MiSeq System Handbuch zur Standortvorbereitung

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1 MiSeq System Handbuch zur Standortvorbereitung NUR FÜR FORSCHUNGSZWECKE Versionshistorie 3 Einleitung 4 Lieferung und Installation 6 Laboranforderungen 7 Elektrische Anforderungen 10 Unterbrechungsfreie Stromversorgung 11 Produkt-Zertifizierungen und -Compliance 12 Umgebungsanforderungen 13 Netzwerkerwägungen 14 Virenschutz-Software 16 Vom Benutzer bereitzustellende Verbrauchsmaterialien und Geräte 17 Platzanforderungen für die Lagerung der Verbrauchsmaterialien 19 Technische Unterstützung ILLUMINA EIGENTUMSRECHTLICH GESCHÜTZT Teile-Nr Rev. F DEU August 2014

2 Dieses Dokument und dessen Inhalt sind Eigentum von Illumina, Inc. und verbundenen Unternehmen ( Illumina ) und ausschließlich für den bestimmungsgemäßen Gebrauch durch den Kunden in Verbindung mit dem Gebrauch des hier beschriebenen Produkts (der hier beschriebenen Produkte) und für keinen anderen Bestimmungszweck ausgelegt. Dieses Dokument und dessen Inhalt dürfen ohne schriftliches Einverständnis von Illumina nicht verwendet und zu keinem anderen Zweck verteilt bzw. anderweitig übermittelt, offengelegt oder auf irgendeine Weise reproduziert werden. Illumina überträgt mit diesem Dokument keine Lizenzen unter seinem Patent, Markenzeichen, Urheberrecht oder bürgerlichem Recht bzw. ähnlichen Rechten an Drittparteien. Die Anweisungen in diesem Dokument müssen von qualifiziertem und entsprechend ausgebildetem Personal genau befolgt werden, damit die in diesem Dokument beschriebene Anwendung der Produkte sicher und ordnungsgemäß erfolgt. Vor der Verwendung dieser Produkte muss der Inhalt dieses Dokuments vollständig gelesen und verstanden worden sein. FALLS NICHT ALLE HIERIN AUFGEFÜHRTEN ANWEISUNGEN VOLLSTÄNDIG GELESEN UND BEFOLGT WERDEN, KÖNNEN PRODUKTSCHÄDEN, VERLETZUNGEN DER BENUTZER UND ANDERER PERSONEN SOWIE ANDERWEITIGER SACHSCHADEN EINTRETEN. ILLUMINA ÜBERNIMMT KEINERLEI HAFTUNG FÜR SCHÄDEN, DIE AUS DER UNSACHGEMÄSSEN VERWENDUNG DER HIERIN BESCHRIEBENEN PRODUKTE (EINSCHLIESSLICH TEILEN HIERVON ODER DER SOFTWARE) ENTSTEHEN, ODER JEDER ANDEREN ART DER VERWENDUNG DER PRODUKTE AUSSERHALB DES GÜLTIGKEITSBEREICHS DER AUSDRÜCKLICHEN SCHRIFTLICHEN LIZENZEN ODER DER DURCH ILLUMINA GENEHMIGTEN ZULASSUNGEN IN VERBINDUNG MIT DEM ERWERB DER PRODUKTE DURCH DEN KUNDEN. NUR FÜR FORSCHUNGSZWECKE Illumina, Inc. Alle Rechte vorbehalten. Illumina, 24sure, BaseSpace, BeadArray, BlueFish, BlueFuse, BlueGnome, cbot, CSPro, CytoChip, DesignStudio, Epicentre, GAIIx, Genetic Energy, Genome Analyzer, GenomeStudio, GoldenGate, HiScan, HiSeq, HiSeq X, Infinium, iscan, iselect, ForenSeq, MiSeq, MiSeqDx, MiSeq FGx, NeoPrep, Nextera, NextBio, NextSeq, Powered by Illumina, SeqMonitor, SureMDA, TruGenome, TruSeq, TruSight, Understand Your Genome, UYG, VeraCode, verifi, VeriSeq, die orangene Farbe und das Streaming-Basen-Design sind Marken von Illumina, Inc. und/oder ihren Tochtergesellschaften in den USA und/oder in anderen Ländern. Alle anderen Namen, Logos und Marken sind Eigentum der jeweiligen Eigentümer.

