Verwendung von Proben aus der Biobank

Transkript

1 Verwendung von Proben aus der Biobank Berthold Huppertz Direktor der Biobank Graz Leiter der OE für Forschungsinfrastruktur Stv. Leiter des Instituts für Zellbiologie, Histologie und Embryologie Medizinische Universität Graz

2 Biobank Graz: Sammelstrategie Heart Diabetes Aging Oncology Liver Lung Research Focus Research Focus Research Focus Research Focus Research Focus Research Focus Kohorte Kohorte Sammlung der pathologischen Routineproben Diversivität von Proben und Daten Pathologien

3 Biobank Graz: Probeneingang Biobank Graz: Probeneingang FFPE Schnitte FFPE Blöcke Flüssigproben Kryoproben Paraffin Lagerung bei Raumtemperatur Flüssigproben Lagerung bei -80 C Kryoproben Lagerung bei -150 C

4 Biobank Graz: Projektanfragen Biobank Graz: interne Projektanfragen Klinik Klinische Studien Pathologie Vorklinik/OFIS Gesamt Biobank Graz: Projektanfragen gesamt

5 Biobank Graz: Probenausgang Cryo Proben Flüssigproben FFPE Proben

6 Anonymisierung und Pseudonymisierung Proben-Anonymisierung: Hoher Zeitaufwand für umfangreiche interne Projekte Problem, wenn die ForscherInnen nachträglich noch zu einzelnen Fällen etwas nachrecherchieren wollen Unklar, welche Proben wann anonymisiert werden müssen Die derzeit intern ausgearbeitete Strategie sieht folgendermaßen aus: laut Datenschutzgesetz 46-1 anonymisiert anonymisiert anonymisiert (eingeschränkte Nutzung)

7 Biobank Graz: Probenanfrage

8 Biobank Graz: Projektantrag Approval Committee Gerger, Armin - Haybäck, Johannes - Leithner, Andreas - Obermayer-Pietsch, Barbara - Speicher, Michael Projektantrag - Einreichen des Formulars bei der Biobank mit Beschreibung des Projektes - Einreichen eines Ethik-Antrages bei der EK mit Bestätigung der Biobank, dass Proben vorliegen - Information der Proben-liefernden Klinik(-en) durch Stellungnahme des/der Biobank-Beauftragten - Beurteilung des Projektantrages durch das AP unter Berücksichtigung der o.g. Stellungnahme - Genehmigung des Ethik-Antrages durch die EK - Genehmigung des Projektantrages durch das AP - Ausgabe der Proben

9 Biobank Graz: Projektantrag Publikationen mit BB-Nennung FoDok Meldung Nennung im Text Bei der Übernahme der Proben wird vom Forscher/von der Forscherin per Unterschrift bestätig, dass bei einer Publikation mit diesen Proben die Biobank genannt wird (Methoden oder Acknowledgements). Leider wird das nur in den seltensten Fällen beachtet!

10 Biobank Graz: Proben für Methodenetablierung Proben für Methodenetablierungen - Gelegentlich kommt es vor, dass Proben benötigt werden, um einen neuen Kit, eine neue Färbemethode o.ä. auszutesten. - Dafür sind wenige Proben ohne jede Daten ausreichend. - Hier bietet die Biobank Graz den Service an, solche Proben unkompliziert zu erhalten. - Kein Projektantrag - Kein Ethikvotum - ABER: Damit auch KEINE Publikation! - Natürlich wird versucht, damit das normale Antragssystem zu unterlaufen. - 5 Anträge für Methodenetablierung ergeben genügend Proben - Daher geben wir diese Proben nur aus, wenn per Unterschrift bestätigt wird, dass die wiss. Daten aus diesen Proben NICHT für eine Publikation verwendet werden.

