SE aus Informatik: High Performance Computing in the Cloud



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Transkript:

SE aus Informatik: High Performance Computing in the Cloud Erich Mraz, Maximilian Schorr 8. Juni 2013 Erich Mraz, Maximilian Schorr SE aus Informatik: High Performance Computing in the Cloud 1 / 30

HPC Infrastruktur HPC & Cloud Anwendungsmodi & Herausforderungen HPC Infrastruktur Erich Mraz, Maximilian Schorr SE aus Informatik: High Performance Computing in the Cloud 2 / 30

Cluster Computing HPC hin zur Cloud HPC Infrastruktur HPC & Cloud Anwendungsmodi & Herausforderungen paralleles und verteiltes System Ansammlung eng verbundener Einzelrechner homogene Ressourcen (Hardware und OS) gesammelt an einem Standort idr durch sehr schnelles LAN verbunden arbeiten zusammen als einheitlich integriertes System Single System Image zentralisiertes Job Management & Scheduling System hohe Performance zu geringem Preis und gute Skalierbarkeit Erich Mraz, Maximilian Schorr SE aus Informatik: High Performance Computing in the Cloud 3 / 30

Grid Computing HPC hin zur Cloud HPC Infrastruktur HPC & Cloud Anwendungsmodi & Herausforderungen paralleles und verteiltes System Kombination von Rechenressourcen verschiedener administrativer Domains lose verbunden (Dezentralisation) heterogene Ressourcen haben nicht den selben Standort verbunden über LAN, MAN oder WAN autonome Knoten eigener Resource Manager unabhängige Einheit Diversity und Dynamism verteiltes Job Management & Scheduling Abrechnung von fixem Betrag pro Service oder verschiedene Organisationen teilen sich untätige Ressourcen Teilen, Auswählen und Zusammenlegen (von Ressourcen) dynamisch zur Laufzeit abhängig von ihrer Verfügbarkeit, Leistungsfähigkeiten, Performance, Kosten und QoS Ansprüchen Erich Mraz, Maximilian Schorr SE aus Informatik: High Performance Computing in the Cloud 4 / 30

Cloud Computing HPC hin zur Cloud HPC Infrastruktur HPC & Cloud Anwendungsmodi & Herausforderungen paralleles und verteiltes System Ansammlung zusammenhängender Computer generell homogene Ressourcen (besseres Hardware Management) Daten liegen auf zentralem Server (besseres Daten Management) großer Pool von leicht benutzbaren und on-demand zugänglichen virtualisierten Ressourcen dynamisch bereitgestellt, dargestellt als eine oder mehrere vereinte Rechenressourcen on-demand Bereitstellung von Applikationen skalieren entsprechend variabler Last und erlauben optimale Ausnutzung von Ressourcen pay-per-use Modell IT-Kapazität erhöhen (oder Leistungsfähigkeiten ausbauen) on the fly und in Echtzeit kosteneffektiv Bereitstellen, Konfigurieren und Verwalten von Infrastruktur und es Forschern ermöglichen sich auf die Wissenschaft zu fokusieren und den Aufbau von Software und Experimenten mit Kollegen zu teilen Erich Mraz, Maximilian Schorr SE aus Informatik: High Performance Computing in the Cloud 5 / 30

HPC Infrastruktur HPC & Cloud Anwendungsmodi & Herausforderungen HPC & Cloud Erich Mraz, Maximilian Schorr SE aus Informatik: High Performance Computing in the Cloud 6 / 30

HPC Applikationen HPC hin zur Cloud HPC Infrastruktur HPC & Cloud Anwendungsmodi & Herausforderungen heterogene und dynamische Applikation Workflows eng verbunden großer Aufwand an Interprozessor Kommunikation schnelle Verbindungen zwischen Prozessoren benötigen idr große Mengen Rechenpower für kurze Zeitspanne large scale Erich Mraz, Maximilian Schorr SE aus Informatik: High Performance Computing in the Cloud 7 / 30

