Statistische Beratung Doktorandenkurs Heinz Haverkamp, Dipl.-Math. Anna Hagemeier, M. Sc. Inhalt in Stichworten: Organisation und Voraussetzungen Datenmanagement Einführung in SPSS Datenbeispiel in SPSS Folien stehen online zur Verfügung
Organisation und Voraussetzungen v2.0 Doktorandenkurs IMSB 2
Statistische Beratung am IMSB Möglichkeit zur statistischen Beratung bei Promotionen, Habilitationen, Forschungsprojekten, Masterarbeiten, Anmeldung: Frau Sablonsky (82929, imsb-kontakt@unikoeln.de) Anmeldeformular auf: http://imsieweb.uni-koeln.de/beratung/promotion/ Erster Schritt bei Beratung für Abschlussarbeiten: Doktorandenkurs Statistischer Berater wird nach Kursteilnahme zugewiesen (Sie müssen sich nicht erneut melden!) Statistische Beratung umfasst bis zu 3 Termine (à 60 Minuten) v2.0 Doktorandenkurs IMSB 3
Inhalt der statistischen Beratung Mögliche Strukturierung der Beratungstermine 1. Studienplanung 2. Studienauswertung 3. Ergebnisdarstellung und -interpretation Ratsam: Schon in der Planungsphase mit dem Biometriker ein Treffen vereinbaren Wichtig: Gute Vorbereitung auf das Treffen mit dem Biometriker v2.0 Doktorandenkurs IMSB 4
Wobei wir Ihnen helfen können: Studien- und Versuchsplanung Klinische Fragestellungen in statistische Hypothesen übersetzen Zielkriterien auswählen / diskutieren Fallzahlberechnung / Powerberechnung Auswahl adäquater statistischer Methoden für die Auswertung Beratung zur Datenauswertung mit Hilfe statistischer Software Interpretation der Analyseergebnisse Statistische Bewertung wissenschaftlicher Publikationen Dabei bieten wir Ihnen Hilfe zur Selbsthilfe! v2.0 Doktorandenkurs IMSB 5
Was wir nicht bieten können: Einführung in die statistische Methodik Klinische Fragestellungen erarbeiten Ethikanträge formulieren / Prüfpläne erstellen Datenerfassung und -eingabe / Datenbank-Management Durchführung der statistischen Auswertung Umgang mit Statistiksoftware vermitteln Praktische Durchführbarkeit einschätzen / garantieren v2.0 Doktorandenkurs IMSB 6
Voraussetzungen Gute Kenntnisse der eigenen Arbeit Ausgangssituation Genaue Fragestellungen Grundkenntnisse in medizinischer Statistik Deskriptive Statistik, Prinzip des statistischen Testens Bereitschaft zur Einarbeitung in statistische Auswertungssoftware (i.d.r. SPSS) Kenntnisse der Guten Wissenschaftlichen Praxis https://www.portal.uni-koeln.de/wissprax.html v2.0 Doktorandenkurs IMSB 7
Voraussetzungen - Kurse Q1: Epidemiologie, Med. Biometrie und Med. Informatik Auffrischung der Kenntnisse aus dem Studium http://imsieweb.uni-koeln.de/lehre/q1/materialien/ Benutzer: Q1, Passwort: IMSB Blockkurs: Grundlagen Medizinische Statistik http://imsieweb.uni-koeln.de/lehre/blockstat/ SPSS Blockkurs IMSB http://imsieweb.uni-koeln.de/lehre/spss/ Computer-Kurse am RRZK z.b. SPSS https://rrzk.uni-koeln.de/kursangebot.html v2.0 Doktorandenkurs IMSB 8
