Der neue cobas T BRAF V600 Mutation Test (CE-IVD) Was wäre, wenn Sie ihr die richtige Antwort früher geben könnten?

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Lennart Meinhardt
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1 Der neue cobas T BRAF V600 Mutation Test (CE-IVD) Was wäre, wenn Sie ihr die richtige Antwort früher geben könnten?

2 cobas T BRAF V600 Mutation Test Diagnostik für die personalisierte Hautkrebstherapie Unkontrollierte Zellproliferation bei Patienten mit Mutation im BRAF Onkogen Therapieoptionen Das BRAF Protein spielt bei der Kontrolle des Zellwachstums eine entscheidende Rolle. Es ist Teil der Signalkaskade des EGFR Rezeptors und kann durch eine Mutation im BRAF Onkogen dauerhaft aktiviert werden. Die V600E Mutation wurde als häufigste BRAF Mutation identifiziert und wird mit einer schlechten Prognose des Tumors assoziiert. Eine Therapie mit BRAF-Inhibitoren (z.b. Vemurafenib) kann einem unkontrollierten Zellwachstum entgegenwirken. Wachstumsfaktor Wachstumsfaktor EGFR EGFR EGFR EGFR Zellmembran Zellmembran RAS RAS BRAF Wildtyp Vemurafenib BRAF V600 MEK MEK ERK ERK normale Zellproliferation gehemmte Zellproliferation Im gesunden Zustand wird die Signalkaskade, die zur Zellproliferation führt, durch Wachstumsfaktoren stimuliert. Liegt eine Mutation im BRAF Onkogen vor, führt dies zu einer unkontrollierten Zellproliferation, die durch BRAF- Inhibitoren gehemmt werden kann. Der cobas T BRAF V600 Mutation Test identifiziert unter anderem die häufigste BRAF Mutation V600E und unterstützt somit Ärzte in der Auswahl einer geeigneten Therapie.

Die V600E Mutation wurde als häufigste BRAF Mutation identifiziert und wird mit einer schlechten Prognose des Tumors assoziiert. Eine Therapie mit BRAF-Inhibi

3 cobas T BRAF V600 Mutation Test Ihre Vorteile auf einen Blick Der auf Real-Time PCR Technologie basierende CE-IVD zertifizierte cobas T BRAF V600 Mutation Test identifiziert den BRAF Mutationstatus bei Patienten mit malignem Melanom, die von einer Therapie mit BRAF-Inhibitoren (z.b. Vemurafenib) profitieren können. Ihre Vorteile Schnell Geeignete Therapieentscheidung in sehr kurzer Zeit möglich Mutationsstatus 8 Stunden nach Vorliegen des FFPE-Gewebeblocks bekannt Genau Hohe Sensitivität und Spezifität führen zu einer zuverlässigen Therapieprädiktion Zuverlässig Hohe Standardisierung ermöglicht reproduzierbare Ergebnisse laborunabhängig Automatisiert Automatisierte Ergebnisinterpretation und Reporting sparen Zeit Breite Mutationsabdeckung 1 Identifiziert hohen Prozentsatz aller klinisch relevanten BRAF Mutationen Klinisch validiert Der cobast BRAF V600 Mutation Test ist der derzeitig einzig klinisch validierte Test 1 Häufigkeit der Mutationsbefunde im malignen Melanom Mutationsbefunde [%]* % 5,4 % 1,1 % 0,5 % V600E V600K V600R V600E2 0,2 % V600D 5 % andere Die durch den cobast BRAF V600 Mutation Test identifizierte V600E Mutation ist mit 87 % die häufigste klinisch relevante Mutation im BRAF Gen. Eine Erkennung der Mutationen V600K und D ist ebenfalls möglich. * Häufigkeit der Mutationen im BRAF Onkogen nach COSMIC V.52 (Catalogue of somatic mutation in cancer)

Ihre Vorteile Schnell Geeignete Therapieentscheidung in sehr kurzer Zeit möglich Mutationsstatus 8 Stunden nach Vorliegen des FFPE-Gewebeblocks bekannt Genau Hohe Sensitivität und Spezifität führen

