Bedienungsanleitung Micro-Manager mit Digitalsystem d-drive
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- Martha Bieber
- vor 5 Jahren
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1 Bedienungsanleitung Micro-Manager mit Digitalsystem d-drive Bedienungsanleitung Micro-Manager, Version 1.01 Seite 1 von 16
2 Inhalt 1 Installation Hardware-Konfiguration Konfigurationsdatei im Texteditor bearbeiten Erstellen von persönlichen Einstellungen Steuern über Plug-ins...16 Bedienungsanleitung Micro-Manager, Version 1.01 Seite 2 von 16
3 1 Installation Zur Verwendung des Micro-Managers ist ein Download der Software von der Homepage erforderlich. In diesem Downloadpaket befinden sich bereits die benötigten Bibliotheken für das Digitalsystem d-drive. Bitte folgen Sie den Bildschirmhinweisen zur Installation. Ist eine ältere Version (vor ) des Micro-Managers installiert, ist es notwendig die Bibliothek des Digitalsystems auf der Homepage von piezosystem jena herunterzuladen. Anschließend ist die Datei mit dem Namen mmgr_dal_piezosystem_ddrive.dll zu entpacken und in das Hauptverzeichnis des Programms zu kopieren. Somit kann der Micro- Manager auf die Bibliothek zugreifen. 2 Hardware-Konfiguration Der Micro-Manager wird ohne Konfiguration ( none ) gestartet. Dieses Fenster wird mit OK geschlossen. Bedienungsanleitung Micro-Manager, Version 1.01 Seite 3 von 16
4 Für die Nutzung des Digitalsystems d-drive ist die Erstellung einer Konfigurationsdatei erforderlich. Dieses muss dazu eingeschaltet werden. Die Konfiguration wird über das Hauptfenster im Menü Tools Hardware Configuration Wizard vorgenommen. Im öffnenden Fenster wird über den Button Next eine Bibliothek geöffnet, in der PSJ_dDrive unter dem Punkt Piezosystem_dDrive ausgewählt wird. Fügen Sie es mit einem Doppelklick oder dem Button Add der Liste hinzu. Bedienungsanleitung Micro-Manager, Version 1.01 Seite 4 von 16
5 In dem sich öffnenden Fenster erfolgt die Einstellung des Port. Über den Button Scan wird das Gerät gesucht. Optional kann dem Gerät über Label ein Name gegeben werden. Übernehmen Sie die Einstellung mit OK. Bedienungsanleitung Micro-Manager, Version 1.01 Seite 5 von 16
6 Wählen Sie im nächsten Fenster die gewünschten Aktoren über die Checkbox in der Spalte Selected aus. Bestätigen Sie mit OK. Im folgenden Fenster erfolgt die Wahl der Kanalnummer und optional die Vergabe eines eigenen Aktornamens. Die Bestätigung erfolgt mit OK. Bedienungsanleitung Micro-Manager, Version 1.01 Seite 6 von 16
7 Nach dem letzten Aktor kommen Sie zum Konfigurationsfenster zurück. Bestätigen Sie mit Next >. Die in diesem Feld festzulegenden Standardgeräte können jederzeit geändert werden. Bedienungsanleitung Micro-Manager, Version 1.01 Seite 7 von 16
8 Überspringen Sie die Punkte 4 und 5 mit Next und speichern Sie die Konfiguration in einer Datei mit beliebigem Namen. Diese kann beim nächsten Programmstart geladen werden. Beenden Sie den Wizard mit Finish. Bedienungsanleitung Micro-Manager, Version 1.01 Seite 8 von 16
9 Nach erfolgreicher Konfiguration kann das ddrive über das Menü Tools Device/Property Browser geladen und bedient werden. Bedienungsanleitung Micro-Manager, Version 1.01 Seite 9 von 16
10 Die Einstellungen sind alphabetisch geordnet. Grau unterlegte Felder können nur gelesen und nicht verändert werden. Sie dienen der Information. Bedienungsanleitung Micro-Manager, Version 1.01 Seite 10 von 16
11 3 Konfigurationsdatei im Texteditor bearbeiten Eine Bearbeitung der Konfigurationsdatei ist auch mit einem Texteditor möglich. Dabei können Veränderungen an folgenden Punkten vorgenommen werden: Label Änderung Kanal eines Geräts Trennung Tritor in XYStage und ZStage Als Beispiel wurde eine Datei mit Label statt der Gerätebezeichnung erstellt. Diese sollen in sinnvolle Namen geändert werden. # Reset Property,Core,Initialize,0 # Devices Device,COM4,SerialManager,COM4 Device,Label_1,Piezosystem_dDrive,PSJ_dDrive Device,Label_2,Piezosystem_dDrive,PSJ_Tritor1 Device,Label_3,Piezosystem_dDrive,PSJ_Shutter1 # Pre-init settings for devices Property,Label_1,Port,COM4 Property,Label_2,Channel X,1 Property,Label_2,Channel Y,2 Property,Label_2,Channel Z,3 Property,Label_3,Channel,5 Property,Label_3,Version (zero volt position),edges open # Pre-init settings for COM ports Property,COM4,AnswerTimeout, Property,COM4,BaudRate, Property,COM4,DelayBetweenCharsMs, Property,COM4,Handshaking,Software Property,COM4,Parity,None Property,COM4,StopBits,1 Property,COM4,Verbose,1 # Hub (parent) references Parent,Label_2,Label_1 Parent,Label_3,Label_1 # Initialize Property,Core,Initialize,1 # Delays # Roles Property,Core,Shutter,Label_3 Property,Core,AutoShutter,1 # Camera-synchronized devices # Labels # Configuration presets # Group: Channel # Group: System Bedienungsanleitung Micro-Manager, Version 1.01 Seite 11 von 16