3 Versionshistorie Teile-Nr. Überarbeitete Fassung Datum Beschreibung der Änderung _DEU F August 2014 Kompatibilitätsempfehlungen für Netzwerkwartungsaktivitäten wurden hinzugefügt. Die Informationen zur Virenschutz-Software- Konfiguration wurden aktualisiert. Die Produktzertifizierungs- und Compliance- Informationen wurden aktualisiert. Natriumhypochlorit für Matrizenleitungswaschläufe wurde zur Liste der vom Benutzer bereitzustellenden Verbrauchsmaterialien hinzugefügt. Informationen zum VeriSeq-Workflow wurden zu Weitere Ressourcen hinzugefügt. VWR-Katalognummer für Alkoholtücher in geändert. SDS-Link zu support.illumina.com/sds.html aktualisiert E April 2014 Nur in Englisch verfügbar. Die Angabe zur Schwankung der Umgebungstemperatur im Labor wurde entfernt. Die Angabe zum Temperaturbereich des Labors wurde in 19 C bis 25 C (22 C ±3 C) geändert. Die Angabe zur relativen, nicht kondensierenden Luftfeuchtigkeit im Labor wurde in 30 bis 75 % geändert D Oktober 2013 Nur in Englisch verfügbar. Tris-Cl 10 mm, ph 8,5 wurde aus der Liste der vom Benutzer bereitzustellenden Verbrauchsmaterialien entfernt. Tween 20 zur Durchführung von Gerätewaschläufen wurde zur Liste der vom Benutzer bereitzustellenden Verbrauchsmaterialien hinzugefügt. Mikrozentrifugenröhrchen zur Liste der vom Benutzer bereitzustellenden Verbrauchsmaterialien hinzugefügt _DEU C Februar 2012 Informationen über das falsche Verschieben des MiSeq-Systems hinzugefügt _DEU B Dezember A September 2011 Hinweis hinzugefügt, dass für die Sequenzierung von PCR-Amplikonen die Platzierung des Geräts in einem Nach-PCR-Labor empfohlen wird. Informationen über generatorgestützte Stromausfälle bei Sequenzierungsläufen hinzugefügt. Nur in Englisch verfügbar. Erste Version Versionshistorie MiSeq-System Handbuch zur Standortvorbereitung 3

4 Einleitung Dieses Handbuch enthält Spezifikationen und Richtlinien zur Vorbereitung Ihres Standorts für die Installation und den Betrieb des Illumina MiSeq -Systems. } Laborplatzanforderungen } Elektrische Anforderungen } Umgebungsbedingungen } IT-Anforderungen } Vom Benutzer bereitzustellende Verbrauchsmaterialien und Geräte Weitere Ressourcen Die folgenden Dokumente stehen auf der Illumina-Website zum Herunterladen zur Verfügung. Ressource MiSeq-System Sicherheits- und Compliance-Handbuch MiSeq-Workflow Kurzanleitungskarten Illumina Experiment Manager Benutzerhandbuch BlueFuse Workflow Manager Referenzhandbuch MiSeq-Probenblatt Kurzanleitung MiSeq Handbuch zur Reagenzienvorbereitung DNA-Bibliotheken für die Sequenzierung auf dem MiSeq vorbereiten Anwendungsspezifische Primer im MiSeq verwenden Beschreibung Bietet Informationen zu Gerätekennzeichnungen und Compliance-Zertifizierungen sowie sicherheitsbezogene Informationen. Enthalten eine zweiseitige grafische Darstellung des Workflows für erfahrene Benutzer. Die Kurzanleitungskarten fassen die Probenvorbereitung, die Laufkonfiguration und die Laufüberwachung zusammen und geben einen Überblick über die von MiSeq Reporter durchgeführte Analyse. Bietet Anweisungen zum Erstellen von Probenplatten und Probenblättern für unterschiedliche Workflows und Bibliothekstypen. Illumina empfiehlt, das Probenblatt während der Probenvorbereitung zu erstellen. Bietet Anweisungen zum Erstellen von Probenplatten und Probenblättern für Kunden, die den VeriSeq-Workflow durchführen. Illumina empfiehlt, das Probenblatt während der Probenvorbereitung zu erstellen. Enthält Informationen über das Hinzufügen von Probenblatteinstellungen zu Ihrem Probenblatt. Enthält eine Beschreibung des Kit-Inhalts sowie Anweisungen zum Vorbereiten der Reagenzienkartusche, bevor Sie mit dem Sequenzierungslauf beginnen. Bietet Anweisungen zum Denaturieren und Verdünnen von vorbereiteten Probenbibliotheken vor der Sequenzierung auf dem MiSeq sowie zum Vorbereiten einer PhiX- Kontrolle. Dieser Schritt gilt für die meisten Bibliothekstypen. Bietet Anweisungen für das Vorbereiten und Laden von anwendungsspezifischen Primern und das Bearbeiten des Probenblatts für anwendungsspezifische Primer. 4 Teile-Nr Rev. F DEU

