Forschungsstelle 2 Dr. Thomas Hackl Juliane Klare Fachbereich Chemie Abteilung für NMR Spektroskopie. Wissenschaftlicher Ansatz I Omics-Kaskade RNA

Ähnliche Dokumente
Fortschritte in der Non Target Analytik

LEBENSMITTEL Ist drin was draufsteht? Informationen zum Studiengang Lebensmittelchemie

LEBENSMITTEL Ist drin was draufsteht? Informationen zum Studiengang Lebensmittelchemie

Food Profiling Identität und Herkunft von Lebensmitteln

LEBENSMITTEL Ist drin was draufsteht? Informationen zum Studiengang Lebensmittelchemie

Bund Mitglieder nach KV-Bezirk 1-25 Familienangehörige nach KV-Bezirk Versicherte nach KV-Bezirk 51-75

DAS METABOLOM: ERNÄHRUNGSSTATUS, METABOLISMUS, METABOLITEN

Flavonoide in Zitronensaft. Stabilität und antioxidative Wirkung

Strukturerklärung mit Flüssigchromatographie Massenspektrometrie (LC-MS)

Anwendung von UNIFI Screening Methode im Bereich Lebensmittel. von Anna Bauer

Einlasssystem oder Voraussetzung für optimale Datenqualität Die Rolle des LC in der LC/MS Analytik

Transcriptomics: Analysis of Microarrays

Elektrophorese. Herbstsemester ETH Zurich Dr. Thomas Schmid Dr. Martin Badertscher,

LEBENSMITTELCHEMIE 2014 Quo vadis?

5 HPLC-Methodenentwicklung zur Isomerentrennung

Trennung und strukturelle Charakterisierung von. mittels GC MS, NMR Analyse und

High Performance Liquid Chromatography

INAUGURAL - DISSERTATION. zur. Erlangung der Doktorwürde. der. Naturwissenschaftlich-Mathematischen Gesamtfakultät. der

3-MCPD in Fischen und Fischölen (gekürzte Fassung) H. Karl 1), S. Merkle 2), J. Kuhlmann 3), J. Fritsche 2)

Seminar HPLC. Seminar HPLC / WS 2003/04. Dr. R. Vasold

Kursinhalte der Weiterbildung Molekulare Biotechnologie (MNr.: 237 / 0411 / 2010)


Im Wein ist Wahrheit... Bestimmung des geographischen Ursprungs mittels Multikomponentenanalyse

Die -omics. Metabolomics. Institut für angewandte Biowissenschaften. Methoden HPLC / GC GC/MS LC/MS

Inhaltsverzeichnis. Vorwort

ANALYTISCHE CHEMIE I Trennmethoden 5. Prozess-Analytik GC-MS, LC-MS WS 2007/2008

Produktionsbasiertes Energiemanagement in der Lebensmittelindustrie

Leistungskatalog. Core Facilities. Juli Seite 1 von 6

Einfache messtechnische Überwachung von Stoffgemischen in der Arbeitsplatzluft

Deskriptives Metadatenprofil für RADAR

Schwermetalle Ph.Eur max. 20 ppm Methode F. Trocknungsverlust Ph.Eur max. 3,0% 80 C; 2 h. Sulfatasche Ph.Eur max.

Pharmazeutische Biologie und Phytochemie. Naturstoffe als Inhibitoren c-myb-abhängiger. Transkriptionsprozesse

Was ist Biophysik? Mögliche Definition: Biophysik ist die Lehre von den physikalischen Gesetzmäßigkeiten, die den lebenden Systemen zu Grunde liegen.

Papier und Pappe verarbeitende Industrie

Holz und Kunststoff verarbeitende Industrie

Chromatographie für Dummies

Top quality is what makes the difference Vergleichende Untersuchungen von Acetonitril in Gradienten-Qualität verschiedener Hersteller.

Vorwort zur 2. Auflage

Protokoll Praktikum für Humanbiologie Studenten

Food Profiling Qualitätssicherung in der Lebensmittelproduktion

Nutrigenomics der Schlüssel zur personalisierten Ernährung?

1 Einleitung 1 2 Ziel der Arbeit 5 3 Allgemeiner theoretischer Teil 11

Analytische Methoden und Verfahren zur Überwachung und Optimierung von Biogasanlagen. Prof. Dr. Thomas Kirner

Papier verarbeitende Industrie

Biotechnologie (Bachelor) Biotechnologie (Master)

DAP Deutsches Akkreditierungssystem Prüfwesen GmbH

Die Kosten des Datenmanagements in wissenschaftsinitiierten klinischen Prüfungen

Inhaltsverzeichnis Seite 1. Einleitung 1 2. Stand des Wissens bei Hanf Biologie des Hanfes Entwicklung des Hanfanbaus

Sedimentation, Elektrophorese

Spielhallenkonzessionen Spielhallenstandorte Geldspielgeräte in Spielhallen

SPEZIALITÄTEN AUS DEM BEREICH KAUTSCHUK UND KUNSTSTOFFANALYSE

Hefewachstum. Peter Bützer

Lehrveranstaltung LV-Leiter ECTS Prüfungspasscodes

Akustische Härtungskontrolle von UV- Farben und -Lacken

Spektroskopie. im IR- und UV/VIS-Bereich. Optische Rotationsdispersion (ORD) und Circulardichroismus (CD)