4 cobas T BRAF V600 Mutation Test Schneller Workflow und hohe Wirtschaftlichkeit Mit dem cobas T BRAF V600 Mutation Test liegen die Ergebnisse über den BRAF Mutationsstatus spätestens 8 Stunden nach Vorliegen des FFPE-Gewebeblocks vor. Zusammen mit der cobas T DNA Probenvorbereitung aus FFPE Gewebe und dem cobas T BRAF V600 Mutation Test wird ein ganzheitlicher CE-IVD Workflow erreicht, der eine zuverlässige Mutationsdiagnostik gewährleistet. Workflow (1) H&E- Färbung und Bestimmung Tumorgehalt FFPE Tumorblock/ Gewebeschnitte (2) PCR Makrodissektion bei < 50 % Tumorgehalt DNA-Isolierung DNA Quantifizierung cobas BRAF V600 Ergebnisbericht BRAF Testergebnisse Standardisierter Report Automatisierte Analyse cobas z 480 Analyzer PCR Vorbereitung Der Workflow des cobas T BRAF V600 Mutation Tests auf dem cobas z 480 Analyzer zeichnet sich durch eine sehr geringe Hands-on-time und hohe Automatisierung aus. Damit ermöglicht er Ihnen eine sehr hohe Flexibilität und Effizienz im Laboralltag. Prozessdauer und Hands-on-time Manuelle Probenvorbereitung PCR Vorbereitung Ergebnisinterpretation PCR Lauf Prozessdauer 3 h < 1,5 h 5' Hands-on-time 20' 15' 1' 1' 8:00 h 9:00 h 10:00 h 11:00 h 12:00 h 13:00 h 14:00 h 15:00 h 16:00 h 17:00 h 18:00 h Uhrzeit

Zusammen mit der cobas T DNA Probenvorbereitung aus FFPE Gewebe und dem cobas T BRAF V600 Mutation Test wird ein ganzheitlicher CE-IVD Workflow erreicht, der eine zuverlässige Mutationsdiagnostik

5 cobas T BRAF V600 Mutation Test Sie werden Sanger Sequenzierung mit anderen Augen sehen Klinische Studien bestätigen: Der cobas T BRAF V600 Mutation Test bietet eine deutlich erhöhte Sensitivität im 1, 2, 3 Vergleich zur Sanger Sequenzierung Ihre Vorteile* cobas T BRAF V600 Mutation Test Sanger Sequenzierung CE-IVD Zertifizierung Nachweisgrenze mutierter DNA im Hintergrund von Wildtyp DNA 5 % 20 % Zeit bis zum Ergebnis 8 Stunden 3 Tage AmpErase T Uracil-N-Glycosylase (UNG) Enzym Häufigkeit invalider Analysen 0,2 % 9,2 % Nachweisgrenze mutierter DNA [%] im Hintergrund von Wildtyp DNA cobas T BRAF V600 Sanger Sequenzierung Mutation Test Der cobast BRAF V600 Mutation Test weist eine bis zu 4-fach niedrigere Nachweisgrenze für mutierte DNA im Hintergrund von Wildtyp-DNA im Vergleich zur Sanger Sequenzierung auf. Kontaminationsschutz Bestätigte Mutationen 1 % 99 % cobas T BRAF V600 Mutation Test 4 % 96 % Sanger Sequenzierung Mutationen bestätigt* falsch negative/positive Ergebnisse * Mittels Next Generation Sequencing (454-Technologie) Package Insert cobast BRAF V600 Mutation Test Das Enzym AmpErase T dient dem Schutz vor Kontaminationen durch PCR-Amplifikate aus vorhergehenden PCR Reaktionen, indem spezifisch Desoxiuracilhaltige Amplifikate abgebaut werden. Die Verwendung der Sanger Sequenzierung kann im Vergleich zum cobas T BRAF V600 Mutation Test entweder zu einer unnötig verzögerten Diagnostik von BRAF-Mutationen führen oder Patienten fälschlicherweise einer Therapie mit Vemurafenib vorenthalten. 1) Halait et al. The analytical performance of a real-time PCR-based assay for the BRAF V600E mutation used as the companion diagnostic test for the novel BRAF inhibitor vemurafenib (RG7204/PLX4032) in metastatic melanoma. Abstract#2212 (Presented on April 4 th, 2011 at the American Association of Cancer Research 2011 conference). 2) Bloom et al. Molecular testing for BRAF V600 mutations in the BRIM-2 trial of the BRAF inhibitor vemurafenib (RG7204 PLX4032) in metastatic melanoma. Abstract #10523 (Presented on Saturday June 4 th at the American Society of ClinicalOncology 2011 conference). 3) Anderson et al. Molecular testing for BRAF V600E mutations in clinical trials of the BRAF inhibitor vemurafenib (RG7204; PLX4032) in metastatic melanoma: clinical validation studies of the analytic performance of a companion diagnostic assay. Abstract#1403 (Presented in September 2011 at the European Society for Medical Oncology (ESMO) cancer congress).

