Bezeichnung Sequenz Verwendung
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- Jasmin Matilde Diefenbach
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1 8 ANHANG i 8 ANHANG I Oligonukleotide Bezeichnung Sequenz Verwendung D ATGGCAGACGGTGAGGATATTCA-3 5 Aktin AC1 (neu) D GCCTTTGCAATCCACATCTGTTG-3 3 Aktin AC2 (neu) D98 5 -AT CC ATG GCA ATG TCA ATG GTG GTG TAC AAC-3 5 -MP17, AtSUC2-Prom. (NcoI) D C CAT GGC TCC GCG CTT GAT AAG TTT TGG-3 3 -MP17, AtSUC2-Prom. (NcoI) D GGA TCC TGT GCT TTA TTC TTT AGA AAC AAA AAA TAA-3` 3 -Tprom (BamHI) D GTC GAC GTT GAT GTT AAT ACA CGT TTC ACA ACT GAG-3 5 -Tprom_DL(-1645 (SalI) D AT GAG CTC TTA TTT GTA TAG TTC ATC CAT GC-3 3 -GFP f. TP -Fusion (SacI) D AT GGA TCC TCC GCG CTT GAT AAG TTT TGG-3 3 -MP17 f. TP -GUS (BamHI) KK8 5 -AGG TTT TAT TGC TTT TCA CA-3 5 ciw12, Chr. I, Genomk. KK9 5 -CTT TCA AAA GCA CAT CAC A -3 3 ciw12, Chr. I, Genomk. KK10 5 -TGT TTT TTA GGA CAA ATG GCG -3 5 nga111, Chr. I, Genomk. KK11 5 -CTC CAG TTG GAA GCT AAA GGG-3 3 nga111, Chr. I, Genomk. KK12 5 -CCC AAA AGT TAA TTA TAC TGT -3 5 ciw2, Chr. II, Genomk. KK13 5 -CCG GGT TAA TAA TAA ATG T-3 3 ciw2, Chr. II, Genomk. KK14 5 -GCA CAG TCC AAG TCA CAA CC-3 5 nga1126, Chr. II, Genomk. KK15 5 -CGC TAC GCT TTT CGG TAA AG-3 3 nga1126, Chr. II, Genomk. KK16 5 -CTC TGT CAC TCT TTT CCT CTG G-3 5 nga162, Chr. III, Genomk. KK17 5 -CAT GCA ATT TGC ATC TGA GG-3 3 nga162, Chr. III, Genomk. KK18 5 -ATG GAG AAG CTT ACA CTG ATC-3 5 nga6, Chr. III, Genomk. KK19 5 -TGG ATT TCT TCC TCT CTT CAC-3 3 nga6, Chr. III, Genomk. KK20 5 -GGT TAA AAA TTA GGG TTA CGA-3 5 ciw5, Chr. IV, Genomk. KK21 5 -AGA TTTACG TGG AAG CAA T-3 3 ciw5, Chr. IV, Genomk. KK22 5 -AAT TTG GAG ATT AGC TGG AAT-3 5 ciw7, Chr. IV, Genomk. KK23 5 -CCA TGT TGA TGA TAA GCA CAA-3 3 ciw7, Chr. IV, Genomk. KK24 5 -TAG TGA AAC CTT TCT CAG AT-3 5 ciw8, Chr. V, Genomk. KK25 5 -TTA TGT TTT CTTCAA TCA GTT-3 3 ciw8, Chr. V, Genomk. KK26 5 -CCA CATTTTCCT TCT TTC ATA-3 5 ciw10, Chr. V, Genomk. KK27 5 -CAA CAT TTA GCA AAT CAA CTT-3 3 ciw10, Chr. V, Genomk. KK28 5 -GGC TTT CTC GAA ATC TGT CC-3 5 F21M12, Chr. I, Genomk. KK29 5 -TTA CTT TTT GCC TCT TGT CAT TG-3 3 F21M12, Chr. I, Genomk. KK30 5 -ACA TTT TCT CAA TCC TTA CTC-3 5 ciw1, Chr. I, Genomk. KK31 5 -GAG AGC TTC TTT ATT TGT GAT-3 3 ciw1, Chr. I, Genomk.