Voraussetzungen Literatur Med. Statistik Weiß, Christel: Basiswissen Medizinische Statistik, 6. Auflage, Springer-Verlag, Berlin Heidelberg, 2013 Held, Leonard: Medizinische Statistik. Konzepte, Methoden, Anwendungen, 1. Auflage, Pearson, 2013 Campbell, Michael J et al: Medical Statistics: A Textbook for the Health Sciences, 4. Auflage, Wiley, 2007 Bewertung wissenschaftlicher Publikationen Serie im Deutschen Ärzteblatt https://www.aerzteblatt.de/dae-plus/serie/35/bewertung-wissenschaftlicher-publikationen Statistik-Serie in der Deutschen Medizinischen Wochenschrift https://www.thieme-connect.de/products/ejournals/issue/10.1055/s-002-6753 v2.0 Doktorandenkurs IMSB 9
Einbindung des klinischen Betreuers Statistische Beratung erst sinnvoll, wenn Fragestellung und Konzept für Durchführung mit Betreuer festgelegt wurde Teilnahme des Betreuers zu empfehlen bei erstem Gespräch bei Termin zur Besprechung und Interpretation der Ergebnisse der statistischen Auswertung um Rückfragen direkt klären zu können, Ergebnisse einordnen zu können und relevante Punkte diskutieren zu können Mit guter Einbindung des Betreuers ist statistische Beratung effizienter und effektiver v2.0 Doktorandenkurs IMSB 10
Informationen für den statistischen Berater Vollständig ausgefüllter Anmeldebogen als erste Orientierung Ausarbeitung: Allgemeines medizinisches Problem Spezielle Aspekte des Problems in der konkreten Studie Liste der klinischen Fragestellungen Liste der Variablen und der möglichen Werte Studienangaben: Studiendesign (prospektiv, retrospektiv, randomisiert, verblindet,...), Gruppen, Variablen, Fallzahlen Für Nicht-Mediziner verständlich schreiben! Je ausführlicher und präziser die Angaben sind / je besser die Vorbereitung auf Gespräch ist, desto zielführender ist die Beratung! v2.0 Doktorandenkurs IMSB 11
Datenmanagement v2.0 Doktorandenkurs IMSB 12
Datenerhebung Erfassung der Daten in Tabellenform Tabellenkalkulations-Programm (Excel, Open Office) Eingabe direkt in SPSS möglich pro Zeile eine Untersuchungseinheit pro Spalte ein Merkmal Originaldaten schreibgeschützt abspeichern Sicherheitskopien erstellen Daten pseudonymisieren! Lösung: 2 getrennte Dateien - Schlüsseldatei mit ID und Klarname - Datendatei nur mit ID v2.0 Doktorandenkurs IMSB 13
Praktischer Tipp zur Datenerhebung in Excel Ansicht > Fenster einfrieren > Fenster einfrieren v2.0 Doktorandenkurs IMSB 14
Praktischer Tipp zur Datenerhebung in Excel Ansicht > Fenster einfrieren > Fenster einfrieren v2.0 Doktorandenkurs IMSB 15
Praktischer Tipp zur Datenerhebung in Excel Zellen markieren, Daten > Filtern v2.0 Doktorandenkurs IMSB 16
Praktischer Tipp zur Datenerhebung in Excel Zellen markieren, Daten > Filtern v2.0 Doktorandenkurs IMSB 17
Praktischer Tipp zur Datenerhebung in Excel Strg + h > Suchen und Ersetzen v2.0 Doktorandenkurs IMSB 18
Häufige Fehler bei der Datenerhebung Angabe von Klarnamen Leerzeilen, Leerspalten Leerzeichen in den Variablennamen Sonderzeichen in den Variablennamen Kategorien von qualitativen Variablen ausgeschrieben Text in Datumsangaben (statt DD.MM.YYYY) keine Kodierung für fehlende Angaben Text als Kennzeichen für fehlende Angaben Sonderzeichen bei Messwerten Mehrfachantworten in einer Spalte bereits durchgeführte Berechnungen v2.0 Doktorandenkurs IMSB 19
