Zeichenketten. 10. Mai 2017 Simon Bachstein Simon Bachstein Hallo Welt -Seminar - LS 2 Zeichenketten 1
|
|
- Ralph Geier
- vor 5 Jahren
- Abrufe
Transkript
1 Zeichenketten 10. Mai 2017 Simon Bachstein Simon Bachstein Hallo Welt -Seminar - LS 2 Zeichenketten 1
2 Übersicht String-Matching Problem Motivation Algorithmen zur Lösung Naive Stringsuche KMP Algorithmus Boyer-Moore Algorithmus Rabin-Karp Algorithmus Manacher Algorithmus für Palindrome Suffix-Tries Simon Bachstein Hallo Welt -Seminar - LS 2 Zeichenketten 2
3 String-Matching Problem Text T = t 1 t 2...t n mit Länge n Suchmuster (Pattern) P = p 1 p 2...p m mit Länge m t k, m k aus gemeinsamen Alphabet Ziel: Finde ein (alle) k sodass t k = m k, t k+1 = m k+1, t k+m-1 = m k+m-1 D.h. finde die Position(en) von Muster im Text Beispiel: T = Nudelauflauf, M = lauf k 1 = 4 (Nudelauflauf), k 2 = 8 (Nudelauflauf) Simon Bachstein Hallo Welt -Seminar - LS 2 Zeichenketten 3
4 Naiver Algorithmus Text und Suchmuster linksbündig untereinander stellen Zeichen pro Zeichen vergleichen Bei Mismatch Suchmuster um eine Position nach rechts verschieben und die Suche bei Beginn des Suchmusters erneut beginnen Mit Worst-Case-Laufzeit O(nm) vergleichsweise sehr langsam Keine Vorbereitungen notwendig Simon Bachstein Hallo Welt -Seminar - LS 2 Zeichenketten 4
5 KMP Algorithmus Entwickelt von Donald Ervin Knuth, James Hiram Morris und Vaughan Ronald Pratt Baut auf naivem Algorithmus auf Verwirft bei Mismatches das Wissen bisheriger Vergleiche nicht Reduziert Laufzeit von O(nm) auf O(n) Läuft in zwei Phasen ab Analyse des Suchmusters Eigentliches Suchen des Musters Simon Bachstein Hallo Welt -Seminar - LS 2 Zeichenketten 5
6 KMP Algorithmus Analyse des Suchmusters Suchmuster in seine m+1 Präfixe zerlegen Präfixe auf Ränder absuchen Länge der längsten Ränder jeweils für spätere Verwendung speichern Länge des Rands des Leerstrings ist per Definition -1 Beispiel am Suchmuster abacaba k Substring Rand Länge Rand 0 (leer) (leer) -1 1 a (leer) 0 2 ab (leer) 0 3 aba a 1 4 abac (leer) 0 5 abaca a 1 6 abacab ab 2 7 abacaba aba Simon Bachstein Hallo Welt -Seminar - LS 2 Zeichenketten 6
7 KMP Algorithmus Analyse des Suchmusters Algorithmus zur Implementierung der Präfixtabelle: public int[] getprefixtable(char[] input) { int j = -1; int[] table = new int[input.length + 1]; table[0] = j; for(int i = 0; i < input.length; i++) { while(j >= 0 && input[j]!= input[i]) j = table[j]; j++; table[i+1] = j; } } return table; Position Zeichen a b a c a b a Tabelle Simon Bachstein Hallo Welt -Seminar - LS 2 Zeichenketten 7
8 KMP Algorithmus Eigentliche Suche List<Integer> getmatches(char[] text, char[] muster) { List<Integer> resultlist = new ArrayList<Integer>(); int[] prefixtable = getprefixtable(input); int j = 0; // Position im Muster // Den Text Zeichen um Zeichen durchgehen for(int i = 0; i < text.length; i++) { // Muster verschieben bis aktuelle Position // im Text mit Position im Muster übereinstimmt while(j >= 0 && text[i]!= input[j]) j = prefixtable[j]; j++; // Muster um eins verschieben if(j == input.length) { // Muster fertig durchsucht resultlist.add(i - input.length); j = prefixtable[j]; } } return resultlist; } Simon Bachstein Hallo Welt -Seminar - LS 2 Zeichenketten 8
9 KMP Algorithmus Eigentliche Suche Suchmuster und Text werden untereinander geschrieben Text wird Zeichen für Zeichen durchgegangen, ähnlich wie bei naiver Suche An jedem Zeichen: Solange Mismatch auftritt: Verschieben des Musters mittels Präfixtabelle nach rechts, ggf. mehrfach Eine Stelle weiter gehen Falls Suchmuster zu Ende: Treffer gefunden, entweder aufhören oder wieder mittels Präfixtabelle nach rechts verschieben Simon Bachstein Hallo Welt -Seminar - LS 2 Zeichenketten 9
10 KMP Algorithmus Eigentliches Suchen Index Zeichen a b a c a b a Tabelle Textposition a b a a b b a b a c a b a Text a b a c a b a Mismatch Pos 3, Tabelle[3] = 1 Um (3-1) = 2 verschieben a b a c a b a Mismatch Pos 1, Tabelle[1] = 0 Um (1-0) = 1 verschieben a b a c a b a Mismatch Pos 2, Tabelle[2] = 0 a b a c a b a Mismatch Pos 0, Tabelle[0] = -1 a b a c a b a Match an Textposition Simon Bachstein Hallo Welt -Seminar - LS 2 Zeichenketten 10
11 KMP Algorithmus Laufzeit Erstellen der Präfixtabelle in O(m) Einmaliges Durchlaufen des Textes, insgesamt O(n) Vergleiche Laufzeit beträgt also O(m+n) = O(n), wenn m <= n m > n kein Treffer möglich Aussteigen in O(1) Simon Bachstein Hallo Welt -Seminar - LS 2 Zeichenketten 11