2 8 ANHANG ii KK32 5 -CTG ATC TCA CGG ACA ATA GTG C-3 5 nga280, Chr. I, Genomk. KK33 5 -GGC TCC ATA AAA AGT GCA CC-3 5 ciw3, Chr. II, Genomk. KK34 5 -GAA ACT CAA TGA AAT CCA CTT-3 5 ciw3, Chr. II, Genomk. KK35 5 -TGA ACT TGT TGT GAG CTT TGA-3 3 ciw3, Chr. II, Genomk. KK36 5 -TCG TCT ACT GCA CTG CCG-3 5 nga168, Chr. II, Genomk. KK37 5 -GAG GAC ATG TAT AGG AGC CTC G-3 3 nga168, Chr. II, Genomk. KK38 5 -CCC CGA GTT GAG GTA TT-3 5 ciw11, Chr. III, Genomk. KK39 5 -GAA GAA ATT CCT AAA GCA TTC-3 3 ciw11, Chr. III, Genomk. KK40 5 -GTT CAT TAAACT TGC GTG TGT-3 5 ciw4, Chr. III, Genomk. KK41 5 -TAC GGT CAG ATT GAG TGA TTC-3 3 ciw4, Chr. III, Genomk. KK42 5 -CTC GTA GTG CAC TTT CAT CA-3 5 ciw6, Chr. IV, Genomk. KK43 5 -CAC ATG GTT AGG GAA ACA ATA -3 3 ciw6, Chr. IV, Genomk. KK44 5 -GCG AAA AAA CAA AAA AAT CCA-3 5 nga1107, Chr. IV, Genomk. KK45 5 -CGA CGA ATC GACAGA ATT AGG-3 3 nga1107, Chr. IV, Genomk. KK48 5 -CTC AGA GAA TTC CCA GAA AAA TCT-3 5 PHYC, Chr. V, Genomk. KK49 5 -AAA CTC GAG AGT TTT GTC TAG ATC-3 3 PHYC, Chr. V, Genomk. KK50 5 -CAG ACG TAT CAA ATG ACA AAT G-3 5 ciw9, Chr. V, Genomk. KK51 5 -GAC TAC TGC TCA AAC TAT TCG G-3 3 ciw9, Chr. V, Genomk. II Kohlenhydratgehalte in MP17:GFP-transgenen Arabidopsis Glukose Fruktose Saccharose Stärke Lösliche Zucker/Stärke Col-9 Col-14 Col-16 0,48 ± 6 0,52 ± 6 1,01 ± 0,15** 5,26 ± 0,54*** 0,92 ± 0,11 1,87 ± 0,36* 1,64 ± 6*** 2,11 ± 0,16*** 1,15 ± 7 0,99 ± 8 1,07 ± 7 2,65 ± 0,24*** 11,29 ± 0,46 10,43 ± 0,56 10,88 ± 0,43 23,10 ± 2,01*** 0,23 ± 1 0,32 ± 3* 0,34 ± 9,61e-3*** 0,44 ± *** Ler WT Ler-1 Ler-12 0,82 ± 0,10 5,52 ± 0,58 *** 3,49 ± 0,61*** 1,62 ± 0,13 4,72 ± 0,37*** 3,37 ± 0,29*** 1,21 ± 4 2,48 ± 0,15*** 2,02 ± 0,26** 12,04 ± 0,43 17,10 ± 1,26 ** 13,21 ± 1,43 0,30 ± 2 0,78 ± 9*** 0,76 ± 0,16* C24 WT C24-81 C24-84 C ,18 ± 0,15 0,92 ± 0,12 0,84 ± 7 1,10 ± 0,15 1,02 ± 0,18 0,93 ± 0,12 1,08 ± 9 1,20 ± 0,10 1,00 ± 6 0,78 ± 6* 0,79 ± 6* 1,09 ± 6 13,05 ± 0,66 12,05 ± 0,85 13,90 ± 0,93 14,76 ± 0,52 0,25 ± 3 0,22 ± 1 0,20 ± 1 0,20 ± 3 Angegeben sind die Mittelwerte mit Standardfehler der einzelnen Zuckermessungen aus je 10 Doppelproben von 5 Wochen alten source-blättern. Signifikante Unterschiede (* P < 5, ** P < 1, *** P < 01) im Vergleich zur jeweiligen Wildtyp-Kontrolle wurden mit Hilfe des Student s t-test ermittelt. Col-0: Columbia, Ler: Landsberg erecta.