HPC & Cloud HPC hin zur Cloud HPC Infrastruktur HPC & Cloud Anwendungsmodi & Herausforderungen Cloud Computing Services stellen Plattform für Applikationen bereit, wenn lokale Infrastruktur nicht verfügbar ist ergänzen existierende Plattformen mit zusätzlichen Kapazitäten oder Leistungsfähigkeiten verbessern Usability und Produktivität von traditionellem HPC Haupt-Anwendungsmodi 1 HPC in the Cloud - gesamte Applikation auslagern 2 HPC plus Cloud - HPC/Grid Ressourcen mit Cloud Services komplementieren 3 HPC as a Cloud - HPC/Grid Ressourcen als Cloud zur Verfügung stellen elastische on-demand Cloud Abstraktionen verwenden Flexibilität von Cloud-Modellen mit der Performance von HPC-Systemen verbinden Abbildung: Hybrid HPC/Grid + Cloud usage modes Erich Mraz, Maximilian Schorr SE aus Informatik: High Performance Computing in the Cloud 8 / 30

HPC Infrastruktur HPC & Cloud Anwendungsmodi & Herausforderungen Anwendungsmodi & Herausforderungen Erich Mraz, Maximilian Schorr SE aus Informatik: High Performance Computing in the Cloud 9 / 30

HPC in the Cloud HPC hin zur Cloud HPC Infrastruktur HPC & Cloud Anwendungsmodi & Herausforderungen nur effektiv bei bestimmten Arten von HPC-Applikationen hohe Parallelität (MapReduce) minimale Synchronization minimale Interprozess-Kommunikation geringe I/O Ansprüche modest scale Herausforderungen mangelnde Leistungsfähigkeiten und Homogenität der Cloud-Hardware fehlende High-Speed Netzwerkverbindung hohe Latenzen unterbinden Vorteile in Skalierbarkeit, Flexibilität und Fehler-Toleranz alternative Code-Formulierungen für Applikationen Erich Mraz, Maximilian Schorr SE aus Informatik: High Performance Computing in the Cloud 10 / 30

HPC plus Cloud HPC hin zur Cloud HPC Infrastruktur HPC & Cloud Anwendungsmodi & Herausforderungen Cloud bursting Applikation läuft auf traditionellen HPC-Ressourcen bursting auf die Cloud bei plötzlich eintretendem Bedarf nach Rechenkapazität Bedarf nach spezieller Leistungsfähigkeit, um heterogene Applikations-Ansprüche zu erfüllen neue und effektivere Nutzungsarten Herausforderungen Heterogenität und Dynamik Ressourcen mit unterschiedlicher Konfiguration, Performance, Verfügbarkeit, Laufzeitverhalten, Stabiliät, Kosten dynamische Anforderungen und Beschränkungen auf Applikationsseite Bereitstellung und Scheduling geeigneter Ressourcen hinsichtlich Kosten/Leistung autonomes Monitoring und Management von dynamischem Verhalten und Anforderungen Erich Mraz, Maximilian Schorr SE aus Informatik: High Performance Computing in the Cloud 11 / 30

HPC as a Cloud HPC hin zur Cloud HPC Infrastruktur HPC & Cloud Anwendungsmodi & Herausforderungen HPC Ressourcen werden mittels Cloud Computing-Abstraktionen als on-demand Ressourcen angeboten speziell für HPC Applikationen Hardware mit schnelleren Prozessoren und Netzwerkverbindungen nicht-virtualisierte Hardware zwei Hauptansätze Large HPC systems Small HPC clusters connected together Physical Solutions Physical Solutions Virtualized Solutions E.g., Blue Gene/P E.g., Penguin on Demand, E.g., EC2 Compute as a Service Silicon Graphics, HPCynergy Cluster, Azure, Adaptive Systems, CloudCycle Tabelle: Cloud Paradigms and Practices for CDS&E, Table 1: HPC as a Cloud classification Herausforderungen Scale & Performance Bereitstellung - Aufbau einer virtuellen Schicht zwecks einfacher Konfiguration und Zugang zu HPC Ressourcen als Cloud Flexibilität und on-demand Zugang aufgesetzt auf batch-queue Systeme Programmierbarkeit unabhängig von der darunterliegenden Hardware Erich Mraz, Maximilian Schorr SE aus Informatik: High Performance Computing in the Cloud 12 / 30

Summary of the key usage modes HPC Infrastruktur HPC & Cloud Anwendungsmodi & Herausforderungen Advantages Disadvantages Typical applications Sample systems HPC Easy to use, Low performance, E/P, L/S, A, HTC Amazon EC2, in the Cloud infinite resources expensive Microsoft Azure HPC Elasticity, on Small scale, limited QoS, S, M, HPC, MTC EC2CC, SGI, POD as a Cloud demand access medium performance HPC Acceleration, Different prices, performance, HPC + CometCloud, plus Cloud conservation, resilience availability of resources Analytics/Visualization InterGrid, GridWay Tabelle: Cloud Paradigms and Practices for CDS&E, Table 2: HPC Cloud landscape Erich Mraz, Maximilian Schorr SE aus Informatik: High Performance Computing in the Cloud 13 / 30