12 Boyer-Moore-Algorithmus Entwickelt von Robert S. Boyer und J. Strother Moore Benutzt bei Mismatches zwei Heuristiken zur Ermittlung wie weit das Suchmuster verschoben werden kann Berechnet für beide Heuristiken Sprungtabellen Text und Muster werden linksbündig untereinander gestellt und Zeichen für Zeichen von rechts beginnend verglichen Pro Schritt wird die Heuristik die größeren Sprung erlaubt angewendet Worst-Case-Laufzeit mit geringfügiger Modifikation ist O(n) Falls das Alphabet im Vergleich zum Muster groß ist bis zu O(n/m) Simon Bachstein Hallo Welt -Seminar - LS 2 Zeichenketten 12
13 Boyer-Moore-Algorithmus Bad Character Heuristic Bei Mismatch: Muster so lange nach rechts verschieben bis an der betrachteten Stelle kein Mismatch mehr auftritt Wie weit gesprungen werden muss wird zur Beschleunigung vorberechnet Einzelner Sprung um 4 Positionen: a b a b c a b a b c a b a b c a b a b Im Vorlauf werden hierfür die Positionen des jeweils letzten Auftretens der einzelnen Zeichen im Muster gespeichert: a b c d Simon Bachstein Hallo Welt -Seminar - LS 2 Zeichenketten 13
14 Boyer-Moore-Algorithmus Good Suffix Heuristic Bei Mismatch wird Muster soweit verschoben, dass das passt Suffix erneut passt Wie weit gesprungen werden muss wird zur Beschleunigung vorberechnet Einzelner Sprung um 3 Zeichen: a b b b a c b a a b a c b a b a c b a Im Vorlauf werden für alle möglichen Suffixe die entsprechenden Sprungziele gespeichert, ähnlich der Präfixtabelle bei KMP Simon Bachstein Hallo Welt -Seminar - LS 2 Zeichenketten 14
15 Rabin-Karp Algorithmus Entwickelt von Michael O. Rabin und Richard M. Karp Vergleicht Signaturen (Hashwerte) der Substrings des Textes mit Signaturen des Musters anstelle der Originalstrings Beispiel mit Quersumme als Signaturfunktion: Anstatt 123 mit 456 wird = 6 mit = 15 verglichen Bei gleichen Signaturen muss nachträglich der Originalstring nochmal geprüft werden wegen Kollisionsgefahr Wahl der Signatur sodass die Signatur an der Stelle i + 1 ohne großen Aufwand aus der Signatur an der Stelle i berechnet werden kann Vergleich der Signaturen erfolgt in (kurzer) konstanter Zeit Average Case Laufzeit: O(n), Worst Case (selten): O(mn) Mehrere Muster gleichzeitig performant suchbar Simon Bachstein Hallo Welt -Seminar - LS 2 Zeichenketten 15
16 Rabin-Karp Algorithmus Beispiel: Text = , Muster = 265, Signaturfunktion ist Quersumme Signatur des Musters ist = Sig. Substr = = = = = = = Match = Kein Match Simon Bachstein Hallo Welt -Seminar - LS 2 Zeichenketten 16
17 Manacher Algorithmus Algorithmus um das längste Palindrom in einem String zu ermitteln Basiert auf naivem Ansatz jede Position als Zentrum eines Palindroms auszutesten Reduziert Laufzeit O(n²) des naiven Ansatzes auf O(n) Zeichenkette wird vorbereitet: Zwischenräume werden durch ein Trennzeichen ersetzt, vor und nach den String wird jeweils ein Sonderzeichen platziert Symmetrieeigenschaft von Palindromen wird ausgenutzt um Vergleiche einzusparen Das Palindrom mit höchster rechter Grenze wird jeweils zwischengemerkt um durch die Symmetrieeigenschaften Vergleiche einzusparen Simon Bachstein Hallo Welt -Seminar - LS 2 Zeichenketten 17
18 Manacher Algorithmus Beispiel: ABABA, Trennzeichen: #, Ende: $ # A # B # A # B # A # $ Zeichen 0 0 und 2 passen nicht 1 1 und 3 passen 1 * 0 und 4 passen nicht Neues Merkpalindrom 0 2 und 4 passen nicht 1 3 und 5 passen 2 2 und 6 passen 3 1 und 7 passen 3 * 0 und 8 passen nicht Neues Markpalindrom 0 Kopiert von und 6 passen nicht 1 Kopiert von und 8 passen 5 und 7 keine Prüfung! 5 * 3 und 9, 2 und 10, 1 und 11 passen, 0 und 12 nicht Neues Merkpalindrom Simon Bachstein Hallo Welt -Seminar - LS 2 Zeichenketten 18
19 Tries Datenstruktur: Gerichteter Baum speichert mehrere Wörter Kanten sind beschriftet mit Buchstaben der Worte Jedes Blatt repräsentiert ein mögliches Wort (gelesen von Wurzel in Richtung Blatt) Anwendungsbeispiel: Autovervollständigung Simon Bachstein Hallo Welt -Seminar - LS 2 Zeichenketten 19
20 Suffix Tries Datenstruktur: Gerichteter Baum zu einem Wort Terminierungszeichen wird an das Wortende angehangen Kanten sind beschriftet mit Buchstaben des Wortes Jedes Blatt repräsentiert ein mögliches Suffix des Wortes (von der Wurzel in Richtung Blatt gelesen) Können in O(n) mit O(n) Speicher generiert werden (Ukkonen Algorithmus) Anwendung: Substringprüfung: Ist aba Substring von ababa? Gehe jedes Zeichen von aba durch und prüfe vom Startknoten ausgehend ob es eine Kante mit diesem Zeichen gibt. Ja Gehe die Kante entlang, ist der potentielle Substring zu Ende ist er Substring Ja und Zielknoten ist Blatt Substring ist sogar Suffix Nein Der potentielle Substring ist kein Substring Simon Bachstein Hallo Welt -Seminar - LS 2 Zeichenketten 20
21 Suffix Tries Beispieltrie von ababa und Mustern aba und bab Simon Bachstein Hallo Welt -Seminar - LS 2 Zeichenketten 21
22 Quellen Jeweils am abgerufen Jeweils am abgerufen Simon Bachstein Hallo Welt -Seminar - LS 2 Zeichenketten 22
Zeichenketten Benedikt Straßner. Programming Systems Group Martensstr Erlangen Germany
