Musterstudent, Fredy

Transkript

1 Musterstudent, Fredy

2 Zellwandassoziiertes Protein Teichonsäure Lipoteichonsäure Murein (Peptidoglycan) Cytoplasmamembran Membranprotein O- Polysaccharid Core- Polysaccharid Lipid A repeating unit

3 Membranproteinkomplex für den aktiven Transport (Import oder Export) von Molekülen; besteht aus ATP Bindeprotein (A), Transportkomponenten (BC), und ev. periplasmatisches Bindeprotein. ATP Hydrolyse treibt den Transport. Enzym, welches in der Mureinsynthese die β(1-4) glycosidische Bindung von N-acetylglucosamin an N-Acetylmuraminsäure katalysiert. Multiproteinkomplex in der Zellhülle von manchen Gram-negativen Bakterien, welche Effektorproteine und/oder Toxine von der Bakterienzelle in die Wirtszelle sekretieren. Protoplast, an den noch Teile der Zellwand gebunden sind. Zellwandprotein von Gram-negativen Bakterien, welches das Peptidoglycan mit der äusseren Membran verbindet.

4 1. π x : 6 Verdoppelungen in 3 Std; Generationszeit also 30 min 2. Etwas wissenschaftlicher durch Benutzung der Formeln: t = 180 min; N 0 = 10 4 ; N t = 6.4 x 10 5 n = 3.3(log N t log N 0 ) = ~6 g = t/n = 180/6 = 30 min

5 RNA Polymerase (core enzyme) σ Faktor Transkriptionsstart 35 Region des Promotors 10 Region des Promotors (Pribnow Box)

6 DNA Topoisomerase I ( reverse gyrase ) ist ein Enzym, das die von der DNA Gyrase erzeugten DNA Supercoils entfernt. DnaA ist ein zum Replikationsinitiationskomplex gehörendes Protein. Es bindet an die vier 9bp Repeats im oric Locus, aggregiert, und erlaubt dann die Strangtrennung innerhalb der drei 13bp Repeats für die nachfolgende Bindung von DnaB und DnaC. Autonom replizierende dsdna (meist circulär), welche keine essentiellen housekeeping Gene enthält. Plasmide sind von unterschiedlicher Grösse ( bp) und Kopienzahl (1-100) in der Zelle. Das Operon besteht aus Operator/Promoter-Sequenzen und zwei oder mehr Genen (meist ORFs), die als polycistronische mrna co-transcribiert werden. Die Transcription endet an einer Terminatorsequenz. Temperente Bacteriophagen integrieren ihre DNA in die DNA des Wirtsgenoms und unterwerfen sie der Replikationskontrolle des Bakteriums (lysogener Zustand). Die Umwandlung in den lytischen Zyklus muss induziert werden.

7 Virulenz ist das Potential eines Bakteriums, eine Infektionskrankheit auszulösen. Der Grad der Virulenz wird determiniert durch die Summe aller vorhandenen oder induzierbaren Pathogenitätsfaktoren. Es handelt sich um ein relativ ungeordnetes Netzwerk von Polymeren auf der Aussenseite der Bakterienzelle, bestehend aus negativ geladenen Polysacchariden (z.b. Hyaluronsäure). Die Kapsel vermittelt Schutz gegen Phagozytose und kann die Anheftung an Oberflächen ermöglichen AB-Toxine sind effiziente Virulenzfaktoren, in denen das B Protein an die Plasmamembran der Wirtszelle bindet (oft als Pentamer, B 5 ) und den Durchtritt eines prozessierten A-Fragments in die Wirtszelle erlaubt. In der Zelle wirkt A toxisch, indem es verschiedene essentielle Zielproteine modifiziert (z.b. durch ADP-Ribosylierung). Y.p. ist ein Gram-neg. invasives Enterobacterium; Auslöser von Enterocolitis und Lymphadenitis. Invasion wird vermittelt durch Bindung von Invasin auf der Y.p.-Oberfläche an β- Integrin Rezeptoren der Wirtszelle.

8

9 R R F R R

10 Ammonium/NH 4 + Oxidation, Nitrifikation Nitrat, NO 3 - Nitrat-Atmung, Denitrifikation N 2 nein

11 N 2 Fixierung: 8[H] und 16 ATP für die Bildung von 2 NH 3 + H 2 (also 8ATP pro NH 3 mehr als bei der Nitrat-Assimilation) Nitrat-Assimilation: 9[H] für die Bildung von 1 NH H 2 O (also 5[H] pro NH 3 mehr als bei der N 2 Fixierung) N 2 Fixierung energetisch aufwendiger [Aber: der Unterschied ist überraschend gering, wenn das Nitrat-assimilierende Bakterium aerob wächst und eine effiziente Atmungkette zur Verwertung der 5[H] besitzt.]

12 1. Ubiquitous and essential, i.e., present in all organisms 2. Ancient molecule; possible remnant of an RNA world (peptide bond formation in the ribosome is catalyzed by RNA!) 3. Easy isolation (rrna), or amplification by PCR (rdna) 4. Contains both, conserved and variable nucleotide sequences 5. Appropriate length (~1600 nt) that allows rapid sequencing and the establishment of meaningful phylogenetic trees

13 Cystein, Valin Penicillin G Acylase Penicillin G Aminopenicillansäure --- Semisynthetische Penicilline nach chemischer Acylierung

14 Propionsäuregärung Gasblasen hierfür gibt s leider keine Punkte

15 Guten Erfolg!