Public - Cloud - Vergleiche Erich Mraz, Maximilian Schorr SE aus Informatik: High Performance Computing in the Cloud 14 / 30

Informationen HPC hin zur Cloud Wichtige Fragen: Was wird bereitgestellt? Wie ist die Performance?? Welche Public-Clouds: Amazon Elastic Cloud Compute (EC2) Microsoft Windows Azure Rackspace Erich Mraz, Maximilian Schorr SE aus Informatik: High Performance Computing in the Cloud 15 / 30

Hardware und Softwarekonfigurationen Amazon EC2: Ram: 613MByte bis 68GByte Konfigurationen: drei große mit jeweils 8 CPU Kernen 1 high I/O performance 2 high memory size 3 high CPU performance Betriebssysteme: 1 5 GNU/Linux Versionen 2 5 Windows Versionen Clustermöglichkeit: 1 5 oder 8 Knoten 2 Spezieller Kluster für hohe I/O performance 3 GPU Cluster CPU: eingeteilt in Compute Units 2007 Intel Xeon 1.0-1.2Ghz 2006 Intel Xeon 1.6Ghz Erich Mraz, Maximilian Schorr SE aus Informatik: High Performance Computing in the Cloud 16 / 30

Hardware and Software Configurations Microsoft Windows Azure: Ram: 768MByte bis 14GByte Konfigurationen: 5 1 1Ghz single Core (Quelle: Azure) 2 1.6Ghz 8 Core (Quelle: Azure) Betriebssysteme: Rackspace: 1 4 GNU/Linux Versionen 2 5 Windows Versionen Ram: 256MByte bis 30GByte Konfigurationen: 8 Single virtual Core 8 virtual Cores Betriebssysteme: 1 20 GNU/Linux Versionen 2 9 Windows Versionen Erich Mraz, Maximilian Schorr SE aus Informatik: High Performance Computing in the Cloud 17 / 30

Instanzen - Setup HPC hin zur Cloud 1 Amazon EC2 Tool mit acht Schritten Linux Kernel Version Windows Mehrere Instanzen gleichzeitig erstellbar 2 Windows Azure Vier Schritte nötig Instanzen müssen einzeln erstellt werden 3 Rackspace Drei Schritte 1 Betriebssystem 2 Name des Systems 3 Größe der Maschine Instanzen müssen einzeln erstellt werden Erich Mraz, Maximilian Schorr SE aus Informatik: High Performance Computing in the Cloud 18 / 30

Erich Mraz, Maximilian Schorr SE aus Informatik: High Performance Computing in the Cloud 19 / 30

- NPB HPC hin zur Cloud Numerical Aerodynamic Simulation Parallel (NPB) Bechmark um hochparallele Supercomputer zu vergleichen NASA Advanced Supercomputing (NAS) Division OpenMP und MPI Implementierungen ammlung zum Testen von: 1 Floating point performance: BT, EP, SP 2 Integer performance: IS 3 Communication performance: CG, FT, LU, MG, UA 4 Data Movement performance: DT Programmiersprachen: C und Fortran Erich Mraz, Maximilian Schorr SE aus Informatik: High Performance Computing in the Cloud 20 / 30

- eingesetzte Hardware Parameter EC2 Azure Rackspace Cluster Instanzname High-CPU Extra Large - - Extra Large VM CPU Typ 2006/07 - - Intel Xeon Intel Xeon E5530 CPU Takt (GHz) 2.5-3.0 1.6 2.4 2.33 CPU Kerne 8 8 8 8 RAM/Maschine 7 14 30 12 (GByte) Tabelle: Eigenschaften der Benchmarkmaschinen Erich Mraz, Maximilian Schorr SE aus Informatik: High Performance Computing in the Cloud 21 / 30

Benchmarkergebnisse - NPB Abbildung: Links: OpenMP bei Benutzung eines Knotens Rechts: MPI bei Benutzung von zwei Knoten CPU: Floating Point: BT, EP, SP - Integer: IS Communication: CG, FT, LU, MG, UA - Data Movement: DT Erich Mraz, Maximilian Schorr SE aus Informatik: High Performance Computing in the Cloud 22 / 30

