Western-Analyse Protein-Elektrophorese ELISA Protein-Chip
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- Katrin Ackermann
- vor 8 Jahren
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Transkript
1 Western-Analyse Protein-Elektrophorese ELISA Protein-Chip
2 DNA-RNA RNA-Protein
3 Die Struktur der DNA
4 Ebene der Proteinstruktur
5 Die Gruppen der Aminosäuren
6 Darstellung Räumliche R Proteinstrukturen (Röntgen ntgen- Krystallographie)
7 Proteinisolierung und Aufreinigung Lyse der Zellen/Gewebe (Detergens, Mechanisch; Hemmung der Proteasen) Aufreinigung (Zentrifugierung, Chromatographie) Probevorbereitung (Hängt von Zwecken ab; Elektrophorese: nativ-denaturierend; Enzymaktivität; t; Proteomik: 2-D-Elektrophorese) 2
8 Antigen-Antik Antikörper Antigen: Fremdes Material, welches Wirbeltiere erkennen und dagegen die B-Zellen des Immunsystems hochspezifische Antikörper bilden. Stärke der Antigene: Proteine> Polysaccharide > Lipide > Nukleinsaure. Antikörper: Proteine, die aus schwere- und leichte Ketten bestehen. Antikörper bilden spezifische Bindung mit dem Antigen. Nach der Immunisierung kann man sie aus dem gamma-globulin-fraktion des Blutserum isolieren.
9 Antikörper-Klassen
10 Kinetik der Antikörperbildung
11 Erzeugung monoklonaler Antikörper
12 Die auf Antigen-Antik Antikörper-Bindung gegründeten Verfahren Direktes Verfahren Primärer Antikörper trägt ein konjugiertes Protein, welches Detektierung ermöglicht Indirektes Verfahren Der sekundäre Antikörper erkennt die schwere Kette des primären Antikörpers und trägt konjugierten Teil (Enzym, fluoreszierende Verbindung) für Detektierung Affinität-Verfahren ( sandwich ) Kovalent-Bindung des primaren Antikörpers an Träger Chromatographie der Antigen-Lösung Bindung Elution des Antigens/Detektierung mit markierten Antikörper
13 Detektierung Antigen-Antik Antikörper Bindung Chromogener Substrat, Farbreaktion Fluorochrom Markierung, Fluoreszenz-Entstehung
14 Die Western-Analyse Während Western-analyse detektieren wir a. Die Grösse des Proteins (kd) b. Die Konzentration des Proteins
15 Poly-Akrylamid Akrylamid-Gelelektrophorese Vorbereitung der Probe: Denaturierung und Reduzierung mit SDS und -Merkapto-Ethanol, 3-5 Min, 90 o C Polyakrylamid-Gelelektrophorese (Sammler-Gel, Trennung-Gel) Elektrischer Transfer der Proteine auf Nitrozellulose (bindet Proteine mit hocher Affinität) A Kontrolle des Transfers (Färbung, Ponceau-red)
16 Polymerisierung von Akrylamid Achtung: Toxisch!!!!
17 Denaturierung von Proteine mit SDS SDS kezelés előtt Töltéssel rendelkező részek Betain-Struktur, Zwitterion Hidrofób részek SDS kezelés után Einheitlich negativgeladenes Protein
18 Vertikale Gelelektrophorese
19 Färbung getrennter Proteine
20 Farbstoff für f r FärbungF
21 Western-Analyse Membran-Blockierung Gesättigung unspezifischer Protein-Bindungsstellen mit Kasein oder BSA Inkubierung mit dem primären ren Antikörper Erkennung spezifischer Bindungsstellen 3x Waschen Inkubierung mit dem sekundären Antikörper z.b. horse-raddish raddish (Meerretich)-Peroxidase Peroxidase-Konjugat (HRP) 3x Waschen Detektierung Alkalische Phosphatase, HRP, ECL (Chemilumineszenz)
22 Elektro-Transfer
23 Kontrolle des Protein-Transfers: Ponceau-Färbung Elektro-Transfer
24 Ergebnis der Western-Analyse Ponceau: Färbt alle Proteine; Antikörper markiert das Zielprotein
25 ECL-Detektierung
26 Substrat für f r Alkalische Phosphatase
27 Bestimmung Lyme-Erkrankung mithilfe WesternAnalyse Zecke - Borrelia burgdorferi - bakterielle Proteine aus Blutserum
28 Beispiel für Lyme-Erkrankung Proben: 1: Molekulargewicht-Marker 2-3: Lyme-positiv-Sera 4-7: Diskriminierungsantikörper 8: Positive Kontrolle
29 Bestimmung Dystrophin-Protein
30 Protein-Chip Ligand-Chip Chip: : Mit spezifischer Antigen- Antikörper rper-bindung; Expressionsmuster- Bestimmung auf Protein-Ebene (DNA-Chip: Hybridisierung) Antikörper rper-bindungen auf Glass-Oberfl Oberfläche Anwendung: Forschung, Diagnose
31 Protein-Chip:Detektierung Antigen- Antikörper Wechselwirkungen
32 Muster von Hefeproteine
33 Chip-Automatisierung
34 ELISA-Verfahren ELISA (Enzyme Linked Immunosorbent Assay, Enzym-gekoppeltes gekoppeltes-immunosorbenz-verfahren) Antigen wird auf festen Träger (Mikrotiter-Platte) gebunden Reaktion mit Serum der Patienten nach Verdünnungen Anwendung: Klinische Labordiagnose Bestimmung von Bakterien, Viren, Hormone, usw.
35 Die in ELISA angewandten Enzyme Enzyme und Substrate Meerettichperoxidase (HRP) Alkalische Phosphatase (AP) (Konjugiert mit dem AK) Substratmoleküle 3,3',5,5'-Tetramethylbenzidine (HRP) 3,5-Dichloro-2-hydroxybenzenesulfonic acid (HRP) 5-Bromo-4-chloro-3-indoxyl phosphate, BCIP (AP) Indoxyl phosphate (AP) AP-BCIP-Farbreaktion
36 ELISA-Reaktion
37 Quantitative Ergebnisse von ELISA Positive Kontrolle Negatíve Kontrolle Patient A Patient B Patient C Test- Kontrolle O ELISA-Platte (Mikrotiterplatte)
38 Semiquantitative Bildanalyse Nach der Gelseparation von Proteine und Nukleinsären kann aus der Densität des Bandes (summierung der grauheitsstufen der Bildpunkte) auf dem grauen Gelbild eine quantitative Information gewonnen werden. Densität auf einem Pixel: Grauheitswert auf einem Pixel. 32 stufiger Durchgang 16 bit Graumatrix 8 bit (256 Farben) Durchgang 255 Wert = schwarz 0 Wert= weiss
39 Analyse der farbigen Aufnahmen geschieht aufgrund der Aufteilung auf RGB Farben Rot Grün Blau
40 Densitometrische Analyse des Gelbildes a) Profil b) Flächenanalyse Ablauf: Wir stellen das Querschnittprofil des Bandes her, mit der Subtraktion der Grunddensität des Gels kann aus der Flächengrösse unter der Kurve eine quantitative Schlussfolgerung gezogen werden. (Intensität/Pixel) Wir markieren ein, von dem Band etwas grösseren Gebiet. Wir bestimmen die Densitätsumme der Pixeln mit Grundintensität, welche aus der Summe der Pixeldensitätwerte des aktuellen Bandes subtraktiert wird
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