Data Science-Lehre aus Sicht der Medizinischen Informatik Erfahrungen aus 6 Jahren TMF School

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1 Data Science-Lehre aus Sicht der Medizinischen Informatik Erfahrungen aus 6 Jahren TMF School Workshop "Wissenschaft im Digitalen Wandel" Mannheim PD Dr. med. Thomas Ganslandt 1 1 Lehrstuhl für Medizinische Informatik der FAU Erlangen-Nürnberg

2 Aufbruchsstimmung in der Med. Informatik Zunehmende Verfügbarkeit digitaler Versorgungsdaten Hochdimensionale molekular- biologische Daten Förderung von Infrastruktur und Sekundärnutzung Ganslandt T. "Data Science-Lehre aus Sicht der Med. Informatik". Wissenschaft im Digitalen Wandel, Mannheim

3 Sekundärnutzung in der Versorgungsforschung Ganslandt T. "Data Science-Lehre aus Sicht der Med. Informatik". Wissenschaft im Digitalen Wandel, Mannheim

4 Sekundärnutzung in der Versorgungsforschung Hripcsak G et al. Proc Natl Acad Sci USA. 2016;113(27): Ganslandt T. "Data Science-Lehre aus Sicht der Med. Informatik". Wissenschaft im Digitalen Wandel, Mannheim

5 Sekundärnutzung im Forschungslebenszyklus Hypothesengenerierung Ganslandt T. "Data Science-Lehre aus Sicht der Med. Informatik". Wissenschaft im Digitalen Wandel, Mannheim

6 Sekundärnutzung im Forschungslebenszyklus Hypothesengenerierung Kohortenrecherche Stratifizierung Kohortengröße Ganslandt T. "Data Science-Lehre aus Sicht der Med. Informatik". Wissenschaft im Digitalen Wandel, Mannheim

7 Sekundärnutzung im Forschungslebenszyklus Hypothesengenerierung Kohortenrecherche Rekrutierung Rekrutierungskandidat Ganslandt T. "Data Science-Lehre aus Sicht der Med. Informatik". Wissenschaft im Digitalen Wandel, Mannheim

8 Sekundärnutzung im Forschungslebenszyklus Hypothesengenerierung Vorbelegung von ecrfs Annotation & Tracking von Bioproben Kohortenrecherche Rekrutierung Erhebung (Daten, Proben) Ganslandt T. "Data Science-Lehre aus Sicht der Med. Informatik". Wissenschaft im Digitalen Wandel, Mannheim

9 Sekundärnutzung im Forschungslebenszyklus Hypothesengenerierung Statistische Auswertung Kohortenrecherche Visualisierung Auswertung Data Mining Rekrutierung Erhebung (Daten, Proben) Ganslandt T. "Data Science-Lehre aus Sicht der Med. Informatik". Wissenschaft im Digitalen Wandel, Mannheim

10 Sekundärnutzung im Forschungslebenszyklus Hypothesengenerierung Langzeit- Archivierung Kohortenrecherche Good Scientific Practice Nachhaltige Nutzung Auswertung Rekrutierung Erhebung (Daten, Proben) Ganslandt T. "Data Science-Lehre aus Sicht der Med. Informatik". Wissenschaft im Digitalen Wandel, Mannheim

11 Notwendige interdisziplinäre Kompetenzen Erschließung von Rohdaten Datenschutz Semantische Integration ID- & Consent- Management Datenqualität & Provenance Good Clinical & Scientific Practice Bild- & Signalverarbeitung Statistische Auswertung Bioinformatik Visualisierung Verständnis der Daten, Anwendungsfälle und Fragestellungen Ganslandt T. "Data Science-Lehre aus Sicht der Med. Informatik". Wissenschaft im Digitalen Wandel, Mannheim

12 Mangel an Personal & Strukturen Über alle Ebenen hinweg Datenmanagement WissenschaftlerInnen Besetzung von Professuren Aktuell 16 Data Science-Studiengänge* nur 1 mit Schwerpunkt Medizin nur 2 berufsbegleitend nur 1 dualer Studiengang * Quelle: Kaum ÄrztInnen in der MI Fehlende "Datenkultur" Langzeitarchivierung Data Citation Anreize Kaum Angebote für ÄrztInnen 1 Kurs im klin. Abschnitt Zusatzbezeichnung MI "Wettbewerb um die Köpfe" Relevante Hürde für die in 2018 startenden Konsortien des Förderkonzepts MI Ganslandt T. "Data Science-Lehre aus Sicht der Med. Informatik". Wissenschaft im Digitalen Wandel, Mannheim

13 TMF School Einführung 2011 über BMBF-Förderung "MethInfraNet" "[...] Ausschlaggebend war die Analyse, dass es für viele der spezifischen Aspekte der Forschung in Netzwerken - z.b. notwendige biometrische, epidemiologische, bio- und medizininformatische und andere Themen - in den regulären Curricula der Hochschulen keine eigenen Veranstaltungen gibt. Die notwendigen Kenntnisse fehlen also beim wissenschaftlichen Nachwuchs, obwohl das Wissen in den Arbeitsgruppen und Gremien der TMF gebündelt vorhanden ist. [...]" Permanente Nachwuchsförderung im methodischen Bereich in Zusammenarbeit mit der Fachgesellschaft GMDS und dem Berufsverband BVMI jährliche Durchführung, 3-tägig, 25 TeilnehmerInnen ausgewiesene Referenten aus den TMF-Arbeitsgruppen kontinuierliche Evaluation und Aktualisierung des Curriculums Ganslandt T. "Data Science-Lehre aus Sicht der Med. Informatik". Wissenschaft im Digitalen Wandel, Mannheim