11 Biobank Graz: Was kostet es? Anfragen für prospektive Sammlungen von Proben - Sammlungsanfrage MUG-intern - Sammlungsanfrage MUG-extern

12 Biobank Graz: Was kostet es? Anfragen für prospektive Sammlungen von Proben - Sammlungsanfrage MUG-intern: 0,00! (bei 15% Veto-Proben) Prospektive Probensammlung Flüssigproben (Blut und Derivate) Kosten/ Einheit Anzahl der Aliquot Anzahl der PatientInnen Lagerdauer (Jahre) Kosten gesamt (100% Veto) 75% Veto 50% Veto 15% Veto Lagerkosten (pro Aliquot) 6, ,66 Asservierungskosten (pro Aliquot) 6,66 6,66 Verbrauchmaterialien (pro Aliquot) 6,66 6,66 Probenaushebung (pro Pat.) 6,66 6,66 Gesamtkosten für x Jahr in Euro 6,66 5,00 3,33 0,00 Kryoproben Kosten/ Einheit Anzahl der Proben Anzahl der PatientInnen Lagerdauer (Jahre) Kosten gesamt (100% Veto) 75% Veto 50% Veto 15% Veto Lagerkosten (pro Probe) 6, ,66 Asservierungskosten (pro Probe) 6,66 6,66 Verbrauchsmaterial (pro Probe) 6,66 6,66 Verbrauchsmaterial (pro PatientIn) 6,66 6,66 Probenaushebung (pro Pat.) 6,66 6,66 Gesamtkosten für x Jahr in Euro 6,66 5,00 3,33 0,00 Zahlen stimmen NICHT mit aktueller Kostenkalkulation der Biobank Graz überein, sondern sind Fantasiewerte!

13 Biobank Graz: Was kostet es? Anfragen für prospektive Sammlungen von Proben - Sammlungsanfrage MUG-extern akad.: 0,00! (bei 15% Veto-Proben) Prospektive Probensammlung Flüssigproben (Blut und Derivate) Kosten/ Einheit Anzahl der Aliquot Anzahl der PatientInnen Lagerdauer (Jahre) Kosten gesamt (100% Veto) 75% Veto 50% Veto 15% Veto Lagerkosten (pro Aliquot) 6, ,66 Asservierungskosten (pro Aliquot) 6,66 6,66 Verbrauchmaterialien (pro Aliquot) 6,66 6,66 Probenaushebung (pro Pat.) 6,66 6,66 Gesamtkosten für x Jahr in Euro 6,66 5,00 3,33 0,00 Kryoproben Kosten/ Einheit Anzahl der Proben Anzahl der PatientInnen Lagerdauer (Jahre) Kosten gesamt (100% Veto) 75% Veto 50% Veto 15% Veto Lagerkosten (pro Probe) 6, ,66 Asservierungskosten (pro Probe) 6,66 6,66 Verbrauchsmaterial (pro Probe) 6,66 6,66 Verbrauchsmaterial (pro PatientIn) 6,66 6,66 Probenaushebung (pro Pat.) 6,66 6,66 Gesamtkosten für x Jahr in Euro 6,66 5,00 3,33 0,00 Zahlen stimmen NICHT mit aktueller Kostenkalkulation der Biobank Graz überein, sondern sind Fantasiewerte!

14 Biobank Graz: Was kostet es? Anfragen für bereits vorliegende Proben und Daten - Probenanfrage MUG-intern - Probenanfrage MUG-extern

