Jahreshauptversammlung 2013 Bericht aus Kiel Wolfram Klapper & Reiner Siebert
Häufigkeit von Non-Hodgkin-Lymphomen KINDERKREBSINITIATIVE BUCHHOLZ Holm-Seppensen (KKI) Burkhardt et al., 2005 (n=2084)
Wo kann molekulare Diagnostik bei Lymphomen eingesetzt werden? DLBCL Burkitt Wenn sich zwei Erkrankungen sehr ähnlich sind. Wenn sich in einer Erkrankung verschiede "molekularen" Typen verbergen.
ncounter UNIVERSITÄTSKLINIKUM Genexpression Bild: www.nanostring.com/
Onkogene KINDERKREBSINITIATIVE BUCHHOLZ Holm-Seppensen (KKI) Normale Gene regulieren das Zellwachstum Eine Mutation ( Vollgas ) führt zu beschleunigter Zellteilung
Burkitt-Translokation: t(8;14)(q32;q21) MYC-Onkogen-Aktivierung UNIVERSITÄTSKLINIKUM KINDERKREBSINITIATIVE BUCHHOLZ Holm-Seppensen (KKI) 8 8 14 14 MYC-Onkogen = Gaspedal IGH-Gen = Bleifuß 8 der(8) 14 der(14)
Modell der Entstehung eines Burkitt Lymphomas UNIVERSITÄTSKLINIKUM KINDERKREBSINITIATIVE BUCHHOLZ Holm-Seppensen (KKI) Antigen ID3 TCF3/4 TP53 SMARCA4 IG-MYC
Nat Genet, 2012 UNIVERSITÄTSKLINIKUM
KINDERKREBSINITIATIVE BUCHHOLZ Holm-Seppensen (KKI) Viren in BL Nicht-kodierende Gene in BL MYC-negative BL
Epigenetik- der zweite Code Spermium Eizelle EPIGENETIK!? Befruchtetes Ei Genom Nervenzelle Hautzelle Herzzelle Darmzelle Leberzelle Knochenzelle Und viele mehr
EBV-Einfluss auf Epigenetik UNIVERSITÄTSKLINIKUM
KINDERKREBSINITIATIVE BUCHHOLZ Holm-Seppensen (KKI) Viren in BL Nicht-kodierende Gene in BL MYC-negative BL
Nicht-kodierende Gene Zellinie mit induzierbarem MYC Burkitt Lymphom-Zellinien Burkitt Lymphom-Biopsien Bestimmung von lncrnas Expressions-Signaturen Funktioneller Screen Identifizierung von neuen Lymphomspezifischen Biomarkern Identifizierung von neuen Therapie- Zielmolekülen
Nicht-kodierende Gene 1 sirnas Platte, in der die indentifizierten lncrnas herunterreguliert werden 2 Platte mit Molekülen, welche die identifizierten Signalwege beeinflussen Lymphom-Zellen http://www.mtxlsi.com/bio-tek-synergy-ht.htm Funktioneller Screens mit der KKI Synergy HT Multi-Mode Microplate Reader Messung der Viabilität und Proliferation Neue therapeutische Ziel- Moleküle
KINDERKREBSINITIATIVE BUCHHOLZ Holm-Seppensen (KKI) Viren in BL Nicht-kodierende Gene in BL MYC-negative BL
Christoph-Schubert-Forschungsprogramm Identifizierung von funktionell relevanten Genen bei Krebserkrankungen im Kindesalter durch Kombination von DNA-Mutationsanalyse und shrna Studien
Christoph-Schubert-Programm Liste der identifizierte Genveränderungen in kindlichen Lymphome Suche nach Lymphom-Zelllinien mit Veränderungen in denselben Genen (Modell, KKI-Zellkulturlabor) GeneChip-Arrays (n=4 Linien) KKI-GeneChip-Gerät Exom-Sequenzierung (n=5 Linien) Kandidatengen-Sequenzierung (n=18 Linien) KKI-Sequenzierer 4 Gene - - + - + - - - - - - - + + + + + + + - - - - - Gen-Aktivität und Eiweiß Funktion (KKI-LightCycler, KKI-Western Blot)
Christoph-Schubert-Programm Liste der identifizierte Genveränderungen in kindlichen Lymphome Kann man durch Ausschalten aktivierter Gene oder durch Einschalten inaktivierter Gene die Krebszellen umbringen? shrna Ausschalten Einschalten Plasmide - - + - + - - - - - - Gen-Aktivität und Eiweiß Funktion (KKI-LightCycler, KKI-Western Blot) - + + + + + + + - - - - -
http://www.bdbiosciences.com/sg/instruments/f acscalibur/index.jsp UNIVERSITÄTSKLINIKUM Christoph-Schubert-Programm Liste der identifizierte Genveränderungen in kindlichen Lymphome Kann man durch Ausschalten aktivierter Gene oder durch Einschalten inaktivierter Gene die Krebszellen umbringen? Nutzung von Virus-basierter-Transfertechnologie von shrna Tod oder Leben?
Modell der Entstehung eines Burkitt Lymphoms - offene Fragen - Antigen KKI- LightCycler ID3 TCF3/4 UNIVERSITÄTSKLINIKUM KINDERKREBSINITIATIVE BUCHHOLZ Holm-Seppensen (KKI) TP53 SMARCA4 KKI-MiSeq KKI- Zell- Kultur IG-MYC Christoph- Schubert Forschungs- Programm
DANKE KKI!!! KINDERKREBSINITIATIVE BUCHHOLZ Holm-Seppensen (KKI)