Benchmarkergebnisse - NPB & Durchschnittsergebnisse Abbildung: Links: MPI bei Benutzung von vier Knoten Rechts: Durchschnittsergebnisse CPU: Floating Point: BT, EP, SP - Integer: IS Communication: CG, FT, LU, MG, UA - Data Movement: DT Erich Mraz, Maximilian Schorr SE aus Informatik: High Performance Computing in the Cloud 23 / 30

- Erkenntnisse Ein Knoten: Cluster war schnellstes System Zwei Knoten: Cluster war schnellstes System Azure erreicht fast Clusterergebnisse Vier Knoten: Azure ist schneller als das Clustersystem Aufgrund von schnellem Netzwerktransfer? Cloud bringt Vorteile bei großem Rechenaufwand / hoher Parallelität Erich Mraz, Maximilian Schorr SE aus Informatik: High Performance Computing in the Cloud 24 / 30

Erich Mraz, Maximilian Schorr SE aus Informatik: High Performance Computing in the Cloud 25 / 30

Kosten - Cluster HPC hin zur Cloud Clusteranschaffungskosten: 12.000$ Kosten pro Stunde bei einer Nutzungsdauer von drei Jahren: 12.000$ 3 365 24 = 0.457$/h Angenommen der Cluster verbraucht bei Volllast 275W Preis für eine Kilowattstunde: 0.0991$ 275W 0.0991$ = 0.0273$/h Kosten pro Stunde für den Cluster: 0.484$/h Erich Mraz, Maximilian Schorr SE aus Informatik: High Performance Computing in the Cloud 26 / 30

Kostenvergleich - Kosten pro Stunde Parameter EC2 Azure Rackspace Cluster Cloudkosten 0.66 0.64 1.80 - Hardwarekosten - - - 0.475 Stromkosten - - - 0.0273 Kosten pro Node 0.66 0.64 1.80 0.484 Kosten für zwei Nodes 1.32 1.28 3.60 0.968 Kosten für vier Nodes 2.64 2.56 7.20 1.936 Tabelle: Kosten in USD pro Stunde Cluster (nur) bei hoher Nutzungsdauer im Kostenvorteil Erich Mraz, Maximilian Schorr SE aus Informatik: High Performance Computing in the Cloud 27 / 30

Kostenvergleich - und Break Even Point Kosten pro Stunde bei gleicher Rechenarbeit = durchschnittliche Performance Kosten pro Stunde Break Even Point Tag an dem die Cloudkosten gleich dem Anschaffungspreis der Cluster sind Break Even Point = JahreskostenCluster 24 Clusterkosten: 4239.8$ pro Jahr Erich Mraz, Maximilian Schorr SE aus Informatik: High Performance Computing in the Cloud 28 / 30

Kostenvergleich - und Break Even Point Parameter EC2 Azure Rackspace Cluster Ausführungszeit 1 Knoten 361.3 172.3 187.1 100.0 der 2 Knoten 281.0 146.7 382.8 100.0 (in %) 4 Knoten 120.7 73.2 140.2 100.0 1 Knoten 2.39 1.10 3.37 0.484 (in $ pro Stunde) 2 Knoten 3.71 1.89 13.78 0.968 4 Knoten 3.19 1.14 10.09 1.936 Break Even Point 1 Konten 74 161 53 - (in Tagen) 2 Knoten 96 187 26-4 Knoten 222 620 71 - Tabelle: und Break Even Erich Mraz, Maximilian Schorr SE aus Informatik: High Performance Computing in the Cloud 29 / 30

Kosten & Effizienz - Erkenntnisse Cluster meist effizienter als Cloud 1 Knoten zu 2 Knoten: kaum Effizienzänderung 4 Knoten Clouds erreichen bessere 4 Knoten: Azure ist 41% Koteneffizienter als der Cluster d.h.: Azure kostet 41% weniger um die gleiche Arbeit zu erledigen als der Cluster Break Even Point Kleinster Break Even: Rackspace mit zwei Knoten 26 Tage Break Even, jedoch nur bei vollen 26 Tagen Rechenzeit Größter Break Even: Azure mit vier Knoten 620 Tage Erich Mraz, Maximilian Schorr SE aus Informatik: High Performance Computing in the Cloud 30 / 30