15 Biobank Graz: Was kostet es? Anfragen für retrospektive Erhebung von Proben - Probenanfrage MUG-intern - Beispiel Flüssigproben Anzahl Zahlen stimmen NICHT mit aktueller Kostenkalkulation der Biobank Graz überein, sondern sind Fantasiewerte! KALKULATION GESAMTSUMME LEISTUNGEN INTERN PROBENGEWINNUNG Intern Intern Preis/ Einheit Einheit Bezeichnung Gesamtkosten Schnitt 6,66 Paraffin Lagerung (alt) je Originalschnitt p.a. 0,00 Schnitt 6,66 Paraffin Lagerung YLOG je Originalschnitt p.a. 0,00 Block 6,66 Paraffin Lagerung (alt) je Block p.a. 0,00 Block 6,66 Paraffin Lagerung YLOG je Block p.a. 0,00 Stück 6,66 Kryo Lagerung je Stück p.a. 0,00 Stück 6,66 Kryo Asservierung je Stk. 0,00 Stück 6,66 Kryo Verbrauchsmaterialien je Stk. 0,00 Patient 6,66 Kryo Verbrauchsmaterialien ZUSÄTZLICH je Patient 0,00 Stück 6,66 Frisches Gewebe Lagerung je Stk. 0,00 Stück 6,66 Frisches Gewebe Asservierung je Stk. 0,00 Stück 6,66 Frisches Gewebe Verbrauchsmaterialien je Stk. 0,00 Aliquot 6,66 Flüssigproben - Lagerung DOMETIC-Freezer je Aliquot auf Micronic-Platte p.a. 0, Aliquot 6,66 Flüssigproben - Lagerung Liconic je Aliquot p.a. 3256,74 Aliquot 6,66 Flüssigproben - Asservierung-manuelle Pipettierung je Aliquot auf Micronic-Platte 0, Aliquot 6,66 Flüssigproben - Asservierung Hamilton je Aliquot auf Micronic-Platte 3256,74 Flüssigproben - Verbrauchsmaterialien-manuelle Pipettierung je Aliquot auf Micronic- Aliquot 6,66 Platte 0, Aliquot 6,66 Flüssigproben - Verbrauchsmaterialien Hamilton je Aliquot auf Micronic-Platte 3256,74 Aliquot 6,66 Flüssigproben - Lagerung DOMETIC-Freezer je Aliquot in Kryobox p.a. 0,00 Aliquot 6,66 Flüssigproben - Asservierung-manuelle Pipettierung je Aliquot in Kryobox 0,00 Aliquot 6,66 Flüssigproben - Verbrauchsmaterial-manuelle Pipettierung je Aliquot in Kryobox 0,00 1. Probengewinnung Preis Lagerung p. a. 3 Jahre Preis Lagerung Gesamtjahre Preis Asservierung Preis Verbrauchsmaterialien SUMME PROBENGEWINNUNG INKIND MUG BEI KOOPERATIVEN PROJEKTEN 0,00 SUMME PROBENGEWINNUNG NACH ABZUG INKIND MUG

16 Biobank Graz: Was kostet es? Zahlen stimmen NICHT mit aktueller Kostenkalkulation der Biobank Graz überein, sondern sind Fantasiewerte! PROBENAUSGABE & DATENGEWINNUNG UND -AUSGABE Anfragen für retrospektive Erhebung von Proben - Probenanfrage MUG-intern - Beispiel Flüssigproben Intern Intern Anzahl Einheit Preis/Einheit Bezeichnung Gesamtkosten 6 Stunde 6,66 Machbarkeitsanfrage Probe - Standard je Stunde 39,96 Stunde 6,66 Machbarkeitsanfrage Probe - Sonderfälle IMI (ZUSÄTZLICH zu Standard) je Stunde 0,00 0,5 Stunde 6,66 Vidierung Machbarkeitsanfrage Probe je Stunde 3,33 Patient 6,66 Probenaushebung PARAFFIN je Patient 0, Patient 6,66 Probenaushebung FLÜSSIG-/KRYOPROBEN je Patient 11085,58 Patient 6,66 Nachbefundung PARAFFIN-/KRYOPROBEN Pathologe je Patient 0, Patient 6,66 Erhebung Minimaldatensatz je Patient 1085, Patient 6,66 Vidierung Minimaldatensatz je Patient 1085, Patient 6,66 Erhebung Standarddatensatz je Patient 1085, Patient 6,66 Vidierung Standarddatensatz je Patient 1085,58 Stunde 6,66 Erhebung erweiterter Datensatz je Stunde 0,00 Stunde 6,66 Vidierung erweiterter Datensatz je Stunde 0,00 2 Stunde 6,66 Pseudonymisierung je Stunde 13,32 1 Stunde 6,66 Verknüpfung der Proben und Daten je Stunde 6,66 Schnitt 6,66 Herstellung - Leerschnitte je Schnitt 0,00 Span 6,66 Herstellung - Paraffinspäne je Span 0,00 Span 6,66 Herstellung - Kryospäne je Span 0,00 Core 6,66 Herstellung - TMA je Core 0,00 Stunde 6,66 zusätzliche Arbeitszeit MTF je Stunde 0,00 Stunde 6,66 zusätzliche Arbeitszeit BMA je Stunde 0,00 Stunde 6,66 Vorbereitung der Proben für Versand je Stunde 0,00 Pauschale 6,66 Pauschale - Bearbeitungsgebühr der Ethikkommission 0,00 Pauschale 6,66 Pauschale - Aufbereiten Ethikantrag durch BB-Personal 0,00 2. Datengewinnung und Probenausgabe Preis Projektentwicklung Preis Datensätze Preis Asservierung 0,00 Preis Ethikpauschale 0,00 SUMME PROBENAUSGABE & DATENGEWINNUNG UND -AUSGABE INKIND MUG BEI KOOPERATIVEN PROJEKTEN 0,00 SUMME NACH ABZUG INKIND MUG