Quantitative Allergen-Analytik als Voraussetzung für harmonisierte action-level (EU-VITAL)

Der SGU-Leitfaden Ein internetbasiertes Werkzeug des Landes Rheinland-Pfalz zur Einhaltung wesentlicher Umwelt- und Arbeitsschutzbestimmungen

Biopharmazeutika - Optimierung der Überwachung des biopharmazeutischen Herstellprozesses. Dissertation. zur Erlangung des

Biomasse Konditionierung

Terroirauspragung bei der Rebsorte Riesling: Korrelation sensorischer, chemischer, bodenkundlicher und klimatischer Parameter

GURN (GNSS Upper Rhine Graben Network) - Stand und erste Ergebnisse

CORNELIA BANDOW. Wechselwirkungen von Pflanzenschutzmitteln und Umwelteinflüssen auf Bodenorganismen

8 Better Peakshape. min

Der IT Business Case

FOOD PROFILING: Authentizitätsüberprüfung von Edelkakao basierend auf Sequenzunterschieden im Chloroplastengenom

RESOLUTION OIV/OENO 427/2010 KRITERIEN FÜR METHODEN ZUR QUANTIFIZIERUNG VON POTENTIELL ALLERGENEN RÜCKSTÄNDEN EIWEISSHALTIGER SCHÖNUNGSMITTEL IM WEIN

Workflow- basiertes Data Mining in der Bioinformatik

Plasmidisolierung. Mit Plasmiden können Sie Gene in Organismen einschleusen und so deren Eigenschaften verändern.

Kombinierte Verfahren der Bioanalytik inklusive Massenspektrometrie : Grundlagen. Christopher Gerner

Pflanzenbiotechnologie bei BASF Dr. Hans Kast Geschäftsführer BASF Plant Science

Physik für Mediziner im 1. Fachsemester

Teil I. Rekombinante Überexpression von Proteinen

Innovative Technologien in der Wirkungsbezogenen Analytik. Dr. Thorsten Buhrke

HPLC im Spannungsfeld zwischen Auflösung und Probedurchsatz

Wichtige (Säulen-)chromatographische Trennmethoden in der Proteinanalytik: Adsorptions-/Verteilungschromatographie

Messungen und Modellierung für die regionale Beobachtung von Treibhausgasemissionen

Flüssigkeitschromatographie

Die antivirale Therapie der chronischen Hepatitis B: Identifikation neuer Resistenzmutationen und Optimierung der Verlaufskontrolle

Thiole und Disulfide 1

Kursprogramm. Education for Excellence Chromatographie und Massenspektrometrie. Kurse für Einsteiger und Interessenten

Dachflächen-Analyse durch Überfliegung: Inventarisierung, Begrünungspotenzial und weitere Aspekte. Rot ist das neue Grün

LV LV-Leiter ECTS Prüfungspasscodes W - Spektroskopisches Praktikum, 6st., UE Kählig, Hanspeter 6,00 TC-4, OC-5, CHE I-2.

Biochemische Übungen

Die Entwicklung der modernen Analytik und ihre Auswirkung auf das unternehmerische, politische und mediale Umfeld

Hormonell wirkende Umweltchemikalien

Informationsveranstaltung Abbrüche und Rutschungen an den Steilküsten Rügens Möglichkeiten und Grenzen geologischer Gefährdungsabschätzung

Tierische Bestandteile in Futtermitteln Neue Wege in der Analytik

Zur Wurzelverteilung von Leguminosen im Gemengeanbau

Dip-Pen Nanolithography. Ramona Augustin Einführung in die Biophysik SoSe 2013

Screening, Kultivierung und Gewinnung von High-Value Produkten in Algen am Beispiel Eicosapentaensäure

Business & Media Breakfast des Digital Hub Frankfurt Rheinmain e.v. Zukunft der Verkehrskommunikation das Forschungsprojekt sim TD

Die Evangelische Kirche in Deutschland Die Gliedkirchen und ihre Lage in den Bundesländern

BMBF-Verbundprojekt RISK-IDENT

Untersuchung der Alterungskinetik organischer Wärmeträger

Ausdehnung des Nahfeldes nur durch Strukturgrösse limitiert

Seminarkalender. Analysen. Seminare. Lösungen. Techniken. Deutschland Österreich Schweiz. Schulungen. Januar bis Juli Was ist NEU?

Zwischenbericht: Research Project on Sebaceous Adenitis (SA) Dr. Ina Pfeiffer Institute of Veterinary Medicine University of Göttingen

Analytische Chemie (für Biol. / Pharm. Wiss.)

