XML und seine Anwendungsmöglichkeiten bei der Archivierung im Gesundheitswesen

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1 Institut für Terminologie und angewandte Wissensforschung XML und seine Anwendungsmöglichkeiten bei der Archivierung im Gesundheitswesen Johannes Palme (itaw), Lukas Faulstich (ID) Karlsruher Archivtage Pfad Akte Nr.: 7700/00040

2 itawmediabase (imb) - 3cXVision Funktionsumfang: Erstellen, Archivieren, Präsentieren und Auswerten. Beispiel Workflow: Arztbrief und klinische Studien. Erstellung von Dokumente mit XML-Editoren (xmetal, ), Archivierung von Dokumenten über webdav- Schnittstelle Web-basiertes Präsentieren Retrieval: Volltextsuche (Stichwortsuche, Phrasensuche, Wordstammreduktion, Fuzzy- Suche, Boolesche Verknüpfungen). Treffersortierung (Ranking). Suche über Wortlisten. XML & Archivierung im Gesundheitswesen Folie 1

3 Strukturbild imb HTTP Web-Browser webdav Client Anwendungen präsentieren Dateioperationen Library- Servlet webdav- Servlet Servlet-Container(Tomcat) Indexer (Lucene) FO Apache Dateien XIS-Modul imb-3cxvision XML & Archivierung im Gesundheitswesen Folie 2

4 Demonstration der imb (1) XML & Archivierung im Gesundheitswesen Folie 3

5 Recherche in medizinischen Dokumenten Problem: vielfältige Varianten des Suchbegriffs erkennen Beispiel: Mittelohrentzündung Varianten: Otitis media Epitympanitis Entzündung des Mittelohrs Entzündung des linken Mittelohrs Ausschluß Mittelohrentzündung XML & Archivierung im Gesundheitswesen Folie 4

6 Recherche in medizinischen Dokumenten (2) Anforderungen: Abkürzungen und unvollständige Worte auflösen Schreibfehler korrigieren Von Schreibvarianten abstrahieren Synonyme finden Unterbegriffe und Bestandteile finden Lösung: linguistische Textaufbereitung Indexierung mit medizinischen Nomenklaturen (Wingert WNC, SNOMED CT) Suche auf Begriffen statt auf Worten Ausnutzung ontologischer Beziehungen bei der Suche (ID MACS medical semantic network ) XML & Archivierung im Gesundheitswesen Folie 5

7 Textaufbereitungs-Pipeline Gliederung Segmentierung Abk.- Exp. Satzsegmentierung Unstrukturierter Text Un- Text Extraktion semant. Indexierung Beziehungen Parsen / Floskeln erkennen Konzeptgraph XML & Archivierung im Gesundheitswesen Folie 6

8 Ergebnisse der Textaufbereitung Otitis media li. M001BC2 Mittelohrentzündung, GA0070C links Mittelohrentzündungen li. M001BC2 Mittelohrentzündung, GA0070C links Entzündung des linken Mittelohrs M001BC2 Mittelohrentzündung, GA0070C links vereinheitlichte semantische Darstellung Unabhängigkeit von Abkürzungen, Schreibfehlern, Schreibvarianten, Synonymen XML & Archivierung im Gesundheitswesen Folie 7

9 ID MACS medical semantic network D pathologischer Prozess M Entzündung M00210A Otitis M001BC2 Mittelohrentzündung M Epitympanitis M001D35 akute nichteitrige Otitis media Suche nach M00210A Otitis soll auch M001BC2 Mittelohrentzündung, M Epitympanitis, M001D35 akute nichteitrige Otitis media finden... XML & Archivierung im Gesundheitswesen Folie 8

10 imb mit ID LOGIK Technologieserver HTTP Web-Browser webdav Client Servlet Container ID LOGIK imb Dateien XIS ID MACS Terminologieserver XML & Archivierung im Gesundheitswesen Folie 9

11 Archivieren von XML-Dokumenten 1. Hochladen per Web-GUI oder WebDAV 2. Sicherung im Dokumentenspeicher der imb 3. Erzeugung einer semantischen Repräsentation im ID LOGIK Terminologieserver 4. Volltextindexierung der semantischen Repräsentation in der imb XML & Archivierung im Gesundheitswesen Folie 10

12 Recherche 1. Anfrage wird per Web-GUI der imb gestellt 2. ID LOGIK Terminologieserver transformiert Anfrage zu semantischer Anfrage und expandiert diese mit Informationen aus dem semantischen Netz ID MACS 3. imb führt expandierte Anfrage auf den gespeicherten semantischen Repräsentationen aus 4. gefundene Dokumente werden an den Terminologieserver geschickt und dort weiter semantisch gefiltert 5. Ergebnismenge wird von der Web-GUI der imb präsentiert XML & Archivierung im Gesundheitswesen Folie 11

13 Demonstration der imb (2) XML & Archivierung im Gesundheitswesen Folie 12

14 Zusammenfassung imb: Archivierungslösung für medizinische XML- Dokumente einfache Volltextrecherche auf medizinischen Texten reicht nicht aus Terminologieserver ID LOGIK ermöglicht semantische Indexierung und Ontologie-basierte Anfrageerweiterung imb + ID LOGIK = Archivierung und intelligente Recherche XML & Archivierung im Gesundheitswesen Folie 13

15 Institut für Terminologie und angewandte Wissensforschung Vielen Dank für Ihre Aufmerksamkeit! Pfad Akte Nr.: 7700/00040