III. Nucleinsäurechemie-Treffen

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Britta Ritter
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1 III. Nucleinsäurechemie-Treffen am an der Universität Stuttgart Liste der angemeldeten Poster 1.) Synthesis of fluorescently labelled 3'-O-blocked nucleotides with fluoride cleavable blocking group and linker for array based Sequencing-by-Synthesis application Jennifer D'Onofrio 1, Diana C. Knapp 1, Angelika Keller 1, Arvydas Lubys 2, Saulius Serva 2, Ants Kurg 3,4, Maido Remm 4, Marek Kwiatkoski 5 and Joachim W. Engels 1 1 Institut für Organische Chemie und Chemische Biologie, J. W. Goethe Universität Frankfurt am Main,Max-von-Laue Str. 7, D Frankfurt am Main, Germany; 2 Fermentas UAB, V.Graiciuno 8, LT-02241Vilnius, Lithuania; 3 Asper Biotech Ltd., Oru 3, EE Tartu, Estonia; 4 University of Tartu, 23 Riia St. EE Tartu, Estonia; 5 OLIGOVATION AB, Dag Hammarskjölds väg 32B, SE Uppsala, Sweden. 2.) Chemically modified nucleotides for the stabilisation of Z-DNA André Nadler, Daniel Heinrich, Ansgar Fitzner, Ulf Diederichsen Institut für Organische und Biomolekulare Chemie, Universität Göttingen, Tammannstr. 2, Göttingen/Deutschland 3.) The unusual case of Orotidine-5'-Monophosphate Decarboxylase (OMPD) - From selectivity to chemodiversity Daniel Heinrich, Markus Rudolph, Ulf Diederichsen Institut für Organische und Biomolekulare Chemie, Universität Göttingen, Tammannstr. 2, Göttingen/Deutschland 4.) Pyrrolobenzodiazepine conjugates: DNA binding mode and thermodynamic profile Michael Rettig, Klaus Weisz Institut für Biochemie, Ernst-Moritz-Arndt-Universität, Felix-Hausdorff-Str. 4, D Greifswald 5.) Template directed oligonucleotide ligation using disulfide exchange chemistry new oligonucleotide analoga for programmable replication experiments Dr. Volker Patzke Lehrstuhl für Organische Chemie I, Bioorganische Chemie, NC3/174, Ruhr-Universität Bochum, Universitätsstr. 150, D Bochum

Knapp 1, Angelika Keller 1, Arvydas Lubys 2, Saulius Serva 2, Ants Kurg 3,4, Maido Remm 4, Marek Kwiatkoski 5 and Joachim W. Engels 1 1 Institut für Organische Chemie und Chemische Biologie, J. W. Goethe Universität Frankfurt am Main,Max-von-Laue Str.

2 6.) Synthesis of 3'-labeled nucleotides and their application in chemical primer extension reactions Kerstin Gießler, Manuel Röthlingshöfer, Tanja Lommel, Eric Kervio, Clemens Richert Institut für Organische Chemie, Universität Karlsruhe (TH), Fritz-Haber Weg 6, Karlsruhe 7.) F-PNA: Synthesis and Potential Application in PNA Replication Analysis Tobias A. Plöger, Günter von Kiedrowski Lehrstuhl für Organische Chemie I - Bioorganische Chemie, Universitätsstraße 150, Bochum 8.) Binding and bending DNA by artifical peptides Katharina Fejfar, Stefanie Scholz, Nadine Kohlmorgen, Ulf Diederichsen Institut für Organische und Biomolekulare Chemie, Universität Göttingen, Tammannstr. 2, Göttingen/Deutschland 9.) "Diazonia- and Tetraazoniapolycyclic Cations as Motif for Quadruplex-DNA Ligands" Heiko Ihmels, Katharina Jäger Organische Chemie II, Universität Siegen, Adolf-Reichwein-Str. 2, Siegen 10.) In vitro selection and engineering of deoxyribozymes based on a three-helixjunction architecture Claudia Höbartner 1,2, P.I. Pradeepkumar 2,3, Scott K. Silverman 2 1 Max Planck Institute of Biophysical Chemistry, AG Nucleic Acid Chemistry, Am Fassberg 11, D Göttingen 2 Department of Chemistry, University of Illinois at Urbana-Champaign, IL 61801, US 3 Department of Chemistry, Indian Institute of Technology, Bombay, Mumbai , India 11.) "Dodecahedral DNA nano-scaffolds" Jan Castonguay, Jan Zimmermann, Günter von Kiedrowski Ruhr-Universität Bochum, Organische Chemie I, Universitätsstrasse 150, Bochum.

Plöger, Günter von Kiedrowski Lehrstuhl für Organische Chemie I - Bioorganische Chemie, Universitätsstraße 150, 44780 Bochum 8.

