Die effiziente Literaturrecherche Grundlagen am Beispiel von Medline via PubMed

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1 Die effiziente Literaturrecherche Grundlagen am Beispiel von Medline via PubMed Konserve? oder eigene Kreation? Stand Juli Edith Motschall Institut für Medizinische Biometrie und Statistik, Freiburg

2 Gibt es die perfekte Suche? Relevant Nicht relevant Gefunden Nicht gefunden a c b d Genauigkeit Vollständigkeit Precision = (Positive Predictive Value) gefundene relevante Zitate (a) alle gefundenen Zitate (a + b) gefundene relevante Zitate (a) Recall = (=Sensitivity) in Datenbank vorhandene relevante Zitate (a + c)

3 Suche nach Primärprophylaxe von Ösophagusvarizenblutungen 1. Beta-blocker plus nitrate for primary prophylaxis of variceal bleeding. 2. Efficacy of prophylactic sclerotherapy for prevention of a first variceal hemorrhage. 3. Beta-blockers for the prevention of variceal haemorrhage in patients with cirrhosis. 4. Primary prevention of bleeding from esophageal varices.

4 Einfache Suche in PubMed

5 PubMed-interne Erweiterung: Automatic Term Mapping Die Konserve Automatic Term Mapping enthält: Gesucht am Das Automatic Term Mapping wird durchgeführt, wenn Suchbegriffe - ohne Trunkierung, - ohne Feldkürzel und - ohne Hochkommas eingegeben werden.

6 Medline-Zitat via PubMed MeSH/subheading * Hauptaspekt des Artikels

7 Textwortsuche (Freitextsuche) (1) Wörtliche Suche: Wortstamm mit variabler Endung: Truncation prevent* findet prevent, preventing, prevention, preventive Manche Suchoberflächen erlauben auch eine Wildcard innerhalb und/oder am Anfang eines Wortes (erlaubte Wildcard-Zeichen in der Online-Hilfe der Datenbankanbieter)

8 Textwortsuche (Freitextsuche) (2) Variable Reihenfolge, Wörter dazwischen: Primary prevention of bleeding from esophageal varices. Begriffe kombinieren, die in der Nähe zueinander in beliebiger Reihenfolge stehen: Beispiele (je nach Suchoberfläche): NEAR SAME adjn AND Proximity Operatoren: nicht bei PubMed (bei PubMed unspezifisch) Beispiel (bei PubMed): varic* AND (bleed* OR hemorrhag* OR haemorrhag*)

9 Textwortsuche (Freitextsuche) (3) Phrasensuche (sucht genau so wie eingegeben): variceal bleeding Manche Suchoberflächen verbinden mehrere Wörter nebeneinander automatisch mit AND Phrasensuche erzwingen, meist mit Hochkommata. Textwortsuche (Freitextsuche) (4) Wörter zusammen oder getrennt schreiben non-variceal nonvariceal mit OR kombinieren

10 In welchen Feldern wird gesucht? In voreingestellten Feldern suchen (variiert je nach Datenbank und Suchoberfläche) oder Feldauswahl selbst vornehmen: PubMed Feldkürzel: Syntax: Titel (sehr spezifische Suche) Titel + Abstract Autor u.a. [ti] [tiab] [au] siehe PubMed Help Search Field Descriptions and Tags Syntax-Beispiel: bleed*[tiab] OR hemorrhag*[tiab] OR haemorrhag*[tiab]

11 MeSH=Medical Subject Headings erstellt von der National Library of Medicine (NLM) Kontrolliertes Vokabular (Thesaurus) - ca Begriffe (mit Verweisen und Synonymen) - polyhierarchische Struktur ( Tree structure) Standardisierung der sprachlichen Ausdrucksmöglichkeiten und inhaltliche Kennzeichnung des Artikels: Verschlagwortung (Indexierung) der Artikel nach festgelegten Regeln. Suche nach allen Unterbegriffen in einem Schritt mit Explode (interne OR-Verbindung)

12 Vor- und Nachteile der Suche mit MeSH (1) Vorteile: Synonyme und versch. Schreibweisen werden automatisch berücksichtigt. Artikel durch Fachpersonal verschlagwortet vergebenes Schlagwort ist Gegenstand der Arbeit. Bei hierarchischem Aufbau Suche nach Ober- und Unterbegriffen in einem Schritt. Inhaltliche Zusammenhänge sind suchbar durch MeSH/Subheading-Kombination. Bsp.: Gastrointestinal Hemorrhage/prevention & control

13 Vor- und Nachteile der Suche mit MeSH (2) Nachteile: Uneinheitliche Verschlagwortung (Indexierung) Zutreffendes wird nicht gefunden. Aktuelle, noch nicht verschlagwortete Artikel werden nicht gefunden (Komponenten Medline in process, supplied by publisher, pubmednotmedline). Für neue Substanzen oder neue medizinische Begriffe existiert noch kein MeSH.

14 Suchfrage in Teilaspekte zerlegen und Aspekte kombinieren: Boolesche Operatoren Aspekt 1 Aspekt 2 Aspekt 3 Variceal bleeding Prevention Article Type z.b. Metaanalysis Vorsicht mit dem Operator NOT!