17 Biobank Graz: Was kostet es? Anfragen für retrospektive Erhebung von Proben - Probenanfrage MUG-intern - Beispiel Flüssigproben Zahlen stimmen NICHT mit aktueller Kostenkalkulation der Biobank Graz überein, sondern sind Fantasiewerte! 3. Gesamtkosten für 489 Flüssigproben von 163 PatientInnen mit Standard-Daten Investigator-initiated Study ohne Finanzierung Drittelmittel-gefördertes Projekt mit Finanzierung Beschreibung Preis Probengewinnung 2.000,00 Projektentwicklung und Probenaufbereitung 2.000,00 Datengewinnung ,00 Ethikpauschale 0,00 GESAMTSUMME ,00 Beschreibung Preis Probengewinnung 2.000,00 Projektentwicklung und Probenaufbereitung 2.000,00 Datengewinnung ,00 Ethikpauschale 0,00 GESAMTSUMME ,00 In-Kind Leistung Biobank Graz ,00 GESAMTSUMME ABZÜGLICH IN-KIND BB GRAZ 0,00 In-Kind Leistung Biobank Graz 0,00 GESAMTSUMME ABZÜGLICH IN-KIND BB GRAZ ,00

18 Biobank Graz: Was kostet es? Anfragen für retrospektive Erhebung von Proben - Probenanfrage MUG-extern akad - Beispiel FFPE-Proben Zahlen stimmen NICHT mit aktueller Kostenkalkulation der Biobank Graz überein, sondern sind Fantasiewerte! KALKULATION GESAMTSUMME LEISTUNGEN EXTERN PROBENGEWINNUNG Extern Extern Anzahl Einheit Preis/ Einheit Bezeichnung Gesamtkosten Schnitt 6,66 Paraffin Lagerung (alt) je Originalschnitt p.a. 0, Schnitt 6,66 Paraffin Lagerung YLOG je Originalschnitt p.a. 6660,00 Block 6,66 Paraffin Lagerung (alt) je Block p.a. 0, Block 6,66 Paraffin Lagerung YLOG je Block p.a. 666,00 Stück 6,66 Kryo Lagerung je Stück p.a. 0,00 Stück 6,66 Kryo Asservierung je Stk. 0,00 Stück 6,66 Kryo Verbrauchsmaterialien je Stk. 0,00 Patient 6,66 Kryo Verbrauchsmaterialien ZUSÄTZLICH je Patient 0,00 Stück 6,66 Frisches Gewebe Lagerung je Stk. 0,00 Stück 6,66 Frisches Gewebe Asservierung je Stk. 0,00 Stück 6,66 Frisches Gewebe Verbrauchsmaterialien je Stk. 0,00 Aliquot 6,66 Flüssigproben - Lagerung DOMETIC-Freezer je Aliquot auf Micronic-Platte p.a. 0,00 Aliquot 6,66 Flüssigproben - Lagerung Liconic je Aliquot p.a. 0,00 Aliquot 6,66 Flüssigproben - Asservierung-manuelle Pipettierung je Aliquot auf Micronic-Platte 0,00 Aliquot 6,66 Flüssigproben - Asservierung Hamilton je Aliquot auf Micronic-Platte 0,00 Flüssigproben - Verbrauchsmaterialien-manuelle Pipettierung je Aliquot auf Micronic- Aliquot 6,66 Platte 0,00 Aliquot 6,66 Flüssigproben - Verbrauchsmaterialien Hamilton je Aliquot auf Micronic-Platte 0,00 Aliquot 6,66 Flüssigproben - Lagerung DOMETIC-Freezer je Aliquot in Kryobox p.a. 0,00 Aliquot 6,66 Flüssigproben - Asservierung-manuelle Pipettierung je Aliquot in Kryobox 0,00 Aliquot 6,66 Flüssigproben - Verbrauchsmaterial-manuelle Pipettierung je Aliquot in Kryobox 0,00 1. Probengewinnung Preis Lagerung p. a. 1 Jahre Preis Lagerung Gesamtjahre Preis Asservierung 0,00 Preis Verbrauchsmaterialien 0,00 SUMME PROBENGEWINNUNG INKIND MUG BEI KOOPERATIVEN PROJEKTEN 0,00 SUMME NACH ABZUG INKIND MUG

