Der Experimentator: Immunologie



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Werner Luttmann Kai Bratke Michael Küpper Daniel Myrtek Der Experimentator: Immunologie 4., vollständig überarbeitete und korrigierte Auflage Springer Spektrum

Inhaltsverzeichnis 1 Antikörper 1 1.1 Des Antikörpers Eigenheiten 2 1.1.1 Molekülstruktur von Antikörpern 4 1.1.2 Die Antigen-Antikörper-Bindung 7 1.2 Herstellung von Antikörpern 7 1.2.1 Das Antigen 8 1.2.2 Die Wahl der Spezies 10 1.2.3 Antigenapplikation 11 1.2.4 Polyklonale Antikörper 14 1.2.5 Monoklonale Antikörper 17 1.2.6 Rekombinante Antikörper 21 1.3 Reinigung von Antikörpern 24 1.3.1»Quick and dirty«- Präzipitationsmethoden 25 1.3.2 Affinitätschromatographie 26 1.3.3 Klassische Methoden der Proteinreinigung 29 1.3.4 Aufreinigung von IgY aus Eigelb 31 1.3.5 Aufreinigung rekombinanter Antikörper 32 1.3.6 Wichtige analytische Techniken 33 1.4 Chemische Kopplung und Markierung von Antikörpern 35 1.4.1 Chemische Kopplung von Antikörpern an feste Phasen 35 1.4.2 Kopplung von Markerenzymen an Antikörper 38 1.4.3 Kopplung von Fluorochromen an Antikörper 39 1.4.4 Kopplung von Biotin 42 1.4.5 Markierung mit Gold 43 1.4.6 Markierung mit radioaktiven Isotopen 45 1.5 Antikörper-Mikroarray 46 Weiterführende Literatur 49 2 Zellseparation 51 2.1 Trennung nach Zellgröße und Zelldichte - Zentrifugationstechniken 52 2.1:1 Differenzialzentrifugation 52 2.1.2 Dichtegradienten-Zentrifugation 53 2.1.3 Separationsmedien 55 2.1.4 Gegenstromzentrifugation 63 1.2 Trennung nach zellspezifischen Oberflächenmolekülen 64 2.2.1 Adhäsion an Kunststoffoberflächen 65 2.2.2 Adhäsion an Nylonwatte 66 2.2.3 Erythrocyten-Rosettierung. 67 2.2.4 Immunmagnetische Separation 68 2.2.5 Lysierende Antikörper 70 Weiterführende Literatur 71 3; Durchflusscytometrie 73 3.1 Wie funktioniert das eigentlich?... 74 3.2 Fluoreszenzen 78

Inhaltsverzeichnis 3.3 Probenvorbereitung 82 3.3.1 Zellmarkierung 82 3.4 Inbetriebnahme des Durchflusscytometers 87 3.5 Kompensation und Messung 87 3.5.1 Kompensation 89 3.5.2 Messung 93 3.6 Auswertung 96 3.6.1 Histogramm-Plot 96 3.6.2 Dot-Plot 96 3.6.3 Dichteplot 96 3.6.4 Konturplot 97 3.6.5 Isometrische Darstellung 98 3.7 Modelle und Ausstattungen 98 3.7.1 Autosampier 98 3.7.2 Zellsorter 98 3.8 Vergleichbarkeit durchflusscytometrischer Daten 100 Weiterführende Literatur 100 4 Quantitative Immunoassays 103 4.1 Assaykonzepte 104 4.1.1 Der kompetitive Assay 105 4.1.2 Der Sandwich-Assay 105 4.1.3 Welches Assaykonzept für welche Anwendung? 107 4.2 Radioimmunoassay (RIA) 108 4.2.1 Historisches 108 4.2.2 Praktisches 108 4.3 Enzyme-Iinked Immunosorbent Assay (ELISA) 111 4.3.1 Coaten, Blocken, Waschen 111 4.3.2 Enzyme und Substrate 112 4.3.3 ELISA in der Praxis 113 4.4 ELISPOT-Assay 117 4.4.1 Anwendung und Vergleich mit anderen Methoden 117 4.4.2 Prinzip und Praxis 1 118 4.5 Partikel-Immunoassay (PIA) 120 4.5.1 Prinzip der Mini-Kugeln 120 4.5.2 Trapping-Assay > 121 4.5.3 Multiplex-Assa?". 121 4.5.4 Vergleich mit anderen Immunoassays 124 4.6 Verstärkersysteme 124 4.6.1 Erhöhung der Markerdichte 125 4.6.2, Multi-Enzym-Kaskaden 125 4.6.3 Immuno-PCR 127 Weiterführende Literatur 130 5 Western-Blot., 133 5.1 Probenvorbereitung 134 5.2 Auftrennung eines Proteingemisches mittels Gelelektrophorese 135 5.2.1 Die diskontinuierliche SDS-PAGE 135 5.2.2 Native Gelelektrophorese und isoelektrische Fokussierung 139