Zeichenketten 16.04.2018 Benedikt Straßner Programming Systems Group Martensstr. 3 91058 Erlangen Germany Übersicht String Matching Algorithmen Naive Stringsuche Knuth Morris Pratt (KMP) Algorithmus Boyer-Moore
MehrZeichenketten. 29. April 2015 Benedikt Lorch. Benedikt Lorch Zeichenketten April
Vorlage Zeichenketten 29. April 2015 Benedikt Lorch Benedikt Lorch Zeichenketten 17. 29. April 2015 1 Motivation String Matching in the DNA Alphabet 1 Σ DNA = {A, G, C, T} DNA Text: 1 982 672 Zeichen Suchstring:
MehrZeichenketten. Michael Fularczyk Michael Fularczyk Zeichenketten / 41
Zeichenketten Michael Fularczyk 17.05.2011 Michael Fularczyk Zeichenketten 17.05.2011 1 / 41 Inhalt Zeichenketten Zeichensätze Darstellung Suchverfahren naive Stringsuche Knuth-Morris-Pratt Boyer-Moore
MehrPraktikum Algorithmische Anwendungen WS 2006/07 Ausarbeitung: Schnelle Stringsuchalgorithmen Boyer-Moore und Knuth-Morris-Pratt
Praktikum Algorithmische Anwendungen WS 2006/07 Ausarbeitung: Schnelle Stringsuchalgorithmen Boyer-Moore und Knuth-Morris-Pratt Team A Rot Daniel Baldes (Nr. 11041002, ai688@gm.fh-koeln.de) Holger Pontius
MehrAlgorithmen und Datenstrukturen II. Suchen in Texten. Prof. Dr. Oliver Braun. Fakultät für Informatik und Mathematik Hochschule München
Algorithmen und Datenstrukturen II Suchen in Texten Fakultät für Informatik und Mathematik Hochschule München Letzte Änderung: 27.03.2018 06:32 Inhaltsverzeichnis Ein Text.......................................
MehrEffiziente Algorithmen 2
Effiziente Algorithmen 2 Dr. Hanjo Täubig Lehrstuhl für Effiziente Algorithmen (Prof. Dr. Ernst W. Mayr) Institut für Informatik Technische Universität München Sommersemester 2009 Übersicht Algorithmen
MehrAlgorithmen und Datenstrukturen
Algorithmen und Datenstrukturen Prof. Martin Lercher Institut für Informatik Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf Teil 4 Suchen in Texten Version vom: 15. November 2016 1 / 39 Vorlesung 8 15. November
MehrAlgorithmische Bioinformatik 1
Algorithmische Bioinformatik 1 Dr. Hanjo Täubig Lehrstuhl für Effiziente Algorithmen (Prof. Dr. Ernst W. Mayr) Institut für Informatik Technische Universität München Sommersemester 2009 Übersicht Algorithmen
MehrUniversität Bremen. Textsuche. Thomas Röfer. Naive Suche Verfahren von Knuth-Morris-Pratt Verfahren von Boyer-Moore Ähnlichkeitssuche Editierdistanz
Textsuche Thomas Röfer Naive Suche Verfahren von Knuth-Morris-Pratt Verfahren von Boyer-Moore Ähnlichkeitssuche Editierdistanz Rückblick Graphenalgorithmen Scan-Line-Prinzip Adjazenzmatrix Adjazenzlisten
MehrSuchen in Texten. Naives Suchen Verfahren von Knuth-Morris-Pratt Verfahren von Boyer-Moore Ähnlichkeitssuchen Editierdistanz
Suchen in Texten Naives Suchen Verfahren von Knuth-Morris-Pratt Verfahren von Boyer-Moore Ähnlichkeitssuchen Editierdistanz Textsuche Gegeben ist ein Zeichensatz (Alphabet) Σ. Für einen Text T Σ n und
MehrProgramm heute. Algorithmen und Datenstrukturen (für ET/IT) Entartete Suchbäume. Beispiel: Balancieren von Suchbaum. Wintersemester 2012/13
Programm heute Algorithmen und Datenstrukturen (für ET/IT) Wintersemester / Fortgeschrittene Datenstrukturen Dr. Tobias Lasser Computer Aided Medical Procedures Technische Universität München 8 Such-Algorithmen
MehrZeichenketten. Hallo Welt für Fortgeschrittene Daniel Wust Informatik 2 Programmiersysteme Martensstraße Erlangen
Zeichenketten Hallo Welt für Fortgeschrittene Daniel Wust 23.04.2013 Informatik 2 Programmiersysteme Martensstraße 3 91058 Erlangen Inhalt Zeichenketten ASCII Regionsspezifische Erweiterungen Unicode Speicherung
MehrADS: Algorithmen und Datenstrukturen 1
ADS: Algorithmen und Datenstrukturen 1 Teil 12 Uwe Quasthoff Institut für Informatik Abteilung Automatische Sprachverarbeitung Universität Leipzig 16. Januar 2018 [Letzte Aktualisierung: 15/01/2018, 15:02]
MehrInformatik II, SS 2018
Informatik II - SS 2018 (Algorithmen & Datenstrukturen) Vorlesung 20 (9.7.2018) String Matching (Textsuche) Algorithmen und Komplexität Textsuche / String Matching Gegeben: Zwei Zeichenketten (Strings)
MehrInformatik II, SS 2016
Informatik II - SS 2016 (Algorithmen & Datenstrukturen) Vorlesung 20 (13.7.2016) String Matching (Textsuche) Algorithmen und Komplexität Textsuche / String Matching Gegeben: Zwei Zeichenketten (Strings)
MehrString - Matching. Kapitel Definition
Kapitel 1 String - Matching 1.1 Definition String - Matching ( übersetzt in etwa Zeichenkettenanpassung ) ist die Suche eines Musters ( Pattern ) in einem Text. Es findet beispielsweise Anwendung bei der
MehrBoyer Moore Algorithmus
LMU, CIS, SoSe 2006 Veranstaltung: Programmierung von Stringmatchingalgorithmen in C Kursleiter: Max Hadersbeck Referenten: Galina Hinova Stefan Partusch Andreas Neumann Die Erfinder J Strother Moore J.