5 Ressource MiSeq-System Benutzerhandbuch Beschreibung Bietet einen Überblick über die Gerätekomponenten und die Software sowie Anweisungen für die Durchführung von Sequenzierungsläufen. Außerdem werden die Verfahren für eine ordnungsgemäße Wartung des Geräts und zur Fehlerbehebung beschrieben. Einleitung MiSeq Reporter Benutzerhandbuch BlueFuse Multi Referenzhandbuch MiSeq Reporter Online-Hilfe BaseSpace Online-Hilfe Bietet einen umfassenden Überblick über Analyseverfahren, Analyse-Workflows und die von MiSeq Reporter generierten Ausgabedateien sowie IT- Anforderungen, Anweisungen für die Installation separat vom Gerät und Informationen zur Fehlerbehebung. Für Kunden, die den VeriSeq-Workflow durchführen, bietet das Referenzhandbuch einen umfassenden Überblick über Analyseverfahren, Analyse-Workflows und von BlueFuse Multi generierte Dateien sowie IT-Anforderungen und Informationen zur Fehlerbehebung. Enthält Anweisungen zur Verwendung der MiSeq Reporter-Software. Enthält Anweisungen zur Verwendung von BaseSpace sowie Beschreibungen zu den Diagrammen der einzelnen Analyse-Workflows. Auf der MiSeq-System-Supportseite der Illumina-Website können Sie auf Dokumentation, Software-Downloads, Online-Schulungen und häufig gestellte Fragen zugreifen. MiSeq-System Handbuch zur Standortvorbereitung 5

6 Lieferung und Installation Ein von Illumina beauftragtes Unternehmen liefert das Gerät, packt das System aus und platziert es auf dem Labortisch. Der Platz und der Tisch müssen vor der Lieferung bereit stehen. VORSICHT Nur von Illumina autorisiertes Personal darf das Gerät auspacken, installieren oder transportieren. Durch eine falsche Handhabung des Geräts können die Ausrichtung beeinflusst oder Gerätekomponenten beschädigt werden. Ein Mitarbeiter von Illumina wird das Gerät installieren und vorbereiten. Wenn Sie das Gerät mit einem Datenverwaltungssystem oder Remote-Netzwerk verbinden möchten, vergewissern Sie sich, dass der Pfad für die Datenspeicherung vor dem Datum der Installation festgelegt ist. Der Illumina-Mitarbeiter kann die Datenübertragung im Rahmen der Installation testen. VORSICHT Platzieren Sie das Gerät nicht an einem anderen Standort, nachdem der Illumina- Mitarbeiter das Gerät installiert und vorbereitet hat. Ein unsachgemäßes Bewegen des Geräts kann zur Beeinträchtigung der Ausrichtung der optischen Elemente und der Datenintegrität führen. Falls Sie den Standort des Geräts ändern müssen, wenden Sie sich an Ihren Illumina-Vertreter. Maße und Inhalt der Transportkiste Das MiSeq-Gerät wird in einer Transportkiste geliefert. Anhand der folgenden Maße können Sie die Mindest-Türbreite ermitteln, die für den Lieferbehälter erforderlich ist. Maßangabe Breite Höhe Tiefe Gewicht Maße der Transportkiste 72,4 cm 76,8 cm 83,8 cm 90,7 kg Die Transportkiste enthält das MiSeq-Gerät zusammen mit den folgenden Komponenten: } Abfallflasche, Auffangschale und zwei Etiketten für die Positionen der Versandfixierungen. } MiSeq-Zubehör-Kit mit den folgenden Komponenten: MiSeq-System Benutzerhandbuch MiSeq-System Sicherheits- und Compliance-Handbuch Waschablage Waschflasche, 500 ml Stopfen für die Abfallflasche (rot) Sechskantschlüssel mit T-Griff, 6 mm Sechskantschlüssel mit T-Griff, 5/64 Zoll Netzwerkkabel, geschirmt CAT6 } Netzkabel 6 Teile-Nr Rev. F DEU

