Nationale Biobanken und internationale Vernetzung: KORA-gen
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- Edith Vogt
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1 Nationale Biobanken und internationale Vernetzung: KORA-gen Christian Gieger 1, 2, H.-Erich Wichmann 1, 2 1 GSF, Neuherberg 2 LMU - Lehrstuhl für Epidemiologie, Universität München Biomaterialbanken TMF-Symposium am
2 KORA-gen Kooperative Gesundheitsforschung in der Region Augsburg für genetische Fragestellungen Populationsbasierte Kohortenstudie Region Augsburg Einwohner 4 Surveys seit 1984/85 Ca Probanden, Jahre (Zufallsstichprobe) Follow-up: Untersuchungen (bis 10 Jahre), Befragungen, Mortalität (bis 20 Jahre) permanentes Studienzentrum
3 KORA Studienregion Augsburg Augsburg-Land 123,000 Inh. 234,000 Inh. 255,000 Inh. Aichach/Friedberg Augsburg-Stadt
4 KORA Populationen 1985 KORA Myocardial Infarction Register /85 (S1) n= /90 (S2) n= /95 (S3) n= /98 questionnaire Survival status and Follow-upquestionnaire for S1-S3 populations 23 y. 2001/02 Survival status and questionnaire Follow-up- for S1-S3 populations 10 y. 2004/05 (F3) n= /08 Survival status and Follow-up- for S1-S4 populations 1999/2001 (S4) n= years 2006/07 (F4) planned 1985 Bio Samples 2009
5 KORA-gen Einverständnis: aktive Zustimmung, Rücktrittsrecht, z.t. Einschränkung auf ausgewählte Krankheiten/ Fragestellungen Datenhaltung: pseudonymisiert Zugang: Antrag, Projektvereinbarung
6 KORA-gen: Internetportal (1)
7 KORA-gen: Internetportal (2)
8 KORA-gen: Internetportal (3)
9 KORA-gen Informationen über folgende Parameter verfügbar: - Soziodemographie - Umweltfaktoren, Ernährung, Rauchen - Anamnese: Erkrankungen, Medikation - Relevante Laborwerte für die untersuchten Krankheiten Schwerpunkte: - Herz-Kreislauf Erkrankungen - Metabolische Erkrankungen - Allergien - Krebs - Bevölkerungsbezogene Kontrollen
10 Genetische Ressource KORA-Bioproben - DNA, Serum n = Zelllinien n = SNP-Analyse im Genom Analyse Zentrum möglich
11 KORA Probanden mit Risikofaktoren (4 surveys) Bluthochdruck (RR > 140/90 mm Hg) Übergewicht (BMI 30) Hypercholesterinämie (Chol. 250) Aktive Raucher Ex-Raucher 5.100
12 KORA Phänotypen (4 surveys) lebend verstorben Diabetes Krebs Herzinfarkt < 75 J. 800
13 KORA 500K Projekt KORA S3/F3 wird für f r eine genom-weite Assoziationsstudie genutzt Affymetrix 500K GeneChip Technologie, Probanden 10 ausgewählte Phänotypen (Atopie( Atopie,, BMI, Hypertonie,...) Mehrstufiges Design Genotypen werden innerhalb des NGFN als Kontrollen in Fall-Kontrollstudien verfügbar gemacht
14 Voraussetzungen für f r die erfolgreiche Durchführung hrung genetischer Studien Statistik Große e gut phänotypisierte Population Geeignete Bioproben Hochdurchsatz- Genotypisierungssystem Bioinformatik Populationsbasiert, Fall- Kontroll KORA Biobank MALDI TOF MS, Illumina, Affymetrix Skalierbares Informations- managementsystem GEM
15 Internationale Initiativen zum Aufbau von Biobanken Island ( ) Großbritannien (UK) ( ) Kanada (50.000) Japan ( ) USA (> ) P3G-Konsortium
16 Send correspondence to: Bartha Maria Knoppers Chair of Interim Board Centre de recherche en Droit Public Université de Montréal 3101, Chemin de la tour Montréal, (QC) H3T 1J7 Phone: +1 (514) Fax: +1 (514) Public Population Project in Genomics (P3G) Thomas J. Hudson Director of Scientific Operations McGill University and Genome Quebec Innovation Centre 740 Dr. Penfield Avenue, Room 7105 Montréal, (QC), H3A 1A4 Phone: +1 (514) ext Fax: +1 (514)
17 Public Population Project in Genomics (P³G) Ziel: Harmonisierung (Standardisierung von Phänotypen, Methoden, Qualitätskontrolle) Kompatible Genotyp/Phänotyp Datenbanken, gemeinsame Nomenklatur Koordination der Regeln für Datenzugang, Datenschutz, Ethik Entwicklung von Sicherungsmaßnahmen zum Datenschutz Bioinformatik für data mining, Eigentumsfragen Öffentliche Beteiligung, intellectual properties Austausch von Experten und jungen Wissenschaftlern etc.
18 Consortium Model An international resource for the coordination and exchange of ideas and data that will be generated by the various population biobanks Estonian Genome Project GenomEutwin P3G CartaGene
19 Public Population Project in Genomics P3G Consortium An international resource for the coordination and exchange of ideas and data that will be generated by the various population biobanks Kora-gen (Germany) Estonian Genome Project LifeGene (Sweden) NHLBI (USA) Genome Espana (Spain) GenomEutwin (Europe) P3G CartaGene (Canada) Danubian Biobank Foundation (Europe) CIGMR (UK) WAGHP (Australia)
20 Internationale Biobank-Initiativen Bewertung Erhebliche Aufbruchstimmung zur Etablierung von Biobanken Meist hohe Investitionskosten fast alle Projekte in der Aufbauphase, letztendliche Entwicklung schwer vorhersagbar
21 Zusammenfassung Biobanken Große Patientensammlungen erhalten zunehmende Bedeutung Schub für die Erforschung der Ursachen häufiger Krankheiten Prospektiver Ansatz bietet Vorteile für Früherkennung und Prävention
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