NACHWEIS von FEUERBRAND an PFLANZENPROBEN im LABOR



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Transkript:

NACHWEIS von FEUERBRAND an PFLANZENPROBEN im LABOR Mag. Helga Reisenzein Abteilung Phytopathologie in Raumkulturen Institut für Pflanzengesundheit Wien, Juni 2010 www.ages.at Österreichische Agentur für Gesundheit und Ernährungssicherheit GmbH

Allgemeine Informationen Feuerbrand ist eine Quarantänekrankheit an Pflanzen Der Erreger dieser Krankheit ist ein Bakterium (Erwinia amylovora) Der Nachweis von Erwinia amylovora erfolgt im Diagnose-Labor des Institutes für Pflanzengesundheit durch akkreditierte Untersuchungsverfahren Eine Untersuchung von Pflanzenproben mit Feuerbrandsymptomen (Feuerbrand-Verdachtsproben) dauert zwischen 3 bis 5 Werktagen Die Untersuchung von symptomlosen Pflanzenproben (Feuerbrand- Latenzproben) dauert zwischen 5 Tagen und 3 Wochen (abhängig welche Untersuchungsverfahren angewandt werden müssen) Das detaillierte Untersuchungsschema und die Untersuchungskosten sind in den folgenden Grafiken zusammengefasst 2

Untersuchungsschema für Pflanzenproben zum Nachweis von Feuerbrand (Erwinia amylovora) Verdachtsprobe (mit Symptomen) Latenzprobe (ohne Symptome) 1. Untersuchungsschema 3. Untersuchungsschema 3.1 Erweiterte Untersuchung 2. Prüfbericht Ergebnis 4. Prüfbericht Ergebnis 5. Untersuchungspreise 3

Feuerbrand-Verdachtsproben Pflanzenproben mit TYPISCHEN FEUERBRANDSYMPTOMEN Foto: AGES 4

1. Untersuchung von Feuerbrand-Verdachtsproben Isolierung des Bakteriums durch Anreicherungsverfahren (akkreditiert) Visuelle Bewertung der Bakterienkolonien Identifizierung des Bakteriums durch molekulargenetische oder serologische Methoden (akkreditiert) PCR-Ergebnis und/oder serologischer Schnelltest negativ PCR-Ergebnis und/oder serologischer Schnelltest positiv E.amylovora negativ E.amylovora positiv Ergebnis: Der Feuerbranderreger wurde nicht nachgewiesen Ergebnis: Der Feuerbranderreger wurde nachgewiesen 5

2. Ergebnisdokumentation für Feuerbrand-Verdachtsproben Prüfbericht 1 / Verdachtsproben Ergebnis 6

5. Untersuchungspreise für Feuerbrand-Verdachtsproben FEUERBRAND-VERDACHTSPROBEN werden für die amtlichen Pflanzenschutzdienste der Bundesländer im Rahmen eines jährlich durch das BMLFUW festgelegten Kontingentes kostenlos untersucht. Für Privatproben bzw. für Proben außerhalb des Gratis-Kontingentes werden folgende Preise verrechnet: Preise Bakterienanreicherung Qualitativer molekulargenetischer Nachweis einfach (Colony-PCR) Serologischer Schnelltest (Lateral flow assay) Euro exkl. 6,81 41,29 9,58 Die Untersuchung der Feuerbrand-Verdachtsprobe kostet je nach eingesetztem Untersuchungsverfahren zwischen 18,82 und 56,88 (inkl. Ust.). Stand der Preise vom 01.01.2010 7

Feuerbrand-Latenzproben Pflanzenproben OHNE FEUERBRANDSYMPTOME Foto: AGES 8

Untersuchungsschema für Pflanzenproben zum Nachweis von Feuerbrand (Erwinia amylovora) Verdachtsprobe (mit Symptomen) Latenzprobe (ohne Symptome) 1. Untersuchungsschema 3. Untersuchungsschema 3.1 Erweiterte Untersuchung 2. Prüfbericht Ergebnis 4. Prüfbericht Ergebnis 5. Untersuchungspreise 9