% Zeit bis zum Ergebnis 8 Stunden 3 Tage AmpErase T Uracil-N-Glycosylase (UNG) Enzym Häufigkeit invalider Analysen 0,2 % 9,2 % Nachweisgrenze mutierter DNA [%] im Hintergrund von Wildtyp DNA 20 15 10

6 cobas z 480 Analyzer Das schnelle Ergebnis zählt Mit dem cobas z 480 Analyzer können die neuen prädiktiven cobas T Biomarker BRAF, KRAS und EGFR analysiert werden. Der gesamte Abarbeitungsprozess inklusive der individuell entwickelten cobas T Probenvorbereitung, dem Test sowie dem Analysengerät ist CE-IVD zertifiziert. Ihre Vorteile Schnelligkeit Keine Kalibrierung, keine Wartung: Einschalten, Test starten, Ergebnis innerhalb weniger Stunden erhalten Einfach in der Anwendung Mikrotiterplatten-Format: Durchsatz bis zu 96 Proben/Lauf möglich Zuverlässigkeit CE-IVD Zertifizierung: ganzheitliche Kontrolle des gesamten Workflows stellt zuverlässige Ergebnisse sicher Patentierte Optik und Therma Base Technologie: homogene Reaktionsbedingungen liefern reproduzierbare Ergebnisse auf der ganzen Mikrotiterplatte Fexibilität User defined Workflow (UDF): ermöglicht die Anwendung vielfältiger PCR-Formate für eigene Homebrew -Diagnostik oder medizinische Forschung cobas z 480 Analyzer Anregung Emmission dunkel 510/20 465/25 580/20 498/40 610/20 540/10 645/20 610/20 670/20 680/ LP Die Bandbreiten des cobas z 480 Filters ermöglichen geringere Fluoreszenzhöhen und weniger Crosstalk. Daher ist mit einer besseren Auflösung der Fluoreszenzsignale zu rechnen.

Ihre Vorteile Schnelligkeit Keine Kalibrierung, keine Wartung: Einschalten, Test starten, Ergebnis innerhalb weniger Stunden erhalten Einfach in der Anwendung Mikrotiterplatten-Format: Durchsatz bis

7 cobas T DNA Sample Preparation Kit (CE-IVD) Schaffen Sie die Basis für zuverlässige Ergebnisse Das cobas T DNA Sample Preparation Kit bietet eine effiziente Isolation genomischer DNA aus FFPE Gewebe und ist für die Verwendung mit den cobas T Biomarker Kits validiert. Ihre Vorteile Hohe DNA Ausbeuten Bis zu 3,4 µg DNA aus einem 5 µm FFPE Gewebsschnitt extrahierbar Hohe Qualität Geringe RNA Co-Aufreinigung ermöglicht hohe PCR-Performance Unempfindlich gegenüber hohen Melaninkonzentrationen Kurze Bearbeitungsdauer In nur 3 Stunden das DNA-Extrakt in Händen halten Ein Kit enthält alle Reagenzien für bis zu 24 DNA Isolationen Workflow 30 Minuten 2 Stunden 20 Minuten 10 Minuten cobas DNA sample Preparation Kit Entparaffinierung Zellaufschluss und DNA Extraktion Isolierte DNA DNA Quantifizierung 0 h 1 h 2 h 3 h Stunden

Ihre Vorteile Hohe DNA Ausbeuten Bis zu 3,4 µg DNA aus einem 5 µm FFPE Gewebsschnitt extrahierbar Hohe Qualität Geringe RNA Co-Aufreinigung ermöglicht hohe PCR-Performance Unempfindlich gegenüber

8 cobas T Biomarker Tests Bestellinformationen Produkt Produktinformation Bestellnummer cobas z 480 Analyzer 1 System cobas T DNA Sample Preparation Kit 24 DNA Isolationen cobas T BRAF V600 Mutation Test 24 Befunde/Kit* cobas T KRAS Mutation Test 24 Befunde/Kit* cobas T EGFR Mutation Test 24 Befunde/Kit* cobas T 4800 microwell plate and sealing film 50 Stück * Ausgehend von einer Serienlänge von 3 Patienten inklusive Kontrollen Ihr Kontakt zu Roche Auftragsannahme: Montag Freitag 8:00 18:00 Uhr Telefon: (0800) (gebührenfrei) Fax: (0621) Kundendienst und Beratung: Montag Sonntag 8:00 18:00 Uhr Gerätebedienung - Telefon: (0621) (gebührenfrei) Reagenzien und Technik - Fax: (0621) mannheim.kundenservice-pcr@roche.com Roche Diagnostics Deutschland GmbH Sandhofer Straße Mannheim COBAS, COBAS Z und LIFE NEEDS ANSWERS sind Marken von Roche Roche Diagnostics. Alle Rechte vorbehalten ➀

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