MehrAlgorithmen zur exakten Suche in Texten. Algorithmen und Datenstrukturen II 1
Algorithmen zur exakten Suche in Texten Algorithmen und Datenstrukturen II 1 Die Klasse String Zeichenketten sind in Java Objekte. Sie können mit dem +-Operator zu neuen Objekten verknüpft werden. String
MehrTU München. Hauptseminar: WS 2002 / Einführung in Suffix - Bäume
TU München Hauptseminar: WS 2002 / 2003 Einführung in Suffix - Bäume Bearbeiterin: Shasha Meng Betreuerin: Barbara König Inhalt 1. Einleitung 1.1 Motivation 1.2 Eine kurze Geschichte 2. Tries 2.1 Basisdefinition
MehrAlgorithmen und Datenstrukturen
Algorithmen und Datenstrukturen Dipl. Inform. Andreas Wilkens 1 Suchen Bisher: Sequentielle Suche Binäre Suche Interpolationssuche Jetzt: Suchen in Zeichenfolgen 2 1 Suchen in Zeichenfolgen Das Problem:
MehrAlgorithmen und Datenstrukturen (für ET/IT) Programm heute. Sommersemester Dr. Tobias Lasser
Algorithmen und Datenstrukturen (für ET/IT) Sommersemester 06 Dr. Tobias Lasser Computer Aided Medical Procedures Technische Universität München Programm heute 7 Fortgeschrittene Datenstrukturen 8 Such-Algorithmen
MehrAlgorithmische Bioinformatik 1
Algorithmische Bioinformatik 1 Dr. Hanjo Täubig Lehrstuhl für Effiziente Algorithmen (Prof. Dr. Ernst W. Mayr) Institut für Informatik Technische Universität München Sommersemester 2009 Übersicht Algorithmen
MehrAlgorithmen und Datenstrukturen 2
Algorithmen und Datenstrukturen 2 Sommersemester 2006 8. Vorlesung Peter Stadler Universität Leipzig Institut für Informatik studla@bioinf.uni-leipzig.de Suche in Texten Einführung Suche in dynamischen
Mehr2.2 Der Algorithmus von Knuth, Morris und Pratt
Suchen in Texten 2.1 Grundlagen Ein Alphabet ist eine endliche Menge von Symbolen. Bsp.: Σ a, b, c,..., z, Σ 0, 1, Σ A, C, G, T. Wörter über Σ sind endliche Folgen von Symbolen aus Σ. Wörter werden manchmal
MehrAlgorithms & Data Structures 2
Algorithms & Data Structures 2 Strings & Pattern Matching WS2017 B. Anzengruber-Tanase (Institute for Pervasive Computing, JKU Linz) (Institute for Pervasive Computing, JKU Linz) STRING SEARCHING Problemstellung:
MehrRückblick: Längste gemeinsame Zeichenkette
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
MehrAlgorithmen und Datenstrukturen II
Algorithmen und Datenstrukturen II AG Praktische Informatik Technische Fakultät Vorlesung Sommer 2009 Teil I Algorithmen zur exakten Suche in Texten Die Klasse String Zeichenketten sind in Java Objekte.
