Produktinformation. Update Online Visualisierung für SAMI EX und Betrieb ohne Biomek

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1 ANALYTICAL INSTRUMENT GROUP INTERNATIONAL SERVICES Produktinformation Update Online Visualisierung für SAMI EX und Betrieb ohne Biomek Version: 1.0 Analytical Instrument GmbH Friedrich- Barnewitz- Str Rostock Ansprechpartner für das Produkt: Dr.-Ing. Steffen Junginger Steffen.Junginger@aigis.de Tel.:

2 Ein Update der Automationsanlage auf SAMI EX erfordert nur Aktualisierungen in den SILAS Modulen der Online Visualisierung. Diese werden auf SILAS 4 aktualisiert. Für einen flexibleren Betrieb mit unterschiedlichen Liquid Handlern erfolgt jetzt die Zuordnung der Plattenbarcodes sowie die Zuordnung Quell und Zielplatte in einem separaten SAMI EX Node. Im Zuge eines Updates auf SAMI EX erfolgen keine Modifikationen an der Datenbankstruktur der Online Visualisierung. Im Folgenden wird nur auf die neuen features der Online Visualisierung für SAMI EX eingegangen und nicht auf bereits bestehende Funktionalität.

3 SAMI Modul Transfer Das Transfer(Assign) SAMI Modul verknüpft Barcodes zwischen Mikrotiterplatten und setzt die entsprechenden Flags für Assay Plate und Measurement Plate. Abbildung 1 zeigt die Anwendung innerhalb einer SAMI Methode. Abbildung 1: Transfer(Assign) in SAMI Methode Pfad Dest wird für die Ziel - Mikrotiterplatte verwendet. Pfad Src1 bis Src4 enthält die Quell Mikrotiterplatten. Die Barcodes dieser Platten werden den entsprechenden Quadranten der Ziel Mikrotiterplatte zugewiesen. (Src1 -> Quadrant1 usw.) Im Konfigurationsdialog für Transfer(Assign) muss der entsprechende Ziel Plattentyp ausgewählt werden. Abbildung 2: Transfer(Assign) Konfigurationsdialog Das Transfer(Assign) Modul ersetzt den Biomek Step zum Verknüpfen von Barcodes und Zielquadranten für die Online Visualisierung.

4 SAMI Modul MaskAssign Das SAMI Modul MaskAssign verknüpft Wells einer Mikrotiterplatte mit verschiedenen Bedeutungen, die für die späteren Berechnungen und Visualisierungen verwendet werden. Man kann aus einer Liste existierender Masken diejenige auswählen, die den entsprechenden Mikrotiterplatten auf dem zugehörigen SAMI Pfad zugeordnet werden soll. In SAMI 4 wird die Maske nur der untersten Labware in einem Stack zugeordnet, es sei denn, die Checkbox Assign to whole stack wurde aktiviert. Abbildung 3: MaskAssign Konfigurationsdialog

5 SAMI Modul OnlineVis Das SAMI Modul OnlineVis sammelt die während eines SAMI Runs entstehenden Daten und schreibt diese in die angeschlossene Datenbank. Dabei werden die empfangenen Daten entsprechend der Auswahl im Konfigurationsdialog (Abbildung 4) gedeutet. Der Methodeneintrag in der Datenbank setzt sich in SAMI 4 aus Projektnamen und Methodennamen zusammen. Version 3 speichert zusätzliche Informationen in der Datenbank falls die Tabellen 'fehler', 'fehler_platten', 'lims_experimente', 'lims_zaehl_richtung' vorhanden sind. Abbildung 4: OnlineVis Konfigurationsdialog Beim Start einer SAMI Methode mit aktivierten OnlineVis Modul wird durch dieses die Experimentnummer abgefragt. Als Gedankenstütze wird die Liste der zuletzt verwendeten Nummern und ihr Verwendungsdatum angezeigt.

6 Abbildung 5: Eingabedialog für die Experimentnummer bei Methodenstart Stand: Änderungen vorbehalten