Genotyping Platform der Abteilung Wein- und Obstbau der BOKU Dr. Ulrike CM Anhalt Ulrike CM Anhalt I Abteilung Wein- und Obstbau I BOKU Wien
Idee der Plattform Verbindung von Grundlagenforschung und serviceorientierte, angewandte Forschung Was machen wir? Genotypisierung durch verschiedene genetische Marker Markerentwicklung für Obstsorten und Reben Vermehrung von Genotypen in vitro Nutzen: Wissenstransfer in die Praxis für Obstbauern, Winzer, Vereine etc Synergieeffekte innerhalb Abteilungen und Departments Die Netzwerkbildung von MitarbeiterInnen und StudentInnen im studentische Projekte 2
Genotypisierung Informationsgewinn: Praxis/Industrie Sortenunterscheidung Sortenbestimmung Klonenidentifikation Informationsgewinn: Wissenschaft Phylogenetik Genfunktion Mutation Photo: Bisich 3
Methodik Molekulare Marker - PCR Genotypisierung von Pflanzenmaterial ist eine etablierte Methode. Verschiedene Primer können hier mit unterschiedlichen Zielen eigesetzt werden: SSR, SNP Marker eignen sich hervorragen zur Sortenidentifizierung AFLP, RAPD, IRAP, REMAP, SSAP Marker zur genetischen Diversitätsstudie sowie zur klonalen Analyse einer Sorte 4
Vermehrung von Genotypen in vitro Sortenerhaltung und Sortenvermehrung alter Sorten und neuer Züchtungen Was machen wir? Meristemkulturen zur Etablierung von virusfreien Mutterpflanzen Veredelungen von virusfreiem Material In vitro Veredelungen 5
Geräte Drei Geräte sind in der Abteilung Wein und Obstbau der BOKU im Einsatz: 4300 DNA Analyzer von LI-COR (AFLP Marker) Fragment Analyzer von AATI (SSR Marker) Rotorgene 2000 von Quiagen (HRM Analysen) www.licor.com aati-us.com www.qiagen.com 6
Schon etablierte Obstsorten auf der Plattform Kirsche Kriecherl Rebe Heidelbeere Birne Marille Apfel Department für Nutzpflanzen Foto: Spörr Foto: Klein 7
1) Projekt: Alte Rebsorten in Kroatien und Montenegro Projekt mit den Universitäten in Zagreb (Sortenerkennung, Ampelographie), Podgorica (Ampelographie), Geisenheim (Virentests) und BOKU (Genetische Diversitätsstudie, SSAP Molekularen Markern) * Magrovina * Dišeća Ranina * Jarbola * GRK * Kratošija Artikel: Zulj et al. Cultivar Identity, Intravarietal Variation, and Health Status of Native Grapevine Varieties in Croatia and Montenegro 2015 American Journal of Enology and Viticulture dio 10.5344/ajev.2015.15023 8
2) Projekt: Waldviertler Kriecherl Projekt mit dem Verein der Waldviertel Kriecherl, Georg Schramayr und der BOKU Ampelographische Analysen von Bäumen an 16 Standorten (Blüte, Frucht) Gabriele Eder und Andreas Spornberger Genetische Analysen mit SSR Markern Magdalena Butz und Ulrike Anhalt Photo: Bisich Photo: Bisich 9
Ablauf Sie schildern uns Ihr Problem Wir beraten Sie Sie schicken uns die Proben zu oder wir sammeln die Proben für Sie Wir führen die Analysen durch Wir senden Ihnen die Ergebnisse zu Bei Bedarf interpretieren wir die Daten auch für Sie 10
Fazit und Vorteile Service bei konkreten Fragen Schnelle und zielgerichtete Antwort Servicepauschale und Probenpreis Flexible Möglichkeit der Analysen Statistische Auswertung möglich 11
Nutzer BOKUinternen Nutzen Obstbauer und Winzer Baumschulen, Rebzüchter und Rebveredler Erhaltungszüchter Universitäten und Forschungsanstalten mit Forschungsprojekten. 12
Department für Angewandte Pflanzen und Pflanzenbiotechnologie Abteilung Wein- und Obstbau Dr. Ulrike CM Anhalt UFT Tulln Konrad Lorenz Straße 24, A-3430 Tulln Ulrike.anhalt@boku.ac.at, www.boku.ac.at 13