Datenbeispiel (schlecht) v2.0 Doktorandenkurs IMSB 20
Datenbeispiel (schlecht) v2.0 Doktorandenkurs IMSB 21
Datenbeispiel (gut) v2.0 Doktorandenkurs IMSB 22
Datenbeispiel (gut) v2.0 Doktorandenkurs IMSB 23
Einführung in SPSS v2.0 Doktorandenkurs IMSB 24
SPSS Anfangs: Statistical Package for the Social Sciences Jetzt: SPSS Inc. Programm zur statistischen Datenanalyse von IBM Dateneingabe Datenspeicherung SPSS kann über das Menü oder mit Hilfe von SPSS- Befehlssprache (Syntax) bedient werden. v2.0 Doktorandenkurs IMSB 25
Literatur und Links Literatur Angele G: SPSS Statistics 25, Bamberg 2018 https://www.uni-bamberg.de/fileadmin/rz/spss/skript.pdf Bühl, Achim: SPSS 23, Pearson Studium, München, 2016 Andy Field: Discovering Statistics using IBM SPSS Statistics, London 2014 Hilfe Raynald s SPSS Tools http://www.spsstools.net/spss.htm Hilfe, Links, Tipps, Tutorials z.b. zum Thema Häufigkeiten v2.0 Doktorandenkurs IMSB 26
SPSS-Lizenzen Persönliche SPSS Mietlizenz über RRZK https://rrzk.uni-koeln.de/software-spss.html ca. 25 /Jahr für Angehörige der Fakultät Lizenzdauer: 1. September bis 31. August v2.0 Doktorandenkurs IMSB 27
SPSS-Dateien und Fenster In SPSS wird mit verschiedenen Dateitypen gearbeitet. Jeder Dateityp wird in einem anderen Fenster geöffnet. Datei Datendateien: *.sav Ausgabedateien: *.spv Syntaxdateien: *.sps Fenster Daten-Editor Viewer Syntax-Editor Diagramm-Editor Tabellen-Editor v2.0 Doktorandenkurs IMSB 28
Daten-Editor Syntax-Editor Viewer Diagramm-Editor Die nachfolgenden Screenshots zeigen: SPSS Statistics, Version 25 (IBM Corp., Armonk, NY, USA) unter Windows v2.0 Doktorandenkurs IMSB 29
Daten-Editor Syntax-Editor Viewer Diagramm-Editor v2.0 Doktorandenkurs IMSB 30
Daten-Editor Syntax-Editor Viewer Diagramm-Editor v2.0 Doktorandenkurs IMSB 31
Daten-Editor Syntax-Editor Viewer Diagramm-Editor v2.0 Doktorandenkurs IMSB 32
SPSS-Datensätze Ein Datensatz besteht aus Zeilen, jede Zeile wird in Spalten eingeteilt. Jede Spalte kann ein oder mehrere Zeichen (Ziffer, Buchstabe) aufnehmen. MERKREGELN Jede Zeile repräsentiert eine Untersuchungseinheit (z.b. Patient, Proband, Zahnspange, Hand, Wirbelkörper usw.) Jede Spalte repräsentiert ein Merkmal einer Untersuchungseinheit (z.b. Geschlecht, Alter, Größe, Material, Blutdruck, Haustier usw.) v2.0 Doktorandenkurs IMSB 33
Daten-Editor Datenansicht: Datensatz mit einzelnen Fällen und Variablen Variablenansicht: Betrachten und Definition von Variablenattributen v2.0 Doktorandenkurs IMSB 34
Variablendefinition: Name Variablennamen müssen eindeutig sein. Sie dürfen maximal 64 Zeichen lang sein und beginnen mit einem der Zeichen A-Z, a z, @, oder #. Leerzeichen sind nicht gestattet. Dem ersten Zeichen eines Namens dürfen beliebige Kombinationen aus Buchstaben, Ziffern, die Zeichen @, #, $,., und _ folgen. Variablennamen dürfen nicht mit. oder _ enden. v2.0 Doktorandenkurs IMSB 35
Variablendefinition: Typ Im Dialogfeld (Variablen)Typ eintragen oder mit Hilfe der Syntax zuweisen: NUMERIC Alter (F3.0). EXECUTE. v2.0 Doktorandenkurs IMSB 36
