Nutzung des TMF-PID-Generators am IMISE, Leipzig Lehren aus der Installation des PID-Generators beim IFB Adipositas (Leipzig) und CSCC Sepsis (Jena)

Transkript

1 Nutzung des TMF-PID-Generators am IMISE, Leipzig Lehren aus der Installation des PID-Generators beim IFB Adipositas (Leipzig) und CSCC Sepsis (Jena) Dr. Frank Meineke TMF-Workshop ID-Tools Institut für Medizinische Informatik, Statistik und Epidemiologie TMF-PID Nutzung in Leipzig F. Meineke 1

2 Szenarien Kompetenznetz Herzinsuffizienz TMF-PID Generator (WEB-Anwendung) IFB Sepsis&Sepsisfolgen Jena (im Auftrag) TMF-PID Generator (WEB-Anwendung im Hintergrund) LIFE Leipziger Forschungszentrum für Zivilisationserkrankungen Algorithmische PID Berechnung (Oracle basiert) IFB AdipositasErkrankungen Anforderung: kompatibel zu LIFE, ergänzend TMF-PID TMF-PID Nutzung in Leipzig F. Meineke 2

3 Integriertes Forschungs- und Behandlungszentrum AdipositasErkrankungen Mit einem IFB soll in einem bedeutsamen Krankheitsbereich der nachhaltige Aufbau eines Forschung und Versorgung umfassenden Zentrums zu einem gemeinsamen, das Profil bestimmenden Schwerpunkt sowohl einer Medizinischen Fakultät als auch des zugehörigen Universitätsklinikums gefördert werden. Depression u. Schlaf- Wach-Regulation Hirnstruktur Lernprozesse Telefonberatung Leberentfettung Bariatische Chirurgie Gestationsdiabetes Vererbbarkeit Seratoninverfügbarkeit (PET) Essstörungen Fettgewebsentwicklung (Kinder) Kraft- vs. Ausdauertraining TMF-PID Nutzung in Leipzig F. Meineke 3

4 Integriertes Forschungs- und Behandlungszentrum Sepsis und Sepsisfolgen (CSCC) Risikoabschätzung und Prävention z.b. ALERTS: Nutzen eines krankenhausweiten Infektionspräventions- Programmes zur Reduktion septischer Krankenhausinfektionen Neue diagnostische Verfahren z.b. ACTION: Prognostische und diagnostische Relevanz des Nachweises bakterieller DNA bei Patienten mit Leberzirrhose und Aszites Intensivmedizinische Versorgung z.b. MEDUSA: Medizinisches Weiterbildungsprogramm zur Fokuskontrolle und Antibiotikatherapie Sepsis bedingtes Organversagen Langzeitfolgen Gesundheitswesen TMF-PID Nutzung in Leipzig F. Meineke 4

5 LIFE Herausforderung Zivilisationserkrankungen Umwelt- und lebensstilassoziierte Zivilisationskrankheiten führen mit über 60% die Krankheits- und Todesursachenstatistiken in unserer Bevölkerung an Allergie Adipositas Pankreatitis Atherosklerose Depression/ Krebs Demenz TMF-PID Nutzung in Leipzig F. Meineke 5

6 Anforderungen an das ID-Management (hier: CSCC) Datenzusammenführung Studien (Multizentrisch) + Registerstudie, Versorgungsdaten (SAP/Copra/Labor) Aufbau Forschungsdatenbank (DataMart + DWH) vollumfängliche Lösung PID-Generator Pseudonymisierung 2.ter Stufe SIC-Generator (Randomisierung z.zt. kein Thema) PID-SIC Verwaltung (= MappingTabelle ) Bezug zu Versorgungsdaten (Pat-ID, Fall-Nr., Proben Nr,...) Integration SAP Worklist RegisterMaske ( PID Dispatcher ) (PID/SIC, PID-Gen, EDC/OpenClinica via SOAP) TMF-PID Nutzung in Leipzig F. Meineke 6

7 UKJ Studie Registry TMF-PID Nutzung in Leipzig F. Meineke 7

8 IFB LIFE UKL TMF-PID Nutzung in Leipzig F. Meineke 8

9 Erfahrungen (1) Installation Wir sind ein Oracle -Haus... Programmgesteuerte PostgresSQL DB Anlage problematisch (z.b. Latin1/UTF) Compilations Probleme (z.b. Zeitkonstanten in Header) in Linux; Integration vermisst: Schnittstellen, Standards außerhalb CGI; Web-Services problematisch Verknüpfung zu PID-SIC Listen, EDC, SAP zu entwickeln Einbetten / kapseln Konfiguration Aufbau der Konfigurationsdateien (teils DB, teils Konfiguration) Umlaute auf verschiedenen Ebenen problematisch Fragen zur Konfiguration: z.b. Rolle des AES Schlüssels, Fallen: Standardkonfiguration z.b. pid.k3 = > 2^32 Empfehlungen: z.b. phon. Suche Hannover und/oder Köln oder weder noch? TMF-PID Nutzung in Leipzig F. Meineke 9

10 Erfahrungen (2) Dokumentation vermisst: Einführung / Basisverständnis / (No)Use-cases / Bezug zu TMF-DS-Konzepten keine Validierungsunterstützung Überraschungen z.b. Gleiche Konfig, gleiche IDAT = gleiche PID? Einsatz / Nutzung hat Projekt -Charakter Misstrauen in Funktion z.b. bei phonetischen Suchen: Stat. Aussagen bzgl. Kollisionen- TMF-PID Nutzung in Leipzig F. Meineke 10

11 Ausblick / Wünsche SW-Entwicklung Schnittstellen (java API? jpa / jdbc? WebServices?) Bitte keine bleeding Edge frameworks! Konflikte lösen über Schnittstellen (Adminoberflächen) Dokumentation Praxis-nahe WI/SOPs, z.b. klare Empfehlungen bei Konflikten Validierungsunterlagen unabhängig von einer Förderung I Bilden einer breiteren bzw. offeneren Community / UserGroup Übersicht nutzende Einrichtungen Übersicht zu etwaigen SW Erweiterungen Community-Edition der ID-Tools TMF-PID Nutzung in Leipzig F. Meineke 11