R Installationsanleitung Mac (Version 1.5) R@fom.de ifes 23. Februar 2015
0 Inhaltsverzeichnis 1 Wichtige Hinweise... 3 2 Download von R... 4 3 Installation von R... 5 4 Installation von Paketen... 7 4.1 Installation über die R Konsole... 7 4.2 Installation über das Menü... 8 5 R-Commander...11 5.1 Starten des R-Commanders...11 5.2 Probleme mit dem R-Commander...12 6 Quellen...13 2
1 Wichtige Hinweise 1 Wichtige Hinweise Die folgende Installationsanleitung bezieht sich auf die R Versionen 3.1.2 und später. Sollten Sie eine frühere Version verwenden, wird zu einem Update auf die aktuellste Version geraten, um eine möglichst stabile Funktion von R zu gewährleisten. R 3.1.2 unterstützt die Mac OS X Versionen 10.6 (Snow Leopard) und neuer sowie OS X 10.9 (Mavericks) und neuer. Bevor Sie R auf Ihrem Mac installieren, sollten Sie folgende Punkte überprüfen: 1. Stellen Sie vor der Installation von R sicher, dass die aktuellste Version Ihres Mac OS X Betriebssystem installiert ist. Führen Sie hierzu ein Software Update über das Apple Menü am oberen, linken Bildschirmrand durch. 2. Prüfen Sie ob das X11 Windowing System (X Windows) auf Ihrem Mac installiert ist. Unter OS X 10.6 und 10.7 sollte die X11.app bei den Programmen im Ordner Dienstprogramme (Utilities) zu finden sein. Unter OS X 10.7 sollte die App immer installiert sein. Ab OS X 10.8 heißt die App XQuartz.app. Die XQuartz.app kann auch unter OS X 10.6 oder 10.7 installiert sein. Sollte weder die X11.app noch die XQuartz.app installiert sein, installieren Sie die XQuartz.app von http://xquartz.macosforge.org. Laden Sie hierzu die XQuartz.dmg in der aktuellsten Version. Im Anschluss öffnen Sie diese Datei durch einen Doppelklick. Es öffnet sich die XQuartz.pkg Datei. Durch einen Doppelklick startet die Installation. Nach der Installation müssen Sie Ihren Mac neu starten. Nun können Sie mit Punkt 2 fortfahren. Eventuell ist nach der Erstinstallation von XQuartz und / oder R ein Neustart erforderlich. Eventuell müssen Sie beim ersten Start des R-Commanders noch die Xcode Command Line Tools installieren. Bei Fragen und Hinweisen wenden Sie sich bitte an unsere Hilfe unter R@fom.de. 3
2 Download von R 2 Download von R Folgen Sie dem nachstehenden Link, um zum Download von R für Mac OS X zu gelangen: http://cran.r-project.org/bin/macosx/ Auf dieser Seite können Sie die aktuellste Version von R herunterladen (Abbildung 1). Nachdem Sie auf den Link geklickt haben, startet der Download automatisch. Achten Sie bitte darauf, die für Ihr System passende (Snow Leopoard oder Mavericks / Yosemite) R Version runterzuladen. Abbildung 1: Downloadseite R für Mac OS X 4
3 Installation von R 3 Installation von R Nach erfolgreichem Download der Datei finden Sie die R.pkg-Datei in ihrem Download Ordner (Abbildung 2). Durch einen Doppelklick auf die Datei startet die Installation. Abbildung 2: Downloadordner mit R.pkg-Datei Nachdem Sie den Lizenzbedingungen zugestimmt haben, können Sie den Installationsort und typ für das Programm auswählen (Abbildung 3). Abbildung 3: R Installationsbildschirm 5
3 Installation von R Nach Fertigstellung der Installation können Sie R nun in ihrem Programmordner finden (Abbildung 4). Abbildung 4: Programmordner nach Installation von R Durch einen Doppelklick auf das R Symbol startet das Programm und Sie sehen die R Konsole (Abbildung 5). Abbildung 5: Die R Konsole 6
4 Installation von Paketen Alternativ können Sie (insbesondere wenn Sie den R-Commander benutzen) die R Konsole auch über die Terminal.app im Ordner Dienstprogramme starten (siehe auch 5.2): Starten Sie die Terminal.app (Doppelklick) Tippen Sie R gefolgt von Enter (Return) ein 4 Installation von Paketen Für einige statistische Verfahren werden Pakete benötigt, die nicht standardmäßig vorinstalliert sind. Diese müssen manuell installiert werden. Dies kann auf zwei im Folgenden erklärten Wegen erfolgen. 4.1 Installation über die R Konsole Geben Sie in der R Konsole folgenden Befehl ein: install.packages(c("rcmdr", "klar", "conjoint", "CTT", "linprog", "rela", "Matching", "rpart", "nortest", "plm", "psych", "pwr", "randomforest", "sampleselection", "lavaan", "tseries", "arules", "arulesviz", "tm", "sem", "paran", "ROCR", "forecast", "XLConnect", "fgarch","strucchange", "irr", "coin"), repos="http://ftp5.gwdg.de/pub/misc/cran/", dependencies=true) Nun sind alle benötigten Pakete installiert. 7