3 8 ANHANG iii III Biomasseverteilung in konstitutiv MP17:GFP-exprimierenden Arabidopsis Anzucht Linie vegetative vegetative generative Samenertrag Anmerkungen Biomasse Biomasse Biomasse (Blattfrisch- (Blatttrocken- (Blattfrischgewicht) gewicht) gewicht) [g] [g] [g] [g] 1 2,026 ± 68 0,180 ± 05 0,152 ± 15 A Sept Col-0-9 2,532 ± 98 0,227 ± 08 0,140 ± 0 7 nach 6 Wochen Col ,948 ± 62 0,185 ± 09 0,199 ± 10 Kurztag Col ,361 ± ± 03 0,217 ± 12 Transfer unter Ler WT 2,381 ± 0,102 0,199 ± 07 0,128 ± 07 Langtag Ler-1 0,222 ± ± 01 0,215 ± ,158 ± 09 A Feb Col-0-9 0,132 ± 13 nach 2 Wochen Col ,174 ± 10 Kurztag Col ,188 ± 12 Transfer unter Langtag 3 2,106 ± 0,151 0,184 ± 10 0,120 ± 12 A Aug Col-0-9 2,242 ± 0,135 0,185 ± 09 0,165 ± 0 9 nach 6 Wochen Col ,774 ± 0,173 0,150 ± 11 0,138 ± 12 Kurztag Col ,255 ± ± 02 0,151 ± 60 Transfer unter Ler WT 1,972 ± 0,131 0,154 ± ± 09 Langtag Ler-1 0,219 ± ± 02 0,168 ± ,563 ± 0,106 0,1748 ± 084 A Dez Col-0-9 1,839 ± 44 0,177 ± 16 nach 6 Wochen Col ,343 ± 57 0,188 ± 12 Kurztag Col ,158 ± 12 0,197 ± 06 Transfer unter Ler WT 2,414 ± 0,136 0,124 ± 14 Langtag Ler-1 0,155 ± 17 0,185 ± 11 Ler-12 0,204 ± 24 0,156 ± ,739 ± 0,103 0,323 ± 28 0,139 ± 0, 005 A Aug Col-0-9 1,907 ± 57 0,411 ± 19 0,133 ± 08 nach 6 Wochen Col ,548 ± 78 0,327 ± 22 0,145 ± 0, 011 Kurztag Col ,367 ± 11 0,102 ± 03 0,163 ± 0, 005 Transfer unter Ler WT 2,167 ± 0,138 0,375 ± 22 0,125 ± 02 Langtag Ler-1 0,368 ± 36 0,147 ± 07 0,153 ± 08 Ler-12 0,464 ± 07 0,148 ± 09 0,151 ± 09 Die Daten repräsentieren die Verteilung der Biomasse in unterschiedlichen Entwicklungsstadien von 5 unabhängigen Anzuchten. Die vegetative Blattbiomasse wurde nach 6 Wochen Kurztag ermittelt, die generative Blattbiomasse zu Beginn der Sprossausbildung, nachdem die verbleibenden Pflanzen der
4 8 ANHANG iv vegetativen Biomassebestimmung unter Langtagbedingungen transferiert wurden. Nach vollständigem Abreifen der Pflanzen wurde der Samenertrag bestimmt. Pro Datenset wurden die Mittelwerte mit Standardfehler von 5-10 Pflanzen bestimmt. Angegeben sind die absoluten Werte in [g]. A: Aussaat, Col-0: Columbia, Ler: Landsberg erecta. IV Biomasseverteilung in Col-0-Arabidopsis mit Zell-spezifischer MP17:GFP-Expression Anzucht Linie vegetative Biomasse (Blattfrischgewicht) vegetative Biomasse Samenertrag Anmerkungen (Blattfrischgewicht) [g] [g] [g] 1 2,196 ± 0,154 0,218 ± 40 A Nov Col ,256 ± 13 0,234 ± 43 nach 6 Wochen L ,717 ± 87 0,228 ± 23 Kurztag L ,275 ± 21 0,226 ± 08 Transfer unter PEP-4 2,788 ± 0,237 0,204 ± 08 Langtag PEP-14 1,758 ± 0,176 0,210 ± 36 TP -6 2,496 ± 0,218 0,302 ± 0,300 TP -8 2,302 ± 0,13 0,288 ± 0 TP -16 2,240 ± 0,198 0,339 ± ,644 ± 0,101 0,346 ± 20 0,131 ± 1 3 A April 2006 Col ,251 ± 17 0,162 ± 10 0,166 ± 0 8 nach 6 Wochen L ,714 ± 48 0,229 ± 09 0,165 ± 10 Kurztag L ± 07 0,157 ± 10 0,173 ± 06 Transfer unter PEP-4 1,587 ± 78 0,291 ± 17 0,136 ± 11 Langtag PEP-14 1,696 ± 0,103 0,340 ± 18 0,128 ± 05 TP -6 1,388 ± 0,102 0,321 ± 19 0,190 ± 08 TP -8 1,731 ± 61 0,371 ± 15 0,191 ± 08 TP -16 1,937 ± 0,182 0,346 ± 17 0,195 ± ,739 ± 0,103 0,323 ± 28 0,139 ± 0 5 A Aug Col ,367 ± 11 0,102 ± 03 0,163 ± 0 5 nach 6 Wochen L ,904 ± 60 0,175 ± 08 0,150 ± 05 Kurztag L ,299 ± 28 0,100 ± 03 0,160 ± 09 Transfer unter PEP-4 1,618 ± 0,185 0,316 ± 25 0,128 ± 07 Langtag PEP-14 1,714 ± 0,136 0,337 ± 44 0,135 ± 13 TP -6 1,968 ± 0,215 0,372 ± 29 0,185 ± 08 TP -8 1,949 ± 26 0,376 ± 49 0,182 ± 15 TP -16 1,964 ± 37 0,371 ± 20 0,184 ± 08 In der Tabelle ist die Verteilung der Biomasse während unterschiedlicher Entwicklungsstadien von drei unabhängigen Anzuchten transgener Arabidopsis-Pflanzen zusammengefasst, die im Vergleich zur WT- und konstitutiven Col-0-16-Referenz MP17:GFP unter der Kontrolle eines Photosystem II- (L700), Geleitzell- (PEP) und Bündelscheiden-spezifischen (TP ) Promotors exprimieren. Die vegetative Blattbiomasse wurde nach 6 Wochen Kurztag ermittelt, die generative Blattbiomasse zu Beginn der Sprossausbildung, nachdem die verbleibenden Pflanzen der vegetativen Biomassebestimmung unter Langtagbedingungen transferiert wurden. Nach vollständigem Abreifen der Pflanzen wurde der
5 8 ANHANG v Samenertrag bestimmt. Pro Datenset wurden die Mittelwerte mit Standardfehler von 5-10 Pflanzen bestimmt. Angegeben sind die absoluten Werte in [g] sowie der prozentuale Anteil bezogen auf die WT-Referenz. A: Aussaat, Col-0: Columbia. V Kohlenhydratgehalte in Arabidopsis mit Zell-spezifischer MP17:GFP-Expression Glukose Fruktose Saccharose Stärke Lösliche Zucker/Stärke Col-16 0,72 ± 8 4,62 ± 0,30*** 0,80 ± 0,12 1,77 ± 0,21*** 0,70 ± 4 1,84 ± 0,18*** 13,00 ± 0,55 22,88 ± 2,64** 0,17 ± 1 0,41 ± 6** L L ,14 ± 0,57*** 5,67 ± 0,95*** 1,49 ± 0,11*** 2,04 ± 0,24*** 1,84 ± 0,13*** 2,15 ± 0,19*** 22,19 ± 2,16*** 24,99 ± 2,14*** 0,37 ± 5** 0,42 ± 6*** PEP-4 PEP-14 1,56 ± 0,26** 2,09 ± 0,40** 0,77 ± 0,13 0,67 ± 0,11 0,75 ± 4 0,72 ± 7 12,18 ± 0,45 12,62 ± 0,55 0,25 ± 2** 0,28 ± 4* TP -6 TP -8 TP -16 0,92 ± 0,25 0,69 ± 0,12 1,45 ± 0,20** 0,81 ± 0,19 1,09 ± 9 0,89 ± 7 0,45 ± 4** 0,69 ± 5 0,67 ± 5 10,73 ± 0,54* 