7 Laboranforderungen Gerätemaße Dieser Abschnitt enthält die Anforderungen und Richtlinien für die ordnungsgemäße Einrichtung Ihres Labors für das MiSeq-Gerät. Weitere Informationen finden Sie unter Umgebungsanforderungen auf Seite 13. Abbildung 1 MiSeq-Gerät Laboranforderungen Das MiSeq-Gerät besitzt bei der Installation die folgenden Maße: Maßangabe Breite Höhe Tiefe Gewicht Gerätemaße 68,6 cm 52,3 cm 56,5 cm 57,2 kg Platzierungsanforderungen Das MiSeq-Gerät muss so positioniert werden, dass der Zugang zum Netzschalter und zur Steckdose, eine ordnungsgemäße Belüftung und der Zugang für Wartungsarbeiten am Gerät gewährleistet sind. } Stellen Sie sicher, dass Sie um die rechte Seite des Geräts herum fassen können, um den Netzschalter an der Rückseite neben dem Netzkabel betätigen können. } Positionieren Sie das Gerät so, dass das Personal das Netzkabel schnell von der Steckdose trennen kann. } Das Gerät muss von allen Seiten zugänglich sein, wobei die folgenden Mindestabstände einzuhalten sind: Zugang Seiten Rückseite Mindestabstand Mindestens 61 cm an jeder Seite des Geräts. Mindestens 10,2 cm hinter dem Gerät. MiSeq-System Handbuch zur Standortvorbereitung 7

8 Zugang Oberseite Mindestabstand Mindestens 61 cm über dem Gerät. Wenn das Gerät unter einem Regalbrett positioniert wird, vergewissern Sie sich, dass der erforderliche Mindestabstand eingehalten wird. VORSICHT Wenn Sie den Standort des MiSeq-Geräts ändern müssen, wenden Sie sich an Ihren Illumina-Vertreter. Ein unsachgemäßes Bewegen des Geräts kann zur Beeinträchtigung der Ausrichtung der optischen Elemente und der Datenintegrität führen. Labortisch-Richtlinien Illumina empfiehlt, das Gerät auf einem Labortisch ohne Rollen zu platzieren. Der Labortisch muss das Gewicht des Geräts (57,2 kg) tragen können. Breite Höhe Tiefe Rollen 122 cm 91,4 cm 76,2 cm Nein Kunden in Nordamerika empfiehlt Illumina den folgenden Labortisch: Bench-Tek Solutions ( Teile-Nr. BT40CR-3048BS-PS Richtlinien hinsichtlich Erschütterungen VORSICHT Das MiSeq-Gerät ist empfindlich gegen Vibrationen. Beachten Sie die folgenden Richtlinien, um Vibrationen bei den Sequenzierungsläufen zu minimieren und eine optimale Leistung sicherzustellen: } Platzieren Sie das Gerät auf einem stabilen unbeweglichen Labortisch. } Platzieren Sie kein anderes Gerät auf dem Tisch, das Vibrationen hervorrufen könnte, wie z. B. Rüttler, Vortexer, Zentrifugen oder Geräte mit starken Lüftern. } Installieren Sie das Gerät nicht in der Nähe von häufig benutzten Türen. Das Öffnen und Schließen von Türen könnte Erschütterungen hervorrufen. } Installieren Sie keinen Tastaturauszug unter dem Tisch. } Berühren Sie während einer Sequenzierung nicht das Gerät und öffnen Sie nicht die Reagenzienkammer oder die Fließzellenkammer. } Stellen Sie keine Gegenstände auf das Gerät. Laboreinrichtung für PCR Der PCR-Prozess (Polymerase Chain Reaction, Polymerase-Kettenreaktion) wird mit einigen Probenvorbereitungskits von Illumina verwendet, um Bibliotheken für die Amplikon-Sequenzierung vorzubereiten. Weitere Informationen finden Sie auf den Supportseiten der Illumina-Website. Wenn Sie nicht mit ausreichender Vorsicht vorgehen, können PCR-Produkte Reagenzien, Geräte und Proben kontaminieren, was zu ungenauen und unzuverlässigen Ergebnissen führt. Die PCR-Produktkontamination kann Laborprozesse beeinträchtigen und die normalen Betriebsabläufe verzögern. VORSICHT Legen Sie zur Vermeidung einer PCR-Produktkontamination dedizierte Bereiche und Laborverfahren fest, bevor Sie mit der Arbeit im Labor beginnen. 8 Teile-Nr Rev. F DEU