19 Biobank Graz: Was kostet es? Anfragen für retrospektive Erhebung von Proben - Probenanfrage MUG-extern akad - Beispiel FFPE-Proben Zahlen stimmen NICHT mit aktueller Kostenkalkulation der Biobank Graz überein, sondern sind Fantasiewerte! PROBENAUSGABE & DATENGEWINNUNG UND -AUSGABE Extern Extern Anzahl Einheit Preis/ Einheit Bezeichnung Gesamtkosten 4 Stunde 6,66 Machbarkeitsanfrage Probe - Standard je Stunde 26,64 Stunde 6,66 Machbarkeitsanfrage Probe - Sonderfälle IMI (ZUSÄTZLICH zu Standard) je Stunde 0,00 1 Stunde 6,66 Vidierung Machbarkeitsanfrage Probe je Stunde 6, Patient 6,66 Probenaushebung PARAFFIN je Patient 666,00 Patient 6,66 Probenaushebung FLÜSSIG-/KRYOPROBEN je Patient 0, Patient 6,66 Nachbefundung PARAFFIN-/KRYOPROBEN Pathologe je Patient 666, Patient 6,66 Erhebung Minimaldatensatz je Patient 666, Patient 6,66 Vidierung Minimaldatensatz je Patient 666, Patient 6,66 Erhebung Standarddatensatz je Patient 666, Patient 6,66 Vidierung Standarddatensatz je Patient 666, Stunde 6,66 Erhebung erweiterter Datensatz je Stunde 666, Stunde 6,66 Vidierung erweiterter Datensatz je Stunde 666,00 2 Stunde 6,66 Pseudonymisierung je Stunde 13,32 2 Stunde 6,66 Verknüpfung der Proben und Daten je Stunde 13, Schnitt 6,66 Herstellung -Leerschnitte je Schnitt 6660,00 Span 6,66 Herstellung - Paraffinspäne je Span 0,00 Span 6,66 Herstellung - Kryospäne je Span 0,00 Core 6,66 Herstellung - TMA je Core 0,00 Stunde 6,66 zusätzliche Arbeitszeit MTF je Stunde 0,00 Stunde 6,66 zusätzliche Arbeitszeit BMA je Stunde 0,00 2 Stunde 6,66 Vorbereitung der Proben für Versand je Stunde 13,32 2. Datengewinnung und Probenausgabe Pauschale 6,66 Pauschale - Bearbeitungsgebühr der Ethikkommission 0,00 Pauschale 6,66 Pauschale - Aufbereiten Ethikantrag durch BB-Personal 0,00 Preis Projektentwicklung Preis Datensätze Preis Asservierung Preis Ethikpauschale 0,00 SUMME PROBEN- UND DATENAUSGABE INKIND MUG BEI KOOPERATIVEN PROJEKTEN 0,00 Medizinische Universität Graz Biobank SUMME Graz NACH berthold.huppertz@medunigraz.at ABZUG INKIND MUG

20 Biobank Graz: Was kostet es? Anfragen für retrospektive Erhebung von Proben - Probenanfrage MUG-extern - Beispiel FFPE-Proben Zahlen stimmen NICHT mit aktueller Kostenkalkulation der Biobank Graz überein, sondern sind Fantasiewerte! 3. Gesamtkosten für 1000 Paraffinschnitte von 100 PatientInnen mit extensiven Daten Externes akademisches Projekt ohne MUG-Kooperation Externes akademisches Projekt mit MUG-Kooperation Beschreibung Preis Probengewinnung 1.000,00 Projektentwicklung und Probenaufbereitung ,00 Datengewinnung ,00 Ethikpauschale 0,00 GESAMTSUMME ,00 In-Kind Leistung MUG-Kooperationspartner 0,00 GESAMTSUMME ABZÜGLICH IN-KIND MUG ,00 Beschreibung Preis Probengewinnung 1.000,00 Projektentwicklung und Probenaufbereitung ,00 Datengewinnung ,00 Ethikpauschale 0,00 GESAMTSUMME ,00 In-Kind Leistung MUG-Kooperationspartner ,00 GESAMTSUMME ABZÜGLICH IN-KIND MUG ,00

21 Danke für Ihre Aufmerksamkeit!