15 Search History (Suchstrategie in PubMed: Advanced) Aspekte in Einzelschritten suchen und Ergebnisse kombinieren Gesucht am

16 Schema einer Literatursuche am Beispiel von Medline Frage in Teilaspekte zerlegen, z.b. PICO(S) Suchbegriffe finden Aspekt 1 Aspekt 2 MeSH-Term(s) -Explode: erweitern -Subheadings: eingrenzen Textwörter (verwandte Begriffe, Synonyme, Trunkierung) MeSH-Term(s) -Explode: erweitern -Subheadings: eingrenzen Textwörter (verwandte Begriffe, Synonyme, Trunkierung) Evtl. weitere Aspekte Eingrenzen mit z.b.: Type of Article, Age Groups. Filter: Clinical Queries bei Pubmed Begriffe kombinieren OR, evtl. teilw. AND OR, evtl. teilw. AND Aspekte kombinieren AND AND

17 Umfang von PubMed am Komponenten von PubMed [PubMed - indexed for MEDLINE] Zitate MeSH- u. Textwortsuche [PubMed - as supplied by publisher] [PubMed - in process] [PubMed] nur Textwortsuche Datenbank Medline Verschlagwortung nach einigen Tagen bis zu einigen Monaten ~ Zeitschriften in Medline indexiert

18 Vom Datenbankhersteller zum Nutzer Die Suchfunktionen sind unterschiedlich je nach Anbieter und Datenbank Produkt (Datenbank) Hersteller Anbieter (Host) Auswahl: Suchoberfläche Medline National Library of Medicine (NLM) NLM Wolters Kluwer PubMed (kostenlos) Ovid (lizenzpflichtig) Zugang Uni Freiburg Thomson Reuters Web of Science

19 PubMed und was noch? Im Supermarkt der Informationsquellen UpToDate Medline Web of Science (interdisziplinär) Cochrane Library OvidMD Studienregister Psycinfo CINAHL (Pflege) Biosis Google Scholar Gemeinsamkeiten, Unterschiede: - Erfasste Zeitschriften, Inhalte - Suchmöglichkeiten - Verschlagwortung (Thesaurus) - Aktualität - Kosten

20 Viele Informationsquellen viele Suchmöglichkeiten eigene Kreation (1) - Gibt es ein kontrolliertes Vokabular, z.b. MeSH? - Was geschieht bei der Textwortsuche? - Berücksichtigung von Synonymen? - Automatisch Plural, Singular? - Welche Suchfelder? - Feldkürzel-Syntax - Wildcards / Trunkierung? Am Ende, Anfang innerhalb eines Wortes möglich? - Welche Zeichen für Wildcards? Siehe HELP-Links der Datenbankanbieter

21 Viele Informationsquellen viele Suchmöglichkeiten eigene Kreation (2) - Search History? Kombination von einzelnen Suchschritten? - Boolesche Operatoren? Voreinstellung, z.b. AND? - Reihenfolge der Operatoren? Klammerung bei verschiedenen Operatoren? - Phrasensuche? - Proximity Suche (Begriffe in der Nähe zueinander)? Siehe HELP-Links der Datenbankanbieter

22 Google Scholar: Kein Ersatz, nur Ergänzung!

23 Der kreative Prozess (1) Frage formulieren, in Teilaspekte aufteilen, z.b. PICO Geeignete MeSH-Begriffe finden: 1. Bekannte relevante Zitate in PubMed suchen: Verschlagwortung ansehen 2. Einfache Suche: Umwandlung durch Automatic Term Mapping ansehen (search details) 3. Einfache Suche auf der Clinical Queries Seite: Search Details ansehen und Verschlagwortung einiger Treffer Informationen zum MeSH-Begriff auf der MeSH-Seite ansehen: Verweise, Subheadings, Hierarchie

24 Der kreative Prozess (2) In Einzelschritten suchen, dann kombinieren. Nicht alle Aspekte erforderlich, z.b. seltene Intervention: ausreichend. Zu viele Treffer weiter eingrenzen (siehe Unterlagen: PubMed-Tipps) Zu wenig Treffer erweitern (siehe Unterlagen: PubMed-Tipps) Vollständigkeit abschätzen: Suchergebnis abgleichen mit bekannten relevanten Zitaten

25 Konserve oder eigene Kreation? Je nach Anspruch und Zeit Als Einstieg und erste Orientierung: Suchstrategie aufbauen: der kreative Prozess Precision und Recall variieren:

26 Kochbücher : Online-Hilfen (Help) und Tutorials der Datenbankanbieter Motschall E: Literatursuche mit PubMed - Grundlagen und Tipps: Konserve oder eigene Kreation? Teil 1: Einstieg in die Recherche und Suchfunktionen. Dtsch Zahnärztl Z, 2015; 70 (5): Teil 2: Der kreative Prozess: schrittweiser Aufbau der Recherche. Speichern der Suche. Dtsch Zahnärztl Z, 2015; 70 (6):