9 Zuweisen räumlich getrennter Bereiche Stellen Sie sicher, dass Ihr Labor ordnungsgemäß eingerichtet ist, um das Risiko der PCR-Produktkontamination zu verringern. Wenn Sie beabsichtigen, das MiSeq-Gerät zum Sequenzieren von PCR-Amplikonen zu verwenden, muss sich das Gerät im Nach- PCR-Labor befinden. Weisen Sie einen räumlich getrennten Vor-PCR-Laborplatz zu, wo Vor-PCR- Prozesse durchgeführt werden (DNA-Extraktion, -Quantifizierung und - Normalisierung). Weisen Sie einen räumlich getrennten Nach-PCR-Laborplatz zu, wo PCR- Produkte hergestellt und verarbeitet werden. Verwenden Sie zum Waschen von Vor- und Nach-PCR-Materialien nicht dasselbe Waschbecken. Verwenden Sie für Vor- und Nach-PCR-Prozesse nicht dieselben Wasserreinigungssysteme. Lagern Sie alle Materialien, die in Vor-PCR-Protokollen verwendet werden, im Vor-PCR-Bereich und bringen Sie sie nach Bedarf in den Nach-PCR-Bereich. Laboranforderungen Zuweisen von Gerätschaften und Materialien Weisen Sie vollständige Sätze von Gerätschaften und Materialien (Pipetten, Inkubator, Hitzeblock, Vortexer, Zentrifuge usw.) bestimmten Vor-PCR- und Nach-PCR-Laborprozessen zu. Verwenden Sie Geräte und Verbrauchsmaterialien nicht in beiden Prozessen. Weisen Sie separate Lagerbereiche (Gefrier- und Kühlschränke) für vor und nach der PCR benötigte Verbrauchsmaterialien zu. MiSeq-System Handbuch zur Standortvorbereitung 9

10 Elektrische Anforderungen In diesem Abschnitt werden Leistungsangaben aufgeführt und die elektrischen Anforderungen für Ihre Einrichtung beschrieben. Stromversorgung Typ Netzspannung Stromverbrauch Spezifikation Volt Wechselstrom bei 50/60 Hz 400 Watt Kupplungen Die Elektroinstallation Ihrer Einrichtung muss die folgenden Vorgaben erfüllen: } Für 100 bis 110 Volt Wechselstrom Es ist eine geerdete, dedizierte 10-A-Leitung mit ordnungsgemäßer Spannung und elektrischer Erdung erforderlich. Nordamerika und Japan Kupplung: NEMA 5-15 } Für 220 bis 240 Volt Wechselstrom: Es ist eine geerdete 6-A-Leitung mit ordnungsgemäßer Spannung und elektrischer Erdung erforderlich. } Wenn die Spannung um mehr als 10 % schwankt, ist ein Stromleitungsregler erforderlich. Schutzerde Das Gerät ist über das Gehäuse mit der Schutzerde verbunden. Der Schutzleiter des Stromkabels führt den Schutzleiter an einen sicheren Bezugspunkt zurück. Die Schutzleiter-Verbindung des Netzkabels muss sich in gutem Zustand befinden, wenn dieses Gerät verwendet wird. Netzkabel Sicherungen Im Lieferumfang des Geräts sind eine internationale standardmäßige IEC C13- Kupplung und ein landesspezifisches Netzkabel enthalten. Es liegen nur dann keine gefährlichen Spannungen am Gerät an, wenn das Netzkabel von der Wechselstromquelle abgezogen wurde. Wenden Sie sich an einen Drittanbieter wie Interpower Corporation ( um äquivalente Kupplungen oder Netzkabel zu erhalten, die den lokalen Standards entsprechen. VORSICHT Verwenden Sie niemals ein Verlängerungskabel, um das Gerät an eine Stromquelle anzuschließen. Das MiSeq-Gerät enthält keine vom Benutzer austauschbaren Sicherungen. 10 Teile-Nr Rev. F DEU

