Persistent Identifier im Einsatz für die medizinische Forschung Fallstudie DFG Sonderforschungsbereich 1002 Oliver Wannenwetsch Gesellschaft für wissenschaftliche Datenverarbeitung Göttingen mbh (GWDG) RDA-Deutschland-Treffen 2015 Potsdam, 25.11.2015
Agenda Persistent Identifier (PID) im Einsatz für die medizinische Forschung 1 PIDs in der medizinischen Forschung 2 Ziele des SFB 1002 INF-Projekts 3 Verknüpfung mit PID von Publikationen und Laborbüchern 4 Fazit 5 Fragen / Diskussion 2
1. Einführung PID in der medizinische Forschung Verbesserung der Nachvollziehbarkeit medizinischer Forschung Referenzierbarkeit und Dokumentation der Datenentstehung Publikationen mit dauerhaft verknüpften Forschungsdatenanhängen Bestimmung von datenrelevanten Entitäten Data Sharing Bereitstellung von Forschungsdaten als Open Data Beitrag zu öffentlichen Datenbanken (Antibodypedia) SFB 1002 Modulatorische Einheiten bei Herzinsuffizienz Verknüpfung Publikationen <-> Datensätze mittels PIDs PIDs on Things (Überbrückung von Medienbrüchen) Erfassung relevanter Entitäten in der Datenerzeugung Bildquelle: https://goo.gl/o9uxkt 3
2. Ziele des SFB 1002 INF-Projekts Publikationen nachvollziehbar und reproduzierbar machen Sammlung & Dokumentation von Publikationen Antikörpern Mauslinien Ultraschall-Daten Advanced-Light-Microscopy-Daten* Next-Generation-Sequencing-Daten* Zuordnung von Publikationen zu...... Dokumentation in Laborbüchern... verwendeten Antikörpern... verwendete Maus-Linien... Echokardiographie-Aufnahmen... eingesetzten Großgeräten* * = in Planung 4
Publikationen und Laborbüchern Bidirektionale Verknüpfungen benötigen Kollaboration 11022/umg-sfb1002-9999 10.1371/journal.pcbi.123456 Verknüpfung epic PID Publikation Verknüpfung Publisher Laborbuch 5
Aufbau Laborbuch-Etikett Handle PID (EPIC) Link zu online verfügbaren Laborbuch-Metadaten QR-Code Online-Aktivierung und Metadatenanzeige Laborbuch BesitzerIn und Benutzungszeitraum Sicherheitsetikett Zerstörung bei Ablösung 6
Laborbuch-Etikett Aktivierung Etikettenbögen sind mit Arbeitsgruppen verknüpft Sticker beschriften BesitzerIn Nutzungsbeginn Nutzungsende (optional) Schritt 1 Beschriften 7
Laborbuch-Etikett Aktivierung 2.1 Etikett anbringen Sicherheitsetikett ist selbstklebend 2.2 Schutzfolie anbringen Schutz vor Flüssigkeiten Schutz vor Abrieb Schritt 2 Anbringen Bildquelle: https://goo.gl/fx7ysr 8
Laborbuch-Etikett Aktivierung 3.1 Eingabe per Smartphone QR-Code enthält URL zur PID-Auflösung QR-Code Reader startet Webbrowser und folgt URL zum Eingabeformular Schritt 3 Online aktivieren oder 3.1 Abtippen der PID Öffnen des Eingabeformulars mit Desktop- Webbrowser QR-Code Reader Bildquellen: https://goo.gl/fx7ysr https://goo.gl/avmpjx 9
Laborbuch-Etikett Legitimation Transaktionscode (TAN) befindet sich auf der Ablösefolie des Etiketts TAN ist sichtbar nach Ablösen des Etiketts Sicherstellung, dass nur Etikettenbesitzer Aktivierung vornimmt Bindet Laborbuch-PID fest an Besitzer und die Metadaten Schritt 4 Onlinelegitimation mit TAN 10
Import vom Publikationen 11
Verknüpfung Laborbuch PID mit Publikation 12
4. Fazit PID in der medizinische Forschung PIDs erlauben eine Verknüpfung von Daten und Echtwelt-Entitäten mit Publikationen Verknüpfung von Seiten der Infrastrukturprovider ist heute bereits möglich Bidirektionale Verknüpfungen benötigen Unterstützung und Standardisierung PID-Tagging von Echtwelt-Entitäten ist eine Herausforderung Medizinische Forschung bietet einen hohen Grad an Digitalisierung und Anwendung großes Potential zur Verbesserung von Forschung und Datenqualität Transdisziplinärer Einsatz ist nötig Herausforderungen an Datenschutz und Ethik Publikation 11022/umg-sfb1002-9999 10.1371/journal.pcbi.123456 Verknüpfung epic PID Verknüpfung Publisher Laborbuch 13
5. Fragen / Diskussion Kontakte Ansprechpartner PID-Dienste GWDG Dr. Ulrich Schwardmann ulrich.schwardmann@gwdg.de Dr. Sven Bingert sven.bingert@gwdg.de http://www.pidconsortium.eu Ansprechpartner SFB 1002 Dr. Harald Kusch harald.kusch@med.uni-goettingen.de Universitätsmedizin Göttingen Georg-August-Universität Institut für Medizinische Informatik 14