4 Installation von Paketen 4.2 Installation über das Menü Alternativ können Sie die Pakete auch über den Menüpunkt Pakete und Datensätze Paketinstallation installieren (Abbildung 6). Abbildung 6: Menüpunkt Pakete und Datensätze Es öffnet sich das Fenster für die Paketinstallation (Abbildung 7). Hier müssen sie zunächst eine Liste mit den verfügbaren Paketen anfordern. Abbildung 7: Fenster zur Paketinstallation Zunächst müssen Sie entscheiden von welchem CRAN Mirror Sie die Liste holen wollen. Hier empfiehlt sich einer der deutschen Server (Abbildung 8). 8
4 Installation von Paketen Abbildung 8: Liste der CRAN Mirrors Haben Sie einen Server ausgewählt, werden Sie gefragt ob Sie diesen als Standardserver einrichten wollen. Diese Frage können Sie mit Ja beantworten. Nun wird eine Liste mit den verfügbaren Paketen angezeigt. Über das Suchfenster im oberen, rechten Bereich können Sie ein benötigtes Paket suchen (Abbildung 9). Haben Sie das gesuchte Paket gefunden, wählen Sie es aus und klicken auf Installieren. WICHTIG: Setzen Sie ein Häkchen in das Feld inkl. abhängiger Pakete. Nur so können Sie sicher sein, alle benötigten Pakete funktionieren. Abbildung 9: Suche nach Paketen, hier: conjoint 9
1 Für die statistischen Verfahren, die in dieser und weiteren Veranstaltung behandelt werden, benötigen Sie folgende Pakete: Rcmdr lavaan klar tseries conjoint arules CTT arulesviz linprog tm rela sem Matching paran rpart ROCR nortest forecast plm XLConnect psych fgarch pwr irr randomforest coin sampleselection strucchange 10
5 R-Commander 5 R-Commander 5.1 Starten des R-Commanders Um die Arbeit angenehmer zu gestalten nutzen wir den R-Commander als ein (erweiterbares) R Paket, das eine grafische Oberfläche für eine Vielzahl von Funktionen bereitstellt (GUI). Um diesen zu starten geben Sie in der R Konsole einfach den Befehl: library(rcmdr)ein (Abbildung 10). Abbildung 10: Aufrufen des R-Commanders Tipp: Sie müssen nicht bei jedem Neustart von R den Befehl library(rcmdr)von neuem in die R Konsole schreiben. Haben Sie den Befehl einmal eingegeben, können Sie beim nächsten Start von R über die Pfeiltaste den letzten in der R Konsole eingegebenen Befehl sehen. Sollte dies nicht der Befehl library(rcmdr)sein, können Sie über ein erneutes drücken der Pfeiltaste so lange suchen, bis Sie den Befehl library(rcmdr)gefunden haben und diesen dann aufrufen. Es startet der R-Commander und Sie sind bereit sich den Herausforderungen der statistischen Datenanalyse zu stellen. 11
5 R-Commander 5.2 Probleme mit dem R-Commander Ab Mac OS X 10.9 kann es zu starken Verzögerungen bei der Verwendung des R- Commanders aufgrund des Ruhemodusverhaltens von OS X kommen. Sie können dieses Problem vermeiden indem Sie R in einem Terminal Fenster starten. Gehen Sie hierzu folgendermaßen vor: Öffnen Sie den Ordner Dienstprogramme (Utilities) im Ordner Programme und starten Sie die Terminal.app. Es öffnet sich ein neues Terminal Fenster. In der Kommandozeile im Terminal Fenster geben Sie nun R ein und drücken Enter (oder Return). Es startet R und es erscheinen die üblichen Initialisierungsnachrichten. Es folgt die R Kommandozeile mit der Eingabeaufforderung >. Tippen Sie hier wie üblich den Befehl library(rcmdr)ein und bestätigen mit Enter. Der R-Commander startet und Sie können ihn wie gewohnt verwenden. Nachdem Sie den R-Commander geschlossen haben, können sie das Terminal Fenster (unabhängig davon ob Sie R vorher beendet haben) schließen. Ab der R-Commander Version 2.1.3 können Sie Ruheverhalten auch über das Menü ändern (Abbildung 11). Abbildung 11: Verändern des Ruheverhaltens im R-Commander Schalten Sie dort den Ruhemodus aus (Abbildung 12) Abbildung 12: Ausschalten des Ruheverhaltens im R-Commander 12
6 Quellen 6 Quellen http://socserv.mcmaster.ca/jfox/misc/rcmdr/installation-notes.html (letzter Aufruf am 23.02.2015) 13