Reagenzien-Wegweiser für das MagNA Pure 96 System Entscheidung für mittlere und Hochdurchsatz-Aufreinigung
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- Bernd Bergmann
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1 Reagenzien-Wegweiser für das 96 System Entscheidung für mittlere und Hochdurchsatz-Aufreinigung
2 Nukleinsäure- Probenmaterial Typ genomisch Kulturzellen Volumen 96 DNA and Viral NA Small Volume Large Volume Kit* Kit* Kat.nr. Kat.nr Bis zu DNA Blood LV µl Vollblut DNA Blood ext lys SV 49 Vollblut DNA Blood ext lys LV µl Vollblut (mit bis zu Blutzellen) DNA Blood LV Bis zu 5 mg DNA Tissue SV 60 Bis zu 25 mg oder bis zu FFPE Schnitte DNA Tissue LV 80 1 FFPE Schnitt (1 10 µm) DNA Tissue FFPE SV µl Pathogen Universal Pathogen Universal µl Pathogen Universal µl Pathogen Universal Plasma, Serum, Vollblut µl Viral NA Universal SV Viral NA Plasma SV 55 Plasma, Serum Viral NA Plasma LV Viral NA Universal LV 77 Lysat aus Plasma, Serum, Vollblut µl Plasma, Serum, Vollblut Viral NA Plasma ext lys SV 47 Lysat aus Plasma, Serum Plasma, Serum Viral NA Plasma ext lys LV a) 69 Urin, BAL2), Sputum, CSF 2), Abstriche, Stuhl, Bakterienkultur, Nagelproben 200 µl Pathogen Universal 200 d) e) f) g) Pathogen Universal µl Pathogen Universal Kulturzellen Cellular RNA LV 80 Komplettes WBC Sediment aus einem Paxgene Tube 2,5 ml Vollblut RNA PAXgene LV DNA Frisches Gewebe / FFPE Schnitte RNA / DNA 55 DNA Cells LV Plasma, Serum, Vollblut Urin, BAL2), Sputum, CSF 2), Abstriche, Stuhl, Bakterien kultur RNA DNA Cells SV DNA Blood SV Lysat aus Vollblut GesamtRNA Appl. AufreiniNote gungszeit in min. (96 Proben) µl Vollblut viral Empfohlenes Software-Protokoll1) Bis zu Bakterien/ Pilze Cellular RNA Large Volume Kit# Kat.nr Halbes WBC Sediment aus einem Paxgene Tube 80 d) c) b) RNA PAXgene Half Tube LV 86 RNA Blood LV Vollblut Lysat 400 µl Vollblut 800 µl Vollblut RNA Blood LV Fresh frozen Gewebe oder RNAlater stabilisiertes Gewebe 25 mg RNA Tissue FF High LV mg RNA Tissue FF Standard LV 9 FFPE Gewebeschnitt 1 Schnitt (5-10 µm) RNA Tissue FFPE LV 87 1) Alle Software-Protokolle sind speziell auf die Anforderungen der verschiedenen Probenmaterialien abgestimmt. Sie sind vorinstalliert auf dem 96 System bzw. unter zu finden. 2) BAL=Bronchoalveolar Lavage, CSF= Cerebrospinal Fluid
3 PCR-Setup Auswahl an LightCycler T 96 und LightCycler T 480 Reagenzien für die PCR / RT-PCR ) FastStart Essential DNA Green Kat.nr (500 Reakt.) Kat.nr LightCycler T 480 SYBR Green I Kat.nr (500 Reakt.) Kat.nr Sequenzunabhängiges Format - Ideal für qualitative und quantitative Unter suchungen, sowie zur Produktidentifikation über Schmelzkurven analyse. DNA Fast Start Essential DNA Probes Kat.nr (500 Reakt.) Kat.nr LightCycler T 480 Probes Kat.nr (500 Reakt.) Kat.nr Analyse im Sondenformat Hydrolysis Probes, HybProbe, SimpleProbe - Sequenzspezifische DNA-Detektion ohne Schmelzkurvenanalyse LightCycler T 480 Genotyping Kat.nr (84 Reakt.) Protokoll: PCR Setup with Mix (< 5 min) oder PCR Setup without Mix (< 5 min) - Analyse im Sondenformat HybProbe, SimpleProbe - Sequenzspezifische DNA-Detektion mit oder ohne Schmelzkurvenanalyse LightCycler T 480 RNA Master Hydrolysis Probes # Kat.nr (500 Reakt.) - 1-Schritt RT-PCR - Analyse im Sondenformat Hydrolysis Probes (TaqMan T, Universal Probe Library). Mit Aktivator für eine spezifische und effiziente Ampli fikation und Enhancer für schwierige (GC reiche) Sequenzen. - 2-Schritt RT-PCR - Ready-to-use Kit auch für RNA-Targets mit hohem GC-Gehalt - Anschließende PCR im Sequenzunabhängigen oder -spezifischen Format a) No. 1: Performance Efficient Extraction of Viral DNA and RNA from a Variety of Patient Sample Materials in Routine Diag nostics, June 2011 RNA Transcriptor First Strand cdna Synthesis Kat.nr (50 Reakt.) Kat.nr (100 Reakt) Kat.nr (200 Reakt) Kit # System Application Note b) No. 2: Comparison of Automated 96 and Man ual PAXgene RNA Isolation from Stabilized Peripheral Blood Samples, June 2011 c) No. : Use of 96 and LightCycler T Systems for High Throughput Testing of Stool Samples for enterohemor rhagic E. coli (EHEC) in an Outbreak, August 2011 d) No. 5: High-Throughput detection of bacterial, fungal and viral nucleic acids in routine microbiological sample types using one generic Pathogen Universal Protocol on the 96 System, November 2011 e) No. 6: Utility of the 96 and LightCycler T 480 Systems for testing of Stool Samples for Toxin-producing Clostridium difficile in Routine Use, March 2012 f) No. 7: Use of 96 and LightCycler T Systems for High Throughput Testing of Nail Samples for Dermatophytes Causing Onychomycosis, March 2012 g) No. 8: Utility of the 96 and LightCycler T 480 System for the Detection of Respiratory Pathogens, March 2012 ) Die komplette Übersicht über LightCycler T 480 Kits finden Sie in unserer Broschüre Reagenzien-Wegweiser für das LightCycler T 480 System ( ). * in vitro Diagnostik, # nur für Forschungszwecke
4 Warum 96 Reagenzien? Schnell und validiert zur Nukleinsäure: Validierte, gebrauchsfertige Reagenzien sparen Zeit Parallele Aufreinigung aller Proben ohne Wartezeiten vermeidet Artefakte Softwaregestützte Haltbarkeitskontrolle der Reagenzien sorgt für zuverlässige Aufreinigungen Protokolle für das PCR-Setup verkürzen den Workflow Warum LightCycler T 480 Reagenzien? Schnell, effizient und flexibel zum PCR-Ergebnis: Funktionsgetestete Reagenzien und qualitätsgetestete Multiwell-Platten aus einer Hand sparen Zeit und Kosten Robuste Hot-Start Mastermixe mit voroptimierter Magnesiumkonzentration vereinfachen das PCR-Setup und steigern die Effizienz Hohe Enzymstabilität auch bei Raumtemperatur sorgt für sicheres Arbeiten im automatisierten Hochdurchsatz Sequenzspezifische bzw. -unspezifische Formate bieten mehr Flexibilität bei der Analyse Weitere Informationen inclusive Packungsbeilagen und Application Notes finden Sie unter:
5 Benötigtes Verbrauchsmaterial für einen 96 Kit System Fluid (External)* ml 96 Filter Tips (1000 µl)* 840 St. (8 480) 96 Processing Cartridge* 6 St. 96 Output Plate* 60 St. 96 Internal Control Tube* 150 St. (15 10) 96 Sealing Foil* 100 St ,75 0, 0,5 0,1 Zahl der Zahl der Läufe mit Präpara 96 Proben tionen DNA and Viral NA Small Volume Kit * mit µl Proben 6 0,08 0,04 0,2 4) DNA and Viral NA Large Volume Kit * mit Proben 288 0,7 0,15 0,25 0,05 0,02 mit µl Proben 144 0,7 0,15 0,25 0,05 0, Cellular RNA Large Volume Kit # mit Proben (z.b. halbes PAXgene Röhrchen) 288 0,55 0,2 0,15 0,05 0,02 mit µl Proben (ganzes PAXgene Röhrchen) 144 0,55 0,2 0,15 0,05 0,02 4) abhängig von der Häufigkeit der Reagenzien-Wiederverwendung und den Folgeapplikationen mit der Output Plate Benötigtes Verbrauchsmaterial für einen LightCycler T 96 bzw. 480 Kit FastStart Essential DNA Green Probes LightCycler T 480 Multiwell Plate 96, white # Platten Benötigte Platten pro LightCycler T Kit SYBR Green I LightCycler T 480 Probes Genotyping RNA Master Hydrolysis Probes # (84 Reakt.) (500 Reakt.) 6 /5 6 /5 6/5 6/5 4 6 * in vitro Diagnostik, # nur für Forschungszwecke
6 Bei Fragen steht Ihnen auch unsere Fachliche Information gerne zur Verfügung: Telefon: Bestellungen und Preisinformationen: (gebührenfrei) estore unter Roche Diagnostics Deutschland GmbH Sandhofer Straße Mannheim 201 Roche Diagnostics. Alle Rechte vorbehalten ➀ 041 * Für die in vitro Diagnostik # Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische Anwendungen geeignet. MAGNA PURE, LIGHTCYCLER, TAQMAN und FASTSTART sind Markennamen von Roche. SYBR ist ein registrierter Markenname von Life Technologies Corporation. Exiqon und ProbeLibrary sind registrierte Marken n amen von Exiqon A/S, Vedbaek, Dänemark. Alle anderen Produktnamen und Marken sind Eigentum ihrer jeweiligen Inhaber. Primärprobenhandling PCR-Set-up Interesse an einer automatisierten Gesamtlösung? Sprechen Sie uns an!
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