OR double-blind method[mh] OR clinical trial[pt] OR clinical trials[mh] OR clinical trial*[tiab] OR ((singl*[tiab] OR doubl*[tiab] OR trebl*[tiab] OR tripl*[tiab]) AND (mask*[tiab] OR blind*[tiab])) OR latin square*[tiab] OR placebos[mh] OR placebo*[tiab] OR random*[tiab] OR research design[mh:noexp] OR comparative study[mh] OR evaluation studies[mh] OR follow-up studies[mh] OR prospective studies[mh] OR cross-over studies[mh] OR control[tiab] OR controls[tiab] OR controll*[tiab] OR controle*[tiab] OR prospectiv*[tiab] OR volunteer*[tiab]) NOT (animal[mh] NOT human[mh])

9 Medline-Suchfilter für klinische Fragestellungen (Syntax von PubMed) Ziel: Auswahl einiger relevanter Artikel, nicht Vollständigkeit Systematische Übersichtsarbeiten, Meta-Analysen: Cochrane database syst rev Meta-analysis[pt] systematic*[tw] AND (review[pt] OR review*[tw]) Therapie: Randomized controlled trial[pt] Diagnose: Sensitivity and specificity[mh] Automatische Explode-Funktion umfasst auch: Predictive Value of Tests ROC Curve Ätiologie, Risikofaktoren: Risk[mh] Automatische Explode-Funktion umfasst auch: Logistic Models Risk Assessment Risk Adjustment Risk Factors Cohort studies[mh] umfasst auch Longitudinal Studies, Follow-Up Studies, Prospective Studies Case control studies[mh] umfasst auch: Retrospective studies Cohort Studies[mh] Automatische Explode-Funktion umfasst auch Follow-Up Studies Longitudinal Studies Prospective Studies Prognosis [mh] Automatische Explode-Funktion umfasst auch: Disease-Free Survival Medical Futility Pregnancy Outcome Treatment Outcome Treatment Failure Mortality Automatische Explode-Funktion umfasst auch: Cause of Death Fatal Outcome Hospital Mortality Infant Mortality Maternal Mortality Survival Rate Disease progression[mh] Mortality[sh] Prognose: Leitlinien: Practice guideline[pt] Abkürzungen: [mh] = MeSH, [pt] = publication type, [tw]= Textword, [sh] = subheading Hilfreiche Links: Medline Search strategies ADEPT : Applying Diagnosis, (a)etiology, Prognosis & Therapy methodological filters to retrieving the evidence Search Strategies to Identify Systematic Reviews and Meta-analyses Methodological filters Oxford Centre for Evidence-Based Medicine ( Search filters: Links of tutorials: McKibbon A, Marks E: PDQ Evidence-Based Principles and Practice. B.C. Decker, London 1999 (incl. CD-ROM).

10 Warum nicht Google? Google Schnell und einfach großes Angebot, unübersichtliche Menge Keine unabhängige Bewertung u. Qualitätskontrolle Von wem stammt die Information? Wirtschaftliche Interessen? Ranking nach Häufigkeit der Aufrufe Ranking kann manipuliert werden wenig Variationsmöglichkeit gut für Suche nach Institutionen, Namen, Tagungen evtl. Graue Literatur? Datenbanken/Journals mit Qualitätsfilter z.b. DARE, ACP-Journal Club, Cochrane Library, Clinical Evidence Datenbanken mit speziellen Suchfunktionen z.b. Medline: zur Optimierung und Variation von Precision und Recall Fastfood oder Eigenproduktion? Für den Einstieg und als erste Orientierung: Zutaten selber wählen: -MeSH -Textword - Limits etc. Kochbücher : siehe auch Punkt Literatursuche in der Evidence-Based Medicine Dieser Vortrag: