PubMed - Datenbankrecherche. Dr. Daniel T. Rudolf

Transkript

1 PubMed - Datenbankrecherche Dr. Daniel T. Rudolf

2 Kursziele Nach diesem Kurs sollten Sie wissen Worauf es bei einer Recherche ankommt Warum man Fachdatenbanken benutzt Wie Sie PubMed verwenden Wie Sie an die gefundenen Aufsätze herankommen 2

3 RECHERCHE 3

4 Recherche Idealziel Finden aller relevanter Treffer (Trefferquote = 1) Keine irrelevanten Treffer (Genauigkeit = 1) Genauigkeit bezeichnet die Wahrscheinlichkeit mit der ein zufällig ausgewähltes relevantes Dokument mit Hilfe einer spezifischen Suchanfrage gefunden wird Trefferquote bezeichnet die Wahrscheinlichkeit, dass ein zufällig ausgewähltes Dokument einer spezifischen Gesamttreffermenge relevant ist 4

5 Recherche Genauigkeit und Trefferquote (Precision und Recall) Grafik: Urheber: Walber (CC BY-SA 4.0) (abgerufen am 26. August 2016) 5

6 Datenbanken - Recherche Geeignete Suchbegriffe finden (englisch) Zusammengesetzte Suchbegriffe in Anführungszeichen setzen (Phrasensuche) Beispielthema: The effect of phytochemicals on acetaminophen hepatotoxicity 6 Zerlegen des Themas in Teilaspekte phytochemicals; acetaminophen ; hepatotoxicity Synonyme, Oberbegriffe, Unterbegriffe suchen plant, plant extract, biological product, polyphenol, flavonoid ; acetaminophen, paracetamol, aniline analgesic, analgesic, antipyretic; hepatotoxicity, hepatic injury, organ damage

7 Trunkierung Wildcards Trunkierung bezeichnet das Ersetzen eines oder mehrerer Zeichen durch einen Platzhalter PubMed erlaubt ausschließlich: * (ersetzt beliebig viele Zeichen) M*ller findet z.b. Müller, Mueller, Miller, Moeller, 8

8 Logische Verknüpfungen AND Enthält alle Begriffe acetaminophen AND n-acetycysteine O R Enthält mindestens einen der Begriffe acetaminophen OR paracetamol N O T Der Begriff darf nicht enthalten sein nephrotoxicity NOT hepatotoxicity 9

9 Recherchematrix Quelle: (abgerufen am 04. November 2016) The effect of phytochemicals on acetaminophen hepatotoxicity Phytochemical Plant extracts Acetaminophen aniline analgesic paracetamol hepatotoxicity hepatic injury hepatic lesion 10

10 Beispielsuchanfrage Einstiegssuche (phytochemicals or plant extracts ) and (acetaminophen or aniline analgesic or paracetamol) and (hepatotoxicity or hepatic injury or hepatic lesion* ) Kann man in Folgesuchen durch Ober- und/oder Unterbegriffe erweitern, z.b. (phytochemicals or or biological products ) and (acetaminophen or or analgesic or antipyretic) and (hepatotoxicity or or organ damage ) Die meisten Datenbanken verarbeiten Suchbegriffe von links nach rechts, daher Klammern setzen! 11

11 DATENBANKEN 14

12 Datenbanken Warum nicht Google Scholar? GS durchsucht Fachdatenbanken und Fachbibliografien Kein Qualitätsfilter: Alles kommt rein Intransparentes Ranking der Suchergebnisse (Relevanz) nach einem Algorithmus Zugriffsinformationen (für Uni Bonn) eventuell nicht korrekt Fazit: Kann man machen, muss dabei aber aufmerksam sein 15

13 Datenbankinfosystem - DBIS 16

14 Datenbankinfosystem - DBIS Gesuchte Datenbank(abkürzung) eingeben Liste ausgewählter fachlicher Datenbanken aufrufen 17

15 DBIS - Fachansicht 4 18

16 DBIS - Detailansicht Links zur Datenbank 19

17 PUBMED 20

18 PubMed PubMed am besten aus DBIS heraus aufrufen Angesteuerte URL zeigt der Datenbank, dass man zur Uni Bonn gehört SFX-Linkingservice funktioniert bei Zugriff auf anderem Wege sonst eventuell nicht richtig Also: >> Datenbanken DBIS >> Fachübersicht >> Medizin >> PubMed Wenn man dann ein Lesezeichen setzt, kann man in Folge auch darüber zugreifen 21

19 PubMed Basissuche 22

20 PubMed Basissuche Gut für eine erste Orientierung. Findet auch die aktuellsten Literaturhinweise Ergebnis enthält oft auch weniger relevante Treffer Zum Auffinden relevanter Literaturhinweise evtl. zusätzlich eine Advanced Search verwenden 23

21 PubMed Advanced Search Wenn möglich MeSH Terms verwenden MeSH = Medical Subject Headings Normiertes Vokabular zur Inhaltsbeschreibung Von Menschen intellektuell vergeben Allerdings haben sehr aktuelle Literaturhinweise noch keine MeSH Terms Daher auch Basissuche durchführen 24

22 PubMed Advanced Search 25

23 Suche mit MeSH Terms 26

24 Formate für die Ergebnisanzeige Anzeige der Ergebnisse in unterschiedlichen Formaten. Hier: Summary 27

25 Format Abstract 28

26 PubMed Suchgeschichte : History Suchschritt #1: Hier wurde mit dem Medical Subject Heading (MeSH Term) acetaminophen gesucht. Suchschritt # 2: Hier wurde mit dem Suchwort hepatotoxicity im Titel und im Abstract (Title/Abstract) gesucht. 29

27 PubMed Suchschritte kombinieren Suchschritt #1 und Suchschritt #2 wurden mit AND verknüpft. #1 mit Add einfügen. Auf #2 klicken und die Option AND in builder aussuchen. Dann auf Search klicken. 30

28 PubMed: Ergebnisse sortieren 31

29 MeSH Terms (Format Abstract) 32

30 MeSH Terms (Format Abstract) 33

31 LITERATURBESCHAFFUNG 34

32 Auf gefundene Artikel zugreifen Linkingservice SFX zeigt kürzesten Weg zum gewünschten Dokument In vollem Umfang nur innerhalb der Universität Bonn nutzbar Für Studierende und Mitarbeiter auch von außen über VPN-Client oder Shibboleth-Authentifizierung Externe Nutzer erhalten nur eingeschränkten Zugriff auf Ressourcen Nicht alle Datenbanken unterstützen SFX 35

33 Linkingservice SFX Volltext vorhanden Kein Volltext, aber Teile im Bestand Kein Bestand 36

34 Fernleihe Bücher und Aufsatzkopien können über die Fernleihe bestellt werden, vorausgesetzt es befindet sich kein Bestand in Bonn Kosten in den meisten Fällen: 1,50 Aufsatzkopien dürfen behalten werden Informationen und FAQs unter 37

35 Elektronische Zeitschriftenbibliothek - EZB Elektronische Zeitschriften 38

36 Elektronische Zeitschriftenbibliothek - EZB Uni Bonn voreingestellt Zugänglichkeit Open Access Uni-Netz / VPN Andere Bibliotheken auswählbar Keine Lizenz 39

37 Zeitschriftendatenbank - ZDB Gedruckte Zeitschriften 40

38 ZDB - Suche Stichwort (allgemein): science => Treffer Titel (Stichwort): science => Treffer Titelanfang: science => 1438 Treffer Titelanfang: science => 50 Treffer = Phrasensuche 41

39 ZDB - Besitznachweise Bibliothek Signatur (Aufstellungsnummer) Vorhandene Jahrgänge (hier: bis heute) hier: nur wenige Jahrgänge vorhanden 42

40 Bibliothekssigel Sigel identifizieren die besitzende Bibliothek und stellen ein Ordnungsmerkmal der ZDB dar 5 = ULB Bonn Hauptbibliothek 5 N = ULB Bonn, Abteilungsbibliothek, Nussallee 15a 5/.. = Universität Bonn, Institut 98 = ZB MED Bonn, in der Abteilungsbibliothek Bo.. = weitere Bonner Bibliotheken 38 = USB Köln 38 M = ZB MED, Standort Köln 43

41 Viel Erfolg! Foto: Dún Aengus" von James Britton, lizensiert unter CC BY-NC-SA