MehrString matching: Überblick
String matching: Überblick String matching = Erkennung von Zeichenketten. Problemstellung & Anwendungen Grundlagen Rabin-Karp Verfahren (basierend auf hashing) String-matching mit endlichen Automaten Knuth-Morris-Pratt
MehrADS: Algorithmen und Datenstrukturen 1
ADS: Algorithmen und Datenstrukturen 1 Teil 13+ɛ Prof. Peter F. Stadler & Dr. Christian Höner zu Siederdissen Bioinformatik/IZBI Institut für Informatik & Interdisziplinäres Zentrum für Bioinformatik Universität
Mehr8.4 Suffixbäume. Anwendungen: Information Retrieval, Bioinformatik (Suche in Sequenzen) Veranschaulichung: DNA-Sequenzen
8.4 Suffixbäume Ziel: Datenstruktur, die effiziente Operationen auf (langen) Zeichenketten unterstützt: - Suche Teilzeichenkette (Substring) - Präfix - längste sich wiederholende Zeichenkette -... Anwendungen:
MehrSuche in Texten. Verschiedene Szenarios: Dynamische Texte. Texteditoren Symbolmanipulatoren. Statische Texte
Suche in Texten Suche in Texten Verschiedene Szenarios: Dynamische Texte Texteditoren Symbolmanipulatoren Statische Texte Literaturdatenbanken Bibliothekssysteme Gen-Datenbanken WWW-Verzeichnisse 2 Suche
MehrAlgorithmen und Datenstrukturen 2
Algorithmen und Datenstrukturen 2 Kap. 19: Suffixbäume Faculty of Technology robert@techfak.uni-bielefeld.de Vorlesung, U. Bielefeld, Sommer 2011 Bekannte Verfahren zur exakten Suche in Zeichenreihen Exakte
Mehr1.3 Knuth-Morris-Pratt-Algorithmus
1.3 Knuth-Morris-Pratt-Algorithmus Präprozessing bestimmt längste Ränder der Präfixe von P Die Kenntnis der Ränder erspart Vergleiche bei periodischen Suchwörtern Laufzeit: Θ(m) für das Präprozessing,
MehrAlgorithmische Bioinformatik 1
Algorithmische Bioinformatik 1 Dr. Hanjo Täubig Lehrstuhl für Effiziente Algorithmen (Prof. Dr. Ernst W. Mayr) Institut für Informatik Technische Universität München Sommersemester 2009 Übersicht Algorithmen
MehrProseminar String Matching
Proseminar Textsuche Proseminar String Matching PD Dr. habil. Hanjo Täubig Lehrstuhl für Theoretische Informatik (Prof. Dr. Susanne Albers) Institut für Informatik Technische Universität München Wintersemester
MehrAlgorithmen und Datenstrukturen II
Algorithmen und Datenstrukturen II Algorithmen zur Textverarbeitung III: D. Rösner Institut für Wissens- und Sprachverarbeitung Fakultät für Informatik Otto-von-Guericke Universität Magdeburg Sommer 2009,
MehrAlgorithmen zur exakten Suche in Texten
Kapitel 4 Algorithmen zur exakten Suche in Texten In diesem Kapitel wird ein Problem aus der Sequenzanalyse näher betrachtet, die exakte Textsuche: Gegeben ein Text und ein Muster, finde alle Vorkommen
MehrKapitel 5. Textalgorithmen. 5.1 Grundbegriffe
Kapitel 5 Textalgorithmen 5.1 Grundbegriffe Wir beschäftigen uns hauptsächlich mit Textsuche (und Varianten). Gegeben: Alphabet Σ (mindestens zwei Buchstaben). Text S = s 1... s n Σ in Array S[1..n]. Muster
MehrBerühmte Informatiker
Berühmte Informatiker Teil 10: J. Backus & D. E. Knuth 1924-1938- * 03.12.1924 in Philadelphia John Backus Vorzeitiger Abbruch des Studiums der Chemie (1942) und der Medizin (1945) Während der Arbeit als
MehrMathematisches Praktikum - SoSe 2015
Mathematisches Praktikum - SoSe 2015 Prof. Dr. Wolfgang Dahmen Felix Gruber, Igor Voulis Aufgabe 4 Bearbeitungszeit: drei Wochen (bis Freitag, 5. Juni 2015) Mathematischer Hintergrund: String-Matching-Algorithmen,
MehrIndexieren und Suchen
Universität Potsdam Institut für Informatik Lehrstuhl Maschinelles Lernen Indexieren und Suchen Tobias Scheffer Paul Prasse Michael Großhans Überblick Index-Datenstrukturen Invertierte Indizes Suffix-Bäume
MehrHallo Welt für Fortgeschrittene
Hallo Welt für Fortgeschrittene Zeichenketten von Christopher Saloman Informatik 2 Programmiersysteme Martensstraße 3 91058 Erlangen Übersicht 1. Was sind Zeichenketten und wofür braucht man sie? 2. Suchen
MehrMathematisches Praktikum - SoSe 2014
Mathematisches Praktikum - SoSe 2014 Prof. Dr. Wolfgang Dahmen Felix Gruber, M. Sc., Christian Löbbert, M. Sc., Yuanjun Zhang, M. Sc., Klaus Kaiser, M. Sc. Aufgabe 3 Bearbeitungszeit: zwei Wochen (bis
MehrTextsuche. Textsuche
Textsuche Stringologie Online-Algorithmen Peter Leupold Das allgemeine Problem der Text- oder Mustersuche besteht darin ein (Such-) Muster (pattern) x der Länge m in einem (Such-) Text (text) y der Länge
Mehr8. Mustersuche in Zeichenketten
8. Mustersuche in Zeichenketten Zeichenkette (String) T ist endliche Folge von Symbolen aus endlichem Alphabet Σ. Besteht T aus n Symbolen, so werden diese in T[1], T[2],..., T[n] gespeichert. T[i..j],
Mehr4.9.7 Konstruktion der Suffixbäume
.9.7 Konstruktion der Suffixbäume Beipiel: xabxa (siehe Abbildung.27) Man beginnt mit der Konstruktion eines Suffixbaumes für gesamten String und schreibt eine 1 am Blatt, weil der Suffix xabxa an der
Mehr4. Suche in Texten. Suche in (weitgehend) statischen Texten -> Indexierung 4-1. Einführung
Einführung 4. Suche in Texten Suche in dynamischen Texten (ohne Indexierung) - Naiver Algorithmus (Brute Force) - Knuth-Morris-Pratt (KMP) - Algorithmus - Boyer-Moore (BM) - Algorithmus - Signaturen Suche
MehrEinführung in die Informatik 2
Einführung in die Informatik 2 Suchen in Texten Sven Kosub AG Algorithmik/Theorie komplexer Systeme Universität Konstanz E 202 Sven.Kosub@uni-konstanz.de Sprechstunde: Freitag, 12:30-14:00 Uhr, o.n.v.