'xi;- Inhaltsverzeichnis» H 5.3 Transfer der Proteine auf eine Membran (Blot) 5.3.1 Wet-Blot 5.3.2 Semi-Dry-Blot 5.3.3 Fehlerquellen 5.4 Proteindetektion 5.4.1 Blocking 5.4.2 Antikörpermarkierung 5.4.3 Visualisierung 5.4.4»Stripping«und»Re-probing«von Western-Blot-Membranen 5.4.5 Fehlerquellen und Kontrollen 5.5 Dot- und Slot-Blot Weiterführende Literatur 141 142 143 143 144 144 145 147 147 148 149 149 6 in situ-lmmunlokalisation 6.1 Untersuchung von Zellsuspensionen 6.1.1 Zellsuspensionen 6.1.2 Cytospins 6.1.3 Zellausstriche 6.1.4 Einbettung von Zellen 6.1.5 Variationen und Details zur Behandlung von Zellsuspensionen 6.2 Untersuchung von Geweben 6.2.1 Vorbereitung 6.2.2 Fixierung 6.2.3 Paraffin-Einbettung 6.2.4 Schneiden 6.2.5 Nachbehandlung 6.2.6 Immundetektion 6.2.7 Eindeckung 6.3 Immunelektronenmikroskopische Untersuchung von Geweben 6.3.1 Fixierung :. 6.3.2 Einbettung 6.3.3 Mikrotomie 6.3.4 Immundetektion 6.4 Tissue Microarrays Weiterführende Literatur 151 152 152 152 153 153 153 155 155 156 160 161 161 163 174 176 176 177 177 178 178 179 7 Immunpräzipitation 7.V. Die Klassiker 7.1.1 Eindimensionale Immundiffusion 7.1.2 Zweidimensionale Immundiffusion nach Ouchterlony 7.1.3 Radiale Immundiffusion nach Mancini 7.1.4 Immunelektrophoresen :. 7.1.5 Limitierung und aktuelle Bedeutung 7.2 Immunpräzipitation»heute«7.2.1 Die Präzipitationsmatrix 7.2.2 Reduktion unspezifisch präzipitierender Proteine.' 7.2.3 Analyse der Immunpräzipitate Weiterführende Literatur 181 183 183 185 186 187 190 192 192 192 193 194

XII Inhaltsverzeichnis 8 Die Zelle: leben, fressen, sterben 197 8.1 Zellviabilitätsbestimmung 198 8.1.1 Farbstoff-Exklusion 198 8.1.2 Tetrazoliumsalz-Reduktion 199 8.1.3 ATP-Assay 199 8.2 Zellproliferation 201 8.2.1 DNA-Markierung mit [ 3 H]Thymidin 201 8.2.2 DNA-Markierung mit 5-Brom-2'-desoxyuridin (Brdü) 202 8.2.3 Durchflusscytometrische Bestimmung der Zellproliferation. 203 8.3 Phagocytose-Assays 203 8.3.1 Die Testpartikel- Futter für die Phagocyten 205 8.3.2 Methoden der Partikelvisualisierung 206 8.4 Zellvermittelte Cytotoxizität 209 8.4.1 Chrom[ 51 Cr]-release-Assay 210 8.4.2 Lactat-Dehydrogenase(LDH)-release-Assay 211 8.4.3 DurchflusscytometrischerCytotoxizitätsnachweis 212 8.5 Apoptose-Assays 213 8.5.1 Färbungen des Zellkerns 215 8.5.2 DNA-Leiter 215 8.5.3 Nudeosomen-Quantifizierungs-ELISA 216 8.5.4 TUNEL-Technik 216 8.5.5 Annexin V 217 8.5.6 Messung von Caspase-Aktivität 217 8.5.7 Sonstiges 219 Weiterführende Literatur 219 9 Immunologie in der klinischen Anwendung 223 9.1 Blutgruppenbestimmung 224 9.2 HLA-Typisierung 227 9.2.1 Lymphocytotoxizitätstest 228 9.3 Lymphoblastentransformation 230 9.4 Immunzellen in der Therapie 231 9.4.1 Dendritische Zellen 232 Weiterführende Literatur 236 i 10 Ein kurzer Ausflug in die ungeliebte Welt der Statistik 237 10.1 Deskriptive Statistik 240 10.1.1 Lokationsmaße 240 10.1.2 Streuungsmaße 242 10.1.3 Korrelationsmaße 244 10.2 Prüfstatistik 245 10.2.1 Skalen und ihre Daten :. 246 10.2.2 Skizze des Ablaufs einer wissenschaftlichen Untersuchung 246 10:2.3 Die Wahl eines geeigneten Signifikanztests 249 Weiterführende Literatur 254

Inhaltsverzeichnis XIII 11 Naturwissenschaft vs. Übernatürliches 255 CD-Antigene, Cytokine, Chemokine 257 Glossar 281 Index 293