11,54 ± 0,79 10,77 ± 1,28 0,21 ± 2 0,22 ± 2 0,32 ± 0,10 Angegeben sind die Mittelwerte mit Standardfehler der einzelnen Zuckermessungen aus je 10 Doppelproben der WT-, Col und L700-Linien und aus 4-6 Doppelproben der PEP- und TP - Linien von 5 Wochen alten source-blättern. Signifikante Unterschiede (* P < 5, ** P < 1, *** P < 01) im Vergleich zur Wildtyp-Kontrolle wurden mit Hilfe des Student s t-test ermittelt. Col-0: Columbia, L700: Konstrukt zur MP17:GFP-Expression in chloroplastenhaltigem Gewebe unter Kontrolle des ST-LS1-Promotors aus Solanum tuberosum, PEP: Konstrukt zur MP17:GFP-Expression in Geleitzellen unter Kontrolle des AtSUC2-Promotors aus Arabidopsis thaliana, TP : Konstrukt zur MP17:GFP-Expression in Bündelscheidenzellen unter Kontrolle des TP -Promotors des gdcst-gens aus Flaveria anomala. VI Ergänzende Bestimmung von Frisch- und Trockengewicht von MP17- und MP17:GFP transgenen Arabidopsis-Pflanzen mit konstitutiver und spezifischer Expression Zur Überprüfung der Biomasseverteilung während der vegetativen Wachstumsphase wurde neben dem Frischgewicht das Trockengewicht der konstitutiv MP17:GFPbzw. MP17-exprimierenden Arabidopsis-Linien im Col-0-, Ler- und C24-Hinterund sowie von Col-0-Linien, welche MP17:GFP unter der Kontrolle eines Geleitzell-, Bündelscheiden- und Chloroplasten-spezifischen Promotors exprimieren, ermittelt. Nach 6 Wochen unter Kurztagbedingungen wurde das Frischgewicht und nach
6 8 ANHANG vi weiteren zwei Tagen im Trockenschrank bei 50 C das Trockengewicht bestimmt (s. Abb.). (A) (B) 2,5 3,0 2,0 2,5 Frischgewicht [g] 1,5 1,0 Frischgewicht [g] 2,0 1,5 1,0 0,5 0,5 Trockengewicht [g] 0,3 0,2 0,1 Col-0-9 Col-0-14 Col-0-16 Ler WT Ler -1 Ler-12 C24 WT C24-81 C24-84 C24-74 C24-12 C24-14 C24-16 Trockengewicht [g] 0,3 0,2 0,1 Col-0-16 L L PEP-4 PEP-14 TP-6 TP-8 TP-16 Abbildung 8-1: Frisch- und Trockengewichte konstitutiv MP17:GFP- und MP17 sowie spezifisch MP17:GFP-exprimierender Arabidopsis-Linien während vegetativem Wachstumsstadium im Vergleich zur Ökotyp-spezifischen WT-Kontrolle Nach 6 Wochen Kurztagbedinungen wurden die Frischgewichte und nach weiteren zwei Tagen im Trockenschrank bei 50 C wurden die Trockengewichte bestimmt. Angegeben sind die Mittelwerte in Gramm mit Standardabweichung von 6-10 Pflanzen je Linie. Col-0: Columbia, Ler: Landsberg erecta, L700: Chloroplasten-spezifische Expression (ST LS-1-Promotor)), PEP: Geleitzell-spezifische Expression (At SUC2 SphI-Promotor), TP : Bündelscheiden-spezifische Expression (TP -Promotor).
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7 Anhang 7.1 Primersequenzen Alle Oligonukleotide sind in 5-3 -Orientierung aufgelistet. 7.1.1.1.1 Primer zum Nachweis eukaryoter DNA (Kontroll-PCR) 258 s CCA TCC AAC ATC TCA GCA TGA TGA AA GCC CCT CAG
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Material 13 3 MATERIAL 3.1 Oligonukleotide AGK34 LINE1 Ale1 Ale3 LIS1 LIS2 UR UL RA2 LS2 pbst7 sp6 DOP (6-MW) pcypac2-01 pcypac2-02 SD2 SA2 SA4 SD6 D11S2164 (CP5) forward D11S2164 (CP5) revers M16 forward
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Genannotation bei Prokaryoten Maike Tech Abt. Bioinformatik Institut für Mikrobiologie und Genetik (IMG) Universität Göttingen 28. November 2005 Genetik von Pro- und Eukaryoten Eukaryoten Prokaryoten Zellkern
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A Anhang 1. Verwendete Abkürzungen ACF AM Ap r/s AS ATR ß-Gal BlaM BSA bp C-Quelle CAT CFTR cfu CI CT dntp ECA EDTA ELISA EPS HAP IS Km r/s LB LPS Mbp mcs Min MBK MHK MOI MOPS MSHA NAD OD x ORF accessory
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MODUL 2.36 KLINISCHE CHEMIE UND LABORDIAGNOSTIK TAG 6: HLA-Typisierung Diese Anleitung bitte ausdrucken, vor dem Praktikumstag durcharbeiten und mitbringen! Inhalte der Einführungsvorlesung und der Anleitung
Anhang. Bedeutung Bezeichnung Rs + Nukleotidsequenz (5-3 ) Mutationsprimer Asp 29 Glu
AHAG 115 Anhang Tab. 13: Konstruktion der Primer zur Generierung der EcIPDC-Mutanten. Ausgetauschte ukleotide sind unterstrichen. Das ukleotidtriplett, welches für die mutierte Aminosäure codiert, ist
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2. MATERIAL UND METHODEN 2.1 Material 2.1.1 Proben zur DNA-Analytik Blutproben zur Gewinnung von DNA aus Leukozyten wurden uns freundlicherweise von Dr. Ramaekers, Universität Aachen, überlassen. Ein positives
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TCC CCA GTG AAG ACC TCC TCA GAG TCC GAC TCT. 56 C 67 siehe oben siehe oben siehe oben 56 C 66 CCG GCG CCA TTC TAT CC CGA GAA TCT GAC GCA GG 56 C 738
128 9. Anhang 9.1. Tabelle der verwendeten Primerpaare Nr. Name Sequenz 5 3 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 rcar. 981s rcar. 981s GAPDH. 682s GAPDH. 826a GAPDH. 381s GAPDH. 826a 18S-rRNA. 216s 18S-rRNA.
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