3. Untersuchungsschema für Feuerbrand-Latenzproben Detektion des Bakteriums (Erwinia amylovora) Molekulargenetischer Screening-Test (direkt aus Pflanze, nicht akkreditiert) 1.PCR-Ergebnis positiv Bestätigung durch EPPO Standardmethode (direkt aus Pflanze durch nested PCR) PCR-Ergebnis negativ PCR-Ergebnis negativ E.amylovora negativ E.amylovora negativ E.amylovora positiv 2.PCR-Ergebnis positiv Ergebnis: Der Feuerbranderreger wurde nicht nachgewiesen Vorläufiges Prüfergebnis: Der Feuerbranderreger wurde detektiert, aber kein Nachweis von lebenden Bakterienzellen 10

Untersuchungsschema für Pflanzenproben zum Nachweis von Feuerbrand (Erwinia amylovora) Verdachtsprobe (mit Symptomen) Latenzprobe (ohne Symptome) 1. Untersuchungsschema 3. Untersuchungsschema 3.1 Erweiterte Untersuchung 2. Prüfbericht Ergebnis 4. Prüfbericht Ergebnis 5. Untersuchungspreise 11

3.1 Erweiterte Untersuchung für Feuerbrand-Latenzproben Bestätigung der Pathogenität durch Bioassays (akkreditiert) Pathogenitätstest an Feuerbrandwirtspflanzen (akkred.) Bestätigung von E. amylovora Bakterienanreicherung (akkreditiert) Molekulargenet. oder serolog. Identifizierung des Bakterienisolats (akkredit.) Anwendung der Assays abhängig von der Verfügbarkeit unreifer Früchte Hypersensitivitätstest an Tabakpflanzen (akkred.) Isolierung von E. amylovora in Form einer Reinkulturen nicht möglich Bio-PCR (Nachweis der Bakterien direkt vom künstlichen Nährmedium) PCR-Ergebnis positiv Symptome an Feuerbrand- Wirtspflanzen Symptome an Tabakpflanzen E. amylovora positiv E. amylovora positiv E. amylovora positiv Prüfergebnis: Das Vorhandensein von pathogenen Feuerbranderregern in symptomlosen Pflanzenmaterial wurde nachgewiesen Prüfergebnis: Das Vorhandensein lebender Zellen des Feuerbranderregers in symptomlosen Pflanzenmaterial wurde nachgewiesen 12

4. Ergebnisdokumentation für Feuerbrand-Latenzproben Prüfberichte 2 / Latenzproben Vorläufiges Prüfergebnis Endgültiges Prüfergebnis Untersuchter Schaderreger Proben Nummer Ergebnis Untersuchter Schaderreger Proben Nummer Ergebnis Feuerbrand (Erwinia amylovora) (Quarantäneschaderreger ja x nein ) PPOW 00/10 E. amylovora wurde detektiert Feuerbrand (Erwinia amylovora) (Quarantäneschaderreger ja x nein ) PPOW 00/10 positiv positiv: das Bakterienisolat ist an Wirtspflanzen pathogen negativ: das Bakterienisolat ist an Wirtspflanzen nicht pathogen 13

5. Untersuchungspreise für Feuerbrand-Latenzproben Die Detektion von E. amylovora in FEUERBRAND-LATENZPROBEN kann im Rahmen eines jährlich durch das BMLFUW festgelegten Kontingentes kostenlos durchgeführt werden. Die Untersuchungsverfahren für eine Bestätigung von E. amylovora bei positiver Detektion sind kostenpflichtig. Es werden folgende Preise verrechnet: Preise Bakterienanreicherung Qualitativer molekulargenetischer Nachweis direkt (Screening-Verfahren) Qualitativer molekulargenetischer Nachweis einfach (Bio-PCR, Colony PCR) Qualitativer molekulargenetischer Nachweis aufwendig Serologischer Schnelltest (Lateral flow assay) Pathogenitätstest Hypersensitivitätstest (ab 5 Proben Preisrabatt) Euro exkl. 40,86 31,38 41,29 70,65 9,58 17,02 Auf Anfrage Die Kosten für den bestätigten Nachweis von E. amylovora in Feuerbrand- Latenzproben sind abhängig von den notwendigen Untersuchungsverfahren. 14

Kontaktpersonen: Feuerbrand-Laboruntersuchungen: Mag. Helga Reisenzein Tel.: 050 555 333 40 Email: helga.reisenzein@ages.at Dr. Richard Gottsberger Tel.: 050 555 333 43 Email: richard.gottsberger@ages.at Feuerbrand - allgemein: DI Ulrike Persen Tel.: 050 555 333 42 Email: ulrike.persen@ages.at Pflanzengesundheit allgemein: Tel.: 050 555 333 26 Email: pflanzengesundheit@ages.at 15