Akkreditierung von SARAMIS an der TiHo Hannover

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1 Akkreditierung von SARAMIS an der TiHo Hannover Am Institut für Mikrobiologie der Stiftung Tierärztliche Hochschule Hannover (TiHo) wurde in Zusammenarbeit mit der AnagnosTec GmbH im Juli 2006 erstmals in Deutschland ein neuartiges Verfahren zur Identifizierung und Klassifizierung von Mikroorganismen zur Akkreditierung nach ISO/IEC gebracht. SARAMIS identifiziert beliebige Mikroorganismen anhand von MALDI-TOF Massenspektren und reduziert Zeitbedarf sowie Materialkosten im Vergleich zu bisher verfügbaren biochemischen Systemen deutlich. Das SARAMIS- Verfahren beruht auf der Bestimmung mikrobieller Proteine mittels MALDI-TOF Massenspektrometrie. An der TiHo wird ein Voyager DE Pro von Applied Biosystems (ABI) zur Messung der Proteinspektren eingesetzt, die zur Identifizierung mit den validierten Referenzspektren der AnagnosTec SARAMIS- Datenbank (Spectral ARchive And Microbial Identification System) verglichen werden. Die Datenbank enthält zurzeit mehr als Referenzspektren von über 640 Genera und Spezies und wird in Kooperation mit namhaften internationalen Instituten und klinischen Laboratorien ständig erweitert. Das Verfahren zeichnet sich durch einen minimalen Aufwand an Verbrauchsmaterial sowie eine schnelle und einfache Probenvorbereitung aus. Da alle Keimgruppen prinzipiell mit dem gleichen Verfahren bearbeitet werden, muss im Gegensatz zur biochemischen Differenzierung mittels bislang verfügbarer kommerzieller Systeme

2 keine Voreingruppierung (grampositiv/gramnegativ oder Enterobacteriaceae / Non- Enterobacteriaceae u.ä.) mehr erfolgen. Eine Inkubation der Keime mit Substraten wie bei der biochemischen Differenzierung entfällt, sodass der Zeitaufwand für eine einzelne Differenzierung maximal 2 Minuten beträgt, Über einen Zeitraum von 6 Monaten wurden parallel zur täglichen Routine Identifizierungen mittels SARAMIS - MALDI-TOF MS durchgeführt. Die Ergebnisse waren so überzeugend, dass diese neue Technologie für die mikrobiologische Diagnostik in der täglichen Routine an TiHo akkreditiert wurde. Insgesamt wurden 1430 Isolate getestet. Bei der detaillierten Auswertung von 320 Isolaten, von Enterobacteriaceae aus diagnostischem Untersuchungsmaterial mittels kommerzieller biochemischer Verfahren und Massenspektrometrie wies die neue Methode eine Spezifität von 92% und je nach Grenzwert für die Akzeptanz einer Identifizierung eine Sensitivität von 85-90% im Vergleich zu Biochemie auf. Diese Werte erlauben eine Ablösung der biochemischen Differenzierung für diese Keimgruppe durch die MALDI-TOF Massenspektrometrie. Die Akkreditierung erfolgte aufgrund dieser Untersuchung für den gesamten Bereich der Veterinär Diagnostik an der TiHo. Beim Einsatz in der klinischen Humanmikrobiologie weist das System eine Spezifität von 99,8% und eine Sensitivität von 97% auf. Ein weiterer Aspekt des SARAMIS Verfahrens ist, dass die Datenbank direkt vom Anwender für spezielle Keimgruppen erweitert und anschließend für die Differenzierung bislang unbekannter Isolate eingesetzt werden kann. Diese Option ist in der Veterinärmedizin mit vielen spezialisierten Keimgruppen, die für kommerzielle Anbieter von Differenzierungssystemen nicht von Interesse sind, von besonderem Nutzen. Am Institut für Mikrobiologie der TiHo wird dieses moderne Differenzierungsverfahren derzeit mit Brachyspiren erprobt. Als nächsten Schritt wird die Datenbank, die jetzt die meist verbreiteten pathogenen Spezies enthält, um solche erweitert, die selten auftretenden und die regionale Differenzen beschreiben. Institute und Unternehmen, die an einer aktiven Beteiligung an diesem Programm interessiert sind, können sich direkt an AnagnosTec wenden.