11 Unterbrechungsfreie Stromversorgung Illumina empfiehlt die Verwendung einer vom Benutzer bereitzustellenden unterbrechungsfreien Stromversorgung (USV). Illumina ist unabhängig davon, ob das Gerät an eine USV angeschlossen ist, nicht für Läufe verantwortlich, die von Stromausfällen betroffen sind. Eine standardmäßige generatorgestützte Stromversorgung ist oft nicht unterbrechungsfrei und ein kurzer Stromausfall tritt auf, bevor die Stromversorgung wiederhergestellt wird, wodurch ein Sequenzierungslauf unterbrochen wird. Beachten Sie die landesspezifischen Empfehlungen in der folgenden Tabelle. Spezifikation APC Smart UPS #SUA1500JB (Japan) APC Back-UPS Pro #BR1500G (Nordamerika) Max. Watt 980 W 865 W 865 W APC Back-UPS Pro #BR1500GI (International) Max. Stromstärke 1500 VA 1500 VA 1500 VA Eingangsspannung (nominal) 100 VAC 120 VAC 230 VAC Eingangsverbindung NEMA 5-15P NEMA 5-15P IEC-320 C14 Typische Laufzeit (50 % Ladung) 23,9 Minuten 12,8 Minuten 15,8 Minuten Unterbrechungsfreie Stromversorgung Typische Laufzeit (100 % Ladung) 6,7 Minuten 3 Minuten 5,5 Minuten Wenden Sie sich an einen Drittanbieter wie Interpower Corporation ( um eine äquivalente USV zu erhalten, die den lokalen Standards für Einrichtungen außerhalb der angegebenen Regionen entspricht. MiSeq-System Handbuch zur Standortvorbereitung 11

12 Produkt-Zertifizierungen und -Compliance Das MiSeq-System wurde den folgenden Standards entsprechend zertifiziert: } UL STD } CSA STD C22.2 No } IEC/EN } IEC/EN } IEC/EN Das MiSeq-System erfüllt die folgenden Richtlinien: } Niederspannungsrichtlinie 2006/95/EG } EMV-Richtlinie 2004/108/EG } R&TTE-Richtlinie 1999/5/EG 12 Teile-Nr Rev. F DEU

13 Umgebungsanforderungen Element Temperatur Luftfeuchtigkeit Höhe Luftqualität Lüftung Spezifikation Die Labortemperatur muss 19 C bis 25 C (22 C ± 3 C) betragen. Diese Temperatur ist die Betriebstemperatur des Geräts. Es muss eine relative, nicht kondensierende Luftfeuchtigkeit zwischen 30 und 75 % aufrechterhalten werden. Der Standort des Geräts muss sich in unter 2000 Metern Höhe befinden. Das Gerät muss in einer Umgebung mit dem Verschmutzungsgrad II oder besser betrieben werden. Eine Umgebung mit dem Verschmutzungsgrad II ist als Umgebung definiert, in der sich in der Regel nur nichtleitende Verschmutzungen befinden. Erkundigen Sie sich bei Ihrer für die Einrichtungen zuständigen Abteilung nach den Lüftungsanforderungen, die von der Wärmeabgabe des Geräts abhängig sind. Umgebungsanforderungen Wärmeabgabe Gemessene Wärmeleistung Leistung 400 Watt Btu/h Lärmemission Das MiSeq-Gerät ist ein luftgekühltes Gerät. Die Geräusche des Lüfters sind deutlich hörbar, wenn das Gerät in Betrieb ist. Lärmemission Abstand zum Gerät (db) < 62 db 1 Meter Eine Messung von < 62 db entspricht dem Geräuschpegel eines normalen Gesprächs in einem Abstand von etwa 1 m. MiSeq-System Handbuch zur Standortvorbereitung 13

