Interspergierte Repetitive Elemente

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Transkript:

Interspergierte Repetitive Elemente SINEs = short interspersed nuclear elements LINES = long interspersed nuclear elements MIR = mammalian wide interspersed repeats (Säugerspezifisch?) DNA-Transposons Retroelemente Pro-/Retroviren

SINEs, LINEs, Retroelemente, DNA-Transposons

SINEs: Alu-Elemente

SINEs: Alu-Elemente

Alu-Elemente verbreiten sich durch Retroposition

SINEs: Alu-Elemente

SINEs,

LINEs z. B. L1

LINEs z. B. L1

Retrotransposons

Retrotransposons

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Activator Element Ac bei Mais

Das Ac -Element ist durch kurze direct repeats flankiert

DNA-Transposons erzeugen target site duplications

Das AC-Element besitzt eine aktive Transpsosase, Ds Elemente sind nicht-autonom Die P-Elemente von Drosophila erzeugen hybrid dysgenesis

Bei der Exzision entstehen footprints

Bei der Transposition spielen die inverted repeats ein große Rolle

Die P-Elemente von Drosophila erzeugen hybrid dysgenesis

Die P- Elemente von Drosophila:

Die P-Elemente von Drosophila:

Die hybrid dysgenesis Ist die Folge von einem Wechselspiel von aktiver Transposase In Keimzellen von P-freien Tieren und dem Repressor In P-haltigen Tieren

DNA-Transposons beim Menschen

Mechanismus der replikativen Transpososition

Vermehrung und Transposition von repetitiven Elementen

Interspergierte repetitive Elemente können Inversionen und Deletionen erzeugen

Interspergierte repetitive Elemente können Inversionen und Deletionen erzeugen

Die Variabilität der Immunglobuline:

Die Immunglobuline bestehen aus zwei Ketten, L und H, die über Disulfidbrücken verknüpft sind

Die Gene für Immunglobuline bestehen aus verschiedenen Teilen, die in den Chromosomen nicht unmittelbar zusammen liegen Beispiel Kappa L-Kette

Die Variabilität der Antikörper wird durch Rearrangements der Genteile während der Immunzellenreifung erzeugt: die Southern-Analyse zeigt Unterschiede zwischen Embryo und reifen Immunzellen

Beim Rearrangement werden jeweils einzelne der Genteile rekombiniert

Die Rekombination wird vermittelt durch die Rekombinationssequenz am Ende der Genteile

Bei der VDJ- Rekombination werden noch zusätzlich Nukleotide von der terminalen Nukleotidyltransferase Basen eingefügt,

Bei der VDJ- Rekombination entstehen außerdem somatische Mutationen

Molekulares Geschehen bei der V-D-J-Rekombination / RAG 1 + RAG 2 V D J V D J rearrangiertes Gen extrachromosomale, zirkuläre DNA

Es gibt zusätzlich verschiedene Antikörperklassen. Die Klasse wird durch die C-Region bestimmt

Der Antikörper switch erfolgt durch Rekombination zwischen verschiedenen C-Abschnitten in der switch -Region

Durch Verwendung unterschiedlicher Polyadenylierungsstellen kann entweder die lösliche oder die membranständige Form erzeugt werden

Die IG-Genfamilie hat sehr viele verschieden Mitglieder:

Noch komplizierter sind die Gene für die T-Zell-Rezeptor Ketten

Für die Genregulation ist ein Enhancer im ersten Intron entscheidend:

Was hat das alles mit Transposons zu tun? Stammen die Rekombinationsignale von einem Transposon?

Variabilität bei Oberflächenproteinen von Trypanosomen ( VSGs )

ELC = Expression linked copy Genkonversion sorgt für immer neue Varianten Transplicing stellt den Leader bereit

Was ist Transplicing

Repetitive Gene: Immunglobulingenfamilie Gene für rrna Gene für ribosomale Proteine Gene trna Histongene Gene für snrna und viele andere