14 TMF e.v. Technologie- und Methodenplattform für die vernetzte medizinische Forschung Gründung 1999 als Begleitstruktur zu den Kompetenznetzen in der Medizin 2003 Verstetigung als eingetragener Verein Ziele interdisziplinäre Kooperation in der medizinischen Verbundforschung regelmäßig tagende Arbeitsgruppen Entwicklung & Implementierung von Konzepten zum Datenschutz, IT- und Qualitätsstandards, Biobanking,... Ganslandt T. "Data Science-Lehre aus Sicht der Med. Informatik". Wissenschaft im Digitalen Wandel, Mannheim

15 Setting der TMF School Praktische Übungen in fast allen Themenblöcken Gruppenarbeiten praxisnahe Aufgaben Bereitstellung Infrastruktur (Flipchart, Moderatorenkoffer, Notebook/Beamer) Networking tägliche Neuzusammensetzung der Gruppen großzügig dimensionierte Pausen Anwesenheit der Referenten auch über eigene Blöcke hinaus Auswahl abgelegener Veranstaltungsorte Ganslandt T. "Data Science-Lehre aus Sicht der Med. Informatik". Wissenschaft im Digitalen Wandel, Mannheim

16 Entwicklung des Curriculums IT-Architekturen & Datenmanagement GCP-konformes IT- & Datenmanagement Ethik & Datenschutz in medizinischer Forschung & Versorgung Evening Lecture Ethik in der Medizin Forschungsstrukturen & Förderlandschaft Stakeholder- Dialog Probenmanagement & QS im Biobanking Systembiologie, NGS-Bioinformatik, Management phänotypischer & genomischer Daten Anforderungen an klinische Studien aus AMG, MPG & GCP Registerentwicklung Versorgungs- Forschung clinical Data Warehousing Terminologien, Metadaten & Standards Ganslandt T. "Data Science-Lehre aus Sicht der Med. Informatik". Wissenschaft im Digitalen Wandel, Mannheim

17 Teilnehmerspektrum Ganslandt T. "Data Science-Lehre aus Sicht der Med. Informatik". Wissenschaft im Digitalen Wandel, Mannheim

18 Kosten Während MethInfraNet-Finanzierung ( ) Gesamtkosten ca pro Durchführung, zu je ca. 1/3: Miete für Tagungsräume & Infrastruktur Referentenhonorare Reise- & Übernachtungskosten (inkl. Teilnehmer) davon ca durch Teilnahmegebühren (250 p.p.) refinanziert Nach Auslaufen MethInfraNet (seit 2016) Anpassung der Kostenstruktur Erhöhung der Teilnahmegebühren auf 500 (exkl. Übernachtung) Reduktion von 10 auf 7 Referenten (bei gleichem Umfang) Auswahl preiswerterer Tagungsorte damit Gesamtkosten von ca davon ca durch Teilnahmegebühren refinanziert Ganslandt T. "Data Science-Lehre aus Sicht der Med. Informatik". Wissenschaft im Digitalen Wandel, Mannheim

19 Erfolgreiche Veranstaltung Durchgehend ausgebucht auch nach der Umstellung in 2016 Positive Evaluation durch die Teilnehmer Gesamtbewertung 1,5 (Schulnotenskala) Mehrfachteilnahmen (auch durch "lebendiges" Curriculum) Professionelle Organisation durch die TMF Ganslandt T. "Data Science-Lehre aus Sicht der Med. Informatik". Wissenschaft im Digitalen Wandel, Mannheim

20 Einordnung ins Gesamtbild Extracurriculare "Umleitung" Umgehung der fehlenden universitären Angebote agile Reaktion auf Weiterentwicklung des Themenfelds breites Teilnehmerspektrum Vernetzung über Standorte & Fachgebiete hinweg Dennoch: schmaler Pfad erreicht nur 25 Teilnehmer im Jahr nur 3 Tage für ein breites Themenportfolio Ganslandt T. "Data Science-Lehre aus Sicht der Med. Informatik". Wissenschaft im Digitalen Wandel, Mannheim

21 Notwendiger Ausbau Data Science Nachhaltige universitäre Angebote schaffen auch mit Medizin(-informatischer) Ausrichtung berufsbegleitende und duale Studiengänge Weiterbildungsangebote für ÄrztInnen Informationskompetenz in allen Studiengängen Gezielte extracurriculare Angebote ermöglichen agil & fokussiert Vernetzung Datenkultur verankern Infrastrukturen etablieren Anreize zur Nutzung schaffen Attraktivität steigern und "Köpfe halten" Ganslandt T. "Data Science-Lehre aus Sicht der Med. Informatik". Wissenschaft im Digitalen Wandel, Mannheim

22 Vielen Dank für Ihre Aufmerksamkeit! Ganslandt T. "Data Science-Lehre aus Sicht der Med. Informatik". Wissenschaft im Digitalen Wandel, Mannheim