MehrString-Matching-Algorithmen. von. Thomas Kramer
String-Matching-Algorithmen von Thomas Kramer 20.11.2011 1. Problemstellung und Allgemeines String-Matching-Algorithmen sind Algorithmen, die das Finden von Textfragmenten innerhalb einer Zeichenkette
MehrAlgorithmen und Datenstrukturen (Informatik II) SS Klausur
Lehrstuhl für Algorith. und Datenstrukturen Prof. Dr. Hannah Bast Axel Lehmann Algorithmen und Datenstrukturen (Informatik II) SS 2013 http://ad-wiki.informatik.uni-freiburg.de/teaching Klausur Mittwoch
MehrProseminar "Pattern Matching"
Proseminar "Pattern Matching" Grundlegende Such-Algorithmen Stephan Reichelt Wintersemester 2001/2002 2 1. Einführung Wozu muss man in Zeichenfolgen suchen? => Daten sind oft nicht in Datensätze (ähnlich
MehrAlgorithmische Bioinformatik
Algorithmische Bioinformatik Suffixbäume Ulf Leser Wissensmanagement in der Bioinformatik Ziele Perspektivenwechsel: Von Online zu Offline-Stringmatching Verständnis von Suffix-Bäumen als Datenstruktur
MehrInformatik II, SS 2018
Informatik II - SS 2018 (Algorithmen & Datenstrukturen) Vorlesung 21 (11.7.2018) String Matching (Textsuche) II Greedy Algorithmen I Algorithmen und Komplexität Textsuche / String Matching Gegeben: Zwei
Mehr5. Mustererkennung. Anwendungsbeispiele: suche Zeichenfolge in Text suche Bitmuster in Pixelbild. gegeben: endliches Alphabet Σ. Muster p Σ m, m IN
5. Mustererkennung Anwendungsbeispiele: suche Zeichenfolge in Text suche Bitmuster in Pixelbild gegeben: endliches Alphabet Σ Text t Σ n, n IN Muster p Σ m, m IN gesucht: erste (bzw. jede) Position von
Mehr1.8 Shift-And-Algorithmus
.8 Shift-And-Algorithmus nutzt durch Bitoperationen mögliche Parallelisierung Theoretischer Hintergrund: Nichtdeterministischer endlicher Automat Laufzeit: Θ(n), falls die Länge des Suchwortes nicht größer
MehrProjektdokumentation String-Searching KMP-Algorithmus Boyer-Moore-Algorithmus
Algorithmische Anwendungen Wintersemester 2005/06 Projektdokumentation String-Searching KMP-Algorithmus Boyer-Moore-Algorithmus Stand: 25.01.2006 Gruppe: A-Lila Hicham Settah Dieter Galinowski Inhalt:
MehrAlgorithmen auf Zeichenketten
Algorithmen auf Zeichenketten Rabin-Karp Algorithmus Christoph Hermes hermes@hausmilbe.de Zeichenketten: Rabin-Karp Algorithmus p. 1/19 Ausblick auf den Vortrag theoretische Grundlagen... Zeichenketten:
MehrAlgorithmen auf Sequenzen Vorbereitung zur Prüfung
Algorithmen auf Sequenzen Vorbereitung zur Prüfung Dominik Kopczynski Lehrstuhl für Algorithm Engineering (LS11) Fakultät für Informatik TU Dortmund Überblick Zusammenfassung aller Themen Fragen, die in
MehrAlgorithmen und Datenstrukturen 2
Algorithmen und Datenstrukturen 2 Sommersemester 2006 9. Vorlesung Peter Stadler Universität Leipzig Institut für Informatik studla@bioinf.uni-leipzig.de Invertierte Listen Nutzung vor allem zur Textsuche
MehrGrundlagen Theoretischer Informatik I SoSe 2011 in Trier. Henning Fernau Universität Trier
Grundlagen Theoretischer Informatik I SoSe 2011 in Trier Henning Fernau Universität Trier fernau@uni-trier.de 1 Grundlagen Theoretischer Informatik I Gesamtübersicht Organisatorisches; Einführung Logik
MehrText Analytics. Referat: Improving Suffix Array Locality for Fast Pattern Matching on Disk
Text Analytics Referat: Improving Suffix Array Locality for Fast Pattern Matching on Disk Nils Alberti & Jürgen Eicher, 12. Juni 2008 Einführung Stringmatching bisher: Analyse des Patterns zum schnellen
MehrIndexieren und Suchen
Universität Potsdam Institut für Informatik Lehrstuhl Maschinelles Lernen Indexieren und Suchen Tobias Scheffer Index-Datenstrukturen, Suchalgorithmen Invertierte Indizes Suffix-Bäume und -Arrays Signaturdateien
Mehr6. Algorithmen auf Zeichenketten
6. Algorithmen auf Zeichenketten Motivation Wir lernen nun Algorithmen zur Lösung verschiedener elementarer Probleme auf Zeichenketten zu lösen Zeichenketten spielen eine wichtige Rolle in diversen Gebieten
MehrADS: Algorithmen und Datenstrukturen 1
ADS: Algorithmen und Datenstrukturen 1 Teil 13 Uwe Quasthoff Institut für Informatik Abteilung Automatische Sprachverarbeitung Universität Leipzig 23. Januar 2018 [Letzte Aktualisierung: 22/01/2018, 16:35]
MehrDynamisches Huffman-Verfahren
Dynamisches Huffman-Verfahren - Adaptive Huffman Coding - von Michael Brückner 1. Einleitung 2. Der Huffman-Algorithmus 3. Übergang zu einem dynamischen Verfahren 4. Der FGK-Algorithmus 5. Überblick über
MehrStrings. Stringsuche, Boyer-Moore, Textkompression, Huffman Codes.