3 12.) Caged oligodeoxyribonucleotides activated by red light Annabelle Fülöp, Andrij Mokhir Anorganisch-Chemisches Institut, Universität Heidelberg, Im Neuenheimer Feld 270, D Heidelberg 13.) Spectroscopic studies of DNA triplex formation with a d -carboline-tfo conjugate Andrea Eick, Fanny Riechert, Klaus Weisz Institut für Biochemie, Ernst-Moritz-Arndt-Universität, Felix-Hausdorff-Str. 4, D Greifswald 14.) DNA-detection by fluorescence enhancement via click chemistry Elmar Jentzsch, Andriy Mokhir Anorg-Chem Inst. Uni Heidelberg; INF 270; Heidelberg 15.) Perylene Bisimide Dimers as a Fluorescent "Glue" for DNA Florian Menacher, Daniela Baumstark, Hans-Achim Wagenknecht University of Regensburg, Institute of Organic Chemistry, Universitätsstraße 31, D Regensburg, Germany 16.) Fluorescent color readout of DNA hybridization by thiazole orange as an excimerforming DNA base surrogate Sina Berndl, Hans-Achim Wagenknecht University of Regensburg, Institute of Organic Chemistry, Universitätsstr. 31, D Regensburg, Germany 17.) Sequence specific analysis of nucleic acids using the high turnover catalytic reaction Dumitru Arian; Andriy Mokhir Universität Heidelberg, Anorganisch-Chemisches Institut, Im Neuenheimer Feld 270, Heidelberg, Deutschland

4, D-17487 Greifswald 14.) DNA-detection by fluorescence enhancement via click chemistry Elmar Jentzsch, Andriy Mokhir Anorg-Chem Inst. Uni Heidelberg; INF 270; 69120 Heidelberg 15.

4 18.) Femtosecond solvation and excited state dynamics of 2-hydroxy-7-nitro-fluorene linked into duplex DNA: femtosecond spectroscopy, excited-state dynamics, NMRstructure M. Pfaffe, A. Dallmann, C. Mügge, R. Mahrwald, S. Kovalenko,N. P. Ernsting Humboldt Universität zu Berlin, Institut für Chemie, Brook-Taylor-Str. 2, Berlin 19.) Fluorescent biolabels in DNA-helices: Determination of structure perturbations by NMR-spectroscopy A. Dallmann, C. Mügge, C. Griesinger, J. Tuma,N. P. Ernsting Humboldt Universität zu Berlin, Institut für Chemie, Brook-Taylor-Str. 2, Berlin MPI für biophysikalische Chemie, Am Faßberg 5, Göttingen 20.) Backbone-Base-Integrating Oligonucleosides: RNA-Foldamers with a Novel Architecture Martina Adams und Andrea Vasella Laboratorium für Organische Chemie, ETH Zürich, Wolfgang-Pauli-Strasse 10, CH-8093 Zürich, Schweiz 21.) Synthesis and Proporties of Fluoroindoles, and 7-N-purine as RNA Substitutes? International Symposium? RNA-Ligand-Interactions? Bozilovic, Jelena, Koller Alrun, Gohlke Holger, Engels W. Joachim Institut für Organische Chemie und Chemische Biologie, Johann Wolfgang Goethe-Universität, Maxvon-Laue Strasse 7, D Frankfurt am Main, 22.) Synthesis & Influence of modified Nucleosides on sirna activity and stability Dalibor Odadzic, Joachim W. Engels Institute of Organic Chemistry and Chemical Biology OCCB, Johann Wolfgang Goethe-Universität, Max-von-Laue Strasse 7, D Frankfurt am Main, Germany 23.) Chemical Replication Steps with Ribonucleotides Christopher Deck, Heike Vogel, Clemens Richert Institut für Organische Chemie Universität Stuttgart, Pfaffenwaldring 55, Stuttgart

) Fluorescent biolabels in DNA-helices: Determination of structure perturbations by NMR-spectroscopy A. Dallmann, C. Mügge, C. Griesinger, J. Tuma,N. P.

5 24.) Beyond wobbling: High fidelity base pairing a the 3'-terminus Amritraj Patra, Clemens Richert Institut für Organische Chemie, Universität Karlsruhe (TH), Fritz-Haber Weg 6, Karlsruhe 25.) Kinetic studies of long oligonucleotides formation from dimeric building blocks Olga Taran, Günter von Kiedrowski Department of Organic Chemistry I Bioorganic Chemistry, Faculty of Chemistry, Ruhr University Bochum, Universitätsstraße 150, Bochum 26.) New approaches for preparation of trinucleotide synthons to be used in oligonucleotide synthesis Matthäus Janczyk 1, Hans-Joachim Fritz 2 & Sabine Müller 1 1 Ernst Moritz Arndt Universität Greifswald, Institut für Biochemie, Felix-Hausdorff-Str. 4, Greifswald, Germany 2 Institut für Mikrobiologie und Genetik, Abteilung Molekulare Genetik und Präparative Molekularbiologie, Grisebachstr. 8, Göttingen, Germany

University Bochum, Universitätsstraße 150, 44801 Bochum 26.

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