14 Netzwerkerwägungen Aufgrund der vom MiSeq-Gerät generierten Datenmenge wird eine Netzwerkverbindung empfohlen. } Im Lieferumfang des Geräts ist ein geschirmtes CAT6-Netzwerkkabel mit drei Metern Länge enthalten. Um die folgenden Funktionen zu verwenden, sind Netzwerk- und Internetverbindungen erforderlich: } Empfangen und Installieren von Software-Updates über die MiSeq Control Software- Schnittstelle. } Zugreifen auf Manifestdateien, Probenblätter und Referenzen auf einem Netzwerkserver über die MCS-Schnittstelle. } Einfaches Verschieben von Daten aus früheren Läufen und Analysen an einen Serverspeicherort zur Aufbewahrung sowie zum Verwalten des Speicherplatzes auf dem integrierten MiSeq-Computer. } Überwachen des aktuellen Laufs mithilfe der Illumina Sequenzierungsanalyse- Viewer-Software (optional). } Überwachen und Verwalten der Sekundäranalyse mithilfe der MiSeq Reporter- Analysesoftware. } Verwenden von Live Help, einer integrierten Funktion, die Sie zur Fehlerbehebung mit dem technischen Support von Illumina verbindet. Beachten Sie die folgenden Empfehlungen für die Installation und Konfiguration einer Netzwerkverbindung: } Verwenden Sie zwischen dem Gerät und Ihrem Datenverwaltungssystem eine 1-Gigabit-Verbindung. Diese Verbindung kann direkt oder über einen Netzwerk- Switch hergestellt werden. } Konfigurieren Sie Windows Update so, dass bei der Verbindung mit einem Netzwerk das MiSeq-System nicht automatisch aktualisiert wird. Illumina empfiehlt, nach Veröffentlichung einer neuen Windows-Version mit der Aktualisierung einen Monat zu warten. Netzwerkunterstützung Illumina bietet keine Installations- oder Kundendienstleistungen hinsichtlich der Netzwerkverbindung des Geräts. Prüfen Sie die Netzwerkwartungs-Aktivitäten auf folgende mögliche Kompatibilitätsrisiken mit dem Illumina-System: } Entfernung der Gruppenrichtlinienobjekte (Group Policy Objects, GPO): GPO können sich auf das Betriebssystem (BS) verbundener Illumina-Ressourcen auswirken. BS-Änderungen können die proprietäre Software in Illumina-Systemen stören. Geräte von Illumina wurden auf ihren korrekten Betrieb hin getestet und verifiziert. Nach der Verbindung mit Domänen-GPOs können sich einige Einstellungen auf die Gerätesoftware auswirken. Wenn die Gerätesoftware nicht ordnungsgemäß funktioniert, fragen Sie den IT-Administrator Ihrer Einrichtung nach einer möglichen GPO-Störung. 14 Teile-Nr Rev. F DEU

15 } Aktivierung von Windows Firewall und Windows Defender: Diese Windows- Produkte können sich auf die BS-Ressourcen auswirken, auf die Software von Illumina zugreift. Illumina empfiehlt die Installation von Virenschutz-Software, um den Gerätesteuerungscomputer vor Viren zu schützen. Weitere Informationen finden Sie unter Virenschutz-Software auf Seite 16. } Änderungen an den Rechten vorkonfigurierter Benutzer: Illumina empfiehlt, die bestehenden Rechte von vorkonfigurierten Benutzern beizubehalten. Die vorkonfigurierten Benutzer können jedoch einen Nicht-verfügbar-Status erhalten. Netzwerkerwägungen MiSeq-System Handbuch zur Standortvorbereitung 15

16 Virenschutz-Software Illumina empfiehlt, eine Virenschutz-Software Ihrer Wahl zu kaufen und zu installieren, um den Gerätesteuerungscomputer vor Viren zu schützen. Illumina hat Symantec auf Windows 7 mit folgenden Einstellungen getestet. Konfigurieren Sie die Virenschutz-Software wie folgt, um Störungen des Gerätebetriebs oder den Verlust von Daten zu vermeiden: } Stellen Sie manuelle Virenprüfungen ein. Aktivieren Sie keine automatischen Virenprüfungen. } Führen Sie manuelle Virenprüfungen nur aus, wenn sich das Gerät nicht in Verwendung befindet. } Legen Sie fest, dass Aktualisierungen zwar ohne Autorisierung durch den Benutzer heruntergeladen, jedoch nicht installiert werden sollen. } Führen Sie während des Gerätebetriebs keine Aktualisierungen durch. Aktualisieren Sie die Software nur, wenn das Gerät nicht in Betrieb ist und wenn der Gerätecomputer sicher neu gestartet werden kann. } Lassen Sie den Computer nach einer Aktualisierung nicht automatisch neu starten. } Schließen Sie das Anwendungsverzeichnis und die Datenlaufwerke vom Echtzeit- Dateisystemschutz aus, insbesondere C:\Illumina sowie die Laufwerke D:\ und E:\. 16 Teile-Nr Rev. F DEU