Dokumentation. Bestandsaufnahmen. Vorteile. und. Bestandsdokumentationen mit neuen Techniken

Unterschiedliche Strategien für erfolgreiche, schnelle Chromatographie

Transkript:

SPARGEL- MONITORING M ETABOLOMICS- BASIERTE H ERKUNFTSBESTIMMUNG VON S PARGEL Forschungsstelle 1 Prof. Dr. Markus Fischer Marina Creydt Hamburg School of Food Science Institut für Lebensmittelchemie Uniersität Hamburg Forschungsstelle 2 Dr. Thomas Hackl Juliane Klare Fachbereich Chemie Abteilung für NMR Spektroskopie Uniersität Hamburg Forschungsstelle 3 Prof. Dr. Ing. Olier Kohlbacher Marc Rurik Angewandte Bioinformatik Zentrum für Bioinformatik Eberhard Karls Uniersität Tübingen Wissenschaftlicher Ansatz I Omics-Kaskade exogene Faktoren Standortfaktoren, Prozessierung, anthropogene Interentionen, Metabolite Phänotyp Proteine RNA DNA Genotyp Varianz 1

Metabolomics Anbauweise Düngung Pflanzenschutzmittel Folienmanagement Künstliche Bewässerung Bodenheizung Pflanzen Sorte Alter Mikroorganismen Hefen, Milchsäurebakterien etc. Boden Zusammensetzung Rückstände und Kontaminanten Lagerung/Verarbeitung Schocken Waschen Klimatische Bedingungen Sonneneinstrahlung Niederschläge Metabolomics-Analyse Non-Targeted-Metabolomics Vergleich relatier Metabolitkonzentrationen Hypothesen-freier Ansatz Hochauflösende und glw. teure Analysenmethoden 2

Metabolomics-Analyse Targeted-Metabolomics Absolute Quantifizierung einzelner Metabolite Hypothesen-generierender Ansatz Robuste und kostengünstige Analysenmethoden Signalintensitäten Konzentrationen Workflow und Projektplanung Probenakquisition Probenaufarbeitung (Vermahlung, Trocknung, Extraktion) Entwicklung on non targeted Methoden (LC QToF MS) Anwendung der Methode und Datenakquise on authentischen Proben Multiariate Datenanalyse und Identifizierung on Markersubstanzen Qualitatie und quantitatie Bestimmung des ausgewählten Markerprofils (QqQ MS) Validierung (bzgl. Ernteperioden, Probenanzahl etc.) 3

Probenakquisition Authentisches Referenzmaterial Erfassung on Metadaten (Sorten, Düngung, etc. ) g. g. A. Schrobenhausen Abensberg Franken Bornheim Walbeck Wirtschaftlich releante Anbauregionen Westfalen Niedersachsen Brandenburg Südhessen Pfalz Nordbaden Südbaden Metadaten 4

Synergieeffekte LC-MS I NMR Schnittmenge an identifizierten Molekülen: NMR LC MS Erhöhung der Anzahl insgesamt erfassbarer Metabolite Effiziente Identifizierung durch Kombination LC MS & NMR Zusätzlich: IRMS Analyse als Referenzmethode Z Authentifizierung I Geographischer Ursprung 5

Authentifizierung I Geographischer Ursprung 886 km Authentifizierung I Geographischer Ursprung 6

Authentifizierung I Geographischer Ursprung Authentifizierung I Geographischer Ursprung 7

Probenaufarbeitung Ausgangsmaterial Homogenisierung Gefriertrocknung Flüssig/Flüssig Extraktion Kugelmühle Zentrifugation Extrakt Ultra High Performance Liquid Chromatography Chromatographie Auftrennung eines Stoffgemisches aufgrund on Wechselwirkungen mit einer mobilen und stationären Phase 8

Ultra High Performance Liquid Chromatography Chromatographie Auftrennung eines Stoffgemisches aufgrund on Wechselwirkungen mit einer mobilen und stationären Phase Ultra High Performance Liquid Chromatography Chromatographie Auftrennung eines Stoffgemisches aufgrund on Wechselwirkungen mit einer mobilen und stationären Phase 9

Massenspektrometrie Time-of-Flight-Analysatoren Multiariate Datenanalyse PC 3 0.75 0.50 Loadings Scores Plot Plot P PC 3 Loadings Plot 0.25 0.2 0.00-0.25 0.0-0.50 - -1.5-1.0-0.5 0.0 0.5 1.0 1.5 PC 1-0.2-0.4-0.3-0.2-0.1 0.0 0.1 0.2 0.3 0.4 PC 1 10

Multiariate Datenanalyse Int. x10 5 Intensitätenerteilung Bucket: 3.14min : 496.341m/z 7 6 5 4 0 10 20 30 40 50 60 Analysis Massen Fragmentspektrum Kalkulation on Summenund Strukturformeln Datenbankabgleich Verifizierung mittels NMR 11

Ausblick Finale non-targeted Messungen Identifizierung on Markersubstanzen Entwicklung einer targeted-ms-methode Potenzielle Anwendergruppen Handelslaboratorien Qualitätssicherungslaboratorien in der Industrie Lebensmitteluntersuchungsämter Weitere Forschungsprojekte im Anschluss Anwendung auf weitere Rohstoffe Einzeltest-Schnellmethoden Vielen Dank für Ihre Aufmerksamkeit! 12