Strings Stringsuche, Boyer-Moore, Textkompression, Huffman Codes. Suche Substring Häufiges Problem Relevante Beispiele: Suche ein Schlagwort in einem Buch Alphabet: A-Za-z0-9 Suche Virussignatur auf der
Mehr7. Sortieren Lernziele. 7. Sortieren
7. Sortieren Lernziele 7. Sortieren Lernziele: Die wichtigsten Sortierverfahren kennen und einsetzen können, Aufwand und weitere Eigenschaften der Sortierverfahren kennen, das Problemlösungsparadigma Teile-und-herrsche
MehrAlgorithmen auf Sequenzen
Algorithmen auf Sequenzen Vorlesung von Prof. Dr. Sven Rahmann im Sommersemester 2008 Kapitel 4 Reguläre Ausdrücke Webseite zur Vorlesung http://ls11-www.cs.tu-dortmund.de/people/rahmann/teaching/ss2008/algorithmenaufsequenzen
Mehr(08 - Einfache Sortierverfahren)
Vorlesung Informatik 2 Algorithmen und Datenstrukturen (08 - Einfache Sortierverfahren) Prof. Dr. Susanne Albers Sortieren Motivation, Einführung Datenbestände müssen sehr oft sortiert werden, etwa um
MehrAlgorithmen und Datenstrukturen 1 Kapitel 6 Algorithmen auf Zeichenreihen
Algorithmen und Datenstrukturen 1 Kapitel 6 Algorithmen auf Zeichenreihen Technische Fakultät robert@techfak.uni-bielefeld.de Vorlesung, U. Bielefeld, Winter 2006/2007 February 5, 2007 Kapitel 6: Algorithmen
MehrString Matching 2. Definition Ein Alphabet ist eine nichtleere, endliche Menge S von Zeichen.
1 2 1. Strings Definition Ein Alphabet ist eine nichtleere, endliche Menge S von Zeichen. Ein String über S ist eine endliche Folge S = S(1)S(2)...S(n) von Zeichen S(i) aus S, dessen Länge n wir mit S
MehrSortieren II / HeapSort Heaps
Organisatorisches VL-07: Sortieren II: HeapSort (Datenstrukturen und Algorithmen, SS 2017) Vorlesung: Gerhard Woeginger (Zimmer 4024 im E1) Email: dsal-i1@algo.rwth-aachen.de Webseite: http://algo.rwth-aachen.de/lehre/ss17/dsa.php
MehrLernmodul 7 Algorithmus von Dijkstra
Folie 1 von 30 Lernmodul 7 Algorithmus von Dijkstra Quelle: http://www.map24.de Folie 2 von 30 Algorithmus von Dijkstra Übersicht Kürzester Weg von A nach B in einem Graphen Problemstellung: Suche einer
MehrAlgorithmen und Datenstrukturen (für ET/IT)
Algorithmen und Datenstrukturen (für ET/IT) Sommersemester 207 Dr. Stefanie Demirci Computer Aided Medical Procedures Technische Universität München Programm heute 7 Fortgeschrittene Datenstrukturen 8
MehrSortieralgorithmen. Inhalt: InsertionSort BubbleSort QuickSort. Marco Block
Inhalt: InsertionSort BubbleSort QuickSort Block M.: "Java-Intensivkurs - In 14 Tagen lernen Projekte erfolgreich zu realisieren", Springer-Verlag 2007 InsertionSort I Das Problem unsortierte Daten in
MehrKapitel 1. Exakte Suche nach einem Wort. R. Stiebe: Textalgorithmen, WS 2003/04 11
Kapitel 1 Exakte Suche nach einem Wort R. Stiebe: Textalgorithmen, WS 2003/04 11 Überblick Aufgabenstellung Gegeben: Text T Σ, Suchwort Σ mit T = n, = m, Σ = σ Gesucht: alle Vorkommen von in T Es gibt
MehrAufgabe 3: Erste Versuche im Indexieren des Templates. Ulf Leser Wissensmanagement in der Bioinformatik
Aufgabe 3: Erste Versuche im Indexieren des Templates Ulf Leser Wissensmanagement in der Bioinformatik q-gram Index Ein q-gram Index für einen String T ist ein invertiertes File über allen q-grammen von
MehrAlgorithmen und Datenstrukturen
Universität Innsbruck Institut für Informatik Zweite Prüfung 16. Oktober 2008 Algorithmen und Datenstrukturen Name: Matrikelnr: Die Prüfung besteht aus 8 Aufgaben. Die verfügbaren Punkte für jede Aufgabe
MehrBioinformatik Für Biophysiker
Bioinformatik Für Biophysiker Wintersemester 2005 / 2006 Ulf Leser Wissensmanagement in der Bioinformatik Wissensmanagement in der Bioinformatik Lehrstuhl seit 10/2002 Schwerpunkte Algorithmen der Bioinformatik
MehrUE Algorithmen und Datenstrukturen 1 UE Praktische Informatik 1. Übung 2. Spezifikation Schrittweise Verfeinerung
UE Algorithmen und Datenstrukturen 1 UE Praktische Informatik 1 Übung 2 Spezifikation Schrittweise Verfeinerung Institut für Pervasive Computing Johannes Kepler Universität Linz Altenberger Straße 69,
MehrZeichenketten. Hauptseminar Hallo Welt! für Fortgeschrittene. SS 2006 10. Mai 2006 Tobias Hager. Tobias.Hager@e-technik.stud.uni-erlangen.