Variablendefinition: Variablenlabel Beschreibung der Variablen Bis zu 256 Zeichen möglich Leer- und Sonderzeichen erlaubt In das entsprechende Feld in der Spalte Beschriftung schreiben oder mit Hilfe der Syntax zuweisen: VARIABLE LABELS sysbldr1 'Syst. Blutdruck der 1. Messung [mm Hg]'. EXECUTE. v2.0 Doktorandenkurs IMSB 37
Variablendefinition: Wertelabel Beschreibung der Ausprägungen der Variablen Bis zu 60 Zeichen möglich Leer- und Sonderzeichen erlaubt Im Dialogfeld Werte eintragen oder mit Hilfe der Syntax zuweisen: VALUE LABELS Geschlecht 0 'männlich' 1 'weiblich' 9 'keine Angabe'. EXECUTE. v2.0 Doktorandenkurs IMSB 38
Variablendef.: Benutzerdefiniert fehlende Werte Zahlenwert, der im Falle eines fehlenden Wertes eingesetzt wird darf unter den auftretenden Werten nicht vorkommen wird bei Berechnungen ausgeschlossen Im Dialogfeld Fehlende Wert eintragen oder mit Hilfe der Syntax zuweisen: MISSING VALUES Geschlecht (9). EXECUTE. v2.0 Doktorandenkurs IMSB 39
Variablendefinition: Messniveau v2.0 Doktorandenkurs IMSB 40
Hilfefunktion v2.0 Doktorandenkurs IMSB 41
Datenbeispiel in SPSS v2.0 Doktorandenkurs IMSB 42
Datensatz einlesen Datei > Öffnen > Daten > v2.0 Doktorandenkurs IMSB 43
Daten aufbereiten Beschriftungen, Wertelabels, Fehlende Werte, Nachkommastellen, Messniveau, v2.0 Doktorandenkurs IMSB 44
1. Plausibilitätschecks Vollständigkeit Richtigkeit Stetige Daten (Minimum, Maximum) Ausreißer Kategoriale Daten (Häufigkeitstabellen) Kategorien besetzt Zusätzliche Kategorien Datumsangaben Datum in der Zukunft (Maximum) Reihenfolge zweier Zeitpunkte (Differenz) Konsistenz Geschlecht = männlich und Krankheit = Gebärmutterhalskrebs Alter < 30 und Beruf = Rentner v2.0 Doktorandenkurs IMSB 45
1. Plausibilitätschecks niedrige Minimalgröße hohes Maximalgewicht Zusätzliche Kategorien bei Geschlecht Follow-Up Datum liegt in der Zukunft v2.0 Doktorandenkurs IMSB 46
Stetige Variablen 2. Deskription des Kollektivs symmetrisch verteilt/ normalverteilt: Mittelwert, Standardabweichung schief verteilt: Median, Interquartilsbereich grafisch: Boxplot Kategoriale Variablen absolute und relative Häufigkeiten grafisch: Balkendiagramm v2.0 Doktorandenkurs IMSB 47
2. Deskription des Kollektivs v2.0 Doktorandenkurs IMSB 48
2. Deskription des Kollektivs v2.0 Doktorandenkurs IMSB 49
2. Deskription des Kollektives v2.0 Doktorandenkurs IMSB 50
3. Auswertung t-test Χ 2 -Test Regression nicht-parametrische Verfahren v2.0 Doktorandenkurs IMSB 51
Viel Erfolg für Ihre Doktorarbeit! v2.0 Doktorandenkurs IMSB 52
Backup-Folien v2.0 Doktorandenkurs IMSB 53
SPSS: Test auf Normalverteilung Analysieren > Deskriptive Statistiken > Explorative Datenanalyse: Diagramme v2.0 Doktorandenkurs IMSB 54
SPSS: Test auf Normalverteilung Analysieren > Deskriptive Statistiken > Explorative Datenanalyse: Diagramme v2.0 Doktorandenkurs IMSB 55
SPSS: Deskriptive Statistiken Analysieren > Deskriptive Statistiken > Häufigkeiten v2.0 Doktorandenkurs IMSB 56
SPSS: Deskriptive Statistiken quantitative Variablen v2.0 Doktorandenkurs IMSB 57
SPSS: Deskriptive Statistiken qualitative Variablen v2.0 Doktorandenkurs IMSB 58