Das Datenmodell von Edaphobase Ideal und Wirklichkeit. Jörn Vorwald, Andreas Franzke, Stephan Lesch, Sebastian Rick

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1 Das Datenmodell von Edaphobase Ideal und Wirklichkeit Jörn Vorwald, Andreas Franzke, Stephan Lesch, Sebastian Rick

2 Gliederung Es war einmal ein Modell Warum es das heutige Edaphobase-Modell überhaupt gibt Abstraktionen in relationalen Datenbanken das ideale Objekt-Modell das wurde implementiert die raue Wirklichkeit Ausblicke Edaphobase in der Senckenberg-Datenbank- Landschaft Edaphobase 2.0

3 Es war einmal ein Modell die Projekte Genbank-Fusion und Genbank- Informationssystem ( ) Anforderungen: Sammlungsverwaltung Fundortverwaltung Vermehrung Verwaltung und Dokumentation Zusatzinformationen (Bilder, assoziierte Dokumente, ) Leihverkehr

4 Institutions Institution Geography Site Cultivation Location Evaluation ObservationAct Transfer Transaction Publication Publication Management Sample Passport Accession Register Register Picture Picture Taxonomy ScientificName Collection Specimen

5 Institutions Institution Geography Site Cultivation Location Evaluation ObservationAct Transfer Transaction Publication Publication Management Sample Passport Accession Register Register Picture Picture Taxonomy ScientificName Collection Specimen

6 Abstraktionen in relationalen Datenbanken structures_in splitted_into merged_to leads Institution Person employs participates_in structures_in Am Beispiel von Personen/ Institutionen/ Projekten participates_in leads Project/ Experiment is_a (collecting) Expedition

7 structures_in splitted_into merged_to Institution leads employs is_a participates_in Person is_a Ersetzen der Beziehungen zwischen Entities durch is a -Beziehungen bzw. durch rekursive Beziehungen an abstrakter Entity Project/ Experiment is_a (collecting) Expedition

8 structures_in splitted_into Role merged_to leads employs Institution Generierung eines ER-Modells aus abstraktem Beziehungs-Modell participates_in Institution Role to roleid role rolegerman roleremark validitystart validityend validityremark institutionid

9 fileid host path filename datasets size filenameoriginal fileremark unitid unitcode unit unitgerman unitremark Unit isof File Pattern patternid pattern patterngerman patternremark with uses isof objectid objectname objectnamegerman lifestart lifeend Object Abstrakt geplantes Object-Modell des Genbank-Informationssystems (GBIS) has contactid contact citystate zipcode isprivate lastchecked validity contactremark to Role roleid rolename rolenamegerman roleremark Contact storedat has in object_object_id rank validitystart validityend validityremark isof Site Storage Acronym isof AcronymType acronymtypeid acronymtype acronymtypegerman acronymtyperemark ContactType contacttypeid contacttype contacttypegerman contacttyperemark acronymid acronym

10 Es war einmal ein Modell das wurde implementiert: Edaphobase Publication Rohdaten Literatur Publication Sammlung Collection Geography Ort Name Koordinaten Evaluation Fund Taxon Name Systematik Taxonomy Vegetation Wetter/Klima Boden Methoden div. Details Quantität Morphologie Biologie

11 Es gibt ein Ideal ID Entity Attribute Value Boden Bodentyp TYP Boden Bodenart ART Boden Humusform HUMUS 2 Boden Bodentyp TYP 2 Boden Bodenart ART 2 Boden Humusform HUMUS EAV-Konzept als Relation und als ER-Modell im abstrakt geplanten GBIS Object to Role object_object_id rank validitystart validityend value validityremark roleid rolename rolenamegerman roleremark

12 has Description descriptionid name datefrom dateto versionfield und eine Wirklichkeit DescriptionDetail descriptiondetailid value date minvalue maxvalue average averagerefparam standarddeviation text observationfrom observationtill deleted versionfield to obs2descid versionfield has to Observation observationid versionfield firstdescription deleted Unit to uses has unitid name deleted versionfield formula2baseunit formulafrombaseunit pg2baseunit pgfrombaseunit listid name attributeorder comment ishierarchical lastchanged to List has Column columnid minvalue maxvalue name_de name_en regexpression required description Description_en versionfield tablename schemename query pgpreviewquery to Element elementid valuesummary path with to to Attribute attributeid name values valueid value

13 Edaphobase 98 Parameter und kein Ende 28x Aufsammeln x Allgemein 9x Sammeln 8x Extraktion 79x Fundort 4x Allgemein 27x Boden 0x Vegetation 4x Wetter 4x Klima 67x Objekt 5x Allgemein 3x Quantität 0x Präparat 3x Biologie 25x Morphologie 3x Labor 0x Bestimmung 2x Quellspezifika

14 Datenbank Inhalt Informationsfelder Beschreibung Gruppe Feld Anzahl Sammelbeschreibung Allgemeines Sammel-/ Nachweisdatum Aufsammlung Sammler/ Beobachter Sammel-/ Nachweismethode Beprobter Bodenhorizont 6.00 Bestimmungsbeschreibung Bestimmung Bestimmer Bestimmungsmethode Fundortbeschreibung Allgemeines Biotop-Typ Meteorologie - Klima Niederschlag Bodentemperatur Klima 4 Bodenparameter Bodentyp ph Objektdatenbeschreibung Morphologie Körperlänge 288 Biologie Lebensform Quantität Anzahl in Probe Geschlecht 39.05

15 Etwas Praxis! morgen im Workshop

16 Ausblick I EDAPHOBASE in Senckenberg Kommunikation Literatur Repository CMS WiPE Medien Sammlungen Artnamen Taxonomie Institutionen Rohdaten Geo- DB (Ichno) Taxonomie

17 Ausblick I EDAPHOBASE in Senckenberg Kommunikation Literatur Repository CMS WiPE Medien Sammlungen Artnamen Taxonomie Rohdaten Institutionen Geo-DB (Ichno) Taxonomie

18 Ausblick I EDAPHOBASE in Senckenberg Kommunikation Publication Literatur Repository CMS WiPE Picture Medien Collection Sammlungen Transfer Artnamen Taxonomy Taxonomie Rohdaten Institutionen Institutions Geo-DB Geography (Ichno) Taxonomie Evaluation

19 Ausblick II Edaphobase 2.0 Weiterentwicklung des Informationssystems Modularisierung nur mit forcierter Abstraktion? Taxonomie EDIT-Editor Rohdatenverwaltung BExIS Modelle Einbindung externer Daten Klima (DWD) Boden (UBA) Landnutzung (BfN)

20 Dank an FKZ 0LI090A Edaphobase-Team Görlitz