12 # Preset: Startup # PixelSize settings Die Label werden wie folgt geändert: Label_1 ddrive Label_2 Tritor Label_3 Shutter # Reset Property,Core,Initialize,0 # Devices Device,COM4,SerialManager,COM4 Device,dDrive,Piezosystem_dDrive,PSJ_dDrive Device,Tritor,Piezosystem_dDrive,PSJ_Tritor1 Device,Shutter,Piezosystem_dDrive,PSJ_Shutter1 # Pre-init settings for devices Property,dDrive,Port,COM4 Property,Tritor,Channel X,1 Property,Tritor,Channel Y,2 Property,Tritor,Channel Z,3 Property,Shutter,Channel,5 Property,Shutter,Version (zero volt position),edges open # Pre-init settings for COM ports Property,COM4,AnswerTimeout, Property,COM4,BaudRate, Property,COM4,DelayBetweenCharsMs, Property,COM4,Handshaking,Software Property,COM4,Parity,None Property,COM4,StopBits,1 Property,COM4,Verbose,1 # Hub (parent) references Parent,Tritor,dDrive Parent,Shutter,dDrive # Initialize Property,Core,Initialize,1 # Delays # Roles Property,Core,Shutter,Shutter Property,Core,AutoShutter,1 # Camera-synchronized devices # Labels # Configuration presets # Group: Channel # Group: System # Preset: Startup # PixelSize settings Bedienungsanleitung Micro-Manager, Version 1.01 Seite 12 von 16
13 Achten Sie darauf den Namen nur einmal zu vergeben und verwenden Sie kein Komma im Namen. Nachfolgend soll der Tritor in eine XY-Stage und eine Z-Stage umgewandelt werden. 1. Bei Devices wird der PSJ_Tritor durch PSJ_XYStage und PSJ_Stage ersetz. 2. Bei Pre-init setting for device werden die Label ersetzt und bei Channel Z das Z entfernt. 3. Bei Hub (parent) references wird der Tritor durch XYStage und Stage ersetzt. # Reset Property,Core,Initialize,0 # Devices Device,COM4,SerialManager,COM4 Device,dDrive,Piezosystem_dDrive,PSJ_dDrive Device,XYStage,Piezosystem_dDrive,PSJ_XYStage1 Device,Stage,Piezosystem_dDrive,PSJ_Stage1 Device,Shutter,Piezosystem_dDrive,PSJ_Shutter1 # Pre-init settings for devices Property,dDrive,Port,COM4 Property,XYStage,Channel X,1 Property,XYStage,Channel Y,2 Property,Stage,Channel,3 Property,Shutter,Channel,5 Property,Shutter,Version (zero volt position),edges open # Pre-init settings for COM ports Property,COM4,AnswerTimeout, Property,COM4,BaudRate, Property,COM4,DelayBetweenCharsMs, Property,COM4,Handshaking,Software Property,COM4,Parity,None Property,COM4,StopBits,1 Property,COM4,Verbose,1 # Hub (parent) references Parent,XYStage,dDrive Parent,Stage,dDrive Parent,Shutter,dDrive # Initialize Property,Core,Initialize,1 # Delays # Roles Property,Core,Shutter,Shutter Property,Core,AutoShutter,1 # Camera-synchronized devices # Labels # Configuration presets # Group: Channel # Group: System Bedienungsanleitung Micro-Manager, Version 1.01 Seite 13 von 16
14 # Preset: Startup # PixelSize settings NOTE: Die Stages können auch nur hinzugefügt werden. Der Tritor und die Stages können somit parallel im Programm bedient werden. 4 Erstellen von persönlichen Einstellungen Es ist ratsam, persönliche Einstellungen in Configuration settings vorzunehmen, da der Property Browser eine lange Ladezeit benötigt und daher eher als Überblick über den Micro- Manager dient. Persönliche Einstellungen werden in der zuvor erstellten Konfigurationsdatei gespeichert. Zum Erstellen ist zuerst das Anlegen einer Gruppe über + im Bereich Group notwendig. Bedienungsanleitung Micro-Manager, Version 1.01 Seite 14 von 16
15 Im Group Editor können Sie der Gruppe einen beliebigen Namen geben und die gewünschte Eigenschaft eintragen. Bestätigen Sie mit OK. Im nächsten Fenster geben Sie der Einstellung einen Namen und stellen die gewünschten Werte ein. Bedienungsanleitung Micro-Manager, Version 1.01 Seite 15 von 16
16 Im Hauptfenster werden die Einstellungen dem ddrive übermittelt. 5 Steuern über Plug-ins Die Position kann auch über das Plug-in Stage Control gesteuert werden. Dafür sind ein XYStage und ein Stage für die Z-Achse notwendig. Zusätzlich können auch eigene Plug-ins in Java geschrieben werden oder eigene GUIs über Netbean erstellt werden. Bedienungsanleitung Micro-Manager, Version 1.01 Seite 16 von 16
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