Zeichenketten Hauptseminar Hallo Welt! für Fortgeschrittene SS 2006 10. Mai 2006 Tobias.Hager@e-technik.stud.uni-erlangen.de Friedrich-Alexander Universität Erlangen-Nürnberg Gliederung 2 1. Motivation
MehrKapitel 12: Induktive
Kapitel 12: Induktive Datenstrukturen Felix Freiling Lehrstuhl für Praktische Informatik 1 Universität Mannheim Vorlesung Praktische Informatik I im Herbstsemester 2009 Folien nach einer Vorlage von H.-Peter
MehrGraphalgorithmen II. Werner Sembach Werner Sembach Graphalgorithmen II / 22
Graphalgorithmen II Werner Sembach 14.04.2014 Werner Sembach Graphalgorithmen II 14.04.2014 1 / 22 Übersicht Datenstrukturen Union-Find Fibonacci-Heap Werner Sembach Graphalgorithmen II 14.04.2014 2 /
MehrÜbung 2 Algorithmische Bioinformatik WS 15/16. Yvonne Mayer
Übung 2 Algorithmische Bioinformatik WS 15/16 Yvonne Mayer Lösungen/ Wettbewerb Übung 1 Yvonne Mayer Übungen Algorithmische Bioinformatik WS 15/16 2 Lösungen Übung 1 vorstellen Fasta Sequenzen einlesen
MehrBioinformatik Für Biophysiker
Bioinformatik Für Biophysiker Wintersemester 2006 / 2007 Ulf Leser Wissensmanagement in der Bioinformatik Wissensmanagement in der Bioinformatik Lehrstuhl seit 10/2002 Schwerpunkte Algorithmen der Bioinformatik
MehrÜbersicht. Datenstrukturen und Algorithmen. Übersicht. Heaps. Vorlesung 8: Heapsort (K6) Joost-Pieter Katoen. 7. Mai 2015
Datenstrukturen und Algorithmen Vorlesung 8: (K6) 1 Joost-Pieter Katoen Lehrstuhl für Informatik Software Modeling and Verification Group http://moves.rwth-aachen.de/teaching/ss-15/dsal/ 7. Mai 015 3 Joost-Pieter
Mehr10. Übungsblatt zu Algorithmen I im SS 2010
Karlsruher Institut für Technologie Institut für Theoretische Informatik Prof. Dr. Peter Sanders G.V. Batz, C. Schulz, J. Speck 0. Übungsblatt zu Algorithmen I im SS 00 http//algo.iti.kit.edu/algorithmeni.php
MehrKapitel 2. Suche nach endlich vielen Wörtern. R. Stiebe: Textalgorithmen, Winter 2005/06 113
Kapitel 2 Suche nach endlich vielen Wörtern R. Stiebe: Textalgorithmen, Winter 2005/06 113 Übersicht Aufgabenstellung Gegeben: Text T und eine endliche Menge von Wörtern P = {P 1,..., P r }; Gesucht: alle
MehrAlgorithmen und Datenstrukturen in der Bioinformatik Erstes Übungsblatt WS 05/06 Musterlösung
Konstantin Clemens Johanna Ploog Freie Universität Berlin Institut für Mathematik II Arbeitsgruppe für Mathematik in den Lebenswissenschaften Algorithmen und Datenstrukturen in der Bioinformatik Erstes
MehrExakte Suche nach einem Wort
Kapitel Exakte Suche nach einem Wort Wir betrachten die folgende grundlegende Aufgabenstellung: Gegeben sind ein Suchwort (pattern) P und ein Text T über einem Alphabet Σ mit P = m, T = n, Σ = σ. Gesucht
Mehr12. AuD Tafelübung T-C3
12. AuD Tafelübung T-C3 Simon Ruderich 2. Februar 2011 Kollisionen (Primär)Kollision Stelle mit normal eingefügtem Element schon belegt (gleicher Hashwert) tritt bei verketteten Listen und Sondierung auf
MehrLexikalische Programmanalyse der Scanner
Der Scanner führt die lexikalische Analyse des Programms durch Er sammelt (scanned) Zeichen für Zeichen und baut logisch zusammengehörige Zeichenketten (Tokens) aus diesen Zeichen Zur formalen Beschreibung
MehrSortieren und Suchen. Jens Wächtler Hallo Welt! -Seminar LS 2
Sortieren und Suchen Jens Wächtler 17.05.2017 Hallo Welt! -Seminar LS 2 Überblick Sortieren kurze Wiederholung Binäre & Ternäre Suche Binäre Suche in einer Liste Bisektionsverfahren (Nullstellensuche)
MehrEffiziente Algorithmen und Komplexitätstheorie
1 Effiziente lgorithmen und Komplexitätstheorie Vorlesung Thomas Jansen 29.06.2006 2 Burrows-Wheeler-Kompression: Verbesserungen dreischrittiges Kompressionsverfahren Burrows- Wheeler- Transformation Globale
MehrAnregungen zu Übung 2
Anregungen zu Übung 2 Allgemeine Informatik II - SS 2007 Was sind Arrays und wie kann man sie verwenden? Ein Array ist ein spezieller Datentyp, der mehrere Werte zu einer Einheit zusammenfasst. Er ist
MehrReferat zum Thema Huffman-Codes
Referat zum Thema Huffman-Codes Darko Ostricki Yüksel Kahraman 05.02.2004 1 Huffman-Codes Huffman-Codes ( David A. Huffman, 1951) sind Präfix-Codes und das beste - optimale - Verfahren für die Codierung
MehrRepetitive Strukturen
Repetitive Strukturen Andreas Liebig Philipp Muigg ökhan Ibis Repetitive Strukturen, (z.b. sich wiederholende Strings), haben eine große Bedeutung in verschiedenen Anwendungen, wie z.b. Molekularbiologie,
MehrFortgeschrittene Netzwerk- und Graph-Algorithmen
Fortgeschrittene Netzwerk- und Graph-Algorithmen Prof. Dr. Hanjo Täubig Lehrstuhl für Effiziente Algorithmen (Prof. Dr. Ernst W. Mayr) Institut für Informatik Technische Universität München Wintersemester
MehrKlausur "C#" WS 2012/2013
PD Dr. J. Reischer 13.02.2013 Klausur "C#" WS 2012/2013 Nachname, Vorname Abschluss (BA, MA, FKN etc.) Matrikelnummer, Semester Versuch (1/2/3) Bitte füllen Sie zuerst den Kopf des Angabenblattes aus!
MehrDie Nerode-Relation und der Index einer Sprache L
Die Nerode-Relation und der Index einer Sprache L Eine zweite zentrale Idee: Sei A ein vollständiger DFA für die Sprache L. Repäsentiere einen beliebigen Zustand p von A durch die Worte in Σ, die zu p
Mehr