LABORBEFUNDE IN DER MEDIZININFORMATIK-INITIATIVE

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1 LABORBEFUNDE IN DER MEDIZININFORMATIK-INITIATIVE Dr. med. Andreas Bietenbeck Arbeitsgruppe Medizinische Informatik der Deutschen Gesellschaft für Klinische Chemie und Laboratoriumsmedizin (DGKL) e.v. Institut für Klinische Chemie und Pathobiochemie Klinikum rechts der Isar TU München

2 - Was haben wir erreicht? - Wo wollen wir hin?

3 Das LOINC - TOP 300 Set Ziel: Die 300 wichtigsten Analysen sollen als Ausgangspunkt für die LOINC Kodierung dienen. 1) Daten: nach Häufigkeit geordnete Analysen von 5 Universitätsklinika 2) Daten bereinigen 3) Analysen vereinheitlicht und zusammengeführt 4) Mit robustem Algorithmus werden die 300 Analysen ausgewählt, die in allen Standorten durchschnittlich die häufigsten sind.

4 Vereinheitlichung von Analysen Umrechnungen ohne Informationsverlust Massen- <=> Stoffkonzentration Anzahl bezogen auf 100 Leukozyten <=> Anzahl pro Volumen Anzahl bezogen auf 100 Zellen <=> Anzahl pro Volumen Konzentration bezogen auf Gesamtprotein <=> Konzentration Verallgemeinerungen mit Informationsverlust Analyse mit Methode <=> Analyse ohne Methode Analyse mit spezifischer Blutprobe <=> Analyse mit Blutprobe 4

5 Das TOP 300 Set TIME_ METHOD_ rank primär usedinlabs sekundär COMPONENT PROPERTY ASPCT SYSTEM SCALE_TYP TYP Creatinine SCnc Pt Bld Qn Creatinine MCnc Pt Bld Qn Creatinine SCnc Pt Ser/Plas Qn Creatinine MCnc Pt Ser/Plas Qn Creatinine MCnc Pt BldA Qn Leukocytes NCnc Pt Bld Qn Leukocytes NCnc Pt Bld Qn Estimate Leukocytes NCnc Pt Bld Qn Leukocytes NCnc Pt Bld Qn Hematocrit VFr Pt Bld Qn Automated count Manual count Hematocrit VFr Pt Bld Qn Impedance Hematocrit VFr Pt Bld Qn Hematocrit VFr Pt Bld Qn Spun Automated count Hematocrit VFr Pt Bld Qn Estimated Hematocrit VFr Pt BldA Qn Hematocrit VFr Pt BldV Qn Hematocrit VFr Pt BldMV Qn Hematocrit VFr Pt BldC Qn 5

6 Analysen in den einzelnen Laboren 6

7 Qualitätskontrolle Von den amerikanischen TOP 300 Codes tauchen 137 nicht in unserer Liste auf: loinc rank long Carbon dioxide, total [Moles/volume] in Serum or Plasma Glomerular filtration rate/1.73 sq M predicted among non-blacks by Creatinine-based formula (MDRD) Glomerular filtration rate/1.73 sq M predicted among blacks by Creatinine-based formula (MDRD) Anion gap 3 in Serum or Plasma Bacteria identified in Unspecified specimen by Culture Fetal Neck.soft tissue Translucency width US Pathology report final diagnosis Urea nitrogen/creatinine [Mass ratio] in Serum or Plasma Color of Urine Albumin/Globulin [Mass ratio] in Serum or Plasma Globulin [Mass/volume] in Serum by calculation Leukocyte esterase [Presence] in Urine by Test strip Appearance of Urine Cholesterol in VLDL [Mass/volume] in Serum or Plasma by calculation Leukocytes [#/area] in Urine sediment by Microscopy high power field Globulin [Mass/volume] in Serum Cytology report of Cervical or vaginal smear or scraping Cyto stain.thin prep Pathology report relevant history Bacteria [#/area] in Urine sediment by Microscopy high power field 7

8 Qualitätskontrolle II 66 Analyte aus der TOP 300 tauchen nicht in den COMMON_TEST_RANK auf : loinc rank long Immature granulocytes [#/volume] in Blood Glomerular filtration rate/1.73 sq M.predicted [Volume Rate/Area] in Serum, Plasma or Blood Acid phosphatase [Enzymatic activity/volume] in Blood Cholinesterase [Enzymatic activity/volume] in Blood Procalcitonin [Mass/volume] in Serum or Plasma Beta 2 globulin [Mass/volume] in Serum or Plasma by Electrophoresis Beta 1 globulin [Mass/volume] in Serum or Plasma by Electrophoresis Glutamate dehydrogenase [Enzymatic activity/volume] in Serum or Plasma Normoblasts [#/volume] in Blood Cystatin C [Mass/volume] in Serum or Plasma Leukocytes [#/area] in Urine sediment by Automated count Interleukin 6 [Mass/volume] in Serum or Plasma Bacteria [#/area] in Urine sediment by Automated count Erythrocytes [#/area] in Urine sediment by Automated count Epithelial cells [#/area] in Urine sediment by Automated count Epithelial cells.non-squamous [#/area] in Urine sediment by Automated count Lymphocytes Immunoblastic [#/volume] in Blood Alpha-1-Microglobulin [Moles/volume] in Urine Thyrotropin receptor Ab [Units/volume] in Serum 8

9 The Unified Code for Units of Measure (UCUM) - Alle Einheiten müssen im UCUM Format vorliegen. - In der Labormedizin entsprechen die meisten verwendeten Einheiten bereits dem UCUM Format. - Aber: Eine UCUM Einheit muss wohlformatiert sein. - Validator: mg/dl mg/dl g/dl mg/dl Achtung neu! mg /dl 9

10 LOINC und UCUM in der Routine HL7 OBX 1 NM zca^calcium^swl mmol/l OBX 1 NM zca^calcium^swl^ ^^ln mmol/l 10

11 Bausteine für einen Laborbefund in FHIR ServiceRequest Diagnostic Report Observation Observation Observation Observation Specimen Molecular Sequence 11

12 - Was haben wir erreicht? - Wo wollen wir hin?

13 Standards für besseres Behandlung Ganslandt, and Neumaier CCLM 2018 Plebani et al.; American journal of clinical pathology

14 Breiter Einsatz von Standards in der Labormedizin - Standards für die Labormedizin müssen international sein - Standards für die Labormedizin müssen auch außerhalb der MII anwendbar sein - Standards für die Labormedizin müssen im ambulanten und im stationären Sektor funktionieren => LOINC und UCUM : Unreife Thrombozyten Ringversuche: : Retikulierte Thrombozyten : 血小板. 网织 : 计数型浓度 : 时间点 : 全血 : 定量型 : 自动化计数方法 14

15 Komplexität des Laborbefund muss erhalten bleiben 15

16 Komplexität des Laborbefunds - Der elektronische Befund sollte den vorhanden Befund abbilden. - Alle LOINC Codes sollen erlaubt bleiben. (Wir brauchen eher noch mehr.) - Lücken müssen durch andere Standards gestopft werden. 16

17 Wichtige Details - Wer hat die Untersuchung durchgeführt (welches Labor? Der Patient selbst?) - Für Befundkommentare existiert kein Standard Glukose (LOINC) 562 mg/dl (UCUM, SNOMED CT) Infusionsabnahme? Bietenbeck et al.; Labmed

18 Bessere Forschung und Behandlung im Learning Health System Wissen Behandlung Entity in which progress in science, informatics, and care culture align to generate new knowledge as an ongoing, natural byproduct of the care experience, and seamlessly refine and deliver best practices for continuous improvement in health and health care. Daten Institute of Medicine (IOM). Digital Infrastructure for the Learning Health System,

19 Das Labor als Teil eines Learning Health System - Der Mehraufwand muss kompensiert werden. - Daten-Teilen darf keine Einbahnstraße sein. Die Labormedizin benötigt dringend strukturierte Daten z.b. zu Diagnosen oder Medikamenteneinnahmen. - Die Labormedizin liefert die meisten strukturierten Informationen. Deshalb muss die Labormedizin bei medizinischen IT-Projekten involviert werden. 19

20 Patientenrelevantes Outcome als Ziel Prasser; Methods Inf 2018 Med. Outcome Labor ohne IT Labor mit IT Roda; ClinChem

21 Vielen Dank für Ihre Aufmerksamkeit! 21