Zellbiologie: BSc Arbeiten 15/16

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1 Zellbiologie: BSc Arbeiten 15/16 Lehrstuhl Zellbiologie: Arbeitsgruppen Prof. Benedikt Kost Prof. Georg Kreimer PD Michael Lebert Slot Zeitraum Anzahl Plätze Semester Ferien WS WS/Ferien Ferien/SS SS/Ferien

2 Zellbiologie: Fachmodul 15/16 > Vorlesung Vorlesung: nur WS15/16 Di, 8:15-10:00 Zelluläre Grundlagen der pflanzlichen Entwicklung Teil 1: Benedikt Kost Jan Dettmer Teil 2: Georg Kreimer Teil 3: Michael Lebert > Zytoskelett > Endomembransystem > Zellteilung & -wachstum > zelluläre Grundlagen der Morphogenese > Licht als Umweltfaktor > Lichtperzeption & -Signaltransduktion > Lichtgesteuerte Prozesse: in Zellen & Organentwicklung > Schwerkraft als Umweltfaktor > Schwerkraftperzeption & Signaltransduktion > Schwerkraft gesteuerte Prozesse: in Zellen & Organentwicklung

3 Zellbiologie: Fachmodul 15/16 > Übungen Seminar & Block A 1 WS15/ Praktikum: Block A 2 SS Block B SF Block A & B Woche 1 > Seminar: Literaturvorträge > jeder Teilnehmer stellt eine aktuelle Veröffentlichung vor > Themen passend zu Vorlesung und Praktikum > Ziele: - thematische Vertiefung - Präsentationstechnik Woche 2-4 > Praktikum (A: Kost/Kreimer/Lebert, B: Lebert)

4 Praktikum Block A (Kost): Polares Zellwachstum Tabak Pollenschläuche Apikale Zellen von Physcomitrella patens (Moos) Filamenten (Protonemata) Caulonema Chloronema Rhizoide

5 Praktikum Block A (Kost): Polares Zellwachstum Transformation: direkter Gen-Transfer Transformation: Expressionsanalyse Moos Protoplasten histochemischer GUS assay PEG GFP Expression: Epifluoreszenz Mikroskopie Tabak Pollen particle gun Wachstums- Effekte

6 Praktikum Block A (Kost): Polares Zellwachstum Plasmid Maxi-Prep Protein (Nt-Rac5) Aufreinigung E. coli Transformation & Kultur Plasmid Aufreinigung GST Fusionsprotein Aufreinigung SDS PA Gel- Elektrophorese Plasmid Restriktion Agarose Gel- Elektrophorese Western-Blot ECL-Detektion

7 Praktikum Block A (Kreimer): Zytoskelett 10 µm Experimentelles System: Chlamydomonas reinhardtii

8 Praktikum Block A (Kreimer): Zytoskelett Geißel-Abwurf & Regeneration Experimentelle Manipulation der cytosolischen Ca 2+ -Konzentration

9 Praktikum Block A (Kreimer): Zytoskelett Proteinextrakt Analyse Indirekte Immun-Fluoreszenz SDS PAGE Western Blot (akalische Phosphatase- Detektion) isolierte Zytoskelette (Protein) (Antikörper) Geißeln: Proteinzusammensetzung

10 Praktikum Block A (Lebert): Schwerkraft-Perzeption Experimentelles System: Euglena gracilis

11 Praktikum Block A (Lebert): Schwerkraft-Perzeption polymerase chain reaction PCR Molekulare Klonierung Insert Vektor rekombinantes Plasmid

12 Praktikum Block A (Lebert): Schwerkraft-Perzeption RNAi Gen Knock-down Digitale Bildverarbeitung doppelsträngige RNA r-value: theta: 1 NON RANDOM Ziel Gen: Komponente der Schwerkraft-Wahrnehmung Gen knock-down : Effekte auf die Schwerkraft- Wahrnehmung

13 Praktikum Block A: Systeme & Methoden Experimentelle Systeme: Höhere Pflanzen: Tabak Moose: Physcomitrella Algen: Chlamydomonas Protisten: Euglena Transformation: Molekularbiologie: Protein-Biochemie: Mikroskopie PEG, particle gun, Elektroporation -> Markergen-Expression (GUS, GFP) -> RNAi Gen kock-down PCR molekulare Kolonierung: DNA fragment Plasmid Maxi Prep GST Fusionsprotein: Aufreinigung Proteinextrakte SDS PAGE Western Blot: ECL, alk. Phosphatase GFP Expression, Immunfluoreszenz digitale Bildverarbeitung

14 Praktikum Block B: Systemische Biologie Photosynthese und Pigmente Einfluss äußerer Faktoren (Licht, Temperatur, Trockenstress) auf die photosynthetische Leistung Pigmentanalyse Photodynamische Reaktionen von Chlorophyll zum Abtöten von Parasiten und ihren Überträgern

15 Praktikum Block B: Systemische Biologie Schutzpigmente Phytohormone Induktion von mycosporinähnlichen Aminosäuren durch UV Keimungshemmung durch Abscisinsäure, Mobilisierung von Reservestoffen durch Giberellinsäure etc.

16 Organisatorisches Seminarvorbereitung Klausuren Bewertung 2 Wochen vor jedem Übungs-Block > 1 Veröffentlichung / Student > Anleitung 1x Vorlesung & 1x Übungen > Erster Montag nach Semester > Gesamtnote: 50% Vorlesung (Klausur), 50% Übungen > Übungen: 20% Seminar 40% Protokolle & Mitarbeit (je 50%) 40% Klausur Anzahl Plätze Vorlesung: 1x 48 Plätze (1x WS) Block A: 2x 16 Plätze (1x WS, 1x SS) Block B: 1x 14 Plätze (1x Sommerferien) Anmeldung Stud-ON WWW zentrale Vergabe: Fachschaft > Susanne Mohrbach