3 Über AnagnosTec AnagnosTec wurde im Jahr 1998 als spin-off der Technischen Universität Berlin gegründet, besitzt seine Kernkompetenz in Anwendungsgebieten der MALDI-TOF Massenspektroskopie und bietet Dienstleistungen, Auftragsforschung und Produkte für die Bioanalytik an. Schwerpunkt ist die Entwicklung von innovativen Software- und Datenbanklösungen zur Handhabung und Interpretation der durch die MALDI-TOF Massenspektroskopie erfassten Daten und deren Anwendung in Biotechnologie, der klinischen Diagnostik, der Mikrobiologie und der Lebensmittelindustrie. AnagnosTec's SARAMIS System analysiert zur Identifikation der Mikroorganismen MALDI-TOF Fingerprint- Massenspektren nach einem patentierten Verfahren mit validierten Referenzspektren (SuperSpektren) in der SARAMIS- Datenbank. Das Dendrogram- Modul klassifiziert darüber hinaus unbekannte Isolate in einem taxonomische Baum und derepliziert gleichzeitig mehrfach vorhandene Stämme. Damit beschleunigt es erheblich die Entwicklung neuer Medikamente.

4 Über die Stiftung Tierärztliche Hochschule Hannover (TiHo) Die Stiftung Tierärztliche Hochschule Hannover (TiHo) wurde 1778 als Roßarzney- Schule durch Georg III., gegründet und ist damit eine der ältesten tierärztlichen Bildungsstätten in Europa und die älteste noch bestehende eigenständige in Deutschland. Ein gleichsam historischer wie innovativer Schritt war für die Tierärztliche Hochschule die zum 1. Januar 2003 wirksame Umwandlung in eine Stiftung des öffentlichen Rechts. Damit ist nicht mehr das Land Niedersachsen, sondern eine Stiftung Träger der Hochschule. Das Modell Stiftungshochschule bietet der TiHo neue Gestaltungsspielräume und die Möglichkeit, ein Stiftungsvermögen aufzubauen. Die Hochschule wird diese Chance nutzen, um noch besser die ihr übertragenen Aufgaben in Forschung, Lehre und Dienstleistung zu erfüllen und die Fragestellungen der Gesellschaft aus den Bereichen Tiergesundheit, Tierschutz, Verbraucherschutz, Lebensmittelwissenschaften und biomedizinische Wissenschaften zu beantworten. Im Laufe ihres über 225-jährigen Bestehens hat die TiHo sich zu einer bedeutenden wissenschaftlichen Institution entwickelt, deren fünf Kliniken, 13 Institute, zwei Zentren, zwei Fachgebiete und zwei An-Institute an zwei Standorten in Hannover untergebracht sind. In Ruthe, im Süden Hannovers, und in Bakum bei Vechta betreibt die TiHo zudem zwei Außenstellen, deren Aufgabe neben der Durchführung von Forschungsprojekten in der Ausbildung der Studierenden liegt. Auf dem Lehr- und Forschungsgut in Ruthe lernen Studierende das Sachgebiet moderner Tierproduktion praxisnah kennen. In der Außenstelle für Epidemiologie in Bakum sind die Aktivitäten in Forschung und Lehre darauf gerichtet, tierärztliche Absolventen auf die Bestandsdiagnostik und -medizin sowie die Einbindung in die Lebensmittelkette vorzubereiten

5 Kontaktinformationen AnagnosTec Gesellschaft f. Analytische Biochemie & Diagnostik mbh Herr Dr. Marcel Erhard Im Biotechnologiepark, TGZ II D Luckenwalde m.erhard@anagnostec.de Fon: Fax: Kontakt: Tierärztliche Hochschule Hannover; Institut für Mikrobiologie und Tierseuchen Herr Prof. Dr. Gerald-F. Gerlach Frau Dr. Judith Rohde Bischofsholer Damm 15 D Hannover