17 Vom Benutzer bereitzustellende Verbrauchsmaterialien und Geräte Zur Durchführung von Sequenzierungsläufen auf dem MiSeq werden die folgenden Verbrauchsmaterialien und Geräte benötigt. Weitere Informationen finden Sie im MiSeq-System Benutzerhandbuch. Vom Benutzer bereitzustellende Verbrauchsmaterialien Stellen Sie sicher, dass die folgenden, vom Benutzer bereitzustellenden Verbrauchsmaterialien verfügbar sind, bevor Sie einen Lauf starten. Verbrauchsmaterial Anbieter Zweck Stock 1,0 N NaOH, in Molekularbiologie-Qualität Allgemeiner Laborlieferant Denaturieren der Probenbibliotheken und der PhiX-Kontroll-DNA Alkoholtupfer, 70 % Isopropyl oder Ethanol, 70 % Einweg-Handschuhe, ungepudert Labortücher, fusselfrei Linsenpapier, 4 x 6 Zoll (10,2 x 15,2 cm) VWR, Katalognummer * Allgemeiner Laborlieferant Allgemeiner Laborlieferant VWR, Katalognummer * VWR, Katalognummer * Reinigen des Fließzellenhalters Allgemeine Verwendung Reinigen des Fließzellentischs und der Schutzfolie, die den Probenbehälter abdeckt Reinigen der Fließzelle Mikrozentrifugenröhrchen Allgemeiner Laborlieferant Denaturieren und Verdünnen der Probenbibliotheken und der PhiX-Kontroll-DNA Natriumhypochlorit Allgemeiner Laborlieferant Waschen der Matrizenleitung zur Verwendung mit dem VeriSeq-Workflow (optional für andere Workflows) Tween 20 Sigma-Aldrich, Waschen des Geräts Katalognummer P7949 Pinzette, viereckige Spitze, Kunststoff (optional) McMaster-Carr, Katalognummer 7003A22* Entfernen der Fließzelle aus dem Versandbehälter Wasser, Laborqualität Allgemeiner Laborlieferant Waschen des Geräts * oder vergleichbar Vom Benutzer bereitzustellende Verbrauchsmaterialien und Geräte MiSeq-System Handbuch zur Standortvorbereitung 17

18 Richtlinien für Wasser in Laborqualität Verwenden Sie bei Geräteverfahren immer Wasser in Laborqualität. Verwenden Sie niemals Leitungswasser oder entionisiertes Wasser. Die folgenden Wasserarten sind geeignet: } IlluminaPW1 } 18 Megohm (MΩ)-Wasser } Milli-Q-Wasser } Super-Q-Wasser } Wasser in Molekularbiologie-Qualität Vom Benutzer bereitzustellende Geräte Element Gefrierschrank, -25 C bis -15 C, frostfrei Eiskübel Kühlschrank, 2 C bis 8 C Quelle Allgemeiner Laborlieferant Allgemeiner Laborlieferant Allgemeiner Laborlieferant 18 Teile-Nr Rev. F DEU

19 Platzanforderungen für die Lagerung der Verbrauchsmaterialien MiSeq-Reagenzien werden in Reagenzienkartuschen für den Einmalgebrauch bereitgestellt. Anhand der folgenden Informationen können Sie die Platzanforderungen für die Lagerung der Verbrauchsmaterialien ermitteln. Element (1 pro Lauf) Lagerungsanforderung Größe (B x L x H) Reagenzienkartusche -25 C bis -15 C 11 cm x 21 cm x 7 cm PR2-Flasche 2 C bis 8 C 500-ml-Flasche Fließzelle 2 C bis 8 C 3,7 cm x 5,5 cm Platzanforderungen für die Lagerung der Verbrauchsmaterialien MiSeq-System Handbuch zur Standortvorbereitung 19

20 Anmerkungen

21 Technische Unterstützung Wenn Sie technische Unterstützung benötigen, wenden Sie sich an den technischen Support von Illumina. Tabelle 1 Illumina-Website Tabelle 2 Allgemeine Kontaktinformationen für Illumina techsupport@illumina.com Telefonnummern des Illumina-Kundendiensts Region Telefonnummer Region Telefonnummer Nordamerika Italien Belgien Niederlande Dänemark Norwegen Deutschland Österreich Finnland Schweden Frankreich Schweiz Großbritannien Spanien Irland Andere Länder Technische Unterstützung Sicherheitsdatenblätter Sicherheitsdatenblätter (SDS, Safety Data Sheets) stehen auf der Illumina-Website unter support.illumina.com/sds.html zur Verfügung. Produktdokumentation Die Produktdokumentation steht auf der Illumina-Website im PDF-Format zum Herunterladen zur Verfügung. Gehen Sie zu support.illumina.com, wählen Sie ein Produkt aus und klicken Sie anschließend auf Documentation & Literature. MiSeq-System Handbuch zur Standortvorbereitung

22 Illumina San Diego, Kalifornien 92122, USA ILMN (4566) (außerhalb von Nordamerika)